MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011832	GCT	2	6	483330	483335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851146
11002	NC_011832	CTGG	2	8	483354	483361	0 %	25 %	50 %	25 %	219851146
11003	NC_011832	TCT	2	6	483404	483409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851146
11004	NC_011832	TCC	2	6	483410	483415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851146
11005	NC_011832	ATC	2	6	483451	483456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851146
11006	NC_011832	TGG	2	6	483537	483542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851146
11007	NC_011832	TCGGCG	2	12	483608	483619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219851146
11008	NC_011832	ATCT	2	8	483625	483632	25 %	50 %	0 %	25 %	219851146
11009	NC_011832	GAT	2	6	483666	483671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851146
11010	NC_011832	TTC	2	6	483803	483808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851146
11011	NC_011832	CGA	2	6	483809	483814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851146
11012	NC_011832	TCA	2	6	483815	483820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851146
11013	NC_011832	ACC	2	6	483823	483828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851146
11014	NC_011832	GAG	2	6	483829	483834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851146
11015	NC_011832	GAA	2	6	483840	483845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851146
11016	NC_011832	CTC	2	6	483852	483857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851146
11017	NC_011832	TCC	2	6	483917	483922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851146
11018	NC_011832	ATC	2	6	483940	483945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851146
11019	NC_011832	GGCAG	2	10	483967	483976	20 %	0 %	60 %	20 %	219851146
11020	NC_011832	GA	3	6	483980	483985	50 %	0 %	50 %	0 %	219851146
11021	NC_011832	GGT	2	6	484008	484013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851146
11022	NC_011832	TC	3	6	484016	484021	0 %	50 %	0 %	50 %	219851146
11023	NC_011832	ACC	2	6	484070	484075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851146
11024	NC_011832	CT	3	6	484084	484089	0 %	50 %	0 %	50 %	219851146
11025	NC_011832	ATCT	2	8	484174	484181	25 %	50 %	0 %	25 %	219851146
11026	NC_011832	CAA	2	6	484224	484229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851147
11027	NC_011832	CTC	2	6	484364	484369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851147
11028	NC_011832	G	7	7	484417	484423	0 %	0 %	100 %	0 %	219851147
11029	NC_011832	CTT	2	6	484426	484431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851147
11030	NC_011832	TGC	2	6	484576	484581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851147
11031	NC_011832	GAG	2	6	484628	484633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851147
11032	NC_011832	CCCTCT	2	12	484659	484670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851147
11033	NC_011832	TGG	2	6	484672	484677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851147
11034	NC_011832	GCA	3	9	484678	484686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851147
11035	NC_011832	GATG	2	8	484735	484742	25 %	25 %	50 %	0 %	219851147
11036	NC_011832	CCA	2	6	484770	484775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851147
11037	NC_011832	CT	3	6	484802	484807	0 %	50 %	0 %	50 %	219851147
11038	NC_011832	ATC	2	6	484823	484828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851147
11039	NC_011832	GCA	2	6	484843	484848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851147
11040	NC_011832	ACC	2	6	484913	484918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851147
11041	NC_011832	GAA	2	6	485018	485023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851148
11042	NC_011832	TGC	2	6	485067	485072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851148
11043	NC_011832	AGA	2	6	485133	485138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851148
11044	NC_011832	GAT	2	6	485224	485229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851148
11045	NC_011832	TAT	2	6	485303	485308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851148
11046	NC_011832	CGG	2	6	485310	485315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851148
11047	NC_011832	CCA	2	6	485415	485420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851148
11048	NC_011832	CT	3	6	485423	485428	0 %	50 %	0 %	50 %	219851148
11049	NC_011832	CGA	2	6	485514	485519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851148
11050	NC_011832	CG	3	6	485548	485553	0 %	0 %	50 %	50 %	219851148
11051	NC_011832	C	6	6	485647	485652	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11052	NC_011832	TG	3	6	485665	485670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_011832	CAG	2	6	485729	485734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_011832	TCT	2	6	485764	485769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_011832	CT	3	6	485807	485812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11056	NC_011832	TCG	2	6	485823	485828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_011832	TC	3	6	485876	485881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11058	NC_011832	TC	3	6	485907	485912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_011832	CT	3	6	485944	485949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11060	NC_011832	GA	3	6	485964	485969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_011832	TCTCA	2	10	485982	485991	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11062	NC_011832	AATA	2	8	486013	486020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_011832	ACA	2	6	486030	486035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_011832	CGA	2	6	486049	486054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_011832	TGT	2	6	486078	486083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_011832	ATC	2	6	486182	486187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851149
11067	NC_011832	TTG	2	6	486258	486263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851149
11068	NC_011832	C	6	6	486280	486285	0 %	0 %	0 %	100 %	219851149
11069	NC_011832	TCC	2	6	486291	486296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851149
