MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011832	CGG	2	6	149540	149545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850810
3502	NC_011832	CCT	2	6	149552	149557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850810
3503	NC_011832	TCT	2	6	149558	149563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850810
3504	NC_011832	GAA	2	6	149625	149630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
3505	NC_011832	GATCGA	2	12	149637	149648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219850810
3506	NC_011832	TGG	2	6	149651	149656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850810
3507	NC_011832	CCCT	2	8	149659	149666	0 %	25 %	0 %	75 %	219850810
3508	NC_011832	GCA	2	6	149694	149699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3509	NC_011832	CCG	2	6	149701	149706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850810
3510	NC_011832	GGCCA	2	10	149758	149767	20 %	0 %	40 %	40 %	219850810
3511	NC_011832	GT	3	6	149791	149796	0 %	50 %	50 %	0 %	219850810
3512	NC_011832	AGA	2	6	149816	149821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
3513	NC_011832	TCGA	2	8	149884	149891	25 %	25 %	25 %	25 %	219850810
3514	NC_011832	AGG	2	6	149939	149944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850810
3515	NC_011832	ATC	2	6	150019	150024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850810
3516	NC_011832	CGAC	2	8	150056	150063	25 %	0 %	25 %	50 %	219850810
3517	NC_011832	CGA	2	6	150096	150101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3518	NC_011832	ACC	2	6	150137	150142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850810
3519	NC_011832	CAT	2	6	150154	150159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850810
3520	NC_011832	G	6	6	150166	150171	0 %	0 %	100 %	0 %	219850810
3521	NC_011832	CTG	2	6	150205	150210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3522	NC_011832	CGTT	2	8	150228	150235	0 %	50 %	25 %	25 %	219850810
3523	NC_011832	TC	3	6	150294	150299	0 %	50 %	0 %	50 %	219850810
3524	NC_011832	CTC	2	6	150364	150369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850810
3525	NC_011832	GAACCT	2	12	150384	150395	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219850810
3526	NC_011832	GAG	2	6	150505	150510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850810
3527	NC_011832	TTCTCG	2	12	150544	150555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	219850810
3528	NC_011832	GAGCC	2	10	150575	150584	20 %	0 %	40 %	40 %	219850810
3529	NC_011832	GGTCGA	2	12	150606	150617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219850810
3530	NC_011832	CCA	2	6	150639	150644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850810
3531	NC_011832	GCCCTG	2	12	150772	150783	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219850810
3532	NC_011832	TTC	2	6	150832	150837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850810
3533	NC_011832	GCG	2	6	150845	150850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850810
3534	NC_011832	TC	3	6	150856	150861	0 %	50 %	0 %	50 %	219850810
3535	NC_011832	AAG	2	6	150931	150936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
3536	NC_011832	TTC	2	6	150964	150969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850810
3537	NC_011832	TGC	2	6	150986	150991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3538	NC_011832	GCC	2	6	150997	151002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850810
3539	NC_011832	GTG	3	9	151015	151023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850810
3540	NC_011832	CTG	2	6	151091	151096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3541	NC_011832	CTC	2	6	151165	151170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850810
3542	NC_011832	GTG	2	6	151171	151176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850810
3543	NC_011832	GGA	2	6	151289	151294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850810
3544	NC_011832	GAA	2	6	151314	151319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
3545	NC_011832	GCCG	2	8	151331	151338	0 %	0 %	50 %	50 %	219850810
3546	NC_011832	CTC	2	6	151345	151350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850810
3547	NC_011832	CTT	2	6	151420	151425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850810
3548	NC_011832	CAG	2	6	151519	151524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3549	NC_011832	TTG	2	6	151564	151569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850810
3550	NC_011832	GAT	2	6	151572	151577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850810
3551	NC_011832	TCG	2	6	151658	151663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850810
3552	NC_011832	TCT	2	6	151670	151675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850810
3553	NC_011832	TAT	2	6	151738	151743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850810
3554	NC_011832	GAA	2	6	151782	151787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850810
3555	NC_011832	GTCG	2	8	151797	151804	0 %	25 %	50 %	25 %	219850810
3556	NC_011832	ATC	2	6	151806	151811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850810
3557	NC_011832	ACG	3	9	151857	151865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850811
3558	NC_011832	GAA	2	6	151918	151923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850811
3559	NC_011832	CGG	2	6	151971	151976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850811
3560	NC_011832	ATC	2	6	152015	152020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850811
3561	NC_011832	GCGA	2	8	152075	152082	25 %	0 %	50 %	25 %	219850811
3562	NC_011832	CAG	2	6	152186	152191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850811
3563	NC_011832	CT	3	6	152205	152210	0 %	50 %	0 %	50 %	219850811
3564	NC_011832	G	6	6	152230	152235	0 %	0 %	100 %	0 %	219850811
3565	NC_011832	ACG	2	6	152262	152267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850811
3566	NC_011832	TTC	2	6	152309	152314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850811
3567	NC_011832	CTT	2	6	152374	152379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850811
