MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011832	CGA	2	6	437443	437448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851086
10002	NC_011832	TCGCCA	2	12	437451	437462	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219851086
10003	NC_011832	GGCT	2	8	437522	437529	0 %	25 %	50 %	25 %	219851086
10004	NC_011832	TC	3	6	437533	437538	0 %	50 %	0 %	50 %	219851086
10005	NC_011832	CTCG	2	8	437548	437555	0 %	25 %	25 %	50 %	219851086
10006	NC_011832	CGG	2	6	437568	437573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851086
10007	NC_011832	GT	3	6	437586	437591	0 %	50 %	50 %	0 %	219851086
10008	NC_011832	T	6	6	437634	437639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_011832	CGT	2	6	437673	437678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_011832	ATC	2	6	437690	437695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_011832	CCT	2	6	437862	437867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851087
10012	NC_011832	AT	3	6	437960	437965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_011832	TTC	2	6	438040	438045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_011832	TGT	2	6	438059	438064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851088
10015	NC_011832	AGC	2	6	438079	438084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851088
10016	NC_011832	GCG	2	6	438100	438105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851088
10017	NC_011832	GTG	2	6	438129	438134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851088
10018	NC_011832	CAA	2	6	438216	438221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10019	NC_011832	TCA	2	6	438254	438259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851088
10020	NC_011832	ACA	2	6	438356	438361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10021	NC_011832	TACC	2	8	438390	438397	25 %	25 %	0 %	50 %	219851088
10022	NC_011832	TTCTC	2	10	438436	438445	0 %	60 %	0 %	40 %	219851088
10023	NC_011832	TCG	2	6	438536	438541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851088
10024	NC_011832	AGT	2	6	438553	438558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851088
10025	NC_011832	CGAT	2	8	438599	438606	25 %	25 %	25 %	25 %	219851088
10026	NC_011832	ACC	2	6	438641	438646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851088
10027	NC_011832	CAA	2	6	438780	438785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10028	NC_011832	AAC	2	6	438922	438927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10029	NC_011832	TC	3	6	438955	438960	0 %	50 %	0 %	50 %	219851088
10030	NC_011832	CGA	2	6	438992	438997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851088
10031	NC_011832	CGG	3	9	438998	439006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851088
10032	NC_011832	AGTGG	2	10	439028	439037	20 %	20 %	60 %	0 %	219851088
10033	NC_011832	CAA	2	6	439116	439121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10034	NC_011832	TCA	2	6	439154	439159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851088
10035	NC_011832	ACA	2	6	439256	439261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10036	NC_011832	TACC	2	8	439290	439297	25 %	25 %	0 %	50 %	219851088
10037	NC_011832	TCG	2	6	439436	439441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851088
10038	NC_011832	AGT	2	6	439453	439458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851088
10039	NC_011832	CGAT	2	8	439499	439506	25 %	25 %	25 %	25 %	219851088
10040	NC_011832	ACC	2	6	439541	439546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851088
10041	NC_011832	CAA	2	6	439680	439685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10042	NC_011832	CGA	2	6	439880	439885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851088
10043	NC_011832	TCA	2	6	439946	439951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851088
10044	NC_011832	CG	3	6	439955	439960	0 %	0 %	50 %	50 %	219851088
10045	NC_011832	GAA	2	6	439998	440003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851088
10046	NC_011832	CT	4	8	440035	440042	0 %	50 %	0 %	50 %	219851088
10047	NC_011832	TC	3	6	440075	440080	0 %	50 %	0 %	50 %	219851088
10048	NC_011832	CTGG	2	8	440084	440091	0 %	25 %	50 %	25 %	219851088
10049	NC_011832	AGA	2	6	440099	440104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851088
10050	NC_011832	CCG	2	6	440117	440122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851088
10051	NC_011832	ACCATC	2	12	440194	440205	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	219851088
10052	NC_011832	TC	3	6	440232	440237	0 %	50 %	0 %	50 %	219851088
10053	NC_011832	CAT	2	6	440238	440243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851088
10054	NC_011832	CGA	2	6	440256	440261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851088
10055	NC_011832	CAC	2	6	440282	440287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851088
10056	NC_011832	TCG	2	6	440291	440296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851088
10057	NC_011832	CAACGG	2	12	440394	440405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851088
10058	NC_011832	CAA	2	6	440439	440444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10059	NC_011832	CAA	2	6	440490	440495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10060	NC_011832	CAA	2	6	440535	440540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851088
10061	NC_011832	T	6	6	440552	440557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_011832	AGA	2	6	440561	440566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_011832	GCA	2	6	440592	440597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851089
10064	NC_011832	TCGC	2	8	440614	440621	0 %	25 %	25 %	50 %	219851089
10065	NC_011832	ACC	2	6	440626	440631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851089
10066	NC_011832	GCT	2	6	440751	440756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851089
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10069	NC_011832	CGG	2	6	440799	440804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851089
10070	NC_011832	CGC	2	6	440874	440879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851089
10071	NC_011832	GGT	2	6	440901	440906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851089
10072	NC_011832	AGG	2	6	440987	440992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851089
10073	NC_011832	AGG	2	6	441044	441049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851089
10074	NC_011832	TCC	2	6	441053	441058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851089
10075	NC_011832	GCC	2	6	441187	441192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851089
10076	NC_011832	CAGAA	2	10	441244	441253	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10077	NC_011832	CTC	2	6	441287	441292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10078	NC_011832	GGC	2	6	441391	441396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851090
10079	NC_011832	GGC	2	6	441409	441414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851090
10080	NC_011832	CGG	2	6	441425	441430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851090
10081	NC_011832	GAG	2	6	441440	441445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851090
10082	NC_011832	GTC	2	6	441455	441460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851090
10083	NC_011832	ACG	2	6	441465	441470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851090
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10085	NC_011832	GGGAA	2	10	441515	441524	40 %	0 %	60 %	0 %	219851090
10086	NC_011832	GATC	2	8	441628	441635	25 %	25 %	25 %	25 %	219851090
