MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_011832	AGA	2	6	820953	820958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851459
18502	NC_011832	GAC	2	6	820981	820986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18503	NC_011832	TGA	2	6	821004	821009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851459
18504	NC_011832	CT	3	6	821022	821027	0 %	50 %	0 %	50 %	219851459
18505	NC_011832	CGC	2	6	821028	821033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851459
18506	NC_011832	CTGAC	2	10	821055	821064	20 %	20 %	20 %	40 %	219851459
18507	NC_011832	GCT	2	6	821068	821073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18508	NC_011832	CAC	2	6	821101	821106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851459
18509	NC_011832	GATCT	2	10	821108	821117	20 %	40 %	20 %	20 %	219851459
18510	NC_011832	TCC	2	6	821154	821159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851459
18511	NC_011832	GCC	2	6	821200	821205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851459
18512	NC_011832	CGA	2	6	821283	821288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18513	NC_011832	GTC	2	6	821327	821332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18514	NC_011832	CAA	2	6	821473	821478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851459
18515	NC_011832	GAC	2	6	821495	821500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18516	NC_011832	TGA	2	6	821532	821537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851459
18517	NC_011832	GATC	2	8	821554	821561	25 %	25 %	25 %	25 %	219851459
18518	NC_011832	CGAT	2	8	821603	821610	25 %	25 %	25 %	25 %	219851459
18519	NC_011832	CGG	2	6	821692	821697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851459
18520	NC_011832	TCG	2	6	821703	821708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18521	NC_011832	GAG	2	6	821741	821746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851459
18522	NC_011832	TGA	2	6	821754	821759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851459
18523	NC_011832	GGT	2	6	821782	821787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851459
18524	NC_011832	AATG	2	8	821798	821805	50 %	25 %	25 %	0 %	219851459
18525	NC_011832	G	7	7	821846	821852	0 %	0 %	100 %	0 %	219851459
18526	NC_011832	AC	3	6	821913	821918	50 %	0 %	0 %	50 %	219851459
18527	NC_011832	CGA	2	6	821934	821939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18528	NC_011832	GATC	2	8	822016	822023	25 %	25 %	25 %	25 %	219851459
18529	NC_011832	ACG	2	6	822041	822046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18530	NC_011832	TGG	2	6	822093	822098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851459
18531	NC_011832	AGG	2	6	822108	822113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851459
18532	NC_011832	ACG	2	6	822197	822202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851459
18533	NC_011832	TGA	2	6	822204	822209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851459
18534	NC_011832	GAG	2	6	822230	822235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851459
18535	NC_011832	GCG	2	6	822394	822399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851459
18536	NC_011832	CCT	2	6	822453	822458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851459
18537	NC_011832	CTC	2	6	822530	822535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851459
18538	NC_011832	CAT	2	6	822560	822565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851459
18539	NC_011832	GGC	2	6	822680	822685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851460
18540	NC_011832	TA	3	6	822702	822707	50 %	50 %	0 %	0 %	219851460
18541	NC_011832	GCT	2	6	822728	822733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851460
18542	NC_011832	CCGG	2	8	822769	822776	0 %	0 %	50 %	50 %	219851460
18543	NC_011832	GAG	2	6	822786	822791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851460
18544	NC_011832	CCG	2	6	822823	822828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851460
18545	NC_011832	TCG	2	6	822853	822858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851460
18546	NC_011832	GAG	2	6	822888	822893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851460
18547	NC_011832	AGC	2	6	822919	822924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851460
18548	NC_011832	GGT	2	6	822989	822994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851460
18549	NC_011832	ACG	2	6	823021	823026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851460
18550	NC_011832	GGT	2	6	823072	823077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851460
18551	NC_011832	CCTCG	2	10	823139	823148	0 %	20 %	20 %	60 %	219851460
18552	NC_011832	GGT	2	6	823160	823165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851460
18553	NC_011832	GGA	2	6	823199	823204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851460
18554	NC_011832	G	6	6	823224	823229	0 %	0 %	100 %	0 %	219851460
18555	NC_011832	CTG	2	6	823241	823246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851460
18556	NC_011832	TGGACC	2	12	823273	823284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219851460
18557	NC_011832	TCC	2	6	823327	823332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851460
18558	NC_011832	GGA	2	6	823361	823366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851460
18559	NC_011832	ACC	2	6	823402	823407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851460
18560	NC_011832	GATG	2	8	823481	823488	25 %	25 %	50 %	0 %	219851460
18561	NC_011832	GAT	2	6	823511	823516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851460
18562	NC_011832	CGA	2	6	823582	823587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851460
18563	NC_011832	GATG	2	8	823610	823617	25 %	25 %	50 %	0 %	219851460
18564	NC_011832	G	7	7	823724	823730	0 %	0 %	100 %	0 %	219851461
18565	NC_011832	GAC	2	6	823739	823744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851461
18566	NC_011832	CTC	2	6	823755	823760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851461
18567	NC_011832	GCT	2	6	823793	823798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851461
18568	NC_011832	GAG	2	6	823878	823883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851461
18569	NC_011832	CGGTTC	2	12	823932	823943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851461
18570	NC_011832	GAAGG	2	10	823959	823968	40 %	0 %	60 %	0 %	219851461
18571	NC_011832	CTG	2	6	823977	823982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851461