3568	NC_011832	TG	3	6	152402	152407	0 %	50 %	50 %	0 %	219850811
3569	NC_011832	GAG	2	6	152432	152437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850811
3570	NC_011832	TCT	3	9	152442	152450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850811
3571	NC_011832	ATC	2	6	152579	152584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850811
3572	NC_011832	CTGG	2	8	152591	152598	0 %	25 %	50 %	25 %	219850811
3573	NC_011832	TGA	2	6	152628	152633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850811
3574	NC_011832	GAA	2	6	152687	152692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850811
3575	NC_011832	CTT	2	6	152937	152942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850812
3576	NC_011832	TAT	2	6	153004	153009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850812
3577	NC_011832	AGCGAC	2	12	153062	153073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850812
3578	NC_011832	GCA	2	6	153094	153099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850812
3579	NC_011832	ACA	2	6	153154	153159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850812
3580	NC_011832	CGA	2	6	153180	153185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850812
3581	NC_011832	ACC	2	6	153200	153205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850812
3582	NC_011832	CTT	2	6	153279	153284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850812
3583	NC_011832	GAA	2	6	153339	153344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850812
3584	NC_011832	GCA	2	6	153384	153389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850812
3585	NC_011832	ATG	2	6	153406	153411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850812
3586	NC_011832	TCG	2	6	153425	153430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850812
3587	NC_011832	TC	3	6	153467	153472	0 %	50 %	0 %	50 %	219850812
3588	NC_011832	GAG	2	6	153606	153611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011832	TC	3	6	153613	153618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_011832	GCG	2	6	153620	153625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_011832	TCT	2	6	153641	153646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_011832	AAT	2	6	153665	153670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_011832	GA	3	6	153701	153706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_011832	GAAA	2	8	153767	153774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_011832	AGA	2	6	153842	153847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011832	A	6	6	153898	153903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011832	GCC	2	6	153933	153938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850813
3598	NC_011832	GAG	2	6	153970	153975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850813
3599	NC_011832	CGT	2	6	153981	153986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850813
3600	NC_011832	GGA	2	6	154053	154058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850813
3601	NC_011832	TCG	2	6	154100	154105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850813
3602	NC_011832	CGA	2	6	154154	154159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850813
3603	NC_011832	GTG	2	6	154171	154176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850813
3604	NC_011832	CCA	2	6	154184	154189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850813
3605	NC_011832	CGG	2	6	154209	154214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850813
3606	NC_011832	GAT	2	6	154227	154232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850813
3607	NC_011832	TCG	2	6	154244	154249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850813
3608	NC_011832	TTG	2	6	154303	154308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850813
3609	NC_011832	GAG	2	6	154348	154353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850813
3610	NC_011832	GGCT	2	8	154378	154385	0 %	25 %	50 %	25 %	219850813
3611	NC_011832	GTA	3	9	154386	154394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850813
3612	NC_011832	CT	3	6	154417	154422	0 %	50 %	0 %	50 %	219850813
3613	NC_011832	CGG	2	6	154424	154429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850813
3614	NC_011832	GAA	2	6	154440	154445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850813
3615	NC_011832	TTC	2	6	154447	154452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850813
3616	NC_011832	GTT	2	6	154515	154520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850813
3617	NC_011832	GTT	2	6	154584	154589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850813
3618	NC_011832	CGT	2	6	154607	154612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850813
3619	NC_011832	GAA	2	6	154617	154622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850813
3620	NC_011832	TTG	3	9	154633	154641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850813
3621	NC_011832	GTT	2	6	154653	154658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850813
3622	NC_011832	GTA	2	6	154680	154685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850813
3623	NC_011832	CAT	2	6	154700	154705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850813
3624	NC_011832	GTT	2	6	154737	154742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850813
3625	NC_011832	CTG	2	6	154744	154749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850813
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3635	NC_011832	CTG	2	6	155414	155419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850813
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3645	NC_011832	TC	3	6	155677	155682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3646	NC_011832	TGCAC	2	10	155685	155694	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3649	NC_011832	A	6	6	155791	155796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3650	NC_011832	GA	3	6	155803	155808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3704	NC_011832	CGAT	2	8	158434	158441	25 %	25 %	25 %	25 %	219850816
