MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_011832	CAA	2	6	2159379	2159384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47502	NC_011832	TCG	2	6	2159468	2159473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47503	NC_011832	ATG	2	6	2159536	2159541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852627
47504	NC_011832	GAT	2	6	2159555	2159560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852627
47505	NC_011832	ATG	4	12	2159580	2159591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852627
47506	NC_011832	CGG	2	6	2159600	2159605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852627
47507	NC_011832	A	6	6	2159645	2159650	100 %	0 %	0 %	0 %	219852627
47508	NC_011832	TGGAG	2	10	2159651	2159660	20 %	20 %	60 %	0 %	219852627
47509	NC_011832	CGG	2	6	2159685	2159690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852627
47510	NC_011832	ACC	2	6	2159710	2159715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852627
47511	NC_011832	GAA	2	6	2159757	2159762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852627
47512	NC_011832	CAA	2	6	2159819	2159824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852627
47513	NC_011832	ATCTT	2	10	2159827	2159836	20 %	60 %	0 %	20 %	219852627
47514	NC_011832	GGA	2	6	2159843	2159848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852627
47515	NC_011832	AAT	2	6	2160029	2160034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852627
47516	NC_011832	ATC	2	6	2160042	2160047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852627
47517	NC_011832	CCA	2	6	2160077	2160082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852627
47518	NC_011832	GAC	2	6	2160096	2160101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47519	NC_011832	TGA	2	6	2160143	2160148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47520	NC_011832	ACG	2	6	2160152	2160157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47521	NC_011832	A	6	6	2160238	2160243	100 %	0 %	0 %	0 %	219852628
47522	NC_011832	CAA	2	6	2160257	2160262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852628
47523	NC_011832	ATTC	2	8	2160287	2160294	25 %	50 %	0 %	25 %	219852628
47524	NC_011832	CT	3	6	2160369	2160374	0 %	50 %	0 %	50 %	219852628
47525	NC_011832	TTC	2	6	2160450	2160455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852628
47526	NC_011832	A	7	7	2160491	2160497	100 %	0 %	0 %	0 %	219852628
47527	NC_011832	ATC	2	6	2160541	2160546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852628
47528	NC_011832	GCT	2	6	2160578	2160583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852628
47529	NC_011832	A	6	6	2160610	2160615	100 %	0 %	0 %	0 %	219852628
47530	NC_011832	CTC	2	6	2160658	2160663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852628
47531	NC_011832	ATT	2	6	2160778	2160783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852628
47532	NC_011832	CTG	2	6	2160842	2160847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47533	NC_011832	AGC	2	6	2160925	2160930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47534	NC_011832	A	6	6	2160974	2160979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47535	NC_011832	CGGA	2	8	2161023	2161030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47536	NC_011832	TGG	2	6	2161098	2161103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47537	NC_011832	GGA	2	6	2161127	2161132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47538	NC_011832	CGGA	2	8	2161238	2161245	25 %	0 %	50 %	25 %	219852629
47539	NC_011832	GCC	2	6	2161267	2161272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852629
47540	NC_011832	CGA	2	6	2161302	2161307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852629
47541	NC_011832	ATCC	2	8	2161486	2161493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47542	NC_011832	CAT	2	6	2161544	2161549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47543	NC_011832	TCA	2	6	2161585	2161590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852630
47544	NC_011832	CGC	2	6	2161625	2161630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852630
47545	NC_011832	TCAT	2	8	2161671	2161678	25 %	50 %	0 %	25 %	219852630
47546	NC_011832	CTG	2	6	2161781	2161786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852630
47547	NC_011832	GAG	2	6	2161840	2161845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47548	NC_011832	GCCG	2	8	2161854	2161861	0 %	0 %	50 %	50 %	219852631
47549	NC_011832	TCT	2	6	2161878	2161883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852631
47550	NC_011832	GAG	2	6	2162020	2162025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852631
47551	NC_011832	TGG	2	6	2162102	2162107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852631
47552	NC_011832	CGA	2	6	2162186	2162191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852631
47553	NC_011832	GTG	2	6	2162209	2162214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852631
47554	NC_011832	AGG	2	6	2162246	2162251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852631
47555	NC_011832	CGG	2	6	2162253	2162258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852631
47556	NC_011832	GGGA	2	8	2162263	2162270	25 %	0 %	75 %	0 %	219852631
47557	NC_011832	CGA	2	6	2162277	2162282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852631
47558	NC_011832	AGA	2	6	2162333	2162338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852631
47559	NC_011832	CGA	2	6	2162354	2162359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852631
47560	NC_011832	TTC	2	6	2162398	2162403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852631
47561	NC_011832	CGG	2	6	2162447	2162452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852631
47562	NC_011832	TCC	2	6	2162465	2162470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852631
47563	NC_011832	GAC	2	6	2162502	2162507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852631
47564	NC_011832	GAA	2	6	2162559	2162564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852631
47565	NC_011832	ACCTGA	2	12	2162591	2162602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219852631
47566	NC_011832	GGA	2	6	2162664	2162669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852631
47567	NC_011832	AGCGC	2	10	2162790	2162799	20 %	0 %	40 %	40 %	219852631
47568	NC_011832	AGG	2	6	2162807	2162812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852631
47569	NC_011832	CGAG	2	8	2162813	2162820	25 %	0 %	50 %	25 %	219852631
47570	NC_011832	CGA	2	6	2162847	2162852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852631
47571	NC_011832	TC	3	6	2162862	2162867	0 %	50 %	0 %	50 %	219852631
47572	NC_011832	AAG	2	6	2162869	2162874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852631
