MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 108910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012207	CTT	2	6	529534	529539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_012207	AGGCC	2	10	529611	529620	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13003	NC_012207	CGT	2	6	529621	529626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_012207	CCGT	2	8	529657	529664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_012207	GGA	2	6	529739	529744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_012207	ACG	2	6	529775	529780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13007	NC_012207	CGT	2	6	529863	529868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13008	NC_012207	AAG	2	6	529876	529881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988826
13009	NC_012207	GT	3	6	529910	529915	0 %	50 %	50 %	0 %	224988826
13010	NC_012207	GGA	2	6	529938	529943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988826
13011	NC_012207	AAG	2	6	529987	529992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224988826
13012	NC_012207	CAC	2	6	530016	530021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988826
13013	NC_012207	CGGC	2	8	530075	530082	0 %	0 %	50 %	50 %	224988826
13014	NC_012207	AGG	2	6	530159	530164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988826
13015	NC_012207	CGG	2	6	530204	530209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988826
13016	NC_012207	TCA	2	6	530270	530275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988826
13017	NC_012207	GAG	2	6	530281	530286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988826
13018	NC_012207	GACC	2	8	530364	530371	25 %	0 %	25 %	50 %	224988826
13019	NC_012207	AGG	2	6	530381	530386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988826
13020	NC_012207	GGA	2	6	530394	530399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988826
13021	NC_012207	CTG	2	6	530410	530415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13022	NC_012207	CTG	2	6	530446	530451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13023	NC_012207	GCT	2	6	530454	530459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13024	NC_012207	GCT	2	6	530487	530492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13025	NC_012207	ATC	2	6	530494	530499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988826
13026	NC_012207	GTC	2	6	530536	530541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13027	NC_012207	CCG	2	6	530598	530603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988826
13028	NC_012207	TGC	2	6	530612	530617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13029	NC_012207	GGT	2	6	530638	530643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988826
13030	NC_012207	GCT	2	6	530694	530699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13031	NC_012207	ACC	2	6	530737	530742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988826
13032	NC_012207	TCG	2	6	530744	530749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13033	NC_012207	GGT	2	6	530869	530874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988826
13034	NC_012207	GCC	2	6	530896	530901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988826
13035	NC_012207	GCC	2	6	530962	530967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988826
13036	NC_012207	GAG	2	6	530971	530976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988826
13037	NC_012207	TCG	2	6	530981	530986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13038	NC_012207	CGA	2	6	531048	531053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13039	NC_012207	GTG	2	6	531136	531141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988826
13040	NC_012207	GCG	2	6	531265	531270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988826
13041	NC_012207	ACC	2	6	531292	531297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988826
13042	NC_012207	CGT	2	6	531303	531308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988826
13043	NC_012207	GGC	2	6	531349	531354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988826
13044	NC_012207	GAG	2	6	531399	531404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_012207	CTC	2	6	531428	531433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_012207	GCA	2	6	531521	531526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988827
13047	NC_012207	GC	3	6	531527	531532	0 %	0 %	50 %	50 %	224988827
13048	NC_012207	GCGG	2	8	531552	531559	0 %	0 %	75 %	25 %	224988827
13049	NC_012207	GTC	2	6	531561	531566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988827
13050	NC_012207	CGA	2	6	531602	531607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988827
13051	NC_012207	GGC	2	6	531634	531639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988827
13052	NC_012207	GCA	2	6	531749	531754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988827
13053	NC_012207	CAT	2	6	531788	531793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988827
13054	NC_012207	GGC	3	9	531831	531839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988827
13055	NC_012207	ACCG	2	8	531908	531915	25 %	0 %	25 %	50 %	224988828
13056	NC_012207	CACG	2	8	532009	532016	25 %	0 %	25 %	50 %	224988828
13057	NC_012207	TGC	2	6	532042	532047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988828
13058	NC_012207	AGCC	2	8	532108	532115	25 %	0 %	25 %	50 %	224988828
13059	NC_012207	GCC	2	6	532157	532162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13060	NC_012207	GCG	2	6	532182	532187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988828
13061	NC_012207	GCC	2	6	532287	532292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13062	NC_012207	GCC	2	6	532301	532306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13063	NC_012207	CGG	2	6	532318	532323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988828
13064	NC_012207	GCC	2	6	532335	532340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13065	NC_012207	AGCC	2	8	532345	532352	25 %	0 %	25 %	50 %	224988828
13066	NC_012207	GGC	2	6	532364	532369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988828
13067	NC_012207	CTGC	2	8	532407	532414	0 %	25 %	25 %	50 %	224988828
13068	NC_012207	CCGATG	2	12	532479	532490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	224988828
13069	NC_012207	GCC	2	6	532571	532576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13070	NC_012207	TGCCGG	2	12	532708	532719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	224988828
13071	NC_012207	TGT	3	9	532735	532743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988828
13072	NC_012207	TGT	3	9	532750	532758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988828
13073	NC_012207	CTG	2	6	532844	532849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988828
