MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 467

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011995	ATC	2	6	56	61	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011995	AT	3	6	67	72	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011995	CAT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011995	TCT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011995	TCT	2	6	228	233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011995	TTG	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011995	GAC	2	6	293	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011995	CCA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011995	CTT	2	6	430	435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011995	GAC	2	6	461	466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011995	CTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011995	GTA	2	6	636	641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142562
14	NC_011995	TCAG	2	8	674	681	25 %	25 %	25 %	25 %	222142562
15	NC_011995	T	6	6	682	687	0 %	100 %	0 %	0 %	222142562
16	NC_011995	TCAT	2	8	692	699	25 %	50 %	0 %	25 %	222142562
17	NC_011995	TGT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142562
18	NC_011995	CTT	2	6	734	739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142562
19	NC_011995	GATT	2	8	752	759	25 %	50 %	25 %	0 %	222142562
20	NC_011995	ATT	2	6	763	768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142562
21	NC_011995	GC	4	8	869	876	0 %	0 %	50 %	50 %	222142562
22	NC_011995	ATG	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142562
23	NC_011995	CAT	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142562
24	NC_011995	AAT	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142562
25	NC_011995	T	6	6	973	978	0 %	100 %	0 %	0 %	222142562
26	NC_011995	A	6	6	1015	1020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011995	T	6	6	1041	1046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011995	GTGAT	2	10	1065	1074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011995	TTG	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011995	AAC	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011995	CATCA	2	10	1175	1184	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011995	A	6	6	1194	1199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011995	T	6	6	1260	1265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011995	ACTT	2	8	1312	1319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011995	ATC	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011995	TTC	2	6	1370	1375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011995	GAT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011995	CAT	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011995	TGGAT	2	10	1461	1470	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011995	AATCC	2	10	1495	1504	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011995	CTT	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
42	NC_011995	ATTG	2	8	1677	1684	25 %	50 %	25 %	0 %	222142563
43	NC_011995	TTC	2	6	1687	1692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
44	NC_011995	ATTCA	2	10	1702	1711	40 %	40 %	0 %	20 %	222142563
45	NC_011995	CTGA	2	8	1725	1732	25 %	25 %	25 %	25 %	222142563
46	NC_011995	TTC	2	6	1754	1759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
47	NC_011995	CTT	2	6	1821	1826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
48	NC_011995	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
49	NC_011995	CTTTT	2	10	1861	1870	0 %	80 %	0 %	20 %	222142563
50	NC_011995	GTT	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142563
51	NC_011995	TCT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
52	NC_011995	TCT	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142563
53	NC_011995	TCC	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011995	TTA	2	6	1963	1968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011995	AT	3	6	2014	2019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011995	CAC	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011995	AGG	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011995	CATG	2	8	2071	2078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011995	GTT	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011995	TAT	2	6	2116	2121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011995	T	6	6	2197	2202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011995	ATG	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011995	A	7	7	2257	2263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011995	CAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011995	A	6	6	2294	2299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011995	GTA	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011995	TAA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011995	ATA	3	9	2389	2397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011995	AAAGT	2	10	2413	2422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011995	GAT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011995	TCTA	2	8	2601	2608	25 %	50 %	0 %	25 %	222142564
72	NC_011995	T	6	6	2635	2640	0 %	100 %	0 %	0 %	222142564
73	NC_011995	TGA	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
74	NC_011995	A	7	7	2683	2689	100 %	0 %	0 %	0 %	222142564
75	NC_011995	AAT	2	6	2701	2706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142564
76	NC_011995	T	7	7	2715	2721	0 %	100 %	0 %	0 %	222142564
77	NC_011995	AAC	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142564
78	NC_011995	GA	3	6	2811	2816	50 %	0 %	50 %	0 %	222142564
79	NC_011995	GTT	2	6	2821	2826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142564
80	NC_011995	AGA	2	6	2864	2869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142564
81	NC_011995	CTC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222142564
82	NC_011995	GAT	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
83	NC_011995	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
84	NC_011995	TTA	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
85	NC_011995	TAA	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142564
86	NC_011995	GTT	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142564
87	NC_011995	AGT	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
88	NC_011995	GAA	2	6	3007	3012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142564
89	NC_011995	TAT	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
90	NC_011995	T	6	6	3065	3070	0 %	100 %	0 %	0 %	222142564
91	NC_011995	A	8	8	3074	3081	100 %	0 %	0 %	0 %	222142564
92	NC_011995	ACAA	2	8	3113	3120	75 %	0 %	0 %	25 %	222142564
93	NC_011995	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
94	NC_011995	ATAAA	2	10	3176	3185	80 %	20 %	0 %	0 %	222142564
95	NC_011995	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	222142564
96	NC_011995	GA	3	6	3194	3199	50 %	0 %	50 %	0 %	222142564
97	NC_011995	A	7	7	3210	3216	100 %	0 %	0 %	0 %	222142564
98	NC_011995	ATG	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142564
99	NC_011995	TTA	2	6	3317	3322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142564
