MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_011832	CAT	2	6	2067079	2067084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852547
45502	NC_011832	G	6	6	2067111	2067116	0 %	0 %	100 %	0 %	219852547
45503	NC_011832	ACC	2	6	2067129	2067134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852547
45504	NC_011832	T	8	8	2067237	2067244	0 %	100 %	0 %	0 %	219852547
45505	NC_011832	TCC	2	6	2067273	2067278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852547
45506	NC_011832	GGCA	2	8	2067301	2067308	25 %	0 %	50 %	25 %	219852547
45507	NC_011832	GCT	2	6	2067351	2067356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852547
45508	NC_011832	AGG	2	6	2067384	2067389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45509	NC_011832	TAA	2	6	2067397	2067402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45510	NC_011832	AGT	2	6	2067448	2067453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45511	NC_011832	TCG	2	6	2067664	2067669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852548
45512	NC_011832	TCT	2	6	2067778	2067783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852548
45513	NC_011832	CTC	2	6	2067791	2067796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852548
45514	NC_011832	GTC	2	6	2067822	2067827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852549
45515	NC_011832	TTC	2	6	2067969	2067974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852549
45516	NC_011832	CCT	2	6	2068016	2068021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852549
45517	NC_011832	GAT	2	6	2068067	2068072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852549
45518	NC_011832	CTC	2	6	2068085	2068090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852549
45519	NC_011832	CGA	2	6	2068114	2068119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852549
45520	NC_011832	GGTCA	2	10	2068139	2068148	20 %	20 %	40 %	20 %	219852549
45521	NC_011832	GGC	2	6	2068151	2068156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852549
45522	NC_011832	ATG	2	6	2068161	2068166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852549
45523	NC_011832	CCA	2	6	2068174	2068179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852549
45524	NC_011832	ACC	2	6	2068188	2068193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852549
45525	NC_011832	AGGATC	2	12	2068200	2068211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219852549
45526	NC_011832	GATCAG	2	12	2068223	2068234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219852549
45527	NC_011832	GCATC	2	10	2068279	2068288	20 %	20 %	20 %	40 %	219852549
45528	NC_011832	TCA	2	6	2068327	2068332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852549
45529	NC_011832	CAG	2	6	2068406	2068411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852549
45530	NC_011832	TGA	2	6	2068435	2068440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852549
45531	NC_011832	GAT	2	6	2068451	2068456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852549
45532	NC_011832	CGA	2	6	2068468	2068473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852549
45533	NC_011832	GA	3	6	2068500	2068505	50 %	0 %	50 %	0 %	219852549
45534	NC_011832	TGG	2	6	2068530	2068535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852549
45535	NC_011832	AAG	2	6	2068572	2068577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852549
45536	NC_011832	CCA	2	6	2068591	2068596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852549
45537	NC_011832	GATC	2	8	2068597	2068604	25 %	25 %	25 %	25 %	219852549
45538	NC_011832	TGATA	2	10	2068622	2068631	40 %	40 %	20 %	0 %	219852549
45539	NC_011832	ACCGA	2	10	2068635	2068644	40 %	0 %	20 %	40 %	219852549
45540	NC_011832	CGA	3	9	2068654	2068662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852549
45541	NC_011832	TCA	2	6	2068666	2068671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852549
45542	NC_011832	TC	3	6	2068720	2068725	0 %	50 %	0 %	50 %	219852549
45543	NC_011832	GA	3	6	2068749	2068754	50 %	0 %	50 %	0 %	219852549
45544	NC_011832	AGA	2	6	2068781	2068786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45545	NC_011832	GAA	2	6	2068798	2068803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45546	NC_011832	CCAT	2	8	2068833	2068840	25 %	25 %	0 %	50 %	219852550
45547	NC_011832	ACC	2	6	2068848	2068853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852550
45548	NC_011832	C	6	6	2068909	2068914	0 %	0 %	0 %	100 %	219852550
45549	NC_011832	GAA	2	6	2069091	2069096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852550
45550	NC_011832	CTT	2	6	2069120	2069125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852550
45551	NC_011832	GAT	2	6	2069150	2069155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852550
45552	NC_011832	CTG	2	6	2069165	2069170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852550
45553	NC_011832	ACGA	2	8	2069238	2069245	50 %	0 %	25 %	25 %	219852550
45554	NC_011832	AGC	2	6	2069264	2069269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852550
45555	NC_011832	TCC	2	6	2069283	2069288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852550
45556	NC_011832	AG	3	6	2069335	2069340	50 %	0 %	50 %	0 %	219852550
45557	NC_011832	ATGG	2	8	2069360	2069367	25 %	25 %	50 %	0 %	219852550
45558	NC_011832	GAT	2	6	2069405	2069410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852550
45559	NC_011832	CTG	2	6	2069414	2069419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852550
45560	NC_011832	CAG	2	6	2069468	2069473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852550
