MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011832	CAA	2	6	460113	460118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851107
10502	NC_011832	TCC	2	6	460172	460177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851107
10503	NC_011832	TGA	2	6	460205	460210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851107
10504	NC_011832	CAG	2	6	460259	460264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851107
10505	NC_011832	CAT	2	6	460279	460284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851107
10506	NC_011832	AGCA	2	8	460321	460328	50 %	0 %	25 %	25 %	219851107
10507	NC_011832	GAT	2	6	460331	460336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851107
10508	NC_011832	GGC	2	6	460369	460374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851108
10509	NC_011832	GCAG	2	8	460466	460473	25 %	0 %	50 %	25 %	219851108
10510	NC_011832	TCG	2	6	460507	460512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851108
10511	NC_011832	GTG	2	6	460535	460540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851108
10512	NC_011832	GAA	2	6	460560	460565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851108
10513	NC_011832	GGT	2	6	460600	460605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851108
10514	NC_011832	AGA	2	6	460631	460636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851108
10515	NC_011832	AAGA	2	8	460657	460664	75 %	0 %	25 %	0 %	219851108
10516	NC_011832	GCA	2	6	460693	460698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851108
10517	NC_011832	ATC	2	6	460801	460806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851108
10518	NC_011832	AAG	2	6	460861	460866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851108
10519	NC_011832	AGC	2	6	460907	460912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851108
10520	NC_011832	CTG	2	6	460921	460926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851108
10521	NC_011832	GCA	2	6	460954	460959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851108
10522	NC_011832	CTG	2	6	461011	461016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851108
10523	NC_011832	CAGG	2	8	461029	461036	25 %	0 %	50 %	25 %	219851108
10524	NC_011832	GA	3	6	461080	461085	50 %	0 %	50 %	0 %	219851108
10525	NC_011832	GAT	2	6	461087	461092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851108
10526	NC_011832	GAT	2	6	461123	461128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851109
10527	NC_011832	TTC	2	6	461211	461216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851109
10528	NC_011832	ATG	2	6	461221	461226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851109
10529	NC_011832	TGA	2	6	461245	461250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851109
10530	NC_011832	AAG	2	6	461265	461270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851109
10531	NC_011832	CCGT	2	8	461456	461463	0 %	25 %	25 %	50 %	219851110
10532	NC_011832	TCA	2	6	461468	461473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851110
10533	NC_011832	AAG	2	6	461539	461544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851110
10534	NC_011832	CTG	2	6	461551	461556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851110
10535	NC_011832	TCGGTG	2	12	461570	461581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219851110
10536	NC_011832	CGG	2	6	461691	461696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851110
10537	NC_011832	GTG	2	6	461714	461719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851110
10538	NC_011832	ATC	3	9	461728	461736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851110
10539	NC_011832	CGGT	2	8	461813	461820	0 %	25 %	50 %	25 %	219851110
10540	NC_011832	GGT	2	6	461830	461835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851110
10541	NC_011832	AAG	2	6	461869	461874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851110
10542	NC_011832	TGG	4	12	461952	461963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851110
10543	NC_011832	TCA	2	6	461964	461969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851110
10544	NC_011832	GAA	2	6	462014	462019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851110
10545	NC_011832	GGTT	2	8	462021	462028	0 %	50 %	50 %	0 %	219851110
10546	NC_011832	TGC	2	6	462033	462038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851110
10547	NC_011832	GAA	2	6	462050	462055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851110
10548	NC_011832	GAA	2	6	462077	462082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851111
10549	NC_011832	AGA	2	6	462088	462093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851111
10550	NC_011832	AGA	2	6	462140	462145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851111
10551	NC_011832	GGCGAT	2	12	462152	462163	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219851111
10552	NC_011832	TCC	2	6	462172	462177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851111
10553	NC_011832	TC	3	6	462218	462223	0 %	50 %	0 %	50 %	219851111
10554	NC_011832	TCC	2	6	462301	462306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851111
10555	NC_011832	GAT	2	6	462311	462316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851111
10556	NC_011832	GAGATC	2	12	462324	462335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219851111
10557	NC_011832	CCAG	2	8	462368	462375	25 %	0 %	25 %	50 %	219851111
10558	NC_011832	TGA	2	6	462483	462488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851111
10559	NC_011832	GCA	2	6	462494	462499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851112
10560	NC_011832	CAAAG	2	10	462541	462550	60 %	0 %	20 %	20 %	219851112
10561	NC_011832	TCA	2	6	462600	462605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851112
10562	NC_011832	AAG	2	6	462611	462616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851112
10563	NC_011832	GTC	2	6	462647	462652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851112
10564	NC_011832	AAG	2	6	462659	462664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851112
10565	NC_011832	CGGT	2	8	462730	462737	0 %	25 %	50 %	25 %	219851112
10566	NC_011832	AGAA	2	8	462785	462792	75 %	0 %	25 %	0 %	219851112