100	NC_011995	TAAAG	2	10	3324	3333	60 %	20 %	20 %	0 %	222142564
101	NC_011995	AT	3	6	3355	3360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011995	ATGA	2	8	3366	3373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011995	TCAT	2	8	3379	3386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011995	T	7	7	3391	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	222142565
105	NC_011995	AT	3	6	3460	3465	50 %	50 %	0 %	0 %	222142565
106	NC_011995	ATGA	2	8	3485	3492	50 %	25 %	25 %	0 %	222142565
107	NC_011995	TAAA	2	8	3494	3501	75 %	25 %	0 %	0 %	222142565
108	NC_011995	T	7	7	3527	3533	0 %	100 %	0 %	0 %	222142565
109	NC_011995	TAA	2	6	3535	3540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142565
110	NC_011995	GATT	2	8	3591	3598	25 %	50 %	25 %	0 %	222142565
111	NC_011995	CGAT	2	8	3718	3725	25 %	25 %	25 %	25 %	222142565
112	NC_011995	GAT	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142565
113	NC_011995	TCT	2	6	3770	3775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142565
114	NC_011995	TCTT	2	8	3808	3815	0 %	75 %	0 %	25 %	222142565
115	NC_011995	TCAC	2	8	3832	3839	25 %	25 %	0 %	50 %	222142565
116	NC_011995	TAAAT	2	10	3861	3870	60 %	40 %	0 %	0 %	222142565
117	NC_011995	A	7	7	3871	3877	100 %	0 %	0 %	0 %	222142565
118	NC_011995	ATA	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142565
119	NC_011995	T	6	6	3928	3933	0 %	100 %	0 %	0 %	222142565
120	NC_011995	TCA	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142565
121	NC_011995	TTA	3	9	3993	4001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011995	CAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011995	ATT	2	6	4017	4022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011995	TAT	2	6	4078	4083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011995	CTT	2	6	4114	4119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142566
126	NC_011995	T	7	7	4181	4187	0 %	100 %	0 %	0 %	222142566
127	NC_011995	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	222142566
128	NC_011995	ATA	2	6	4203	4208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
129	NC_011995	TAT	2	6	4223	4228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
130	NC_011995	TTA	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
131	NC_011995	TAA	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
132	NC_011995	AT	4	8	4356	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	222142566
133	NC_011995	TCC	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222142566
134	NC_011995	TAT	2	6	4403	4408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
135	NC_011995	ATA	2	6	4422	4427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
136	NC_011995	TAT	2	6	4451	4456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142566
137	NC_011995	TC	3	6	4459	4464	0 %	50 %	0 %	50 %	222142566
138	NC_011995	TAA	2	6	4493	4498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142566
139	NC_011995	T	6	6	4499	4504	0 %	100 %	0 %	0 %	222142566
140	NC_011995	TA	3	6	4506	4511	50 %	50 %	0 %	0 %	222142566
141	NC_011995	AT	4	8	4521	4528	50 %	50 %	0 %	0 %	222142566
142	NC_011995	GTAT	2	8	4533	4540	25 %	50 %	25 %	0 %	222142566
143	NC_011995	AGAAA	2	10	4558	4567	80 %	0 %	20 %	0 %	222142566
144	NC_011995	A	6	6	4631	4636	100 %	0 %	0 %	0 %	222142567
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421	NC_011995	AT	3	6	13423	13428	50 %	50 %	0 %	0 %	222142573
422	NC_011995	A	6	6	13523	13528	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
423	NC_011995	CAA	2	6	13551	13556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142573
424	NC_011995	AAC	2	6	13582	13587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142573
425	NC_011995	ATA	2	6	13595	13600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142573
426	NC_011995	TAA	2	6	13603	13608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142573
427	NC_011995	A	6	6	13615	13620	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
428	NC_011995	AAT	2	6	13631	13636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142573
429	NC_011995	AGAGT	2	10	13655	13664	40 %	20 %	40 %	0 %	222142573
430	NC_011995	TA	3	6	13665	13670	50 %	50 %	0 %	0 %	222142573
431	NC_011995	ATC	2	6	13693	13698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142573
432	NC_011995	A	6	6	13704	13709	100 %	0 %	0 %	0 %	222142573
433	NC_011995	GA	4	8	13765	13772	50 %	0 %	50 %	0 %	222142573
434	NC_011995	TAA	2	6	13787	13792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_011995	ATTT	2	8	13808	13815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_011995	TATC	2	8	13838	13845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
437	NC_011995	TATC	2	8	13898	13905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
438	NC_011995	TATC	2	8	13958	13965	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
439	NC_011995	TATC	2	8	14018	14025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
440	NC_011995	TATC	2	8	14078	14085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
441	NC_011995	TATC	2	8	14138	14145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
442	NC_011995	TATC	2	8	14198	14205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
443	NC_011995	TATC	2	8	14258	14265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
444	NC_011995	TATC	2	8	14318	14325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
445	NC_011995	TAA	2	6	14367	14372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_011995	CTAT	2	8	14377	14384	25 %	50 %	0 %	25 %	222142574
447	NC_011995	TCTG	2	8	14444	14451	0 %	50 %	25 %	25 %	222142574
448	NC_011995	TGT	2	6	14465	14470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142574
449	NC_011995	ACGT	2	8	14482	14489	25 %	25 %	25 %	25 %	222142574
450	NC_011995	ATC	2	6	14638	14643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142574
451	NC_011995	GATT	2	8	14649	14656	25 %	50 %	25 %	0 %	222142574
452	NC_011995	T	7	7	14695	14701	0 %	100 %	0 %	0 %	222142574
453	NC_011995	TCA	2	6	14733	14738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142574
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457	NC_011995	ATA	2	6	14977	14982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142574
458	NC_011995	ATA	2	6	15020	15025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142575
459	NC_011995	GAT	2	6	15026	15031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142575
460	NC_011995	TGA	3	9	15052	15060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142575
461	NC_011995	TTG	2	6	15113	15118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142575
462	NC_011995	TGTT	2	8	15167	15174	0 %	75 %	25 %	0 %	222142575
463	NC_011995	TGT	2	6	15208	15213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142575
464	NC_011995	TTTTG	2	10	15217	15226	0 %	80 %	20 %	0 %	222142575
465	NC_011995	TTG	3	9	15444	15452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142575
466	NC_011995	T	7	7	15529	15535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_011995	TTG	2	6	15594	15599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding