MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011832	CCG	2	6	708397	708402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851366
16002	NC_011832	AGC	2	6	708415	708420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851366
16003	NC_011832	ATC	2	6	708517	708522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851366
16004	NC_011832	TCG	2	6	708557	708562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851366
16005	NC_011832	CTC	2	6	708576	708581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851366
16006	NC_011832	TCA	2	6	708584	708589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851366
16007	NC_011832	CCTG	2	8	708618	708625	0 %	25 %	25 %	50 %	219851367
16008	NC_011832	GAA	2	6	708637	708642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851367
16009	NC_011832	TCG	2	6	708668	708673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851367
16010	NC_011832	AGG	2	6	708689	708694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851367
16011	NC_011832	TGA	2	6	708759	708764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851367
16012	NC_011832	GCC	2	6	708772	708777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851367
16013	NC_011832	CCTTCA	2	12	708804	708815	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	219851367
16014	NC_011832	GATCG	2	10	708823	708832	20 %	20 %	40 %	20 %	219851367
16015	NC_011832	CGGT	2	8	708868	708875	0 %	25 %	50 %	25 %	219851367
16016	NC_011832	TCTG	2	8	708903	708910	0 %	50 %	25 %	25 %	219851367
16017	NC_011832	ACC	2	6	708972	708977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851367
16018	NC_011832	TCG	2	6	708989	708994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851367
16019	NC_011832	CGA	2	6	709020	709025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851367
16020	NC_011832	CTC	2	6	709036	709041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851367
16021	NC_011832	GA	3	6	709046	709051	50 %	0 %	50 %	0 %	219851367
16022	NC_011832	CCG	2	6	709148	709153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851367
16023	NC_011832	ATC	2	6	709184	709189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851367
16024	NC_011832	GTC	2	6	709190	709195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851367
16025	NC_011832	GC	3	6	709230	709235	0 %	0 %	50 %	50 %	219851367
16026	NC_011832	TGC	2	6	709315	709320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851367
16027	NC_011832	ATT	2	6	709386	709391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_011832	TGGGTG	2	12	709437	709448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_011832	TC	3	6	709465	709470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16030	NC_011832	TC	3	6	709478	709483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_011832	GTC	2	6	709491	709496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_011832	TGA	2	6	709515	709520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_011832	TCA	3	9	709588	709596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851368
16034	NC_011832	TCGA	2	8	709603	709610	25 %	25 %	25 %	25 %	219851368
16035	NC_011832	CTG	2	6	709673	709678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851368
16036	NC_011832	CGG	2	6	709721	709726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851368
16037	NC_011832	TCT	2	6	709747	709752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851368
16038	NC_011832	ATT	2	6	709788	709793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_011832	TCTCC	2	10	709800	709809	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16040	NC_011832	TCATC	2	10	709957	709966	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16041	NC_011832	ATC	2	6	709977	709982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_011832	TGA	2	6	709995	710000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_011832	CTT	2	6	710091	710096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_011832	GAG	2	6	710208	710213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_011832	ATG	2	6	710234	710239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_011832	GGT	2	6	710242	710247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_011832	AGA	2	6	710258	710263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_011832	CT	3	6	710356	710361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16049	NC_011832	AG	3	6	710365	710370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_011832	ATTCC	2	10	710392	710401	20 %	40 %	0 %	40 %	219851369
16051	NC_011832	GTG	2	6	710418	710423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851369
16052	NC_011832	TCG	2	6	710489	710494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851369
16053	NC_011832	GTT	2	6	710514	710519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851369
16054	NC_011832	GAGG	2	8	710530	710537	25 %	0 %	75 %	0 %	219851369
16055	NC_011832	CGAT	2	8	710547	710554	25 %	25 %	25 %	25 %	219851369
16056	NC_011832	TGATCG	2	12	710586	710597	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219851369
16057	NC_011832	CCG	2	6	710627	710632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851369
16058	NC_011832	CGC	2	6	710647	710652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851369
16059	NC_011832	A	6	6	710732	710737	100 %	0 %	0 %	0 %	219851369
16060	NC_011832	AGGA	2	8	710786	710793	50 %	0 %	50 %	0 %	219851369
16061	NC_011832	CGA	2	6	710797	710802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851369
16062	NC_011832	GCA	2	6	710840	710845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851369
16063	NC_011832	ACC	2	6	710871	710876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16064	NC_011832	T	6	6	710922	710927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_011832	CAG	2	6	711009	711014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_011832	GGA	2	6	711040	711045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_011832	CGAT	2	8	711070	711077	25 %	25 %	25 %	25 %	219851370
16068	NC_011832	GAG	2	6	711078	711083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851370
16069	NC_011832	ATC	2	6	711138	711143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851370
16070	NC_011832	GAAGG	2	10	711144	711153	40 %	0 %	60 %	0 %	219851370
16071	NC_011832	TCT	2	6	711172	711177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851370
