MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46501	NC_011832	A	6	6	2112450	2112455	100 %	0 %	0 %	0 %	219852580
46502	NC_011832	GGAAT	2	10	2112477	2112486	40 %	20 %	40 %	0 %	219852580
46503	NC_011832	ATT	2	6	2112512	2112517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46504	NC_011832	T	6	6	2112533	2112538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46505	NC_011832	GAA	2	6	2112567	2112572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46506	NC_011832	GA	3	6	2112583	2112588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46507	NC_011832	A	6	6	2112628	2112633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46508	NC_011832	AGGT	2	8	2112651	2112658	25 %	25 %	50 %	0 %	219852581
46509	NC_011832	CAG	2	6	2112665	2112670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852581
46510	NC_011832	CCTT	2	8	2112724	2112731	0 %	50 %	0 %	50 %	219852581
46511	NC_011832	CAG	2	6	2112842	2112847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852581
46512	NC_011832	TCA	2	6	2112874	2112879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852581
46513	NC_011832	CGG	2	6	2112886	2112891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852581
46514	NC_011832	GAT	2	6	2112896	2112901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852581
46515	NC_011832	TC	3	6	2112907	2112912	0 %	50 %	0 %	50 %	219852581
46516	NC_011832	ACC	2	6	2112936	2112941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852581
46517	NC_011832	CCA	2	6	2112994	2112999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852581
46518	NC_011832	GCA	2	6	2113000	2113005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852581
46519	NC_011832	GTC	2	6	2113010	2113015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852581
46520	NC_011832	GCCGAC	2	12	2113085	2113096	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219852581
46521	NC_011832	CAG	2	6	2113100	2113105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852581
46522	NC_011832	AG	3	6	2113104	2113109	50 %	0 %	50 %	0 %	219852581
46523	NC_011832	CAG	2	6	2113199	2113204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852581
46524	NC_011832	CGC	2	6	2113209	2113214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852581
46525	NC_011832	G	7	7	2113219	2113225	0 %	0 %	100 %	0 %	219852581
46526	NC_011832	TCA	2	6	2113247	2113252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46527	NC_011832	AGG	2	6	2113257	2113262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46528	NC_011832	GGATAT	2	12	2113412	2113423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852582
46529	NC_011832	TTC	2	6	2113429	2113434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852582
46530	NC_011832	GAG	2	6	2113437	2113442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852582
46531	NC_011832	CGA	2	6	2113454	2113459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852582
46532	NC_011832	ATC	2	6	2113464	2113469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852582
46533	NC_011832	GCA	2	6	2113487	2113492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852582
46534	NC_011832	AGG	2	6	2113528	2113533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852582
46535	NC_011832	CGG	2	6	2113554	2113559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852582
46536	NC_011832	GAG	2	6	2113596	2113601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852582
46537	NC_011832	GATC	2	8	2113604	2113611	25 %	25 %	25 %	25 %	219852582
46538	NC_011832	GAG	2	6	2113656	2113661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852582
46539	NC_011832	GAC	2	6	2113725	2113730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46540	NC_011832	GAT	2	6	2113776	2113781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852583
46541	NC_011832	TCG	2	6	2113822	2113827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46542	NC_011832	GCT	2	6	2113913	2113918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46543	NC_011832	ACG	2	6	2113923	2113928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46544	NC_011832	CGC	3	9	2113973	2113981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852583
46545	NC_011832	CCT	2	6	2113994	2113999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852583
46546	NC_011832	CGCC	2	8	2114022	2114029	0 %	0 %	25 %	75 %	219852583
46547	NC_011832	CTC	2	6	2114034	2114039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852583
46548	NC_011832	GCCG	2	8	2114112	2114119	0 %	0 %	50 %	50 %	219852583
46549	NC_011832	CAC	2	6	2114190	2114195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852583
46550	NC_011832	GGA	2	6	2114231	2114236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852583
46551	NC_011832	C	6	6	2114242	2114247	0 %	0 %	0 %	100 %	219852583
46552	NC_011832	CGG	2	6	2114252	2114257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852583
46553	NC_011832	ATC	2	6	2114278	2114283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852583
46554	NC_011832	GGAGAG	2	12	2114370	2114381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852583
46555	NC_011832	GA	3	6	2114396	2114401	50 %	0 %	50 %	0 %	219852583
46556	NC_011832	GTC	2	6	2114424	2114429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46557	NC_011832	CTTC	2	8	2114453	2114460	0 %	50 %	0 %	50 %	219852583
46558	NC_011832	AG	3	6	2114469	2114474	50 %	0 %	50 %	0 %	219852583
46559	NC_011832	TGA	2	6	2114582	2114587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852583
46560	NC_011832	ATC	2	6	2114650	2114655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852583
46561	NC_011832	AGG	2	6	2114657	2114662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852583
46562	NC_011832	CTC	2	6	2114703	2114708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852583
46563	NC_011832	GAA	2	6	2114724	2114729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852583
46564	NC_011832	CGT	2	6	2114747	2114752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46565	NC_011832	TGC	2	6	2114761	2114766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46566	NC_011832	AGC	2	6	2114839	2114844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46567	NC_011832	TCC	2	6	2114876	2114881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852583
46568	NC_011832	CGA	2	6	2115038	2115043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852583
46569	NC_011832	CCG	2	6	2115062	2115067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852583
46570	NC_011832	CTT	2	6	2115144	2115149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852583
