MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_011832	TCG	2	6	2225246	2225251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852688
49002	NC_011832	TCG	2	6	2225282	2225287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852688
49003	NC_011832	AGA	2	6	2225297	2225302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852688
49004	NC_011832	CT	3	6	2225373	2225378	0 %	50 %	0 %	50 %	219852688
49005	NC_011832	TTC	2	6	2225385	2225390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852688
49006	NC_011832	GGT	2	6	2225397	2225402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852688
49007	NC_011832	ATC	2	6	2225449	2225454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852688
49008	NC_011832	ATG	2	6	2225489	2225494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852688
49009	NC_011832	GGTCT	2	10	2225617	2225626	0 %	40 %	40 %	20 %	219852688
49010	NC_011832	TTCAG	2	10	2225662	2225671	20 %	40 %	20 %	20 %	219852688
49011	NC_011832	ATC	2	6	2225677	2225682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852688
49012	NC_011832	C	6	6	2225874	2225879	0 %	0 %	0 %	100 %	219852689
49013	NC_011832	T	6	6	2225902	2225907	0 %	100 %	0 %	0 %	219852689
49014	NC_011832	CTC	2	6	2225962	2225967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852689
49015	NC_011832	TTC	2	6	2225978	2225983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852689
49016	NC_011832	TGCA	2	8	2226113	2226120	25 %	25 %	25 %	25 %	219852689
49017	NC_011832	CTC	2	6	2226139	2226144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852689
49018	NC_011832	CCG	2	6	2226148	2226153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852689
49019	NC_011832	CCG	2	6	2226171	2226176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852689
49020	NC_011832	TCGA	2	8	2226260	2226267	25 %	25 %	25 %	25 %	219852689
49021	NC_011832	CCT	2	6	2226342	2226347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852689
49022	NC_011832	CTT	2	6	2226433	2226438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852689
49023	NC_011832	CGTT	2	8	2226472	2226479	0 %	50 %	25 %	25 %	219852689
49024	NC_011832	GGA	2	6	2226573	2226578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852689
49025	NC_011832	TCGATC	2	12	2226593	2226604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219852689
49026	NC_011832	CCGA	2	8	2226605	2226612	25 %	0 %	25 %	50 %	219852689
49027	NC_011832	AG	3	6	2226628	2226633	50 %	0 %	50 %	0 %	219852689
49028	NC_011832	GAG	3	9	2226631	2226639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852689
49029	NC_011832	TCG	2	6	2226704	2226709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852689
49030	NC_011832	CGGT	2	8	2226731	2226738	0 %	25 %	50 %	25 %	219852689
49031	NC_011832	CCG	2	6	2226799	2226804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852689
49032	NC_011832	CCT	2	6	2226852	2226857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852689
49033	NC_011832	AGG	2	6	2226897	2226902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852689
49034	NC_011832	CCTTGG	2	12	2226912	2226923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852689
49035	NC_011832	CGA	2	6	2226933	2226938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852689
49036	NC_011832	TGA	2	6	2226987	2226992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852689
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49038	NC_011832	ACGA	2	8	2227022	2227029	50 %	0 %	25 %	25 %	219852689
49039	NC_011832	TCG	2	6	2227031	2227036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852689
49040	NC_011832	TCC	2	6	2227050	2227055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852689
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49042	NC_011832	GGT	2	6	2227138	2227143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852689
49043	NC_011832	GTTC	2	8	2227238	2227245	0 %	50 %	25 %	25 %	219852689
49044	NC_011832	GTC	2	6	2227402	2227407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852689
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49046	NC_011832	GAACT	2	10	2227502	2227511	40 %	20 %	20 %	20 %	219852689
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49049	NC_011832	CGG	2	6	2227605	2227610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852689
49050	NC_011832	CCT	2	6	2227620	2227625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852689
49051	NC_011832	ATG	2	6	2227639	2227644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852689
49052	NC_011832	C	6	6	2227656	2227661	0 %	0 %	0 %	100 %	219852689
49053	NC_011832	AGG	2	6	2227670	2227675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852689
49054	NC_011832	CGG	2	6	2227689	2227694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852689
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49056	NC_011832	GCCT	2	8	2227760	2227767	0 %	25 %	25 %	50 %	219852689
49057	NC_011832	ACCG	2	8	2227885	2227892	25 %	0 %	25 %	50 %	219852689
49058	NC_011832	GA	3	6	2227898	2227903	50 %	0 %	50 %	0 %	219852689
49059	NC_011832	TCG	2	6	2227997	2228002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852689
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49089	NC_011832	GGCC	2	8	2229305	2229312	0 %	0 %	50 %	50 %	219852691
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49100	NC_011832	GA	3	6	2229857	2229862	50 %	0 %	50 %	0 %	219852691