11070	NC_011832	GAC	2	6	486376	486381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851149
11071	NC_011832	ACC	2	6	486407	486412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851149
11072	NC_011832	ATC	3	9	486425	486433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851149
11073	NC_011832	CAC	2	6	486514	486519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851149
11074	NC_011832	GAA	2	6	486523	486528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851149
11075	NC_011832	TCT	2	6	486549	486554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851149
11076	NC_011832	TAT	2	6	486569	486574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219851149
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11080	NC_011832	GAG	2	6	486764	486769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851149
11081	NC_011832	GCT	2	6	486778	486783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851149
11082	NC_011832	GGA	2	6	486784	486789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851149
11083	NC_011832	TCA	2	6	486792	486797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851149
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11085	NC_011832	AAC	2	6	486884	486889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851149
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11087	NC_011832	ATC	2	6	486926	486931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851149
11088	NC_011832	GAT	2	6	486946	486951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851149
11089	NC_011832	GGA	2	6	487068	487073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851149
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11091	NC_011832	T	7	7	487095	487101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_011832	CCCT	2	8	487136	487143	0 %	25 %	0 %	75 %	219851150
11093	NC_011832	TCT	2	6	487146	487151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851150
11094	NC_011832	GAA	2	6	487164	487169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851150
11095	NC_011832	AGA	2	6	487178	487183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851150
11096	NC_011832	CCCG	2	8	487185	487192	0 %	0 %	25 %	75 %	219851150
11097	NC_011832	GTG	2	6	487198	487203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851150
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11100	NC_011832	GCCT	2	8	487471	487478	0 %	25 %	25 %	50 %	219851150
11101	NC_011832	CTT	2	6	487547	487552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851150
11102	NC_011832	GAG	2	6	487554	487559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851150
11103	NC_011832	TC	3	6	487569	487574	0 %	50 %	0 %	50 %	219851150
11104	NC_011832	CTG	2	6	487581	487586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851150
11105	NC_011832	GAGG	2	8	487728	487735	25 %	0 %	75 %	0 %	219851150
11106	NC_011832	CGAC	2	8	487748	487755	25 %	0 %	25 %	50 %	219851150
11107	NC_011832	GGA	2	6	487862	487867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851150
11108	NC_011832	ACAT	2	8	487930	487937	50 %	25 %	0 %	25 %	219851150
11109	NC_011832	AT	3	6	487963	487968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_011832	AGT	2	6	487969	487974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_011832	TCT	2	6	488024	488029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_011832	AG	3	6	488074	488079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_011832	TAT	2	6	488152	488157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_011832	CGCT	2	8	488209	488216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11115	NC_011832	GGCT	3	12	488258	488269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11116	NC_011832	CGA	2	6	488272	488277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_011832	TTCG	2	8	488279	488286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11118	NC_011832	TCG	2	6	488293	488298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_011832	ATCGA	2	10	488325	488334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11120	NC_011832	CCTGA	2	10	488344	488353	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11121	NC_011832	GATC	2	8	488359	488366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11123	NC_011832	GGT	2	6	488386	488391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851151
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11243	NC_011832	TGA	2	6	493316	493321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851153
11244	NC_011832	CGT	3	9	493367	493375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851153
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11246	NC_011832	TCGA	2	8	493467	493474	25 %	25 %	25 %	25 %	219851153
11247	NC_011832	GGT	2	6	493550	493555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851153
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11385	NC_011832	CCGAT	2	10	499729	499738	20 %	20 %	20 %	40 %	219851155
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11394	NC_011832	GAG	2	6	500156	500161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11456	NC_011832	CTGTG	2	10	503081	503090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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11478	NC_011832	GCCG	2	8	504514	504521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11479	NC_011832	A	6	6	504597	504602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11480	NC_011832	TTA	4	12	504603	504614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11482	NC_011832	CTT	2	6	504636	504641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851161
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11488	NC_011832	TG	3	6	504742	504747	0 %	50 %	50 %	0 %	219851161
11489	NC_011832	CCT	2	6	504785	504790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11490	NC_011832	T	6	6	504793	504798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11491	NC_011832	CAT	2	6	504819	504824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851162
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11495	NC_011832	CAG	3	9	504933	504941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851162
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