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16073	NC_011832	TCA	2	6	711301	711306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851370
16074	NC_011832	AC	3	6	711380	711385	50 %	0 %	0 %	50 %	219851370
16075	NC_011832	GGA	2	6	711494	711499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851370
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16078	NC_011832	ATC	2	6	711684	711689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851370
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16080	NC_011832	CTG	2	6	711797	711802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851370
16081	NC_011832	TGT	2	6	711818	711823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851370
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16083	NC_011832	CAT	3	9	711914	711922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16085	NC_011832	GCTG	2	8	711966	711973	0 %	25 %	50 %	25 %	219851371
16086	NC_011832	ATC	2	6	712020	712025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851371
16087	NC_011832	ATC	2	6	712032	712037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851371
16088	NC_011832	TCC	2	6	712265	712270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851372
16089	NC_011832	TC	3	6	712287	712292	0 %	50 %	0 %	50 %	219851372
16090	NC_011832	CCTG	2	8	712296	712303	0 %	25 %	25 %	50 %	219851372
16091	NC_011832	CTG	2	6	712327	712332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851372
16092	NC_011832	ATCGG	2	10	712382	712391	20 %	20 %	40 %	20 %	219851372
16093	NC_011832	GGGA	2	8	712435	712442	25 %	0 %	75 %	0 %	219851372
16094	NC_011832	GA	3	6	712454	712459	50 %	0 %	50 %	0 %	219851372
16095	NC_011832	TCT	2	6	712560	712565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851372
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16097	NC_011832	TCC	2	6	712719	712724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851372
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16099	NC_011832	GGAT	2	8	712919	712926	25 %	25 %	50 %	0 %	219851372
16100	NC_011832	TGG	2	6	712951	712956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851372
16101	NC_011832	CT	4	8	713084	713091	0 %	50 %	0 %	50 %	219851372
16102	NC_011832	ATG	2	6	713231	713236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851372
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16105	NC_011832	C	6	6	713349	713354	0 %	0 %	0 %	100 %	219851372
16106	NC_011832	TCA	2	6	713442	713447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851372
16107	NC_011832	TCC	3	9	713453	713461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851372
16108	NC_011832	TCA	2	6	713526	713531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851372
16109	NC_011832	GCG	2	6	713541	713546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851372
16110	NC_011832	CGG	2	6	713610	713615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851372
16111	NC_011832	T	6	6	713635	713640	0 %	100 %	0 %	0 %	219851372
16112	NC_011832	C	7	7	713679	713685	0 %	0 %	0 %	100 %	219851372
16113	NC_011832	GTT	2	6	713710	713715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851372
16114	NC_011832	GAC	2	6	713842	713847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851372
16115	NC_011832	ATG	2	6	713870	713875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851372
16116	NC_011832	TGA	2	6	713907	713912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851372
16117	NC_011832	AAT	2	6	714040	714045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_011832	GTG	2	6	714051	714056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_011832	GTC	2	6	714059	714064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_011832	CAT	2	6	714078	714083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16122	NC_011832	GAT	2	6	714113	714118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16368	NC_011832	TCTTCA	2	12	725142	725153	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219851383
16369	NC_011832	CAT	2	6	725269	725274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851383
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16374	NC_011832	TCC	2	6	725514	725519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851383
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16380	NC_011832	GAG	2	6	725974	725979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16381	NC_011832	TC	3	6	726006	726011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16382	NC_011832	GATC	2	8	726033	726040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16383	NC_011832	TC	3	6	726054	726059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16384	NC_011832	CAG	2	6	726118	726123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16459	NC_011832	GAGGGA	2	12	729446	729457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16486	NC_011832	AGA	2	6	730588	730593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851389
16487	NC_011832	CGA	2	6	730705	730710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851389
16488	NC_011832	CTC	2	6	730751	730756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851389
16489	NC_011832	GTA	2	6	730811	730816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851389
16490	NC_011832	ATT	2	6	730844	730849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851389
16491	NC_011832	GGCG	2	8	730852	730859	0 %	0 %	75 %	25 %	219851389
16492	NC_011832	GTC	2	6	730862	730867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851389
16493	NC_011832	TCC	2	6	730989	730994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851389
16494	NC_011832	TCT	2	6	731011	731016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851389
16495	NC_011832	GCC	2	6	731042	731047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851389
16496	NC_011832	ACC	2	6	731067	731072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851389
16497	NC_011832	GTCCG	2	10	731078	731087	0 %	20 %	40 %	40 %	219851389
16498	NC_011832	TTC	2	6	731097	731102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851389
16499	NC_011832	AGC	2	6	731139	731144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851389
16500	NC_011832	TGC	2	6	731150	731155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851389

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