MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL4

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011998	CTT	2	6	28	33	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011998	CGAAA	2	10	136	145	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011998	CTTT	2	8	170	177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011998	ATA	2	6	214	219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011998	AATTT	2	10	244	253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011998	A	6	6	266	271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011998	TTG	2	6	281	286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011998	ATTT	2	8	331	338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011998	ATA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011998	TAT	2	6	368	373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011998	AAC	2	6	391	396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011998	CGT	2	6	400	405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011998	TAAAAA	2	12	581	592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011998	T	7	7	637	643	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
15	NC_011998	TCT	2	6	680	685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
16	NC_011998	ATCAAA	2	12	691	702	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222142649
17	NC_011998	TCT	2	6	767	772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
18	NC_011998	T	6	6	772	777	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
19	NC_011998	ATATTT	2	12	838	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142649
20	NC_011998	CATT	2	8	872	879	25 %	50 %	0 %	25 %	222142649
21	NC_011998	CAA	2	6	889	894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142649
22	NC_011998	CATA	2	8	895	902	50 %	25 %	0 %	25 %	222142649
23	NC_011998	TTG	2	6	930	935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142649
24	NC_011998	TCA	2	6	986	991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
25	NC_011998	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142649
26	NC_011998	T	6	6	1075	1080	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
27	NC_011998	CT	4	8	1106	1113	0 %	50 %	0 %	50 %	222142649
28	NC_011998	TTC	2	6	1166	1171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
29	NC_011998	TCA	2	6	1185	1190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
30	NC_011998	A	7	7	1192	1198	100 %	0 %	0 %	0 %	222142649
31	NC_011998	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
32	NC_011998	TCAAAA	2	12	1214	1225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222142649
33	NC_011998	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142649
34	NC_011998	TCA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142649
35	NC_011998	ATT	2	6	1309	1314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142649
36	NC_011998	AATTC	2	10	1322	1331	40 %	40 %	0 %	20 %	222142649
37	NC_011998	TCT	2	6	1339	1344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142649
38	NC_011998	TA	3	6	1378	1383	50 %	50 %	0 %	0 %	222142649
39	NC_011998	TTCA	2	8	1390	1397	25 %	50 %	0 %	25 %	222142649
40	NC_011998	TAT	2	6	1416	1421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142649
41	NC_011998	T	6	6	1425	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
42	NC_011998	G	6	6	1539	1544	0 %	0 %	100 %	0 %	222142649
43	NC_011998	T	7	7	1595	1601	0 %	100 %	0 %	0 %	222142649
44	NC_011998	ATTC	2	8	1605	1612	25 %	50 %	0 %	25 %	222142649
45	NC_011998	A	7	7	1622	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011998	AAT	2	6	1712	1717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011998	TGT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011998	ATT	2	6	1776	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011998	T	7	7	1780	1786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011998	T	7	7	1829	1835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011998	ATTT	2	8	1836	1843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011998	A	6	6	1884	1889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011998	T	6	6	1899	1904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011998	GAGC	2	8	1939	1946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011998	GT	3	6	2040	2045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011998	G	6	6	2049	2054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011998	TCT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011998	TGT	2	6	2102	2107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142650
59	NC_011998	CTT	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
60	NC_011998	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142650
61	NC_011998	TC	3	6	2177	2182	0 %	50 %	0 %	50 %	222142650
62	NC_011998	GCTATT	2	12	2218	2229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222142650
63	NC_011998	TTC	2	6	2232	2237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
64	NC_011998	TAA	2	6	2262	2267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142650
65	NC_011998	T	6	6	2324	2329	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
66	NC_011998	TTC	2	6	2359	2364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
67	NC_011998	CT	3	6	2383	2388	0 %	50 %	0 %	50 %	222142650
68	NC_011998	CTT	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
69	NC_011998	T	7	7	2464	2470	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
70	NC_011998	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
71	NC_011998	CAA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142650
72	NC_011998	CTT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
73	NC_011998	CTT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
74	NC_011998	TCT	2	6	2534	2539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
75	NC_011998	TTTC	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	222142650
76	NC_011998	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
77	NC_011998	T	6	6	2622	2627	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
78	NC_011998	TTC	2	6	2707	2712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142650
79	NC_011998	TTTC	2	8	2727	2734	0 %	75 %	0 %	25 %	222142650
80	NC_011998	T	6	6	2782	2787	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
81	NC_011998	T	8	8	2827	2834	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
82	NC_011998	TCA	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
83	NC_011998	TCTTT	2	10	2893	2902	0 %	80 %	0 %	20 %	222142650
84	NC_011998	T	7	7	2917	2923	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
85	NC_011998	TCA	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
86	NC_011998	ATC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
87	NC_011998	TGA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142650
88	NC_011998	CTG	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222142650
89	NC_011998	T	6	6	3116	3121	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
90	NC_011998	TAC	2	6	3180	3185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142650
91	NC_011998	AAC	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142650
92	NC_011998	T	8	8	3199	3206	0 %	100 %	0 %	0 %	222142650
93	NC_011998	AGC	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142650
94	NC_011998	CTTCT	2	10	3275	3284	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_011998	TCT	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011998	ATT	2	6	3372	3377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.