MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_011832	CTG	2	6	2204022	2204027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852666
48502	NC_011832	GGCCG	2	10	2204083	2204092	0 %	0 %	60 %	40 %	219852666
48503	NC_011832	TGC	2	6	2204095	2204100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852666
48504	NC_011832	GCCG	2	8	2204109	2204116	0 %	0 %	50 %	50 %	219852666
48505	NC_011832	ATC	2	6	2204197	2204202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852666
48506	NC_011832	GCC	2	6	2204209	2204214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852666
48507	NC_011832	GAG	2	6	2204239	2204244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852666
48508	NC_011832	GCACCG	2	12	2204258	2204269	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219852666
48509	NC_011832	GCC	2	6	2204280	2204285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852666
48510	NC_011832	GAT	2	6	2204301	2204306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852666
48511	NC_011832	ACC	2	6	2204320	2204325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852666
48512	NC_011832	GTG	2	6	2204353	2204358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852666
48513	NC_011832	CCA	2	6	2204447	2204452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852666
48514	NC_011832	CCTG	2	8	2204453	2204460	0 %	25 %	25 %	50 %	219852666
48515	NC_011832	CCG	2	6	2204488	2204493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852666
48516	NC_011832	GCAC	2	8	2204572	2204579	25 %	0 %	25 %	50 %	219852666
48517	NC_011832	CTG	2	6	2204581	2204586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852666
48518	NC_011832	TCT	2	6	2204666	2204671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48519	NC_011832	T	6	6	2204727	2204732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48520	NC_011832	CGC	2	6	2204825	2204830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852667
48521	NC_011832	CGG	2	6	2204888	2204893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852667
48522	NC_011832	TTC	2	6	2204934	2204939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852667
48523	NC_011832	GGA	2	6	2204967	2204972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852667
48524	NC_011832	CGG	2	6	2205125	2205130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852667
48525	NC_011832	TCC	2	6	2205175	2205180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852667
48526	NC_011832	CTG	2	6	2205182	2205187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852667
48527	NC_011832	TGA	2	6	2205226	2205231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852667
48528	NC_011832	GTC	2	6	2205249	2205254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852667
48529	NC_011832	TTCGA	2	10	2205258	2205267	20 %	40 %	20 %	20 %	219852667
48530	NC_011832	CGG	2	6	2205293	2205298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852667
48531	NC_011832	CAC	2	6	2205302	2205307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852667
48532	NC_011832	CGG	2	6	2205317	2205322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852667
48533	NC_011832	GAC	2	6	2205338	2205343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852667
48534	NC_011832	GGT	2	6	2205362	2205367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852667
48535	NC_011832	ATG	2	6	2205443	2205448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852667
48536	NC_011832	ATT	2	6	2205455	2205460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48537	NC_011832	TAT	2	6	2205480	2205485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48538	NC_011832	ATC	2	6	2205512	2205517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48539	NC_011832	AAC	2	6	2205539	2205544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48540	NC_011832	ATA	2	6	2205624	2205629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48541	NC_011832	TGCA	2	8	2205646	2205653	25 %	25 %	25 %	25 %	219852668
48542	NC_011832	GAG	2	6	2205683	2205688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852668
48543	NC_011832	AGG	2	6	2205715	2205720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852668
48544	NC_011832	CATC	2	8	2205747	2205754	25 %	25 %	0 %	50 %	219852668
48545	NC_011832	AAC	2	6	2205869	2205874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852668
48546	NC_011832	TC	3	6	2205878	2205883	0 %	50 %	0 %	50 %	219852668
48547	NC_011832	ATG	2	6	2205926	2205931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852668
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48551	NC_011832	GCA	2	6	2206051	2206056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852668
48552	NC_011832	CTA	2	6	2206144	2206149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852668
48553	NC_011832	CGA	2	6	2206168	2206173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852668
48554	NC_011832	CGT	2	6	2206192	2206197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852668
48555	NC_011832	CAG	2	6	2206202	2206207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852668
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48557	NC_011832	CGT	2	6	2206306	2206311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852668
48558	NC_011832	TC	3	6	2206323	2206328	0 %	50 %	0 %	50 %	219852668
48559	NC_011832	GTC	2	6	2206364	2206369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852668