18572	NC_011832	TCT	2	6	824030	824035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851461
18573	NC_011832	ATCG	2	8	824042	824049	25 %	25 %	25 %	25 %	219851461
18574	NC_011832	GCA	2	6	824057	824062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851461
18575	NC_011832	TGC	2	6	824140	824145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851461
18576	NC_011832	CTCG	2	8	824210	824217	0 %	25 %	25 %	50 %	219851461
18577	NC_011832	GCCG	2	8	824222	824229	0 %	0 %	50 %	50 %	219851461
18578	NC_011832	GAC	2	6	824280	824285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851461
18579	NC_011832	GCC	2	6	824334	824339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851461
18580	NC_011832	CGCTG	2	10	824399	824408	0 %	20 %	40 %	40 %	219851461
18581	NC_011832	GGC	2	6	824429	824434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851461
18582	NC_011832	CAG	2	6	824552	824557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18583	NC_011832	ATTG	2	8	824588	824595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18584	NC_011832	T	7	7	824598	824604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18585	NC_011832	AAT	2	6	824639	824644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18586	NC_011832	TCA	2	6	824814	824819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18587	NC_011832	TC	3	6	824832	824837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18588	NC_011832	TG	3	6	824904	824909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18589	NC_011832	CT	3	6	824952	824957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18590	NC_011832	ATT	2	6	824967	824972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18591	NC_011832	T	6	6	825019	825024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18592	NC_011832	ATG	2	6	825045	825050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_011832	TGCAT	2	10	825092	825101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18594	NC_011832	TGC	2	6	825105	825110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18595	NC_011832	GCATC	2	10	825147	825156	20 %	20 %	20 %	40 %	219851462
18596	NC_011832	TGC	2	6	825171	825176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851462
18597	NC_011832	AGC	2	6	825201	825206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851462
18598	NC_011832	CAA	2	6	825212	825217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851462
18599	NC_011832	TGC	2	6	825228	825233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851462
18600	NC_011832	AGGAA	2	10	825245	825254	60 %	0 %	40 %	0 %	219851462
18601	NC_011832	GGC	2	6	825303	825308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851462
18602	NC_011832	GGT	2	6	825331	825336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851462
18603	NC_011832	TTC	2	6	825344	825349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851462
18604	NC_011832	CAA	2	6	825428	825433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851462
18605	NC_011832	GGTTC	2	10	825454	825463	0 %	40 %	40 %	20 %	219851462
18606	NC_011832	TCCG	2	8	825481	825488	0 %	25 %	25 %	50 %	219851462
18607	NC_011832	TTC	2	6	825517	825522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851462
18608	NC_011832	AG	3	6	825578	825583	50 %	0 %	50 %	0 %	219851462
18609	NC_011832	CAC	2	6	825633	825638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851462
18610	NC_011832	TCG	2	6	825658	825663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851462
18611	NC_011832	ATC	2	6	825690	825695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851462
18612	NC_011832	GCTGA	2	10	825790	825799	20 %	20 %	40 %	20 %	219851462
18613	NC_011832	CTC	2	6	825906	825911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851462
18614	NC_011832	AGA	3	9	825929	825937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851462
18615	NC_011832	TGG	2	6	825972	825977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851462
18616	NC_011832	TCA	2	6	825995	826000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851462
18617	NC_011832	AAC	2	6	826047	826052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851462
18618	NC_011832	CAG	2	6	826147	826152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851462
18619	NC_011832	ATG	2	6	826178	826183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851462
18620	NC_011832	CCCGGC	2	12	826224	826235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851462
18621	NC_011832	ATCC	2	8	826259	826266	25 %	25 %	0 %	50 %	219851462
18622	NC_011832	CAG	2	6	826307	826312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851462
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18648	NC_011832	T	6	6	827982	827987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18652	NC_011832	GTG	2	6	828232	828237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18653	NC_011832	TAA	2	6	828272	828277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18654	NC_011832	TTC	2	6	828329	828334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18661	NC_011832	GTT	2	6	828573	828578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18721	NC_011832	AT	3	6	831219	831224	50 %	50 %	0 %	0 %	219851464
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18723	NC_011832	TAC	2	6	831380	831385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18732	NC_011832	T	7	7	831759	831765	0 %	100 %	0 %	0 %	219851465
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18742	NC_011832	TCA	2	6	832440	832445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851465
18743	NC_011832	TGT	2	6	832468	832473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851465
18744	NC_011832	CGAT	2	8	832583	832590	25 %	25 %	25 %	25 %	219851466
18745	NC_011832	GCC	2	6	832603	832608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851466
18746	NC_011832	CAGG	2	8	832628	832635	25 %	0 %	50 %	25 %	219851466
18747	NC_011832	AGG	2	6	832704	832709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851466
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18751	NC_011832	TAT	2	6	832895	832900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851466
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18754	NC_011832	TCA	2	6	833147	833152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18755	NC_011832	TCT	2	6	833399	833404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851467
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18766	NC_011832	ATTTT	2	10	833839	833848	20 %	80 %	0 %	0 %	219851467
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