MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011832	CTG	2	6	20604	20609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850708
502	NC_011832	GCTG	2	8	20681	20688	0 %	25 %	50 %	25 %	219850708
503	NC_011832	GAG	2	6	20730	20735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850708
504	NC_011832	CT	3	6	20748	20753	0 %	50 %	0 %	50 %	219850708
505	NC_011832	TCA	2	6	20776	20781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850708
506	NC_011832	TGG	2	6	20801	20806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850708
507	NC_011832	GGC	2	6	20828	20833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850708
508	NC_011832	GTTG	2	8	20888	20895	0 %	50 %	50 %	0 %	219850708
509	NC_011832	GCG	2	6	20976	20981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850708
510	NC_011832	TGGG	2	8	21012	21019	0 %	25 %	75 %	0 %	219850708
511	NC_011832	CTC	2	6	21036	21041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850708
512	NC_011832	GAG	3	9	21108	21116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850708
513	NC_011832	GGA	3	9	21161	21169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850708
514	NC_011832	CGG	2	6	21207	21212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850708
515	NC_011832	TGA	2	6	21223	21228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850708
516	NC_011832	CAC	2	6	21229	21234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850708
517	NC_011832	GGATC	2	10	21338	21347	20 %	20 %	40 %	20 %	219850708
518	NC_011832	AGG	2	6	21397	21402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850708
519	NC_011832	CGA	2	6	21512	21517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850708
520	NC_011832	ATCG	2	8	21563	21570	25 %	25 %	25 %	25 %	219850708
521	NC_011832	TCC	2	6	21577	21582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850708
522	NC_011832	AGG	2	6	21595	21600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850708
523	NC_011832	GAT	2	6	21624	21629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850708
524	NC_011832	CTGG	2	8	21635	21642	0 %	25 %	50 %	25 %	219850708
525	NC_011832	GAG	2	6	21705	21710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850708
526	NC_011832	CGG	2	6	21731	21736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850708
527	NC_011832	TGA	2	6	21742	21747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850708
528	NC_011832	GGT	2	6	21809	21814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850708
529	NC_011832	ATGG	2	8	21819	21826	25 %	25 %	50 %	0 %	219850708
530	NC_011832	AGT	2	6	21874	21879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850708
531	NC_011832	ATCG	2	8	21946	21953	25 %	25 %	25 %	25 %	219850709
532	NC_011832	CAGGTC	2	12	22028	22039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219850709
533	NC_011832	GCC	2	6	22071	22076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850709
534	NC_011832	TCG	2	6	22149	22154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850709
535	NC_011832	CGA	2	6	22180	22185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850709
536	NC_011832	CT	3	6	22203	22208	0 %	50 %	0 %	50 %	219850709
537	NC_011832	GAG	2	6	22247	22252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850709
538	NC_011832	CTC	2	6	22304	22309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850709
539	NC_011832	GAG	2	6	22313	22318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850709
540	NC_011832	GCC	2	6	22413	22418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850709
541	NC_011832	GGC	2	6	22427	22432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850709
542	NC_011832	CTG	2	6	22436	22441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850709
543	NC_011832	AGT	2	6	22477	22482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850709
544	NC_011832	GGC	2	6	22523	22528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850709
545	NC_011832	GGAT	2	8	22547	22554	25 %	25 %	50 %	0 %	219850709
546	NC_011832	CTG	2	6	22555	22560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850709
547	NC_011832	CT	3	6	22577	22582	0 %	50 %	0 %	50 %	219850709
548	NC_011832	CGC	2	6	22592	22597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850709
549	NC_011832	GCC	2	6	22605	22610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850709
550	NC_011832	AGT	2	6	22636	22641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850709
551	NC_011832	CTT	2	6	22661	22666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850709
552	NC_011832	CTGGAA	2	12	22709	22720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219850709
553	NC_011832	CGTC	2	8	22733	22740	0 %	25 %	25 %	50 %	219850709
554	NC_011832	A	8	8	22829	22836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011832	GTG	2	6	22941	22946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850710
556	NC_011832	CGA	2	6	23101	23106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850710
557	NC_011832	CCT	2	6	23143	23148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850710
558	NC_011832	GCCA	2	8	23159	23166	25 %	0 %	25 %	50 %	219850710
559	NC_011832	TGA	2	6	23167	23172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850710
560	NC_011832	GGT	2	6	23174	23179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850710
561	NC_011832	CCA	2	6	23191	23196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850710
562	NC_011832	GCT	2	6	23233	23238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850710
563	NC_011832	GAG	2	6	23291	23296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850710
564	NC_011832	CTCTT	2	10	23310	23319	0 %	60 %	0 %	40 %	219850710