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48564	NC_011832	CCCG	2	8	2206587	2206594	0 %	0 %	25 %	75 %	219852668
48565	NC_011832	ACG	2	6	2206598	2206603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852668
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48569	NC_011832	CGA	2	6	2206828	2206833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852668
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48572	NC_011832	GTC	2	6	2206961	2206966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852668
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48588	NC_011832	AGAA	2	8	2207918	2207925	75 %	0 %	25 %	0 %	219852668
48589	NC_011832	GCTG	2	8	2207942	2207949	0 %	25 %	50 %	25 %	219852669
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48593	NC_011832	CT	3	6	2208113	2208118	0 %	50 %	0 %	50 %	219852669
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48598	NC_011832	AAG	2	6	2208237	2208242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852669
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48601	NC_011832	CGG	2	6	2208334	2208339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852669
48602	NC_011832	GCGAT	2	10	2208373	2208382	20 %	20 %	40 %	20 %	219852669
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48606	NC_011832	TCC	2	6	2208529	2208534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852669
48607	NC_011832	C	6	6	2208539	2208544	0 %	0 %	0 %	100 %	219852669
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48616	NC_011832	CCA	2	6	2209318	2209323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852670
48617	NC_011832	ACC	2	6	2209325	2209330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852670
48618	NC_011832	GTG	2	6	2209382	2209387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852670
48619	NC_011832	ATC	2	6	2209388	2209393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852670
48620	NC_011832	GAC	2	6	2209394	2209399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852670
48621	NC_011832	CGG	2	6	2209411	2209416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852670
48622	NC_011832	CTC	2	6	2209430	2209435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852670
48623	NC_011832	GAAC	2	8	2209543	2209550	50 %	0 %	25 %	25 %	219852670
48624	NC_011832	CTG	2	6	2209573	2209578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852670
48625	NC_011832	G	6	6	2209603	2209608	0 %	0 %	100 %	0 %	219852671
48626	NC_011832	GGCCGA	2	12	2209751	2209762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219852671
48627	NC_011832	CTGC	2	8	2209814	2209821	0 %	25 %	25 %	50 %	219852671
48628	NC_011832	TC	3	6	2209841	2209846	0 %	50 %	0 %	50 %	219852671
48629	NC_011832	CTG	2	6	2209869	2209874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852671
48630	NC_011832	GA	3	6	2209878	2209883	50 %	0 %	50 %	0 %	219852671
48631	NC_011832	ACC	2	6	2209899	2209904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852671
48632	NC_011832	CCT	2	6	2209919	2209924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852671
48633	NC_011832	GCT	2	6	2209926	2209931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852671
48634	NC_011832	GGC	2	6	2210030	2210035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852671
48635	NC_011832	GGT	2	6	2210156	2210161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852671
48636	NC_011832	CCT	2	6	2210174	2210179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852671
48637	NC_011832	GGC	2	6	2210264	2210269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852671
48638	NC_011832	CCTC	2	8	2210287	2210294	0 %	25 %	0 %	75 %	219852671
48639	NC_011832	GAT	2	6	2210306	2210311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852671
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48641	NC_011832	CTG	2	6	2210343	2210348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852671
48642	NC_011832	ACG	2	6	2210398	2210403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852671
48643	NC_011832	GAC	2	6	2210475	2210480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852671
48644	NC_011832	CGA	2	6	2210489	2210494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852671
48645	NC_011832	GAA	2	6	2210509	2210514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852672
48646	NC_011832	CTC	2	6	2210606	2210611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852672
48647	NC_011832	GAT	2	6	2210698	2210703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852672
48648	NC_011832	CATCGA	2	12	2210725	2210736	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219852672
48649	NC_011832	TCA	2	6	2210796	2210801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852672
48650	NC_011832	AGA	2	6	2210880	2210885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852672
48651	NC_011832	GGT	2	6	2210932	2210937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852672
48652	NC_011832	CGA	2	6	2210997	2211002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852672
48653	NC_011832	CGT	2	6	2211010	2211015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852672
48654	NC_011832	CGC	2	6	2211016	2211021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852672
48655	NC_011832	A	7	7	2211035	2211041	100 %	0 %	0 %	0 %	219852672
48656	NC_011832	TTTCA	2	10	2211045	2211054	20 %	60 %	0 %	20 %	219852672
