MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD07

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011890	CTG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011890	CGA	2	6	47	52	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011890	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915116
4	NC_011890	GCCCTC	2	12	145	156	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220915116
5	NC_011890	ATCG	2	8	214	221	25 %	25 %	25 %	25 %	220915116
6	NC_011890	GCCG	2	8	232	239	0 %	0 %	50 %	50 %	220915116
7	NC_011890	GGA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915116
8	NC_011890	GCG	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
9	NC_011890	GGC	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
10	NC_011890	CG	3	6	426	431	0 %	0 %	50 %	50 %	220915116
11	NC_011890	GGC	2	6	438	443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
12	NC_011890	GCCG	2	8	467	474	0 %	0 %	50 %	50 %	220915116
13	NC_011890	CGC	2	6	488	493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915116
14	NC_011890	GCC	2	6	498	503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915116
15	NC_011890	CGG	2	6	536	541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
16	NC_011890	CGGG	2	8	649	656	0 %	0 %	75 %	25 %	220915116
17	NC_011890	CGA	2	6	669	674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011890	CGT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011890	GCG	2	6	926	931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011890	GAG	2	6	939	944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011890	GGC	2	6	968	973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011890	CCG	2	6	980	985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011890	GCT	2	6	998	1003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011890	GCC	2	6	1017	1022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011890	CGGG	2	8	1076	1083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011890	GC	3	6	1090	1095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011890	TCG	2	6	1185	1190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915117
28	NC_011890	GCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915117
29	NC_011890	GAAT	2	8	1289	1296	50 %	25 %	25 %	0 %	220915117
30	NC_011890	CCG	2	6	1320	1325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915117
31	NC_011890	CTTT	2	8	1367	1374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011890	CGAG	2	8	1539	1546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011890	GA	3	6	1583	1588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011890	CGGG	2	8	1623	1630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011890	TGC	2	6	1668	1673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011890	CGC	2	6	1676	1681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011890	TCG	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011890	CGC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011890	TCG	2	6	1779	1784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011890	CGC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011890	GCG	2	6	1802	1807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011890	CG	3	6	1864	1869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011890	GCC	2	6	1882	1887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011890	TCG	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011890	CCT	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011890	GGC	2	6	1982	1987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011890	GCG	2	6	1990	1995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011890	AG	3	6	2047	2052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011890	CGC	2	6	2130	2135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011890	CGC	2	6	2137	2142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011890	CG	5	10	2155	2164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011890	CGC	2	6	2234	2239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011890	CCG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_011890	GA	3	6	2276	2281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011890	AGG	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011890	CGG	2	6	2301	2306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011890	TCCG	2	8	2310	2317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011890	CGG	2	6	2547	2552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915118
59	NC_011890	CTTC	2	8	2618	2625	0 %	50 %	0 %	50 %	220915118
60	NC_011890	GCCC	2	8	2687	2694	0 %	0 %	25 %	75 %	220915118
61	NC_011890	TGT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915118
62	NC_011890	CGGCC	2	10	2760	2769	0 %	0 %	40 %	60 %	220915118
63	NC_011890	CTG	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915118
64	NC_011890	CGC	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915118
65	NC_011890	G	6	6	2868	2873	0 %	0 %	100 %	0 %	220915118
66	NC_011890	C	6	6	3037	3042	0 %	0 %	0 %	100 %	220915119
67	NC_011890	CGT	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
68	NC_011890	GCC	2	6	3081	3086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
69	NC_011890	ACC	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915119
70	NC_011890	CGG	3	9	3132	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
71	NC_011890	TCG	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
72	NC_011890	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
73	NC_011890	CAG	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
74	NC_011890	TGCC	2	8	3208	3215	0 %	25 %	25 %	50 %	220915119
75	NC_011890	CCT	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915119
76	NC_011890	TCG	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
77	NC_011890	CG	3	6	3348	3353	0 %	0 %	50 %	50 %	220915119
78	NC_011890	GGCA	2	8	3372	3379	25 %	0 %	50 %	25 %	220915119
79	NC_011890	CTG	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
80	NC_011890	CGA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
81	NC_011890	CGC	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
82	NC_011890	CGC	2	6	3589	3594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
83	NC_011890	TCA	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
84	NC_011890	TTG	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
85	NC_011890	AGC	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
