MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_011832	GCAG	2	8	2089954	2089961	25 %	0 %	50 %	25 %	219852563
46002	NC_011832	ATC	2	6	2089979	2089984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
46003	NC_011832	TGA	2	6	2090052	2090057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852563
46004	NC_011832	TCC	2	6	2090076	2090081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852563
46005	NC_011832	TGT	2	6	2090230	2090235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852563
46006	NC_011832	AGG	2	6	2090272	2090277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852563
46007	NC_011832	ATC	2	6	2090297	2090302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
46008	NC_011832	GAAGA	2	10	2090321	2090330	60 %	0 %	40 %	0 %	219852563
46009	NC_011832	CAA	3	9	2090470	2090478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852563
46010	NC_011832	GAG	2	6	2090588	2090593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852563
46011	NC_011832	ATC	2	6	2090624	2090629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
46012	NC_011832	CCG	2	6	2090631	2090636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852563
46013	NC_011832	ATC	2	6	2090714	2090719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
46014	NC_011832	CCCGC	2	10	2090746	2090755	0 %	0 %	20 %	80 %	219852563
46015	NC_011832	ACC	2	6	2090765	2090770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852563
46016	NC_011832	TC	3	6	2090811	2090816	0 %	50 %	0 %	50 %	219852563
46017	NC_011832	CAT	2	6	2090827	2090832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
46018	NC_011832	GAG	2	6	2090978	2090983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852563
46019	NC_011832	GGT	2	6	2091010	2091015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852563
46020	NC_011832	GGT	2	6	2091040	2091045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852563
46021	NC_011832	CCT	2	6	2091087	2091092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852563
46022	NC_011832	GCTC	2	8	2091102	2091109	0 %	25 %	25 %	50 %	219852563
46023	NC_011832	CAGG	2	8	2091142	2091149	25 %	0 %	50 %	25 %	219852563
46024	NC_011832	AGG	2	6	2091259	2091264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852563
46025	NC_011832	TC	3	6	2091274	2091279	0 %	50 %	0 %	50 %	219852563
46026	NC_011832	CCGA	2	8	2091323	2091330	25 %	0 %	25 %	50 %	219852563
46027	NC_011832	CGA	2	6	2091337	2091342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852563
46028	NC_011832	ATC	2	6	2091557	2091562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852563
46029	NC_011832	GAT	2	6	2091589	2091594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852563
46030	NC_011832	TTCG	2	8	2091631	2091638	0 %	50 %	25 %	25 %	219852563
46031	NC_011832	CAT	2	6	2091795	2091800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46032	NC_011832	ATA	2	6	2091818	2091823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46033	NC_011832	TCA	2	6	2091855	2091860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46034	NC_011832	TGC	2	6	2091894	2091899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46035	NC_011832	TTC	2	6	2091958	2091963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852564
46036	NC_011832	CAT	2	6	2091981	2091986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46037	NC_011832	ACC	2	6	2092057	2092062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46038	NC_011832	GACCT	2	10	2092063	2092072	20 %	20 %	20 %	40 %	219852564
46039	NC_011832	CCT	2	6	2092097	2092102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852564
46040	NC_011832	GTG	2	6	2092108	2092113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852564
46041	NC_011832	GGA	2	6	2092189	2092194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852564
46042	NC_011832	CTC	2	6	2092195	2092200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852564
46043	NC_011832	GTC	2	6	2092210	2092215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46044	NC_011832	ACC	2	6	2092235	2092240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46045	NC_011832	ATA	2	6	2092421	2092426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852564
46046	NC_011832	CAA	3	9	2092488	2092496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
46047	NC_011832	CAA	2	6	2092500	2092505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
46048	NC_011832	CAT	2	6	2092578	2092583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46049	NC_011832	CGG	2	6	2092584	2092589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852564
46050	NC_011832	G	7	7	2092598	2092604	0 %	0 %	100 %	0 %	219852564
46051	NC_011832	AGA	2	6	2092643	2092648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852564
46052	NC_011832	CGG	2	6	2092649	2092654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852564
46053	NC_011832	CAA	2	6	2092701	2092706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
46054	NC_011832	CCT	2	6	2092727	2092732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852564
46055	NC_011832	ACC	2	6	2092753	2092758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46056	NC_011832	CCA	2	6	2092772	2092777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46057	NC_011832	CCA	2	6	2092808	2092813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46058	NC_011832	GAC	2	6	2092824	2092829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46059	NC_011832	ACCG	2	8	2092842	2092849	25 %	0 %	25 %	50 %	219852564
46060	NC_011832	CGTC	2	8	2092937	2092944	0 %	25 %	25 %	50 %	219852564
46061	NC_011832	TGC	2	6	2092953	2092958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46062	NC_011832	GATCAC	2	12	2092959	2092970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219852564
