MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 108910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012207	GC	3	6	402211	402216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_012207	GGT	2	6	402253	402258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_012207	GGC	2	6	402277	402282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_012207	CCG	2	6	402342	402347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_012207	TGG	2	6	402351	402356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_012207	GCC	2	6	402409	402414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_012207	TTCG	2	8	402452	402459	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_012207	TGA	2	6	402493	402498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_012207	CCA	2	6	402504	402509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_012207	TGG	2	6	402544	402549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_012207	CCCA	2	8	402551	402558	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10012	NC_012207	GCT	2	6	402700	402705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_012207	GCG	2	6	402728	402733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_012207	ACCC	2	8	402755	402762	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10015	NC_012207	GAT	2	6	402789	402794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_012207	ATCGC	2	10	402833	402842	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10017	NC_012207	CGC	2	6	402864	402869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_012207	GC	3	6	402876	402881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_012207	CCG	2	6	402899	402904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_012207	CAC	2	6	402926	402931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_012207	ACG	2	6	402941	402946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_012207	CCG	2	6	402952	402957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_012207	TTG	2	6	402997	403002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_012207	GTT	2	6	403010	403015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_012207	GCG	2	6	403051	403056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_012207	CGC	3	9	403066	403074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_012207	GCT	2	6	403129	403134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10028	NC_012207	GGC	2	6	403175	403180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988723
10029	NC_012207	GAT	2	6	403219	403224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988723
10030	NC_012207	TCT	2	6	403267	403272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988723
10031	NC_012207	CAG	3	9	403277	403285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10032	NC_012207	TCG	4	12	403302	403313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10033	NC_012207	GC	3	6	403354	403359	0 %	0 %	50 %	50 %	224988723
10034	NC_012207	CCG	2	6	403360	403365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988723
10035	NC_012207	GCT	2	6	403420	403425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10036	NC_012207	AGC	2	6	403428	403433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10037	NC_012207	GCC	2	6	403436	403441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988723
10038	NC_012207	GCA	2	6	403444	403449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10039	NC_012207	GCC	2	6	403472	403477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988723
10040	NC_012207	CAG	2	6	403535	403540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10041	NC_012207	GCT	2	6	403559	403564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10042	NC_012207	GCCA	2	8	403590	403597	25 %	0 %	25 %	50 %	224988723
10043	NC_012207	CGAT	2	8	403669	403676	25 %	25 %	25 %	25 %	224988723
10044	NC_012207	CGT	3	9	403696	403704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10045	NC_012207	CAG	3	9	403736	403744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10046	NC_012207	GGTTG	2	10	403805	403814	0 %	40 %	60 %	0 %	224988723
10047	NC_012207	GCC	2	6	403925	403930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988723
10048	NC_012207	CAG	2	6	404000	404005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10049	NC_012207	CGT	2	6	404056	404061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988723
10050	NC_012207	ACC	2	6	404106	404111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988723
10051	NC_012207	GAT	2	6	404174	404179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988723
10052	NC_012207	CG	3	6	404271	404276	0 %	0 %	50 %	50 %	224988723
10053	NC_012207	GC	3	6	404343	404348	0 %	0 %	50 %	50 %	224988723
10054	NC_012207	TGGC	2	8	404358	404365	0 %	25 %	50 %	25 %	224988723
10055	NC_012207	TGG	2	6	404382	404387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988723
10056	NC_012207	CG	3	6	404479	404484	0 %	0 %	50 %	50 %	224988724
10057	NC_012207	GCG	2	6	404553	404558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988724
10058	NC_012207	GGCTG	2	10	404589	404598	0 %	20 %	60 %	20 %	224988724
10059	NC_012207	CGG	2	6	404659	404664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988724
10060	NC_012207	GCG	2	6	404688	404693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988724
10061	NC_012207	CGG	2	6	404752	404757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988724
10062	NC_012207	TGC	2	6	404780	404785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988724
10063	NC_012207	CGGC	2	8	404791	404798	0 %	0 %	50 %	50 %	224988724
10064	NC_012207	CGG	2	6	404818	404823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988724
10065	NC_012207	GC	3	6	404874	404879	0 %	0 %	50 %	50 %	224988724
10066	NC_012207	GGC	2	6	404894	404899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988724
10067	NC_012207	CGC	2	6	404977	404982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988724
10068	NC_012207	CGGC	2	8	404985	404992	0 %	0 %	50 %	50 %	224988724
10069	NC_012207	TTC	2	6	404993	404998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988724
10070	NC_012207	TTC	2	6	405122	405127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988724
10071	NC_012207	GCC	2	6	405143	405148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988724
10072	NC_012207	CAA	2	6	405156	405161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988724
10073	NC_012207	GTG	2	6	405226	405231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988724
10074	NC_012207	TTG	2	6	405243	405248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988724
10075	NC_012207	AGC	2	6	405339	405344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988724
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10080	NC_012207	CGGCGA	2	12	405586	405597	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	224988724
10081	NC_012207	TGG	2	6	405616	405621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988724
10082	NC_012207	TCT	2	6	405622	405627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988724
10083	NC_012207	GTC	2	6	405635	405640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988724
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10085	NC_012207	TCG	2	6	405732	405737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988724
10086	NC_012207	CAT	2	6	405836	405841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988724
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10088	NC_012207	CGA	2	6	405862	405867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988724
10089	NC_012207	CAC	2	6	405913	405918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988724
10090	NC_012207	CA	3	6	405923	405928	50 %	0 %	0 %	50 %	224988724
10091	NC_012207	TGA	2	6	406044	406049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988724
10092	NC_012207	CGC	2	6	406069	406074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988724
10093	NC_012207	ATG	2	6	406140	406145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988724
10094	NC_012207	GCCCA	2	10	406343	406352	20 %	0 %	20 %	60 %	224988724
10095	NC_012207	GCA	2	6	406453	406458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988724
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10102	NC_012207	GAT	2	6	406706	406711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988724
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10105	NC_012207	TC	3	6	406805	406810	0 %	50 %	0 %	50 %	224988724
10106	NC_012207	CAG	2	6	406817	406822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988724
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10108	NC_012207	CCA	2	6	407015	407020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988724
10109	NC_012207	CGC	2	6	407025	407030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988724
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10111	NC_012207	TGA	2	6	407080	407085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988724
10112	NC_012207	CGC	2	6	407176	407181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_012207	GTC	2	6	407206	407211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988725
10114	NC_012207	GCA	2	6	407257	407262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988725
10115	NC_012207	ACA	2	6	407266	407271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988725
10116	NC_012207	GTG	2	6	407318	407323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988725
10117	NC_012207	CAGTAG	2	12	407381	407392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224988725
10118	NC_012207	TTCGCG	2	12	407402	407413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988725
10119	NC_012207	GCG	2	6	407422	407427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988725
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10360	NC_012207	GCG	2	6	417546	417551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988732
10361	NC_012207	ACC	2	6	417561	417566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988732
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10363	NC_012207	GCT	2	6	417620	417625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988732
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10378	NC_012207	TCG	2	6	418200	418205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988732
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10382	NC_012207	ATCG	2	8	418344	418351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10383	NC_012207	TGT	2	6	418365	418370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10388	NC_012207	GCA	2	6	418627	418632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988733
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10482	NC_012207	GATC	2	8	423037	423044	25 %	25 %	25 %	25 %	224988737
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10484	NC_012207	GGGA	2	8	423088	423095	25 %	0 %	75 %	0 %	224988737
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