86	NC_011890	GAC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
87	NC_011890	GCA	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
88	NC_011890	GCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
89	NC_011890	TCA	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
90	NC_011890	CGC	2	6	4082	4087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
91	NC_011890	CGGGCA	2	12	4132	4143	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220915119
92	NC_011890	GCG	2	6	4196	4201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
93	NC_011890	GCC	2	6	4237	4242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
94	NC_011890	TTG	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
95	NC_011890	TCA	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
96	NC_011890	GCA	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
97	NC_011890	TGC	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
98	NC_011890	CCGG	2	8	4451	4458	0 %	0 %	50 %	50 %	220915119
99	NC_011890	TGTCGT	2	12	4471	4482	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	220915119
100	NC_011890	GGCG	2	8	4507	4514	0 %	0 %	75 %	25 %	220915119
101	NC_011890	CAT	2	6	4550	4555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
102	NC_011890	TCC	3	9	4593	4601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915119
103	NC_011890	GAT	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915119
104	NC_011890	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
105	NC_011890	CAG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
106	NC_011890	CCA	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915119
107	NC_011890	CCG	3	9	4839	4847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
108	NC_011890	CGC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
109	NC_011890	GAT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915119
110	NC_011890	TCG	2	6	4941	4946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
111	NC_011890	GGGT	2	8	5025	5032	0 %	25 %	75 %	0 %	220915119
112	NC_011890	ACG	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
113	NC_011890	TGC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
114	NC_011890	AGC	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
115	NC_011890	TGT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
116	NC_011890	CCG	2	6	5120	5125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
117	NC_011890	GCC	2	6	5131	5136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
118	NC_011890	CGG	2	6	5155	5160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
119	NC_011890	CAG	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
120	NC_011890	CGG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
121	NC_011890	CGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
122	NC_011890	GC	3	6	5457	5462	0 %	0 %	50 %	50 %	220915119
123	NC_011890	ATT	2	6	5617	5622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011890	CTT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011890	T	6	6	5634	5639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011890	GGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915120
127	NC_011890	GTC	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915120
128	NC_011890	CGCC	2	8	5997	6004	0 %	0 %	25 %	75 %	220915120
129	NC_011890	GCAC	2	8	6005	6012	25 %	0 %	25 %	50 %	220915120
130	NC_011890	CTC	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915120
131	NC_011890	AGT	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
132	NC_011890	CG	3	6	6151	6156	0 %	0 %	50 %	50 %	220915120
133	NC_011890	TGA	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
134	NC_011890	CG	3	6	6274	6279	0 %	0 %	50 %	50 %	220915120
135	NC_011890	TCC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915120
136	NC_011890	TGA	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
137	NC_011890	GCC	2	6	6442	6447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915120
138	NC_011890	CG	3	6	6474	6479	0 %	0 %	50 %	50 %	220915120
139	NC_011890	GGTCAC	2	12	6481	6492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220915120
140	NC_011890	AGG	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915120
141	NC_011890	GC	3	6	6515	6520	0 %	0 %	50 %	50 %	220915120
142	NC_011890	TCA	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915120
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148	NC_011890	ACG	3	9	6880	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_011890	GCG	2	6	6965	6970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_011890	GCG	3	9	7029	7037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011890	G	6	6	7108	7113	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011890	CAGCGG	2	12	7158	7169	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_011890	GCC	2	6	7194	7199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_011890	G	12	12	7219	7230	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011890	GCC	2	6	7321	7326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_011890	G	6	6	7346	7351	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011890	GGC	2	6	7355	7360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_011890	GCA	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_011890	GCG	2	6	7445	7450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_011890	GGC	2	6	7458	7463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_011890	CCG	2	6	7522	7527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_011890	CGA	2	6	7535	7540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_011890	CCCG	2	8	7565	7572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
170	NC_011890	CGA	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_011890	CCG	2	6	7858	7863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_011890	CGA	2	6	7904	7909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_011890	CGA	2	6	7919	7924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_011890	GT	3	6	8053	8058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011890	GTG	2	6	8092	8097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011890	TCA	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_011890	GCA	2	6	8318	8323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_011890	GCG	2	6	8440	8445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_011890	GCT	2	6	8471	8476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.