MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011832	CT	3	6	550312	550317	0 %	50 %	0 %	50 %	219851221
12502	NC_011832	CTT	2	6	550328	550333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851221
12503	NC_011832	TC	3	6	550340	550345	0 %	50 %	0 %	50 %	219851221
12504	NC_011832	CTT	2	6	550467	550472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851221
12505	NC_011832	GTC	2	6	550584	550589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851221
12506	NC_011832	GGA	2	6	550649	550654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851221
12507	NC_011832	AGGACC	2	12	550673	550684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851221
12508	NC_011832	GATT	2	8	550722	550729	25 %	50 %	25 %	0 %	219851221
12509	NC_011832	CTC	2	6	550739	550744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851221
12510	NC_011832	GGT	2	6	550794	550799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851221
12511	NC_011832	CGA	2	6	550835	550840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851221
12512	NC_011832	TC	3	6	550850	550855	0 %	50 %	0 %	50 %	219851221
12513	NC_011832	CTT	2	6	550902	550907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851221
12514	NC_011832	GT	3	6	550994	550999	0 %	50 %	50 %	0 %	219851221
12515	NC_011832	GAC	2	6	551010	551015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851221
12516	NC_011832	TGA	2	6	551042	551047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851221
12517	NC_011832	GGT	2	6	551085	551090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851221
12518	NC_011832	ATG	2	6	551101	551106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851221
12519	NC_011832	CAC	2	6	551159	551164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851221
12520	NC_011832	GCA	2	6	551253	551258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851221
12521	NC_011832	GCAG	2	8	551282	551289	25 %	0 %	50 %	25 %	219851221
12522	NC_011832	AGG	2	6	551303	551308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851221
12523	NC_011832	GAA	2	6	551602	551607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851222
12524	NC_011832	ATC	2	6	551621	551626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
12525	NC_011832	TTC	2	6	551635	551640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851222
12526	NC_011832	ATC	2	6	551696	551701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
12527	NC_011832	CTG	2	6	551726	551731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851222
12528	NC_011832	TCG	2	6	551738	551743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851222
12529	NC_011832	CCT	2	6	551778	551783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851222
12530	NC_011832	CTC	2	6	551791	551796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851222
12531	NC_011832	TGGA	2	8	551806	551813	25 %	25 %	50 %	0 %	219851222
12532	NC_011832	ACC	2	6	551909	551914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851222
12533	NC_011832	GTTC	2	8	552065	552072	0 %	50 %	25 %	25 %	219851222
12534	NC_011832	TCA	2	6	552083	552088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
12535	NC_011832	TGG	2	6	552123	552128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851222
12536	NC_011832	CAT	2	6	552181	552186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
12537	NC_011832	TCT	2	6	552255	552260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851222
12538	NC_011832	ATG	2	6	552281	552286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851222
12539	NC_011832	CATC	2	8	552332	552339	25 %	25 %	0 %	50 %	219851222
12540	NC_011832	TGT	2	6	552348	552353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851222
12541	NC_011832	CGG	2	6	552396	552401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851222
12542	NC_011832	TTG	2	6	552431	552436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851222
12543	NC_011832	ATC	2	6	552547	552552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
12544	NC_011832	TGGA	2	8	552598	552605	25 %	25 %	50 %	0 %	219851222
12545	NC_011832	ATC	2	6	552626	552631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851222
12546	NC_011832	CCG	2	6	552650	552655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851222
12547	NC_011832	GGT	2	6	552682	552687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851222
12548	NC_011832	GGA	2	6	552716	552721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851222
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12550	NC_011832	AGC	2	6	552774	552779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851222
12551	NC_011832	CGA	2	6	552822	552827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851222
12552	NC_011832	GAT	2	6	552868	552873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851222
12553	NC_011832	CTG	2	6	552904	552909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851222
12554	NC_011832	TTC	2	6	552926	552931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851222
12555	NC_011832	CTT	2	6	552943	552948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851222
12556	NC_011832	TCC	2	6	552989	552994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851222
12557	NC_011832	GTT	2	6	552996	553001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851222
12558	NC_011832	CTC	2	6	553027	553032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12559	NC_011832	GCA	2	6	553094	553099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851223
12560	NC_011832	GAT	2	6	553104	553109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851223
12561	NC_011832	CGA	2	6	553157	553162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851223
12562	NC_011832	TCA	2	6	553177	553182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851223
12563	NC_011832	CGG	2	6	553204	553209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851223
12564	NC_011832	GAA	2	6	553212	553217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851223
12565	NC_011832	GTC	2	6	553224	553229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851223
12566	NC_011832	CCT	2	6	553244	553249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851223
12567	NC_011832	TCC	2	6	553258	553263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851223
12568	NC_011832	TCG	2	6	553276	553281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851223
12569	NC_011832	ATGGCC	2	12	553282	553293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219851223
12570	NC_011832	CT	3	6	553400	553405	0 %	50 %	0 %	50 %	219851223
