MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011832	CTC	2	6	505263	505268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851162
11502	NC_011832	TCA	2	6	505271	505276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851162
11503	NC_011832	GAG	2	6	505308	505313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851162
11504	NC_011832	GAG	2	6	505317	505322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851162
11505	NC_011832	AAG	2	6	505372	505377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851162
11506	NC_011832	GA	3	6	505449	505454	50 %	0 %	50 %	0 %	219851162
11507	NC_011832	TAG	2	6	505474	505479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851162
11508	NC_011832	GTT	2	6	505488	505493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851162
11509	NC_011832	GAT	2	6	505575	505580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851162
11510	NC_011832	ACC	2	6	505591	505596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851162
11511	NC_011832	TCT	2	6	505601	505606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851162
11512	NC_011832	ATC	2	6	505654	505659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851162
11513	NC_011832	GGA	2	6	505694	505699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851162
11514	NC_011832	CCA	2	6	505721	505726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851162
11515	NC_011832	AGAT	2	8	505759	505766	50 %	25 %	25 %	0 %	219851162
11516	NC_011832	CCG	2	6	505970	505975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851162
11517	NC_011832	ATGT	2	8	506102	506109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_011832	ATC	2	6	506143	506148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_011832	GATC	2	8	506166	506173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11520	NC_011832	CTT	2	6	506220	506225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851163
11521	NC_011832	CTG	2	6	506233	506238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851163
11522	NC_011832	GCTC	2	8	506243	506250	0 %	25 %	25 %	50 %	219851163
11523	NC_011832	TCC	2	6	506270	506275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851163
11524	NC_011832	TCT	2	6	506372	506377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851163
11525	NC_011832	TGG	2	6	506418	506423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851163
11526	NC_011832	ATC	2	6	506464	506469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851163
11527	NC_011832	TCTTCC	2	12	506519	506530	0 %	50 %	0 %	50 %	219851163
11528	NC_011832	G	6	6	506586	506591	0 %	0 %	100 %	0 %	219851163
11529	NC_011832	TCA	2	6	506606	506611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851163
11530	NC_011832	ATC	2	6	506638	506643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851163
11531	NC_011832	CTC	2	6	506677	506682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851163
11532	NC_011832	TTC	2	6	506689	506694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851163
11533	NC_011832	CT	3	6	506719	506724	0 %	50 %	0 %	50 %	219851163
11534	NC_011832	TCG	2	6	506837	506842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851163
11535	NC_011832	TCTG	2	8	506864	506871	0 %	50 %	25 %	25 %	219851163
11536	NC_011832	GTT	2	6	506883	506888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851163
11537	NC_011832	GGGA	2	8	506900	506907	25 %	0 %	75 %	0 %	219851163
11538	NC_011832	TTC	2	6	506925	506930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851164
11539	NC_011832	GAG	2	6	507114	507119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851164
11540	NC_011832	TGCTGG	2	12	507184	507195	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219851164
11541	NC_011832	TC	3	6	507242	507247	0 %	50 %	0 %	50 %	219851164
11542	NC_011832	GGTC	2	8	507266	507273	0 %	25 %	50 %	25 %	219851164
11543	NC_011832	ATC	2	6	507336	507341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851164
11544	NC_011832	TC	3	6	507381	507386	0 %	50 %	0 %	50 %	219851164
11545	NC_011832	TCC	2	6	507391	507396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851164
11546	NC_011832	CTG	2	6	507444	507449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851164
11547	NC_011832	GC	3	6	507487	507492	0 %	0 %	50 %	50 %	219851164
11548	NC_011832	CT	3	6	507499	507504	0 %	50 %	0 %	50 %	219851164
11549	NC_011832	CTG	2	6	507510	507515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851164
11550	NC_011832	G	6	6	507532	507537	0 %	0 %	100 %	0 %	219851164
11551	NC_011832	TCT	2	6	507613	507618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_011832	TGA	2	6	507839	507844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851165
11553	NC_011832	GGT	2	6	507854	507859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851165
11554	NC_011832	AGGA	2	8	507954	507961	50 %	0 %	50 %	0 %	219851165
11555	NC_011832	AG	3	6	507976	507981	50 %	0 %	50 %	0 %	219851166
11556	NC_011832	TGA	2	6	508089	508094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851166