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3733	NC_011832	G	6	6	159715	159720	0 %	0 %	100 %	0 %	219850818
3734	NC_011832	GAT	2	6	159726	159731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850818
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3743	NC_011832	CTG	2	6	160026	160031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850819
3744	NC_011832	CGC	2	6	160058	160063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850819
3745	NC_011832	GAG	2	6	160074	160079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850819
3746	NC_011832	TCT	2	6	160091	160096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850819
3747	NC_011832	GAG	2	6	160167	160172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850819
3748	NC_011832	CTC	2	6	160182	160187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850819
3749	NC_011832	ACA	2	6	160192	160197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850819
3750	NC_011832	CAG	2	6	160244	160249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850819
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3752	NC_011832	GTC	2	6	160404	160409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850819
3753	NC_011832	GCCT	2	8	160415	160422	0 %	25 %	25 %	50 %	219850819
3754	NC_011832	CAG	2	6	160434	160439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850819
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3764	NC_011832	TGC	2	6	161016	161021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850820
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3774	NC_011832	GAAA	2	8	161353	161360	75 %	0 %	25 %	0 %	219850820
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3780	NC_011832	CAT	2	6	161755	161760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850821
3781	NC_011832	ATC	2	6	161774	161779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850821
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3790	NC_011832	GCT	2	6	162144	162149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850821
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3814	NC_011832	GAT	2	6	163024	163029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850821
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3824	NC_011832	A	6	6	163380	163385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3825	NC_011832	AT	3	6	163494	163499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3826	NC_011832	GAA	2	6	163565	163570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850822
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3842	NC_011832	CTCCA	2	10	164198	164207	20 %	20 %	0 %	60 %	219850823
3843	NC_011832	GCTC	2	8	164232	164239	0 %	25 %	25 %	50 %	219850823
3844	NC_011832	TCC	2	6	164269	164274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850823
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3846	NC_011832	G	6	6	164444	164449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3847	NC_011832	GTA	2	6	164465	164470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850824
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3850	NC_011832	CCT	2	6	164569	164574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850824
3851	NC_011832	CGA	2	6	164590	164595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850824
3852	NC_011832	CTG	2	6	164609	164614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850824
3853	NC_011832	TCTCCA	2	12	164920	164931	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	219850824
3854	NC_011832	GGT	2	6	164977	164982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850824
3855	NC_011832	GCT	3	9	165076	165084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850824
3856	NC_011832	GAT	2	6	165085	165090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850824
3857	NC_011832	ATA	2	6	165107	165112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850824
3858	NC_011832	CT	3	6	165161	165166	0 %	50 %	0 %	50 %	219850824
3859	NC_011832	GGC	2	6	165170	165175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850824
3860	NC_011832	GCGG	2	8	165188	165195	0 %	0 %	75 %	25 %	219850824
3861	NC_011832	GCCG	2	8	165202	165209	0 %	0 %	50 %	50 %	219850824
3862	NC_011832	T	8	8	165282	165289	0 %	100 %	0 %	0 %	219850824
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3864	NC_011832	TAA	2	6	165329	165334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3983	NC_011832	AGA	3	9	170254	170262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3984	NC_011832	ATC	2	6	170298	170303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850828
3985	NC_011832	GAT	2	6	170306	170311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3986	NC_011832	GAA	2	6	170327	170332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3987	NC_011832	GGC	2	6	170351	170356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850828
3988	NC_011832	GAGG	2	8	170366	170373	25 %	0 %	75 %	0 %	219850828
3989	NC_011832	CGC	2	6	170399	170404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850828
3990	NC_011832	GAT	2	6	170444	170449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3991	NC_011832	GAG	2	6	170474	170479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850828
3992	NC_011832	C	6	6	170485	170490	0 %	0 %	0 %	100 %	219850828
3993	NC_011832	CGTT	2	8	170502	170509	0 %	50 %	25 %	25 %	219850828
3994	NC_011832	ATG	2	6	170511	170516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3995	NC_011832	TCA	2	6	170518	170523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850828
3996	NC_011832	GAA	2	6	170525	170530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850828
3997	NC_011832	GAT	2	6	170573	170578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850828
3998	NC_011832	CCT	2	6	170629	170634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850828
3999	NC_011832	CTG	2	6	170697	170702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828
4000	NC_011832	CTG	2	6	170708	170713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850828

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