12571	NC_011832	TCT	2	6	553418	553423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851223
12572	NC_011832	C	6	6	553461	553466	0 %	0 %	0 %	100 %	219851224
12573	NC_011832	TGA	2	6	553516	553521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851224
12574	NC_011832	TGA	2	6	553582	553587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851224
12575	NC_011832	GAT	2	6	553728	553733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851224
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12577	NC_011832	TCACC	2	10	553800	553809	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12578	NC_011832	TGC	2	6	553835	553840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851225
12579	NC_011832	ATC	2	6	553841	553846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851225
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12582	NC_011832	TTGG	2	8	553939	553946	0 %	50 %	50 %	0 %	219851225
12583	NC_011832	TCT	2	6	553971	553976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851225
12584	NC_011832	GAG	2	6	554059	554064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851225
12585	NC_011832	GAT	2	6	554098	554103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851225
12586	NC_011832	TCC	2	6	554104	554109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851225
12587	NC_011832	TGT	2	6	554157	554162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851225
12588	NC_011832	CGA	2	6	554196	554201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851225
12589	NC_011832	TTCC	2	8	554220	554227	0 %	50 %	0 %	50 %	219851225
12590	NC_011832	C	6	6	554245	554250	0 %	0 %	0 %	100 %	219851225
12591	NC_011832	GAC	2	6	554254	554259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851225
12592	NC_011832	AGA	2	6	554277	554282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851225
12593	NC_011832	GTC	2	6	554293	554298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851225
12594	NC_011832	CAG	2	6	554320	554325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851225
12595	NC_011832	TGA	2	6	554337	554342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851225
12596	NC_011832	CGGC	2	8	554348	554355	0 %	0 %	50 %	50 %	219851225
12597	NC_011832	CCT	2	6	554378	554383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851225
12598	NC_011832	TCT	2	6	554475	554480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851225
12599	NC_011832	TGG	2	6	554505	554510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851225
12600	NC_011832	ACC	2	6	554534	554539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851225
12601	NC_011832	TCT	2	6	554544	554549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851225
12602	NC_011832	GTT	2	6	554585	554590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851225
12603	NC_011832	ATA	2	6	554639	554644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219851225
12604	NC_011832	TCG	2	6	554671	554676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_011832	T	7	7	554686	554692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_011832	CT	3	6	554845	554850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12607	NC_011832	CTGGT	2	10	554915	554924	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12608	NC_011832	TAC	2	6	555012	555017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_011832	AAC	2	6	555041	555046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_011832	TCT	2	6	555047	555052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_011832	TAT	2	6	555058	555063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_011832	A	6	6	555177	555182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_011832	CTT	2	6	555318	555323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851226
12614	NC_011832	C	7	7	555430	555436	0 %	0 %	0 %	100 %	219851226
12615	NC_011832	TCAT	2	8	555488	555495	25 %	50 %	0 %	25 %	219851226
12616	NC_011832	GA	3	6	555518	555523	50 %	0 %	50 %	0 %	219851226
12617	NC_011832	TCAC	2	8	555599	555606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12618	NC_011832	TCC	2	6	555700	555705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12619	NC_011832	TGA	2	6	555715	555720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_011832	GAA	2	6	555728	555733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851227
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12726	NC_011832	TA	3	6	560448	560453	50 %	50 %	0 %	0 %	219851231
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12744	NC_011832	GAA	2	6	561037	561042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851231
12745	NC_011832	GCC	2	6	561065	561070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851231
12746	NC_011832	GCG	2	6	561105	561110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851231
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12845	NC_011832	GA	3	6	565927	565932	50 %	0 %	50 %	0 %	219851235
12846	NC_011832	GATCT	2	10	565934	565943	20 %	40 %	20 %	20 %	219851235
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12986	NC_011832	GGA	2	6	572036	572041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851240
12987	NC_011832	GAT	2	6	572217	572222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851240
12988	NC_011832	CGC	2	6	572281	572286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851240
12989	NC_011832	TCAG	2	8	572362	572369	25 %	25 %	25 %	25 %	219851240
12990	NC_011832	GTG	2	6	572421	572426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851240
12991	NC_011832	GATCAG	2	12	572429	572440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219851240
12992	NC_011832	ATC	2	6	572443	572448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851240
12993	NC_011832	TCA	2	6	572491	572496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851240
12994	NC_011832	ATC	2	6	572509	572514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851240
12995	NC_011832	TCT	2	6	572573	572578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851240
12996	NC_011832	CTG	2	6	572601	572606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851240
12997	NC_011832	GGCA	2	8	572626	572633	25 %	0 %	50 %	25 %	219851240
12998	NC_011832	ATC	2	6	572716	572721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851240
12999	NC_011832	TCA	2	6	572894	572899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851240
13000	NC_011832	TCC	2	6	572953	572958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851240

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