49101	NC_011832	CTG	2	6	2229890	2229895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852691
49102	NC_011832	CT	3	6	2229934	2229939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49103	NC_011832	CATC	2	8	2229944	2229951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49104	NC_011832	CAG	2	6	2229960	2229965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49107	NC_011832	GT	3	6	2230120	2230125	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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49112	NC_011832	GCC	2	6	2230294	2230299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852692
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49115	NC_011832	C	6	6	2230421	2230426	0 %	0 %	0 %	100 %	219852692
49116	NC_011832	ACC	2	6	2230477	2230482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852692
49117	NC_011832	TC	3	6	2230542	2230547	0 %	50 %	0 %	50 %	219852692
49118	NC_011832	ACT	2	6	2230553	2230558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852692
49119	NC_011832	ATC	2	6	2230567	2230572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852692
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49123	NC_011832	TGG	2	6	2230850	2230855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852692
49124	NC_011832	GCCG	2	8	2230914	2230921	0 %	0 %	50 %	50 %	219852692
49125	NC_011832	GCT	2	6	2231058	2231063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852692
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49223	NC_011832	TATT	2	8	2235323	2235330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49233	NC_011832	GAA	2	6	2235660	2235665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49234	NC_011832	T	6	6	2235679	2235684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49235	NC_011832	CTT	2	6	2235709	2235714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852696
49236	NC_011832	ATC	2	6	2235758	2235763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852696
49237	NC_011832	ATCG	2	8	2235775	2235782	25 %	25 %	25 %	25 %	219852696
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49255	NC_011832	CT	3	6	2236328	2236333	0 %	50 %	0 %	50 %	219852696
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49287	NC_011832	ATT	2	6	2237636	2237641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49314	NC_011832	GA	3	6	2239172	2239177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49315	NC_011832	TGC	2	6	2239291	2239296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852699
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49326	NC_011832	A	6	6	2239629	2239634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49327	NC_011832	A	6	6	2239636	2239641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49328	NC_011832	CGA	2	6	2239743	2239748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852700
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49349	NC_011832	GTT	2	6	2241183	2241188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49350	NC_011832	TCT	2	6	2241215	2241220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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49352	NC_011832	CT	3	6	2241281	2241286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49353	NC_011832	AGTT	2	8	2241293	2241300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49354	NC_011832	GTA	2	6	2241345	2241350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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49468	NC_011832	ATCG	2	8	2246025	2246032	25 %	25 %	25 %	25 %	219852703
49469	NC_011832	ATC	2	6	2246033	2246038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852703
49470	NC_011832	TGA	2	6	2246140	2246145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852703
49471	NC_011832	TCA	2	6	2246178	2246183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852703
49472	NC_011832	GCACT	2	10	2246198	2246207	20 %	20 %	20 %	40 %	219852703
49473	NC_011832	AGA	2	6	2246217	2246222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852703
49474	NC_011832	GA	3	6	2246235	2246240	50 %	0 %	50 %	0 %	219852703
49475	NC_011832	AAG	2	6	2246303	2246308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852703
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49479	NC_011832	T	6	6	2246492	2246497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49480	NC_011832	ATAG	2	8	2246541	2246548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49481	NC_011832	GCC	2	6	2246626	2246631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852704
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49485	NC_011832	ACG	2	6	2246878	2246883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852704
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49490	NC_011832	TC	4	8	2247127	2247134	0 %	50 %	0 %	50 %	219852704
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49492	NC_011832	ATC	2	6	2247186	2247191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852704
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49497	NC_011832	CCA	2	6	2247334	2247339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852704
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49499	NC_011832	CGT	2	6	2247362	2247367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852704
49500	NC_011832	TGA	2	6	2247413	2247418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852704

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