45561	NC_011832	TGA	3	9	2069497	2069505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852550
45562	NC_011832	GAT	2	6	2069561	2069566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852550
45563	NC_011832	AG	3	6	2069615	2069620	50 %	0 %	50 %	0 %	219852550
45564	NC_011832	GCG	2	6	2069706	2069711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852550
45565	NC_011832	ACC	2	6	2069784	2069789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852550
45566	NC_011832	C	6	6	2069792	2069797	0 %	0 %	0 %	100 %	219852550
45567	NC_011832	TTC	2	6	2069798	2069803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852550
45568	NC_011832	ATT	2	6	2069844	2069849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852550
45569	NC_011832	GAG	2	6	2069877	2069882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852550
45570	NC_011832	ATCCGG	2	12	2069923	2069934	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219852550
45571	NC_011832	CCGA	2	8	2069937	2069944	25 %	0 %	25 %	50 %	219852550
45572	NC_011832	CCT	2	6	2070037	2070042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852550
45573	NC_011832	CTG	2	6	2070104	2070109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852550
45574	NC_011832	AACG	2	8	2070165	2070172	50 %	0 %	25 %	25 %	219852550
45575	NC_011832	CGA	2	6	2070181	2070186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852550
45576	NC_011832	CTCCCC	2	12	2070248	2070259	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	219852550
45577	NC_011832	ACC	2	6	2070267	2070272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852550
45578	NC_011832	CGC	2	6	2070301	2070306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852550
45579	NC_011832	ACC	2	6	2070321	2070326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852550
45580	NC_011832	CGA	2	6	2070364	2070369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852550
45581	NC_011832	ATC	2	6	2070387	2070392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852550
45582	NC_011832	CAG	2	6	2070439	2070444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45583	NC_011832	GGC	2	6	2070595	2070600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45584	NC_011832	CTT	2	6	2070613	2070618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45585	NC_011832	C	7	7	2070624	2070630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45586	NC_011832	GGGCA	2	10	2070667	2070676	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45587	NC_011832	GGT	2	6	2070681	2070686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45588	NC_011832	CAG	2	6	2070706	2070711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45589	NC_011832	GGA	2	6	2070747	2070752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45590	NC_011832	ATG	2	6	2070772	2070777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45591	NC_011832	TCC	2	6	2070783	2070788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45592	NC_011832	GGA	2	6	2070810	2070815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45593	NC_011832	GCAG	2	8	2070817	2070824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45594	NC_011832	GCA	2	6	2070861	2070866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45595	NC_011832	TCG	2	6	2070875	2070880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45596	NC_011832	GCA	2	6	2070941	2070946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45597	NC_011832	AGA	2	6	2070964	2070969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45598	NC_011832	CTC	2	6	2070996	2071001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852551
45599	NC_011832	GCTG	2	8	2071045	2071052	0 %	25 %	50 %	25 %	219852551
45600	NC_011832	AGG	2	6	2071057	2071062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852551
45601	NC_011832	AGG	2	6	2071171	2071176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852551
45602	NC_011832	CGGT	2	8	2071202	2071209	0 %	25 %	50 %	25 %	219852551
45603	NC_011832	CGA	2	6	2071247	2071252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852551
45604	NC_011832	TCG	2	6	2071253	2071258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852551
45605	NC_011832	CTG	2	6	2071263	2071268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852551
45606	NC_011832	CGA	2	6	2071280	2071285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852551
45607	NC_011832	CAG	2	6	2071331	2071336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852551
45608	NC_011832	CAG	2	6	2071350	2071355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852551
45609	NC_011832	TTC	2	6	2071422	2071427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852551
45610	NC_011832	AG	3	6	2071461	2071466	50 %	0 %	50 %	0 %	219852551
45611	NC_011832	ATCG	2	8	2071563	2071570	25 %	25 %	25 %	25 %	219852551
45612	NC_011832	CTG	2	6	2071588	2071593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852551
45613	NC_011832	ACC	2	6	2071594	2071599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852551
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45615	NC_011832	C	6	6	2071655	2071660	0 %	0 %	0 %	100 %	219852551
45616	NC_011832	ACC	2	6	2071681	2071686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852551
45617	NC_011832	CTG	2	6	2071751	2071756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852551
45618	NC_011832	GCGG	2	8	2071771	2071778	0 %	0 %	75 %	25 %	219852551
45619	NC_011832	AGA	2	6	2071829	2071834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852551
45620	NC_011832	CTT	2	6	2071839	2071844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852551
45621	NC_011832	CTC	2	6	2071902	2071907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852551
