MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Tokyo 172 chromosome

Total Repeats: 108910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012207	TCA	2	6	22031	22036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988401
502	NC_012207	ATG	2	6	22165	22170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988401
503	NC_012207	GTA	2	6	22197	22202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988401
504	NC_012207	TGC	2	6	22205	22210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988401
505	NC_012207	GAT	2	6	22212	22217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988401
506	NC_012207	CG	3	6	22218	22223	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
507	NC_012207	TCA	2	6	22244	22249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988401
508	NC_012207	ACC	2	6	22292	22297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988401
509	NC_012207	GCTG	2	8	22352	22359	0 %	25 %	50 %	25 %	224988401
510	NC_012207	CGGC	2	8	22372	22379	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
511	NC_012207	GTC	3	9	22404	22412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988401
512	NC_012207	CGTAGT	2	12	22451	22462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	224988401
513	NC_012207	CGA	2	6	22463	22468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988401
514	NC_012207	CGA	3	9	22475	22483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988401
515	NC_012207	GCC	3	9	22500	22508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988401
516	NC_012207	CAG	2	6	22617	22622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988401
517	NC_012207	CCT	2	6	22724	22729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988401
518	NC_012207	TCG	2	6	22747	22752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988401
519	NC_012207	GTC	2	6	22773	22778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988401
520	NC_012207	GCA	2	6	22808	22813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988401
521	NC_012207	CG	3	6	22820	22825	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
522	NC_012207	GC	3	6	22945	22950	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
523	NC_012207	CAG	2	6	22971	22976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988401
524	NC_012207	TCG	2	6	22990	22995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988401
525	NC_012207	GCCG	2	8	23043	23050	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
526	NC_012207	CCCA	2	8	23055	23062	25 %	0 %	0 %	75 %	224988401
527	NC_012207	GTT	2	6	23112	23117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988401
528	NC_012207	GC	3	6	23142	23147	0 %	0 %	50 %	50 %	224988401
529	NC_012207	C	6	6	23206	23211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
530	NC_012207	GC	3	6	23222	23227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_012207	TCG	2	6	23253	23258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012207	GTC	2	6	23336	23341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988402
533	NC_012207	GTC	2	6	23443	23448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988402
534	NC_012207	GTC	2	6	23467	23472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988402
535	NC_012207	GC	3	6	23474	23479	0 %	0 %	50 %	50 %	224988402
536	NC_012207	CG	3	6	23513	23518	0 %	0 %	50 %	50 %	224988402
537	NC_012207	CAC	2	6	23539	23544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988402
538	NC_012207	CG	3	6	23573	23578	0 %	0 %	50 %	50 %	224988402
539	NC_012207	CAT	2	6	23614	23619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224988402
540	NC_012207	CAA	2	6	23686	23691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224988402
541	NC_012207	GGT	2	6	23815	23820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012207	GAT	2	6	23875	23880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988403
543	NC_012207	ATCAC	2	10	23900	23909	40 %	20 %	0 %	40 %	224988403
544	NC_012207	GTG	2	6	23951	23956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988403
545	NC_012207	TGG	2	6	23961	23966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988403
546	NC_012207	AC	3	6	24027	24032	50 %	0 %	0 %	50 %	224988403
547	NC_012207	GAT	2	6	24073	24078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988403
548	NC_012207	CGT	2	6	24117	24122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988403
549	NC_012207	CGG	2	6	24147	24152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988403
550	NC_012207	GCC	2	6	24160	24165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
551	NC_012207	GCTG	2	8	24194	24201	0 %	25 %	50 %	25 %	224988403
552	NC_012207	CGTAGT	2	12	24228	24239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	224988403
553	NC_012207	CGGC	2	8	24242	24249	0 %	0 %	50 %	50 %	224988403
554	NC_012207	GAG	2	6	24273	24278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988403
555	NC_012207	GCC	3	9	24325	24333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
556	NC_012207	GCCG	2	8	24342	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	224988403
557	NC_012207	CGGG	2	8	24417	24424	0 %	0 %	75 %	25 %	224988403
558	NC_012207	CTC	2	6	24454	24459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224988403
559	NC_012207	CCG	2	6	24494	24499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
560	NC_012207	GCC	2	6	24511	24516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
561	NC_012207	GCC	2	6	24535	24540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
562	NC_012207	GCCGG	2	10	24587	24596	0 %	0 %	60 %	40 %	224988403
563	NC_012207	AGG	2	6	24604	24609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224988403