47573	NC_011832	AGG	2	6	2162876	2162881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852631
47574	NC_011832	TCGGAG	2	12	2162958	2162969	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219852632
47575	NC_011832	CCG	2	6	2163006	2163011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852632
47576	NC_011832	GTC	2	6	2163049	2163054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852632
47577	NC_011832	GGTT	2	8	2163138	2163145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47578	NC_011832	GTGA	2	8	2163153	2163160	25 %	25 %	50 %	0 %	219852633
47579	NC_011832	TCG	2	6	2163272	2163277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852633
47580	NC_011832	GCA	2	6	2163297	2163302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852633
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47583	NC_011832	TCC	2	6	2163403	2163408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852633
47584	NC_011832	GAG	2	6	2163456	2163461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852633
47585	NC_011832	GGA	2	6	2163486	2163491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852633
47586	NC_011832	GAG	2	6	2163517	2163522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852633
47587	NC_011832	ACG	2	6	2163539	2163544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852633
47588	NC_011832	TGT	2	6	2163561	2163566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852633
47589	NC_011832	TC	3	6	2163651	2163656	0 %	50 %	0 %	50 %	219852633
47590	NC_011832	TCT	2	6	2163731	2163736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852633
47591	NC_011832	TAC	2	6	2163766	2163771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852633
47592	NC_011832	CGA	2	6	2163893	2163898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852633
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47596	NC_011832	ACTT	2	8	2164211	2164218	25 %	50 %	0 %	25 %	219852633
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47599	NC_011832	TTCT	2	8	2164342	2164349	0 %	75 %	0 %	25 %	219852633
47600	NC_011832	GCA	2	6	2164453	2164458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852633
47601	NC_011832	A	6	6	2164473	2164478	100 %	0 %	0 %	0 %	219852633
47602	NC_011832	A	6	6	2164520	2164525	100 %	0 %	0 %	0 %	219852634
47603	NC_011832	TCT	2	6	2164537	2164542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852634
47604	NC_011832	CCT	2	6	2164569	2164574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852634
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47606	NC_011832	CGC	2	6	2164677	2164682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852634
47607	NC_011832	AT	3	6	2164785	2164790	50 %	50 %	0 %	0 %	219852634
47608	NC_011832	ATA	2	6	2164928	2164933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852634
47609	NC_011832	GA	3	6	2164984	2164989	50 %	0 %	50 %	0 %	219852634
47610	NC_011832	GTA	2	6	2164999	2165004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852634
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47612	NC_011832	GAT	2	6	2165105	2165110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852635
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47615	NC_011832	GCCA	2	8	2165176	2165183	25 %	0 %	25 %	50 %	219852635
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47617	NC_011832	CGC	2	6	2165279	2165284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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47733	NC_011832	CAAA	2	8	2170947	2170954	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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47741	NC_011832	CTGT	2	8	2171216	2171223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47742	NC_011832	TACA	2	8	2171237	2171244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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47971	NC_011832	CCA	2	6	2180191	2180196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852654
47972	NC_011832	ATC	2	6	2180228	2180233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852654
47973	NC_011832	GCCACG	2	12	2180360	2180371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219852654
47974	NC_011832	GCC	2	6	2180375	2180380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852654
47975	NC_011832	TCG	2	6	2180397	2180402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852654
47976	NC_011832	GTCGAA	2	12	2180416	2180427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219852654
47977	NC_011832	AGT	2	6	2180499	2180504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852654
47978	NC_011832	GCTC	2	8	2180514	2180521	0 %	25 %	25 %	50 %	219852654
47979	NC_011832	AT	3	6	2180528	2180533	50 %	50 %	0 %	0 %	219852654
47980	NC_011832	CTT	2	6	2180536	2180541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852654
47981	NC_011832	GGT	2	6	2180617	2180622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852654
47982	NC_011832	CCG	2	6	2180632	2180637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852654
47983	NC_011832	TCG	2	6	2180640	2180645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852654
47984	NC_011832	TCT	2	6	2180652	2180657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852654
47985	NC_011832	CCG	2	6	2180689	2180694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852654
47986	NC_011832	CTC	2	6	2180698	2180703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852654
47987	NC_011832	TTC	2	6	2180717	2180722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852654
47988	NC_011832	ACATT	2	10	2180790	2180799	40 %	40 %	0 %	20 %	219852654
47989	NC_011832	CG	3	6	2180822	2180827	0 %	0 %	50 %	50 %	219852654
47990	NC_011832	CGG	2	6	2180887	2180892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852654
47991	NC_011832	GAT	2	6	2180902	2180907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852654
47992	NC_011832	TCA	2	6	2180948	2180953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852654
47993	NC_011832	CGT	2	6	2180991	2180996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852654
47994	NC_011832	TGTT	2	8	2181037	2181044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47995	NC_011832	TCT	2	6	2181099	2181104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47996	NC_011832	CT	3	6	2181103	2181108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47997	NC_011832	TCCT	2	8	2181109	2181116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47998	NC_011832	CGA	2	6	2181123	2181128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47999	NC_011832	CTG	2	6	2181258	2181263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852655
48000	NC_011832	ATC	2	6	2181324	2181329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852655

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