45622	NC_011832	GAA	2	6	2071941	2071946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852551
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45624	NC_011832	CTC	2	6	2071983	2071988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852551
45625	NC_011832	CATG	2	8	2072030	2072037	25 %	25 %	25 %	25 %	219852551
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45645	NC_011832	GCTG	2	8	2072658	2072665	0 %	25 %	50 %	25 %	219852551
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45732	NC_011832	GGC	2	6	2076660	2076665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852553
45733	NC_011832	GAC	2	6	2076666	2076671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852553
45734	NC_011832	AGC	2	6	2076721	2076726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852553
45735	NC_011832	ATG	2	6	2076732	2076737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852553
45736	NC_011832	C	6	6	2076745	2076750	0 %	0 %	0 %	100 %	219852553
45737	NC_011832	TTC	2	6	2076766	2076771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852553
45738	NC_011832	GACC	2	8	2076803	2076810	25 %	0 %	25 %	50 %	219852553
45739	NC_011832	CTC	2	6	2076840	2076845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852553
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45741	NC_011832	ATGGAT	2	12	2077005	2077016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852553
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45745	NC_011832	CGA	2	6	2077145	2077150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852553
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45748	NC_011832	GGTT	2	8	2077208	2077215	0 %	50 %	50 %	0 %	219852553
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45750	NC_011832	GGGT	2	8	2077252	2077259	0 %	25 %	75 %	0 %	219852553
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45755	NC_011832	ATA	2	6	2077399	2077404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852553
45756	NC_011832	GTTG	2	8	2077428	2077435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45757	NC_011832	TTG	2	6	2077452	2077457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45758	NC_011832	TA	3	6	2077460	2077465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45759	NC_011832	GGC	2	6	2077511	2077516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45760	NC_011832	CTC	2	6	2077543	2077548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852554
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45762	NC_011832	GTCG	2	8	2077583	2077590	0 %	25 %	50 %	25 %	219852554
45763	NC_011832	GGCC	2	8	2077615	2077622	0 %	0 %	50 %	50 %	219852554
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45768	NC_011832	TCG	2	6	2078071	2078076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852554
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45771	NC_011832	CGAA	2	8	2078284	2078291	50 %	0 %	25 %	25 %	219852554
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45774	NC_011832	CGG	2	6	2078408	2078413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852554
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45795	NC_011832	AG	3	6	2080095	2080100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45796	NC_011832	AGTC	2	8	2080283	2080290	25 %	25 %	25 %	25 %	219852555
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45831	NC_011832	ATC	2	6	2082688	2082693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852555
45832	NC_011832	TATC	2	8	2082775	2082782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45833	NC_011832	ACAA	2	8	2082823	2082830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45834	NC_011832	AT	3	6	2082833	2082838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45835	NC_011832	GCA	2	6	2082866	2082871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45836	NC_011832	T	7	7	2082883	2082889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45837	NC_011832	ACCC	2	8	2082896	2082903	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45838	NC_011832	GAT	2	6	2083070	2083075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45840	NC_011832	GAC	2	6	2083132	2083137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45841	NC_011832	CAC	2	6	2083140	2083145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45842	NC_011832	ATC	2	6	2083151	2083156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852556
45843	NC_011832	GCT	2	6	2083199	2083204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852556
45844	NC_011832	GTC	2	6	2083209	2083214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852556
45845	NC_011832	GTG	2	6	2083248	2083253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852556
45846	NC_011832	AGA	2	6	2083259	2083264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852556
45847	NC_011832	CGG	2	6	2083283	2083288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852556
45848	NC_011832	GGC	2	6	2083299	2083304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852556
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45968	NC_011832	TC	3	6	2088589	2088594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45969	NC_011832	TGA	2	6	2088595	2088600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45970	NC_011832	AAT	2	6	2088634	2088639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852562
45971	NC_011832	GATC	2	8	2088672	2088679	25 %	25 %	25 %	25 %	219852562
45972	NC_011832	GGCGAT	2	12	2088697	2088708	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219852562
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