46063	NC_011832	GGA	2	6	2093023	2093028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852564
46064	NC_011832	GCA	2	6	2093171	2093176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46065	NC_011832	CGC	2	6	2093196	2093201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852564
46066	NC_011832	CAA	2	6	2093223	2093228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
46067	NC_011832	CAA	2	6	2093235	2093240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
46068	NC_011832	CAG	2	6	2093303	2093308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46069	NC_011832	CAT	2	6	2093316	2093321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46070	NC_011832	GGC	2	6	2093338	2093343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852564
46071	NC_011832	G	6	6	2093351	2093356	0 %	0 %	100 %	0 %	219852564
46072	NC_011832	CCT	2	6	2093420	2093425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852564
46073	NC_011832	AGAT	2	8	2093429	2093436	50 %	25 %	25 %	0 %	219852564
46074	NC_011832	ACCCCG	2	12	2093491	2093502	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	219852564
46075	NC_011832	GAC	2	6	2093505	2093510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46076	NC_011832	GAC	2	6	2093514	2093519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46077	NC_011832	ACC	2	6	2093524	2093529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46078	NC_011832	GTGCCG	2	12	2093551	2093562	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219852564
46079	NC_011832	GAC	2	6	2093577	2093582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46080	NC_011832	CAC	2	6	2093586	2093591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46081	NC_011832	ACCG	2	8	2093604	2093611	25 %	0 %	25 %	50 %	219852564
46082	NC_011832	ACC	2	6	2093632	2093637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46083	NC_011832	CAT	2	6	2093658	2093663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46084	NC_011832	CAC	2	6	2093664	2093669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46085	NC_011832	TAC	3	9	2093670	2093678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46086	NC_011832	CAC	2	6	2093679	2093684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46087	NC_011832	TCA	2	6	2093705	2093710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46088	NC_011832	CAA	2	6	2093748	2093753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
46089	NC_011832	TAC	2	6	2093796	2093801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46090	NC_011832	CACCTT	2	12	2093823	2093834	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	219852564
46091	NC_011832	ATG	2	6	2093942	2093947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852564
46092	NC_011832	CT	3	6	2093958	2093963	0 %	50 %	0 %	50 %	219852564
46093	NC_011832	C	6	6	2093997	2094002	0 %	0 %	0 %	100 %	219852564
46094	NC_011832	CGA	2	6	2094065	2094070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46095	NC_011832	CCG	4	12	2094082	2094093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852564
46096	NC_011832	GACCG	2	10	2094111	2094120	20 %	0 %	40 %	40 %	219852564
46097	NC_011832	TCA	2	6	2094125	2094130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46098	NC_011832	CTA	2	6	2094141	2094146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46099	NC_011832	CTG	2	6	2094148	2094153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46100	NC_011832	CGA	2	6	2094174	2094179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46101	NC_011832	GGT	2	6	2094180	2094185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852564
46102	NC_011832	TCA	2	6	2094311	2094316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46103	NC_011832	CCG	2	6	2094329	2094334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852564
46104	NC_011832	ACG	2	6	2094368	2094373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852564
46105	NC_011832	ACC	2	6	2094394	2094399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852564
46106	NC_011832	CAT	2	6	2094414	2094419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852564
46107	NC_011832	AGGG	2	8	2094476	2094483	25 %	0 %	75 %	0 %	219852564
46108	NC_011832	CTC	2	6	2094490	2094495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852564
46109	NC_011832	AGA	2	6	2094572	2094577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852564
46110	NC_011832	CAA	2	6	2094606	2094611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
46111	NC_011832	CAA	2	6	2094642	2094647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
46112	NC_011832	CAA	2	6	2094657	2094662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
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46114	NC_011832	AAC	2	6	2094712	2094717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852564
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46116	NC_011832	CTCG	2	8	2094732	2094739	0 %	25 %	25 %	50 %	219852564
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46228	NC_011832	TCGA	2	8	2099121	2099128	25 %	25 %	25 %	25 %	219852566
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46230	NC_011832	CAC	2	6	2099261	2099266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852566
46231	NC_011832	ATC	2	6	2099276	2099281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852566
46232	NC_011832	GGTC	2	8	2099289	2099296	0 %	25 %	50 %	25 %	219852566
46233	NC_011832	TCG	2	6	2099304	2099309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852566
46234	NC_011832	CGG	2	6	2099365	2099370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852566