11557	NC_011832	CAA	2	6	508108	508113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851166
11558	NC_011832	CCTGTC	2	12	508134	508145	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	219851166
11559	NC_011832	TGG	2	6	508225	508230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851166
11560	NC_011832	TGC	2	6	508263	508268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851166
11561	NC_011832	C	6	6	508307	508312	0 %	0 %	0 %	100 %	219851166
11562	NC_011832	AGG	2	6	508332	508337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851166
11563	NC_011832	GCA	2	6	508342	508347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851166
11564	NC_011832	CTGTC	2	10	508390	508399	0 %	40 %	20 %	40 %	219851166
11565	NC_011832	GACCGG	2	12	508457	508468	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219851166
11566	NC_011832	TTC	2	6	508478	508483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851166
11567	NC_011832	T	7	7	508495	508501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_011832	CAA	2	6	508574	508579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851167
11569	NC_011832	ATC	2	6	508592	508597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851167
11570	NC_011832	GAA	2	6	508603	508608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851167
11571	NC_011832	GAT	2	6	508634	508639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851167
11572	NC_011832	TGCGC	2	10	508699	508708	0 %	20 %	40 %	40 %	219851167
11573	NC_011832	CT	3	6	508743	508748	0 %	50 %	0 %	50 %	219851167
11574	NC_011832	CGA	2	6	508762	508767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851167
11575	NC_011832	CCG	2	6	508811	508816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851167
11576	NC_011832	A	6	6	508879	508884	100 %	0 %	0 %	0 %	219851167
11577	NC_011832	GATC	2	8	508888	508895	25 %	25 %	25 %	25 %	219851167
11578	NC_011832	CCCGA	2	10	508928	508937	20 %	0 %	20 %	60 %	219851168
11579	NC_011832	TCT	2	6	508965	508970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851168
11580	NC_011832	T	6	6	508985	508990	0 %	100 %	0 %	0 %	219851168
11581	NC_011832	TC	3	6	509095	509100	0 %	50 %	0 %	50 %	219851168
11582	NC_011832	ATTGC	2	10	509123	509132	20 %	40 %	20 %	20 %	219851168
11583	NC_011832	CCAG	2	8	509133	509140	25 %	0 %	25 %	50 %	219851168
11584	NC_011832	TCCA	2	8	509268	509275	25 %	25 %	0 %	50 %	219851168
11585	NC_011832	GCGG	2	8	509326	509333	0 %	0 %	75 %	25 %	219851168
11586	NC_011832	GTA	2	6	509416	509421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851168
11587	NC_011832	GTCT	2	8	509440	509447	0 %	50 %	25 %	25 %	219851168
11588	NC_011832	AATA	2	8	509471	509478	75 %	25 %	0 %	0 %	219851168
11589	NC_011832	CTG	2	6	509508	509513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_011832	AAT	2	6	509525	509530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_011832	TCT	2	6	509544	509549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_011832	GAT	2	6	509645	509650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_011832	CGGAA	2	10	509672	509681	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11594	NC_011832	A	6	6	509728	509733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_011832	TGT	2	6	509734	509739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_011832	GCA	2	6	509789	509794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851169
11597	NC_011832	CCG	2	6	509845	509850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851169
11598	NC_011832	CGT	2	6	509865	509870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851169
11599	NC_011832	CAG	2	6	509875	509880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851169
11600	NC_011832	GATC	2	8	509901	509908	25 %	25 %	25 %	25 %	219851169
11601	NC_011832	CCG	2	6	509945	509950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851169
11602	NC_011832	GCT	2	6	509954	509959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851169
11603	NC_011832	CCG	2	6	509996	510001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851169
11604	NC_011832	CCGT	3	12	510007	510018	0 %	25 %	25 %	50 %	219851169
11605	NC_011832	GCCC	2	8	510090	510097	0 %	0 %	25 %	75 %	219851169
11606	NC_011832	ATCACG	2	12	510116	510127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219851169
11607	NC_011832	CCT	2	6	510132	510137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851169
11608	NC_011832	GGC	2	6	510166	510171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851169
11609	NC_011832	TGG	2	6	510203	510208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851169
11610	NC_011832	CAG	2	6	510246	510251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851169
11611	NC_011832	CGG	2	6	510291	510296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851169
11612	NC_011832	GAC	2	6	510340	510345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851169
11613	NC_011832	GCT	2	6	510417	510422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851169
