MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium leprae Br4923 chromosome

Total Repeats: 67008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011896	AG	3	6	44	49	50 %	0 %	50 %	0 %	221229344
2	NC_011896	CGT	2	6	53	58	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229344
3	NC_011896	CAC	2	6	84	89	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221229344
4	NC_011896	GTC	2	6	103	108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229344
5	NC_011896	GAC	2	6	136	141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229344
6	NC_011896	CCA	2	6	146	151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221229344
7	NC_011896	CTC	2	6	179	184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221229344
8	NC_011896	CAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221229344
9	NC_011896	CAG	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229344
10	NC_011896	ACA	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221229344
11	NC_011896	GAC	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229344
12	NC_011896	CGA	2	6	417	422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229344
13	NC_011896	CGTT	2	8	569	576	0 %	50 %	25 %	25 %	221229344
14	NC_011896	TGC	2	6	603	608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229344
15	NC_011896	CGC	2	6	699	704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221229344
16	NC_011896	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229344
17	NC_011896	TCA	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221229344
18	NC_011896	GAC	2	6	796	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229344
19	NC_011896	AAG	2	6	878	883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229344
20	NC_011896	AAG	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229344
21	NC_011896	TTC	2	6	898	903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221229344
22	NC_011896	CAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221229344
23	NC_011896	TCT	2	6	949	954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221229344
24	NC_011896	AAC	2	6	968	973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221229344
25	NC_011896	TTA	2	6	1019	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221229344
26	NC_011896	CAG	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229344
27	NC_011896	TCA	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221229344
28	NC_011896	CAA	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221229344
29	NC_011896	CCG	2	6	1301	1306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221229344
30	NC_011896	ACC	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221229344
31	NC_011896	GAA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229344
32	NC_011896	ACCAC	2	10	1448	1457	40 %	0 %	0 %	60 %	221229344
33	NC_011896	CAC	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221229344
34	NC_011896	CTT	2	6	1602	1607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011896	GT	3	6	1639	1644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011896	CAA	2	6	1679	1684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011896	TAT	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011896	CAA	2	6	1783	1788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011896	TTC	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011896	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011896	ACT	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011896	CGT	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011896	CGTT	2	8	2002	2009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011896	GTTG	2	8	2102	2109	0 %	50 %	50 %	0 %	221229345
45	NC_011896	TGC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229345
46	NC_011896	TGC	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229345
47	NC_011896	CTT	2	6	2301	2306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221229345
48	NC_011896	GTT	2	6	2332	2337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221229345
49	NC_011896	CGA	2	6	2436	2441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229345
50	NC_011896	GCC	2	6	2615	2620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221229345
51	NC_011896	TGG	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229345
52	NC_011896	TGTC	2	8	2753	2760	0 %	50 %	25 %	25 %	221229345
53	NC_011896	TAC	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221229345
54	NC_011896	CTT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221229345
55	NC_011896	CCA	2	6	2898	2903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221229345
56	NC_011896	TGG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229345
57	NC_011896	GC	3	6	2961	2966	0 %	0 %	50 %	50 %	221229345
58	NC_011896	CCG	2	6	3006	3011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221229345
59	NC_011896	GAT	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221229345
60	NC_011896	GCCGA	2	10	3027	3036	20 %	0 %	40 %	40 %	221229345
61	NC_011896	AGA	2	6	3037	3042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229345
62	NC_011896	CTGA	2	8	3098	3105	25 %	25 %	25 %	25 %	221229345
63	NC_011896	TGC	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229345
64	NC_011896	ATG	3	9	3189	3197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221229345
65	NC_011896	ATG	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221229345
66	NC_011896	GGAC	2	8	3350	3357	25 %	0 %	50 %	25 %	221229346
67	NC_011896	CCA	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221229346
68	NC_011896	GATT	2	8	3526	3533	25 %	50 %	25 %	0 %	221229346
69	NC_011896	TGC	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229346
70	NC_011896	GGGC	2	8	3548	3555	0 %	0 %	75 %	25 %	221229346
71	NC_011896	CGT	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229346
72	NC_011896	GAT	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221229346
73	NC_011896	TGC	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229346
74	NC_011896	GC	3	6	3730	3735	0 %	0 %	50 %	50 %	221229346
75	NC_011896	TGC	2	6	3750	3755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229346
76	NC_011896	AGC	2	6	3784	3789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229346