48657	NC_011832	AGA	2	6	2211117	2211122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852673
48658	NC_011832	CGG	2	6	2211188	2211193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852673
48659	NC_011832	TCA	2	6	2211213	2211218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852673
48660	NC_011832	TC	3	6	2211222	2211227	0 %	50 %	0 %	50 %	219852673
48661	NC_011832	GCT	2	6	2211243	2211248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852673
48662	NC_011832	GGCT	2	8	2211295	2211302	0 %	25 %	50 %	25 %	219852673
48663	NC_011832	CTG	2	6	2211397	2211402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852673
48664	NC_011832	CGC	2	6	2211420	2211425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852673
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48666	NC_011832	CTG	2	6	2211607	2211612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852673
48667	NC_011832	CATC	2	8	2211706	2211713	25 %	25 %	0 %	50 %	219852673
48668	NC_011832	CTG	3	9	2211727	2211735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852673
48669	NC_011832	TGA	2	6	2211821	2211826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852673
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48681	NC_011832	AGCC	2	8	2212300	2212307	25 %	0 %	25 %	50 %	219852674
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48684	NC_011832	GGGA	2	8	2212381	2212388	25 %	0 %	75 %	0 %	219852674
48685	NC_011832	TGG	2	6	2212454	2212459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852674
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48695	NC_011832	AGT	2	6	2212808	2212813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852674
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48702	NC_011832	G	7	7	2213192	2213198	0 %	0 %	100 %	0 %	219852674
48703	NC_011832	TCC	3	9	2213224	2213232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852674
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48705	NC_011832	G	6	6	2213310	2213315	0 %	0 %	100 %	0 %	219852674
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48708	NC_011832	TTC	2	6	2213448	2213453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48709	NC_011832	AAC	2	6	2213465	2213470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48710	NC_011832	ATA	2	6	2213494	2213499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48711	NC_011832	CAT	2	6	2213519	2213524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48714	NC_011832	GAG	2	6	2213603	2213608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852675
48715	NC_011832	AT	3	6	2213611	2213616	50 %	50 %	0 %	0 %	219852675
48716	NC_011832	CAG	2	6	2213617	2213622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852675
48717	NC_011832	GA	3	6	2213637	2213642	50 %	0 %	50 %	0 %	219852675
48718	NC_011832	AAG	2	6	2213717	2213722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852675
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48720	NC_011832	TCGA	2	8	2213837	2213844	25 %	25 %	25 %	25 %	219852675
48721	NC_011832	GAA	2	6	2213845	2213850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852675
48722	NC_011832	TCA	2	6	2213877	2213882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852675
48723	NC_011832	AG	3	6	2213957	2213962	50 %	0 %	50 %	0 %	219852675
48724	NC_011832	GGC	2	6	2213979	2213984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852675
48725	NC_011832	TGA	2	6	2214023	2214028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852675
48726	NC_011832	TGA	2	6	2214102	2214107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48727	NC_011832	A	6	6	2214145	2214150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48728	NC_011832	TGA	2	6	2214154	2214159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48729	NC_011832	A	6	6	2214198	2214203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48730	NC_011832	TGA	2	6	2214207	2214212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48731	NC_011832	GGAT	2	8	2214249	2214256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48732	NC_011832	TCCAT	2	10	2214269	2214278	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48733	NC_011832	CAG	2	6	2214279	2214284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48968	NC_011832	CGG	2	6	2223954	2223959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48969	NC_011832	GA	3	6	2223962	2223967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48970	NC_011832	TGA	2	6	2223974	2223979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48972	NC_011832	TCT	2	6	2224212	2224217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852687
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48974	NC_011832	CTG	2	6	2224340	2224345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852687
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48989	NC_011832	GTT	2	6	2225014	2225019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48994	NC_011832	ATA	2	6	2225153	2225158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48997	NC_011832	CAT	2	6	2225190	2225195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48998	NC_011832	AGAT	2	8	2225196	2225203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48999	NC_011832	GAAGA	2	10	2225209	2225218	60 %	0 %	40 %	0 %	219852688
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