11614	NC_011832	CCG	2	6	510437	510442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851169
11615	NC_011832	CCG	2	6	510473	510478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851169
11616	NC_011832	CTT	2	6	510552	510557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851169
11617	NC_011832	GGA	2	6	510576	510581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851169
11618	NC_011832	CCG	2	6	510596	510601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851169
11619	NC_011832	TGA	2	6	510645	510650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851169
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11860	NC_011832	GTA	2	6	522442	522447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851182
11861	NC_011832	CCA	2	6	522454	522459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851182
11862	NC_011832	TGA	2	6	522470	522475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851182
11863	NC_011832	CGA	2	6	522488	522493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851182
11864	NC_011832	TCG	2	6	522562	522567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851182
11865	NC_011832	CCTT	2	8	522601	522608	0 %	50 %	0 %	50 %	219851182
11866	NC_011832	CTC	2	6	522702	522707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851182
11867	NC_011832	GGA	2	6	522716	522721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851182
11868	NC_011832	CCA	2	6	522802	522807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851182
11869	NC_011832	CGAT	2	8	522848	522855	25 %	25 %	25 %	25 %	219851182
11870	NC_011832	ACG	2	6	522940	522945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851182
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11875	NC_011832	ATG	2	6	523223	523228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11879	NC_011832	GCG	2	6	523324	523329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851183
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11894	NC_011832	TCCA	2	8	523868	523875	25 %	25 %	0 %	50 %	219851183
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11964	NC_011832	CTG	2	6	527255	527260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
11965	NC_011832	CTG	2	6	527276	527281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
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11969	NC_011832	CGG	2	6	527420	527425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851186
11970	NC_011832	TCT	2	6	527466	527471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851186
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11975	NC_011832	CGA	2	6	527599	527604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851186
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11977	NC_011832	GAC	2	6	527758	527763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851186
11978	NC_011832	CCTT	2	8	527790	527797	0 %	50 %	0 %	50 %	219851186
11979	NC_011832	TCG	2	6	527823	527828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851186
11980	NC_011832	CGC	2	6	527854	527859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851186
11981	NC_011832	ATC	2	6	527891	527896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851186
11982	NC_011832	TGA	2	6	528003	528008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851186
11983	NC_011832	CTC	2	6	528026	528031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851186
11984	NC_011832	ACC	2	6	528053	528058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851186
11985	NC_011832	ACC	2	6	528077	528082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851186
11986	NC_011832	T	6	6	528150	528155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11987	NC_011832	GATC	2	8	528168	528175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11988	NC_011832	TCT	2	6	528215	528220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11989	NC_011832	GAT	2	6	528243	528248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11990	NC_011832	TG	3	6	528330	528335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11991	NC_011832	GACT	2	8	528366	528373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11992	NC_011832	TGA	2	6	528380	528385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11993	NC_011832	AGA	2	6	528591	528596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851187
11994	NC_011832	TGA	2	6	528624	528629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851187
11995	NC_011832	GCC	2	6	528676	528681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851187
11996	NC_011832	CTG	2	6	528704	528709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851187
11997	NC_011832	TCG	2	6	528743	528748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851187
11998	NC_011832	CAA	2	6	528894	528899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851188
11999	NC_011832	ATC	2	6	528907	528912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851188
12000	NC_011832	CTC	2	6	528958	528963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851188

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