77	NC_011896	AC	3	6	3822	3827	50 %	0 %	0 %	50 %	221229346
78	NC_011896	GTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221229346
79	NC_011896	GCCA	2	8	4157	4164	25 %	0 %	25 %	50 %	221229346
80	NC_011896	GTT	2	6	4213	4218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221229346
81	NC_011896	TTG	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221229346
82	NC_011896	GAC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229346
83	NC_011896	TGC	2	6	4276	4281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229346
84	NC_011896	CAG	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229346
85	NC_011896	GCG	2	6	4340	4345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221229346
86	NC_011896	AGG	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221229346
87	NC_011896	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229346
88	NC_011896	GC	3	6	4518	4523	0 %	0 %	50 %	50 %	221229347
89	NC_011896	GAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229347
90	NC_011896	TGC	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229347
91	NC_011896	CGT	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229347
92	NC_011896	AGGGT	2	10	4724	4733	20 %	20 %	60 %	0 %	221229347
93	NC_011896	TGG	2	6	4754	4759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229347
94	NC_011896	CAA	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221229347
95	NC_011896	TGC	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229347
96	NC_011896	TGGTG	2	10	4902	4911	0 %	40 %	60 %	0 %	221229347
97	NC_011896	CAT	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221229347
98	NC_011896	GAG	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011896	CGA	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011896	GTG	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011896	CTG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011896	CCA	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221229348
103	NC_011896	GTG	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229348
104	NC_011896	CGA	2	6	5435	5440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229348
105	NC_011896	CGG	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221229348
106	NC_011896	GGT	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229348
107	NC_011896	GTG	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229348
108	NC_011896	GT	3	6	5602	5607	0 %	50 %	50 %	0 %	221229348
109	NC_011896	GGT	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229348
110	NC_011896	CCA	2	6	5626	5631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221229348
111	NC_011896	GGTCGA	2	12	5633	5644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221229348
112	NC_011896	ACG	2	6	5736	5741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229348
113	NC_011896	GC	3	6	5802	5807	0 %	0 %	50 %	50 %	221229348
114	NC_011896	AAG	2	6	5815	5820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229348
115	NC_011896	TTG	2	6	5854	5859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221229348
116	NC_011896	CGA	2	6	5888	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229348
117	NC_011896	GTC	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229348
118	NC_011896	GAA	2	6	5937	5942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229348
119	NC_011896	TGG	2	6	6007	6012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229348
120	NC_011896	CGG	2	6	6119	6124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221229348
121	NC_011896	GGC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221229348
122	NC_011896	GAA	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221229348
123	NC_011896	GTG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229348
124	NC_011896	A	6	6	6240	6245	100 %	0 %	0 %	0 %	221229348
125	NC_011896	CGA	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221229348
126	NC_011896	GGC	2	6	6299	6304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221229348
127	NC_011896	TCG	2	6	6471	6476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221229348
128	NC_011896	TGG	2	6	6542	6547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229348
129	NC_011896	TGTA	2	8	6601	6608	25 %	50 %	25 %	0 %	221229348
130	NC_011896	TGG	2	6	6626	6631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229348
131	NC_011896	ATT	2	6	6750	6755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221229348
132	NC_011896	ATG	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221229348
133	NC_011896	TGT	2	6	6865	6870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221229348
134	NC_011896	GCC	2	6	6932	6937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221229348
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142	NC_011896	ATG	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_011896	TAT	2	6	12954	12959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221229351
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263	NC_011896	GTT	2	6	13597	13602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_011896	TAC	2	6	13634	13639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_011896	GTG	2	6	13642	13647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_011896	AT	3	6	13695	13700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_011896	TAGA	2	8	13739	13746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
270	NC_011896	CTG	2	6	13758	13763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_011896	AT	5	10	14227	14236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_011896	AC	3	6	14398	14403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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401	NC_011896	ATGA	2	8	20458	20465	50 %	25 %	25 %	0 %	221229357
402	NC_011896	TGG	2	6	20474	20479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221229357
403	NC_011896	TTG	2	6	20524	20529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221229357
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500	NC_011896	CGGAT	2	10	26005	26014	20 %	20 %	40 %	20 %	221229361

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