46235	NC_011832	GGT	2	6	2099406	2099411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852566
46236	NC_011832	TC	3	6	2099455	2099460	0 %	50 %	0 %	50 %	219852566
46237	NC_011832	CCA	2	6	2099473	2099478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852566
46238	NC_011832	GCA	2	6	2099479	2099484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852566
46239	NC_011832	TCA	2	6	2099535	2099540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852566
46240	NC_011832	TCG	2	6	2099646	2099651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852566
46241	NC_011832	AG	3	6	2099729	2099734	50 %	0 %	50 %	0 %	219852566
46242	NC_011832	AT	3	6	2099818	2099823	50 %	50 %	0 %	0 %	219852566
46243	NC_011832	CAC	2	6	2099831	2099836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852566
46244	NC_011832	AG	3	6	2100038	2100043	50 %	0 %	50 %	0 %	219852566
46245	NC_011832	ATC	2	6	2100081	2100086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852566
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46247	NC_011832	ATC	2	6	2100133	2100138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852567
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46252	NC_011832	GCCG	2	8	2100518	2100525	0 %	0 %	50 %	50 %	219852567
46253	NC_011832	CCT	2	6	2100560	2100565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852567
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46255	NC_011832	CCGA	2	8	2100610	2100617	25 %	0 %	25 %	50 %	219852567
46256	NC_011832	ACC	2	6	2100670	2100675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852567
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46259	NC_011832	TGA	2	6	2100863	2100868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852567
46260	NC_011832	CAT	2	6	2100903	2100908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852567
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46262	NC_011832	AGG	2	6	2100940	2100945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852567
46263	NC_011832	C	6	6	2100953	2100958	0 %	0 %	0 %	100 %	219852567
46264	NC_011832	TTC	2	6	2100982	2100987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852567
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46304	NC_011832	CTCAC	2	10	2102895	2102904	20 %	20 %	0 %	60 %	219852570
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46309	NC_011832	AAG	2	6	2103181	2103186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46310	NC_011832	TTC	2	6	2103201	2103206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46311	NC_011832	GAG	2	6	2103258	2103263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852571
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46313	NC_011832	GAG	2	6	2103297	2103302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852571
46314	NC_011832	TCC	2	6	2103423	2103428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852571
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46318	NC_011832	TCGG	2	8	2103564	2103571	0 %	25 %	50 %	25 %	219852571
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46331	NC_011832	GCCG	2	8	2104415	2104422	0 %	0 %	50 %	50 %	219852571
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46333	NC_011832	ACT	2	6	2104450	2104455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852571
46334	NC_011832	TCG	2	6	2104468	2104473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852571
46335	NC_011832	T	7	7	2104497	2104503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46336	NC_011832	GAT	2	6	2104547	2104552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46337	NC_011832	ATC	2	6	2104605	2104610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46338	NC_011832	AGGTG	2	10	2104617	2104626	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46339	NC_011832	ACACC	2	10	2104628	2104637	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
46340	NC_011832	GATC	2	8	2104722	2104729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46341	NC_011832	GTT	2	6	2104753	2104758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46342	NC_011832	CAT	2	6	2104807	2104812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46343	NC_011832	A	8	8	2104856	2104863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46344	NC_011832	GTCG	2	8	2104915	2104922	0 %	25 %	50 %	25 %	219852572
46345	NC_011832	GGCC	2	8	2104947	2104954	0 %	0 %	50 %	50 %	219852572
46346	NC_011832	GAG	2	6	2105078	2105083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852572
46347	NC_011832	CAT	2	6	2105100	2105105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852572
46348	NC_011832	CGT	2	6	2105208	2105213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852572
46349	NC_011832	CCG	2	6	2105273	2105278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852572
46350	NC_011832	GGT	2	6	2105413	2105418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852572
46351	NC_011832	GGT	2	6	2105461	2105466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852572
46352	NC_011832	TGG	2	6	2105508	2105513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852572
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46381	NC_011832	T	8	8	2107401	2107408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46388	NC_011832	A	6	6	2107671	2107676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46468	NC_011832	CCA	2	6	2111020	2111025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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46471	NC_011832	TGCAC	2	10	2111108	2111117	20 %	20 %	20 %	40 %	219852577
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46499	NC_011832	AT	3	6	2112341	2112346	50 %	50 %	0 %	0 %	219852580
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