10567	NC_011832	TCAT	2	8	462831	462838	25 %	50 %	0 %	25 %	219851112
10568	NC_011832	TTC	2	6	462872	462877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851112
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10570	NC_011832	GA	3	6	462912	462917	50 %	0 %	50 %	0 %	219851112
10571	NC_011832	AG	3	6	462941	462946	50 %	0 %	50 %	0 %	219851112
10572	NC_011832	GA	3	6	462965	462970	50 %	0 %	50 %	0 %	219851113
10573	NC_011832	TCG	2	6	462975	462980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851113
10574	NC_011832	CGG	2	6	463045	463050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851113
10575	NC_011832	C	6	6	463068	463073	0 %	0 %	0 %	100 %	219851113
10576	NC_011832	ACC	2	6	463166	463171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851113
10577	NC_011832	CAG	2	6	463202	463207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851113
10578	NC_011832	CCG	2	6	463306	463311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851113
10579	NC_011832	GTC	2	6	463343	463348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851113
10580	NC_011832	GCAATC	2	12	463454	463465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219851113
10581	NC_011832	ATC	2	6	463499	463504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851113
10582	NC_011832	CCG	2	6	463505	463510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851113
10583	NC_011832	AAG	2	6	463550	463555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851113
10584	NC_011832	GGT	2	6	463588	463593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851113
10585	NC_011832	GAG	2	6	463604	463609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851113
10586	NC_011832	GGT	2	6	463772	463777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851114
10587	NC_011832	GTCA	2	8	463882	463889	25 %	25 %	25 %	25 %	219851115
10588	NC_011832	TGG	2	6	463913	463918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851115
10589	NC_011832	CAAA	2	8	463939	463946	75 %	0 %	0 %	25 %	219851115
10590	NC_011832	ATC	2	6	463960	463965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851115
10591	NC_011832	GGGGT	2	10	464000	464009	0 %	20 %	80 %	0 %	219851115
10592	NC_011832	AAG	2	6	464106	464111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851115
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10595	NC_011832	TACG	2	8	464313	464320	25 %	25 %	25 %	25 %	219851116
10596	NC_011832	CCCT	2	8	464369	464376	0 %	25 %	0 %	75 %	219851116
10597	NC_011832	CAC	2	6	464438	464443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851116
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10599	NC_011832	GTC	2	6	464561	464566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851117
10600	NC_011832	GGC	2	6	464595	464600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851117
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10602	NC_011832	GAG	2	6	464662	464667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851117
10603	NC_011832	AGA	2	6	464697	464702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851117
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10605	NC_011832	CGA	2	6	464853	464858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851117
10606	NC_011832	GGT	2	6	464871	464876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_011832	AGC	2	6	464912	464917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851118
10608	NC_011832	ATG	2	6	464930	464935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851118
10609	NC_011832	CAGCG	2	10	464947	464956	20 %	0 %	40 %	40 %	219851118
10610	NC_011832	CGCT	2	8	464972	464979	0 %	25 %	25 %	50 %	219851118
10611	NC_011832	CGTG	2	8	465282	465289	0 %	25 %	50 %	25 %	219851119
10612	NC_011832	AGA	2	6	465301	465306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851119
10613	NC_011832	GGCA	2	8	465349	465356	25 %	0 %	50 %	25 %	219851119
10614	NC_011832	TCGA	2	8	465570	465577	25 %	25 %	25 %	25 %	219851119
10615	NC_011832	TGG	2	6	465632	465637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851119
10616	NC_011832	AGA	2	6	465680	465685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851119
10617	NC_011832	AGG	2	6	465766	465771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851119
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10978	NC_011832	TGA	2	6	482255	482260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10980	NC_011832	A	6	6	482312	482317	100 %	0 %	0 %	0 %	219851146
10981	NC_011832	TTC	2	6	482335	482340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851146
10982	NC_011832	CTCTTC	2	12	482419	482430	0 %	50 %	0 %	50 %	219851146
10983	NC_011832	CTG	2	6	482548	482553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851146
10984	NC_011832	C	7	7	482626	482632	0 %	0 %	0 %	100 %	219851146
10985	NC_011832	ATC	2	6	482644	482649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851146
10986	NC_011832	CTG	2	6	482665	482670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851146
10987	NC_011832	TCCG	2	8	482679	482686	0 %	25 %	25 %	50 %	219851146
10988	NC_011832	TTC	2	6	482698	482703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851146
10989	NC_011832	CGA	2	6	482804	482809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851146
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10991	NC_011832	CAT	2	6	482946	482951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851146
10992	NC_011832	CG	3	6	482965	482970	0 %	0 %	50 %	50 %	219851146
10993	NC_011832	GA	3	6	482975	482980	50 %	0 %	50 %	0 %	219851146
10994	NC_011832	TGA	2	6	482990	482995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851146
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10997	NC_011832	CTG	3	9	483145	483153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851146
10998	NC_011832	GAA	2	6	483231	483236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851146
10999	NC_011832	GTC	2	6	483283	483288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851146
11000	NC_011832	ATC	2	6	483295	483300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851146

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