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10089	NC_011832	CCGAA	2	10	441849	441858	40 %	0 %	20 %	40 %	219851090
10090	NC_011832	CCA	2	6	441865	441870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851090
10091	NC_011832	TCC	2	6	441939	441944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851091
10092	NC_011832	TCGT	2	8	441947	441954	0 %	50 %	25 %	25 %	219851091
10093	NC_011832	GCA	2	6	441981	441986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851091
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10100	NC_011832	CT	3	6	442180	442185	0 %	50 %	0 %	50 %	219851091
10101	NC_011832	TCA	2	6	442257	442262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851091
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10103	NC_011832	TC	3	6	442363	442368	0 %	50 %	0 %	50 %	219851091
10104	NC_011832	CTGGA	2	10	442385	442394	20 %	20 %	40 %	20 %	219851091
10105	NC_011832	TGCA	2	8	442404	442411	25 %	25 %	25 %	25 %	219851091
10106	NC_011832	GCA	2	6	442417	442422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851091
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10109	NC_011832	AGG	2	6	442671	442676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851091
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10115	NC_011832	GGAC	2	8	443075	443082	25 %	0 %	50 %	25 %	219851091
10116	NC_011832	TGG	2	6	443091	443096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851091
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10120	NC_011832	ATCG	2	8	443372	443379	25 %	25 %	25 %	25 %	219851092
10121	NC_011832	GAA	2	6	443399	443404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851092
10122	NC_011832	CAG	2	6	443417	443422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851092
10123	NC_011832	CATCGA	2	12	443456	443467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219851092
10124	NC_011832	CGA	2	6	443563	443568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851092
10125	NC_011832	AGC	2	6	443583	443588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851092
10126	NC_011832	GA	3	6	443640	443645	50 %	0 %	50 %	0 %	219851092
10127	NC_011832	GAT	3	9	443654	443662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851092
10128	NC_011832	GTT	2	6	443663	443668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219851092
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10132	NC_011832	CGG	2	6	443779	443784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851092
10133	NC_011832	ACG	2	6	443811	443816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851092
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10135	NC_011832	CAG	2	6	443918	443923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851092
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10137	NC_011832	TTC	2	6	444035	444040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851093
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10139	NC_011832	CTT	2	6	444092	444097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851093
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10142	NC_011832	TCCCTT	2	12	444194	444205	0 %	50 %	0 %	50 %	219851093
10143	NC_011832	CTT	3	9	444203	444211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851093
10144	NC_011832	TC	3	6	444232	444237	0 %	50 %	0 %	50 %	219851093
10145	NC_011832	TTC	2	6	444303	444308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851093
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10151	NC_011832	TCG	2	6	444484	444489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851093
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10156	NC_011832	GCTC	2	8	444645	444652	0 %	25 %	25 %	50 %	219851093
10157	NC_011832	CTG	2	6	444719	444724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851093
10158	NC_011832	CGT	2	6	444907	444912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851093
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10162	NC_011832	A	7	7	445042	445048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_011832	GGA	2	6	445078	445083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851094
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10186	NC_011832	TAT	3	9	445781	445789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10187	NC_011832	TGG	2	6	445825	445830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10188	NC_011832	TC	3	6	445835	445840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10189	NC_011832	TGA	2	6	445841	445846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10191	NC_011832	TA	3	6	445863	445868	50 %	50 %	0 %	0 %	219851095
10192	NC_011832	TGA	2	6	445869	445874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851095
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10222	NC_011832	T	6	6	447124	447129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10223	NC_011832	TCC	2	6	447138	447143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10224	NC_011832	AG	3	6	447173	447178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10225	NC_011832	CTC	2	6	447231	447236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851096
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10230	NC_011832	CTGG	2	8	447449	447456	0 %	25 %	50 %	25 %	219851096
10231	NC_011832	CTGAAT	2	12	447459	447470	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219851096
10232	NC_011832	GTG	2	6	447492	447497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851096
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10235	NC_011832	TC	3	6	447613	447618	0 %	50 %	0 %	50 %	219851096
10236	NC_011832	TACCCC	2	12	447704	447715	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	219851096
10237	NC_011832	CT	3	6	447855	447860	0 %	50 %	0 %	50 %	219851096
10238	NC_011832	AGG	2	6	447863	447868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219851096
10239	NC_011832	GCA	2	6	447930	447935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851096
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10241	NC_011832	ACT	2	6	448068	448073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851096
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10243	NC_011832	CGA	2	6	448183	448188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851096
10244	NC_011832	CGA	2	6	448195	448200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851096
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10361	NC_011832	CTGAC	2	10	453792	453801	20 %	20 %	20 %	40 %	219851101
10362	NC_011832	TCGA	2	8	453814	453821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10363	NC_011832	GAA	2	6	453954	453959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10364	NC_011832	GCG	2	6	453987	453992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851102
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10482	NC_011832	TTC	2	6	458929	458934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10483	NC_011832	TCT	2	6	458960	458965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10484	NC_011832	GAG	2	6	459005	459010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10485	NC_011832	GTGG	2	8	459057	459064	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10486	NC_011832	AGA	2	6	459155	459160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10487	NC_011832	AGGA	2	8	459169	459176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10488	NC_011832	CT	3	6	459186	459191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10489	NC_011832	G	6	6	459198	459203	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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