13074	NC_012207	CGC	2	6	532904	532909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13075	NC_012207	GCC	2	6	532938	532943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13076	NC_012207	CAG	2	6	532994	532999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988828
13077	NC_012207	GCC	2	6	533046	533051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13078	NC_012207	GCC	2	6	533055	533060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13079	NC_012207	GCC	2	6	533115	533120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13080	NC_012207	CAT	2	6	533156	533161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988828
13081	NC_012207	CGC	3	9	533162	533170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988828
13082	NC_012207	GGAC	2	8	533171	533178	25 %	0 %	50 %	25 %	224988828
13083	NC_012207	CCAG	2	8	533179	533186	25 %	0 %	25 %	50 %	224988828
13084	NC_012207	TTC	2	6	533243	533248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988828
13085	NC_012207	GCA	2	6	533274	533279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988828
13086	NC_012207	GGC	2	6	533331	533336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988828
13087	NC_012207	GGC	2	6	533492	533497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_012207	CGC	2	6	533558	533563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988829
13089	NC_012207	CGA	2	6	533612	533617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988829
13090	NC_012207	GCT	2	6	533687	533692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988829
13091	NC_012207	CTG	2	6	533862	533867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988829
13092	NC_012207	TAC	2	6	533874	533879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988829
13093	NC_012207	GTG	2	6	533943	533948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988829
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13095	NC_012207	TCG	2	6	533998	534003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988829
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13097	NC_012207	CCG	2	6	534069	534074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13098	NC_012207	GCC	2	6	534146	534151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13099	NC_012207	TCG	2	6	534171	534176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_012207	CGT	2	6	534350	534355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988830
13101	NC_012207	CCG	2	6	534367	534372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988830
13102	NC_012207	CCG	2	6	534388	534393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988830
13103	NC_012207	CAG	2	6	534416	534421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988830
13104	NC_012207	TGG	2	6	534449	534454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988830
13105	NC_012207	TCA	2	6	534466	534471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988830
13106	NC_012207	CAG	2	6	534473	534478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988830
13107	NC_012207	ACC	2	6	534504	534509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988830
13108	NC_012207	GA	3	6	534535	534540	50 %	0 %	50 %	0 %	224988830
13109	NC_012207	CCGT	2	8	534541	534548	0 %	25 %	25 %	50 %	224988830
13110	NC_012207	G	6	6	534584	534589	0 %	0 %	100 %	0 %	224988830
13111	NC_012207	CGC	2	6	534644	534649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988830
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13113	NC_012207	CGG	2	6	534745	534750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988830
13114	NC_012207	TGG	2	6	534751	534756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988830
13115	NC_012207	CCG	2	6	534757	534762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988830
13116	NC_012207	GAC	2	6	534764	534769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988830
13117	NC_012207	TCG	2	6	534798	534803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988830
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13119	NC_012207	GTCG	2	8	534844	534851	0 %	25 %	50 %	25 %	224988830
13120	NC_012207	TCG	2	6	534867	534872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988830
13121	NC_012207	AGC	2	6	534909	534914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988830
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13123	NC_012207	CGGC	2	8	534969	534976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13124	NC_012207	CCG	2	6	535062	535067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988831
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13225	NC_012207	AGCTG	2	10	538990	538999	20 %	20 %	40 %	20 %	224988835
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13231	NC_012207	GCA	2	6	539261	539266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988835
13232	NC_012207	CGCGG	2	10	539274	539283	0 %	0 %	60 %	40 %	224988835
13233	NC_012207	CG	3	6	539354	539359	0 %	0 %	50 %	50 %	224988835
13234	NC_012207	GTC	2	6	539391	539396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988835
13235	NC_012207	GC	3	6	539398	539403	0 %	0 %	50 %	50 %	224988835
13236	NC_012207	CGACAT	2	12	539406	539417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	224988835
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13238	NC_012207	GCC	2	6	539535	539540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988835
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13343	NC_012207	ATAGTC	2	12	544120	544131	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13345	NC_012207	GC	4	8	544236	544243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13346	NC_012207	TG	3	6	544272	544277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13347	NC_012207	ATGG	2	8	544339	544346	25 %	25 %	50 %	0 %	224988839
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13350	NC_012207	AGT	2	6	544379	544384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988839
13351	NC_012207	GGGCCG	3	18	544385	544402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988839
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13353	NC_012207	GTC	2	6	544426	544431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988839
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13358	NC_012207	CGG	2	6	544587	544592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988839
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13479	NC_012207	GCT	2	6	549180	549185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988844
13480	NC_012207	GGT	2	6	549190	549195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988844
13481	NC_012207	CGG	2	6	549225	549230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988844
13482	NC_012207	GCCA	2	8	549279	549286	25 %	0 %	25 %	50 %	224988844
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13484	NC_012207	GCCA	2	8	549341	549348	25 %	0 %	25 %	50 %	224988844
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