MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011832	GAA	2	6	754474	754479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_011832	GCC	2	6	754503	754508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17003	NC_011832	CGG	2	6	754519	754524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17004	NC_011832	GTG	2	6	754530	754535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_011832	GTT	2	6	754571	754576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_011832	ACC	2	6	754698	754703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17007	NC_011832	GCC	2	6	754865	754870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17008	NC_011832	CAC	2	6	754919	754924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17009	NC_011832	GAT	2	6	754988	754993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_011832	GAG	2	6	755026	755031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_011832	CGT	2	6	755041	755046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17012	NC_011832	CGAG	2	8	755084	755091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17013	NC_011832	GAT	2	6	755125	755130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17014	NC_011832	AGG	2	6	755162	755167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_011832	GTA	2	6	755333	755338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_011832	CA	3	6	755382	755387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17017	NC_011832	TGA	2	6	755417	755422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_011832	CCT	2	6	755513	755518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17019	NC_011832	GAACA	2	10	755543	755552	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17020	NC_011832	ATC	2	6	755677	755682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_011832	TAG	2	6	755945	755950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_011832	GAA	2	6	755959	755964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_011832	TAG	2	6	755982	755987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_011832	GTC	2	6	756080	756085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17025	NC_011832	CGT	2	6	756091	756096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17026	NC_011832	CTC	2	6	756214	756219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17027	NC_011832	TAG	2	6	756236	756241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_011832	GGT	2	6	756274	756279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17029	NC_011832	GTA	2	6	756360	756365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_011832	ACGT	2	8	756389	756396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17031	NC_011832	GAA	2	6	756400	756405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_011832	AG	3	6	756412	756417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_011832	CAA	2	6	756466	756471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17034	NC_011832	CAG	2	6	756519	756524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17035	NC_011832	GGA	2	6	756586	756591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17036	NC_011832	GCA	2	6	756691	756696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17037	NC_011832	CTGG	2	8	756701	756708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17038	NC_011832	C	6	6	756763	756768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17039	NC_011832	ATC	2	6	756789	756794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17040	NC_011832	AGC	2	6	756941	756946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_011832	CTA	2	6	757018	757023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17042	NC_011832	AG	3	6	757057	757062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_011832	TAG	2	6	757131	757136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_011832	CCG	2	6	757162	757167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17045	NC_011832	TGCC	2	8	757551	757558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17046	NC_011832	CAGG	2	8	757566	757573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17047	NC_011832	TAA	2	6	757602	757607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_011832	CGG	2	6	757710	757715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17049	NC_011832	GTA	2	6	757743	757748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_011832	GGA	2	6	757956	757961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_011832	CAA	2	6	757970	757975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17052	NC_011832	TAGG	2	8	758029	758036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_011832	TGGG	2	8	758042	758049	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_011832	A	6	6	758064	758069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_011832	GTC	2	6	758256	758261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17056	NC_011832	CGG	2	6	758285	758290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17057	NC_011832	GCA	3	9	758329	758337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17058	NC_011832	GTT	2	6	758350	758355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_011832	CGT	2	6	758391	758396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17060	NC_011832	CTAT	2	8	758412	758419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17061	NC_011832	TCG	2	6	758475	758480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_011832	ACG	2	6	758643	758648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17063	NC_011832	AGC	2	6	758887	758892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_011832	AC	3	6	758897	758902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17065	NC_011832	GCT	2	6	758987	758992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17066	NC_011832	CTT	2	6	758999	759004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17067	NC_011832	ATC	8	24	759113	759136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17068	NC_011832	GGC	2	6	759146	759151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17069	NC_011832	AGT	2	6	759190	759195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_011832	CGT	2	6	759208	759213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17071	NC_011832	T	7	7	759366	759372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17072	NC_011832	TAT	2	6	759386	759391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_011832	ATG	2	6	759405	759410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_011832	ATG	2	6	759431	759436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17075	NC_011832	TTTG	2	8	759496	759503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17076	NC_011832	TTA	2	6	759527	759532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_011832	T	7	7	759536	759542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17078	NC_011832	TAT	2	6	759558	759563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851404
17079	NC_011832	AAT	2	6	759627	759632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851404
17080	NC_011832	GA	3	6	759652	759657	50 %	0 %	50 %	0 %	219851404
17081	NC_011832	T	7	7	759714	759720	0 %	100 %	0 %	0 %	219851404
17082	NC_011832	CTG	2	6	759740	759745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851404
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17084	NC_011832	TCTG	2	8	759814	759821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17085	NC_011832	T	6	6	759936	759941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17086	NC_011832	ATTTT	2	10	759962	759971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17089	NC_011832	TTC	2	6	760072	760077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17090	NC_011832	GAA	2	6	760126	760131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_011832	GAT	2	6	760156	760161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_011832	AAT	2	6	760185	760190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_011832	ATAA	2	8	760210	760217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_011832	ATC	2	6	760220	760225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17095	NC_011832	TGT	2	6	760227	760232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17099	NC_011832	AAT	2	6	760402	760407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851405
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17103	NC_011832	CTC	2	6	760690	760695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851405
17104	NC_011832	TAT	2	6	760728	760733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_011832	AATT	2	8	760796	760803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17106	NC_011832	GAAT	2	8	760804	760811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_011832	CAG	3	9	760824	760832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17108	NC_011832	ATCAG	2	10	760833	760842	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17109	NC_011832	AAG	2	6	760914	760919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17110	NC_011832	GAT	2	6	760999	761004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17111	NC_011832	TCA	2	6	761015	761020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17112	NC_011832	AAT	2	6	761026	761031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_011832	GAT	2	6	761044	761049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851406
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17116	NC_011832	GAT	2	6	761098	761103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851406
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17118	NC_011832	A	6	6	761208	761213	100 %	0 %	0 %	0 %	219851406
17119	NC_011832	GATA	2	8	761233	761240	50 %	25 %	25 %	0 %	219851406
17120	NC_011832	AAAAT	2	10	761357	761366	80 %	20 %	0 %	0 %	219851406
17121	NC_011832	CAG	2	6	761374	761379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851406
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17124	NC_011832	TAT	2	6	761458	761463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851406
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17126	NC_011832	ATT	3	9	761500	761508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851406
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17256	NC_011832	GGC	2	6	767858	767863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851409
17257	NC_011832	CAG	2	6	768016	768021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851409
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17260	NC_011832	CCGGC	2	10	768111	768120	0 %	0 %	40 %	60 %	219851409
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17269	NC_011832	TGT	2	6	768563	768568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851409
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17367	NC_011832	GTC	2	6	772757	772762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17368	NC_011832	CCGGA	2	10	772764	772773	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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17371	NC_011832	GATT	2	8	772907	772914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17372	NC_011832	AAG	2	6	772965	772970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17373	NC_011832	G	7	7	773003	773009	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17374	NC_011832	C	6	6	773028	773033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17375	NC_011832	ATC	3	9	773143	773151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851414
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