MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_011832	TCA	2	6	686024	686029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851347
15502	NC_011832	TGG	2	6	686078	686083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851347
15503	NC_011832	GAG	2	6	686146	686151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851347
15504	NC_011832	CGGTT	2	10	686211	686220	0 %	40 %	40 %	20 %	219851347
15505	NC_011832	GAT	2	6	686229	686234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851347
15506	NC_011832	CGT	2	6	686250	686255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851347
15507	NC_011832	GCG	2	6	686281	686286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851347
15508	NC_011832	CTGA	2	8	686356	686363	25 %	25 %	25 %	25 %	219851347
15509	NC_011832	GGT	2	6	686382	686387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851347
15510	NC_011832	GAGG	2	8	686407	686414	25 %	0 %	75 %	0 %	219851347
15511	NC_011832	GATCCG	2	12	686415	686426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219851347
15512	NC_011832	ATC	2	6	686449	686454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851347
15513	NC_011832	TCG	2	6	686477	686482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851347
15514	NC_011832	GA	3	6	686534	686539	50 %	0 %	50 %	0 %	219851347
15515	NC_011832	AGC	2	6	686554	686559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851347
15516	NC_011832	GA	3	6	686597	686602	50 %	0 %	50 %	0 %	219851347
15517	NC_011832	ATGA	2	8	686635	686642	50 %	25 %	25 %	0 %	219851348
15518	NC_011832	CATG	2	8	686767	686774	25 %	25 %	25 %	25 %	219851348
15519	NC_011832	TCGC	2	8	686904	686911	0 %	25 %	25 %	50 %	219851348
15520	NC_011832	GGC	2	6	686920	686925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851348
15521	NC_011832	GCA	2	6	686959	686964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15522	NC_011832	TCGA	2	8	687050	687057	25 %	25 %	25 %	25 %	219851348
15523	NC_011832	GGC	3	9	687060	687068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851348
15524	NC_011832	ACG	2	6	687132	687137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15525	NC_011832	GAC	2	6	687182	687187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15526	NC_011832	GAG	2	6	687266	687271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851348
15527	NC_011832	GTC	2	6	687374	687379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15528	NC_011832	GA	3	6	687444	687449	50 %	0 %	50 %	0 %	219851348
15529	NC_011832	CAGGT	2	10	687495	687504	20 %	20 %	40 %	20 %	219851348
15530	NC_011832	TCG	2	6	687525	687530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15531	NC_011832	TGA	2	6	687555	687560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851348
15532	NC_011832	GCA	3	9	687607	687615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15533	NC_011832	ACCA	2	8	687710	687717	50 %	0 %	0 %	50 %	219851348
15534	NC_011832	AGG	2	6	687747	687752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851348
15535	NC_011832	CAG	2	6	687759	687764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15536	NC_011832	ACC	2	6	687882	687887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851348
15537	NC_011832	TCC	2	6	687930	687935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851348
15538	NC_011832	CCGA	2	8	688016	688023	25 %	0 %	25 %	50 %	219851348
15539	NC_011832	CTA	2	6	688162	688167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851348
15540	NC_011832	GATC	2	8	688192	688199	25 %	25 %	25 %	25 %	219851348
15541	NC_011832	GCT	2	6	688204	688209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15542	NC_011832	CGG	2	6	688215	688220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851348
15543	NC_011832	AGC	2	6	688272	688277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15544	NC_011832	CAT	2	6	688376	688381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851348
15545	NC_011832	TCG	2	6	688419	688424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15546	NC_011832	TGGGA	2	10	688429	688438	20 %	20 %	60 %	0 %	219851348
15547	NC_011832	TCC	2	6	688460	688465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851348
15548	NC_011832	TCC	2	6	688482	688487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851348
15549	NC_011832	GAAC	2	8	688576	688583	50 %	0 %	25 %	25 %	219851348
15550	NC_011832	AGA	2	6	688707	688712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851348
15551	NC_011832	GCT	2	6	688864	688869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15552	NC_011832	CATTC	2	10	688879	688888	20 %	40 %	0 %	40 %	219851348
15553	NC_011832	GAG	2	6	688919	688924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851348
15554	NC_011832	CAG	2	6	688958	688963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851348
15555	NC_011832	GTCG	2	8	688978	688985	0 %	25 %	50 %	25 %	219851348
15556	NC_011832	GAG	2	6	688994	688999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851348
15557	NC_011832	CGT	2	6	689058	689063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851348
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15559	NC_011832	TCA	2	6	689123	689128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851348
15560	NC_011832	GGGT	2	8	689142	689149	0 %	25 %	75 %	0 %	219851348
15561	NC_011832	GAA	2	6	689158	689163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851348
15562	NC_011832	GAG	2	6	689165	689170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851348
15563	NC_011832	CGC	2	6	689238	689243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851348
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15565	NC_011832	TCG	2	6	689343	689348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851348
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15568	NC_011832	GCCCT	2	10	689384	689393	0 %	20 %	20 %	60 %	219851348
15569	NC_011832	ATT	2	6	689408	689413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851348
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15572	NC_011832	CTGC	2	8	689483	689490	0 %	25 %	25 %	50 %	219851349
15573	NC_011832	ATCG	2	8	689538	689545	25 %	25 %	25 %	25 %	219851349
15574	NC_011832	CGA	3	9	689564	689572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851349
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15588	NC_011832	AGA	2	6	690155	690160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851350
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15591	NC_011832	TGA	2	6	690260	690265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851350
15592	NC_011832	CTG	2	6	690301	690306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851350
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15595	NC_011832	GCT	2	6	690399	690404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851350
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15599	NC_011832	GA	3	6	690483	690488	50 %	0 %	50 %	0 %	219851350
15600	NC_011832	TGC	2	6	690524	690529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851351
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15602	NC_011832	ATC	2	6	690741	690746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851351
15603	NC_011832	GAG	2	6	690771	690776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851351
15604	NC_011832	GGC	2	6	690788	690793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851351
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15608	NC_011832	CTG	2	6	690890	690895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851351
15609	NC_011832	TCCTCT	2	12	690914	690925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15610	NC_011832	TAA	2	6	690937	690942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_011832	TCT	2	6	691046	691051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_011832	T	6	6	691058	691063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_011832	TTC	2	6	691096	691101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15614	NC_011832	TGC	2	6	691149	691154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_011832	AAC	2	6	691186	691191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_011832	AATAA	2	10	691210	691219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_011832	A	6	6	691400	691405	100 %	0 %	0 %	0 %	219851352
15618	NC_011832	CTC	2	6	691412	691417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851352
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15620	NC_011832	GA	3	6	691430	691435	50 %	0 %	50 %	0 %	219851352
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15844	NC_011832	CCGG	2	8	701662	701669	0 %	0 %	50 %	50 %	219851361
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15982	NC_011832	GCG	2	6	707692	707697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851366
15983	NC_011832	GAAC	2	8	707706	707713	50 %	0 %	25 %	25 %	219851366
15984	NC_011832	GAA	2	6	707727	707732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851366
15985	NC_011832	GAA	2	6	707838	707843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851366
15986	NC_011832	TCA	2	6	707855	707860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851366
15987	NC_011832	G	6	6	707861	707866	0 %	0 %	100 %	0 %	219851366
15988	NC_011832	GAT	2	6	707943	707948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851366
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15990	NC_011832	AGA	2	6	708035	708040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851366
15991	NC_011832	TCG	2	6	708113	708118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851366
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