564	NC_012207	GCG	2	6	24624	24629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988403
565	NC_012207	C	6	6	24635	24640	0 %	0 %	0 %	100 %	224988403
566	NC_012207	CCTGGT	2	12	24666	24677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988403
567	NC_012207	GCC	2	6	24802	24807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
568	NC_012207	C	6	6	24823	24828	0 %	0 %	0 %	100 %	224988403
569	NC_012207	CCA	2	6	24860	24865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988403
570	NC_012207	GTC	2	6	24895	24900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988403
571	NC_012207	TCG	2	6	24908	24913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988403
572	NC_012207	GCCCCT	2	12	24918	24929	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	224988403
573	NC_012207	CGG	2	6	25024	25029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988403
574	NC_012207	CGA	2	6	25090	25095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988403
575	NC_012207	GAC	2	6	25108	25113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988403
576	NC_012207	ATG	2	6	25235	25240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988403
577	NC_012207	GCC	2	6	25292	25297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988403
578	NC_012207	GCA	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988403
579	NC_012207	TCG	2	6	25457	25462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012207	TCAA	2	8	25495	25502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_012207	GAGC	2	8	25523	25530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
582	NC_012207	GGCC	2	8	25537	25544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_012207	CCG	2	6	25558	25563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_012207	CTA	2	6	25593	25598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_012207	TCC	2	6	25610	25615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_012207	GTT	2	6	25617	25622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012207	TCG	3	9	25737	25745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_012207	GCC	2	6	25751	25756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_012207	GC	3	6	25901	25906	0 %	0 %	50 %	50 %	224988404
590	NC_012207	CGC	2	6	25924	25929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988404
591	NC_012207	TTG	2	6	25930	25935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224988404
592	NC_012207	CGG	2	6	25956	25961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
593	NC_012207	CGG	2	6	25998	26003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
594	NC_012207	CTT	2	6	26061	26066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224988404
595	NC_012207	GT	3	6	26135	26140	0 %	50 %	50 %	0 %	224988404
596	NC_012207	GTG	2	6	26180	26185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224988404
597	NC_012207	GTC	2	6	26194	26199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988404
598	NC_012207	GCC	2	6	26207	26212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988404
599	NC_012207	AGC	2	6	26213	26218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988404
600	NC_012207	CGG	2	6	26286	26291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
601	NC_012207	CGG	2	6	26307	26312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
602	NC_012207	CGG	2	6	26340	26345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
603	NC_012207	CG	3	6	26369	26374	0 %	0 %	50 %	50 %	224988404
604	NC_012207	CGA	2	6	26385	26390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988404
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607	NC_012207	CGG	2	6	26535	26540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
608	NC_012207	AGC	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988404
609	NC_012207	TGA	2	6	26652	26657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224988404
610	NC_012207	GCG	2	6	26681	26686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224988404
611	NC_012207	CCAA	2	8	26703	26710	50 %	0 %	0 %	50 %	224988404
612	NC_012207	GCC	2	6	26725	26730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988404
613	NC_012207	CAGC	2	8	26769	26776	25 %	0 %	25 %	50 %	224988404
614	NC_012207	CCG	2	6	26780	26785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988404
615	NC_012207	CAC	2	6	26857	26862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988404
616	NC_012207	AAC	2	6	26863	26868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_012207	CGT	2	6	26881	26886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012207	CTT	2	6	26932	26937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012207	CGAGC	2	10	26949	26958	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
620	NC_012207	CAC	2	6	27046	27051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224988405
621	NC_012207	CAG	2	6	27094	27099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988405
622	NC_012207	CGC	2	6	27135	27140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988405
623	NC_012207	GCA	2	6	27153	27158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224988405
624	NC_012207	CGT	2	6	27159	27164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988405
625	NC_012207	GCC	2	6	27199	27204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224988405
626	NC_012207	GCT	2	6	27273	27278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988405
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628	NC_012207	CGT	2	6	27366	27371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224988405
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