46571	NC_011832	AG	3	6	2115150	2115155	50 %	0 %	50 %	0 %	219852583
46572	NC_011832	CAT	2	6	2115171	2115176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852583
46573	NC_011832	TCTT	2	8	2115188	2115195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46574	NC_011832	ATCTGC	2	12	2115202	2115213	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46575	NC_011832	AGA	2	6	2115214	2115219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46576	NC_011832	GATC	2	8	2115274	2115281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46577	NC_011832	GAA	2	6	2115306	2115311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46578	NC_011832	GCA	2	6	2115330	2115335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46579	NC_011832	CAC	2	6	2115338	2115343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46580	NC_011832	A	7	7	2115344	2115350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46581	NC_011832	TTC	2	6	2115411	2115416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852584
46582	NC_011832	ACC	2	6	2115482	2115487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852584
46583	NC_011832	GCT	2	6	2115610	2115615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852584
46584	NC_011832	CCT	2	6	2115628	2115633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852584
46585	NC_011832	CATT	2	8	2115682	2115689	25 %	50 %	0 %	25 %	219852584
46586	NC_011832	TA	3	6	2115712	2115717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46587	NC_011832	TTG	2	6	2115719	2115724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46588	NC_011832	G	6	6	2115782	2115787	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46589	NC_011832	A	6	6	2115839	2115844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46590	NC_011832	CAT	2	6	2115974	2115979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46591	NC_011832	C	6	6	2115984	2115989	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46592	NC_011832	TGA	2	6	2116045	2116050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852585
46593	NC_011832	TCA	2	6	2116062	2116067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852585
46594	NC_011832	CGC	2	6	2116223	2116228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852585
46595	NC_011832	TGA	2	6	2116249	2116254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852585
46596	NC_011832	CTC	2	6	2116263	2116268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852585
46597	NC_011832	GGT	2	6	2116295	2116300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852585
46598	NC_011832	GCT	2	6	2116301	2116306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852585
46599	NC_011832	CCT	2	6	2116361	2116366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852585
46600	NC_011832	ACC	2	6	2116387	2116392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852585
46601	NC_011832	GAG	2	6	2116401	2116406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852585
46602	NC_011832	TCG	2	6	2116420	2116425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852585
46603	NC_011832	CGG	2	6	2116433	2116438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852585
46604	NC_011832	TGC	2	6	2116439	2116444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852585
46605	NC_011832	GGCT	2	8	2116483	2116490	0 %	25 %	50 %	25 %	219852585
46606	NC_011832	GGC	2	6	2116536	2116541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852585
46607	NC_011832	CTG	2	6	2116572	2116577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852585
46608	NC_011832	ATC	3	9	2116608	2116616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852585
46609	NC_011832	GACCC	2	10	2116632	2116641	20 %	0 %	20 %	60 %	219852585
46610	NC_011832	CGAG	2	8	2116726	2116733	25 %	0 %	50 %	25 %	219852585
46611	NC_011832	CTCCCT	2	12	2116736	2116747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852585
46612	NC_011832	CTG	2	6	2116860	2116865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852585
46613	NC_011832	CAT	3	9	2116895	2116903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852585
46614	NC_011832	CTG	2	6	2116932	2116937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852585
46615	NC_011832	CGA	2	6	2117045	2117050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852585
46616	NC_011832	CAC	2	6	2117105	2117110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852585
46617	NC_011832	GAC	2	6	2117129	2117134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852585
46618	NC_011832	GCC	2	6	2117165	2117170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852585
46619	NC_011832	GAA	2	6	2117239	2117244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852585
46620	NC_011832	TGGTC	2	10	2117279	2117288	0 %	40 %	40 %	20 %	219852585
46621	NC_011832	ACCT	2	8	2117295	2117302	25 %	25 %	0 %	50 %	219852585
46622	NC_011832	CGGCAG	2	12	2117323	2117334	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219852585
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46625	NC_011832	GGT	2	6	2117539	2117544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46626	NC_011832	CTGCA	2	10	2117601	2117610	20 %	20 %	20 %	40 %	219852586
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46633	NC_011832	GGA	2	6	2117959	2117964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852586
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46681	NC_011832	GATC	2	8	2120141	2120148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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46731	NC_011832	GA	3	6	2122513	2122518	50 %	0 %	50 %	0 %	219852590
46732	NC_011832	AGC	2	6	2122539	2122544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852590
46733	NC_011832	CTC	2	6	2122558	2122563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852590
46734	NC_011832	TAA	2	6	2122578	2122583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852590
46735	NC_011832	GGC	2	6	2122605	2122610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852590
46736	NC_011832	ACC	2	6	2122654	2122659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852590
46737	NC_011832	GAC	2	6	2122719	2122724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852590
46738	NC_011832	GCA	2	6	2122751	2122756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852590
46739	NC_011832	CCA	2	6	2122757	2122762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852590
46740	NC_011832	GGGAT	2	10	2122781	2122790	20 %	20 %	60 %	0 %	219852590
46741	NC_011832	GAG	3	9	2122842	2122850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852590
46742	NC_011832	ACC	2	6	2122912	2122917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852590
46743	NC_011832	CGC	2	6	2122926	2122931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852590
46744	NC_011832	CAG	2	6	2122932	2122937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852590
46745	NC_011832	TCC	2	6	2122964	2122969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852590
46746	NC_011832	GAA	2	6	2122971	2122976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852590
46747	NC_011832	CCT	2	6	2123003	2123008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852590
46748	NC_011832	ATAG	2	8	2123055	2123062	50 %	25 %	25 %	0 %	219852590
46749	NC_011832	GCT	2	6	2123078	2123083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852590
46750	NC_011832	AGA	3	9	2123126	2123134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852590
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46752	NC_011832	TCG	2	6	2123195	2123200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852590
46753	NC_011832	TGA	2	6	2123201	2123206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852590
46754	NC_011832	AGG	2	6	2123230	2123235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852590
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46756	NC_011832	TCC	2	6	2123281	2123286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852590
46757	NC_011832	GGA	2	6	2123300	2123305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852590
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46763	NC_011832	TCAGGA	2	12	2123510	2123521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219852590
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46765	NC_011832	GAT	2	6	2123664	2123669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852591
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46770	NC_011832	TCA	2	6	2123825	2123830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852591
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46780	NC_011832	AAT	2	6	2124171	2124176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852591
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46782	NC_011832	GCA	2	6	2124283	2124288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852591
46783	NC_011832	GCT	2	6	2124320	2124325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852591
46784	NC_011832	TAG	2	6	2124337	2124342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852591
46785	NC_011832	ACA	2	6	2124541	2124546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852591
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46788	NC_011832	ATC	2	6	2124716	2124721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46789	NC_011832	GA	3	6	2124800	2124805	50 %	0 %	50 %	0 %	219852592
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46792	NC_011832	CT	3	6	2124873	2124878	0 %	50 %	0 %	50 %	219852592
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46796	NC_011832	AAT	2	6	2125017	2125022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852592
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46801	NC_011832	TCT	2	6	2125247	2125252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852592
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46804	NC_011832	CCCA	2	8	2125312	2125319	25 %	0 %	0 %	75 %	219852592
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46818	NC_011832	GGTAG	2	10	2125872	2125881	20 %	20 %	60 %	0 %	219852592
46819	NC_011832	TCCGA	2	10	2125917	2125926	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46820	NC_011832	GCA	2	6	2125985	2125990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46822	NC_011832	TGG	2	6	2126018	2126023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46824	NC_011832	TCTCAT	2	12	2126084	2126095	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46825	NC_011832	TTTGA	2	10	2126189	2126198	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46826	NC_011832	TGA	2	6	2126210	2126215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46827	NC_011832	ATT	2	6	2126270	2126275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46828	NC_011832	GGC	2	6	2126431	2126436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852593
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46830	NC_011832	TCT	2	6	2126518	2126523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852593
46831	NC_011832	GAT	2	6	2126666	2126671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852593
46832	NC_011832	CGA	2	6	2126728	2126733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852593
46833	NC_011832	CCGCT	2	10	2126757	2126766	0 %	20 %	20 %	60 %	219852593
46834	NC_011832	GAG	3	9	2126880	2126888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852593
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46836	NC_011832	C	6	6	2127071	2127076	0 %	0 %	0 %	100 %	219852593
46837	NC_011832	TGC	2	6	2127112	2127117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852593
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46840	NC_011832	CGA	2	6	2127283	2127288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852593
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46842	NC_011832	TGA	2	6	2127353	2127358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852594
46843	NC_011832	GTG	2	6	2127373	2127378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852594
46844	NC_011832	TCA	3	9	2127407	2127415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852594
46845	NC_011832	AGAA	2	8	2127490	2127497	75 %	0 %	25 %	0 %	219852594
46846	NC_011832	ATC	2	6	2127502	2127507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852594
46847	NC_011832	GAG	2	6	2127517	2127522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852594
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46849	NC_011832	CTT	2	6	2127686	2127691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46850	NC_011832	GGA	2	6	2127698	2127703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46852	NC_011832	GGA	2	6	2127753	2127758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46970	NC_011832	GGA	2	6	2133698	2133703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852600
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46993	NC_011832	CGC	2	6	2134751	2134756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852602
46994	NC_011832	CGA	2	6	2134835	2134840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852602
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