565	NC_011832	CCT	2	6	23326	23331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850710
566	NC_011832	CCG	2	6	23372	23377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850710
567	NC_011832	GCT	2	6	23398	23403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850710
568	NC_011832	CAGGT	2	10	23549	23558	20 %	20 %	40 %	20 %	219850711
569	NC_011832	A	6	6	23589	23594	100 %	0 %	0 %	0 %	219850711
570	NC_011832	TCA	2	6	23597	23602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850711
571	NC_011832	GTT	2	6	23614	23619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850711
572	NC_011832	AGC	2	6	23635	23640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850711
573	NC_011832	TCT	2	6	23700	23705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850711
574	NC_011832	CGT	2	6	23709	23714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
575	NC_011832	AGT	2	6	23775	23780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850711
576	NC_011832	GCT	2	6	23873	23878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
577	NC_011832	GTTCAG	2	12	23929	23940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219850711
578	NC_011832	GA	3	6	23942	23947	50 %	0 %	50 %	0 %	219850711
579	NC_011832	TCG	2	6	23960	23965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
580	NC_011832	TAG	2	6	23975	23980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850711
581	NC_011832	GAG	2	6	24001	24006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850711
582	NC_011832	TCCTT	2	10	24011	24020	0 %	60 %	0 %	40 %	219850711
583	NC_011832	TCCT	2	8	24022	24029	0 %	50 %	0 %	50 %	219850711
584	NC_011832	TCG	2	6	24062	24067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
585	NC_011832	GAT	2	6	24070	24075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850711
586	NC_011832	GCA	2	6	24084	24089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850711
587	NC_011832	TGGA	2	8	24148	24155	25 %	25 %	50 %	0 %	219850711
588	NC_011832	TCG	2	6	24174	24179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
589	NC_011832	TCG	2	6	24257	24262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850711
590	NC_011832	GAG	2	6	24301	24306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850711
591	NC_011832	ACC	2	6	24410	24415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850711
592	NC_011832	GTTC	2	8	24516	24523	0 %	50 %	25 %	25 %	219850711
593	NC_011832	CTC	2	6	24562	24567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850711
594	NC_011832	GGC	2	6	24573	24578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850711
595	NC_011832	GCTTC	2	10	24582	24591	0 %	40 %	20 %	40 %	219850711
596	NC_011832	TCT	2	6	24630	24635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850711
597	NC_011832	TC	3	6	24643	24648	0 %	50 %	0 %	50 %	219850711
598	NC_011832	TCC	2	6	24840	24845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850712
599	NC_011832	GCG	2	6	24935	24940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850712
600	NC_011832	CGA	2	6	24961	24966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850712
601	NC_011832	TCG	2	6	24969	24974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850712
602	NC_011832	T	7	7	25003	25009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011832	TCT	2	6	25041	25046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_011832	ACC	2	6	25140	25145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850713
605	NC_011832	CACT	2	8	25164	25171	25 %	25 %	0 %	50 %	219850713
606	NC_011832	CTG	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850713
607	NC_011832	GTA	2	6	25289	25294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850713
608	NC_011832	CCA	2	6	25332	25337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850713
609	NC_011832	GGCC	2	8	25358	25365	0 %	0 %	50 %	50 %	219850713
610	NC_011832	GAGC	2	8	25397	25404	25 %	0 %	50 %	25 %	219850713
611	NC_011832	GAA	2	6	25408	25413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850713
612	NC_011832	TTC	2	6	25487	25492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850713
613	NC_011832	GCC	2	6	25500	25505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850713
614	NC_011832	ACC	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850713
615	NC_011832	CAG	2	6	25589	25594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850713
616	NC_011832	CAC	2	6	25622	25627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850713
617	NC_011832	CGG	2	6	25687	25692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850713
618	NC_011832	ATC	2	6	25698	25703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850713
619	NC_011832	CAGT	2	8	25753	25760	25 %	25 %	25 %	25 %	219850713
620	NC_011832	CTTCT	2	10	25781	25790	0 %	60 %	0 %	40 %	219850713
621	NC_011832	ATC	2	6	25806	25811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850713
622	NC_011832	TCA	2	6	25825	25830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850713
623	NC_011832	TCG	2	6	25890	25895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850713
624	NC_011832	ATA	2	6	25898	25903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850713
625	NC_011832	CTG	2	6	25942	25947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850714
626	NC_011832	CAC	2	6	26005	26010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850714
627	NC_011832	CCG	2	6	26037	26042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850714
628	NC_011832	CAGTGG	2	12	26090	26101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	219850714
629	NC_011832	TG	3	6	26176	26181	0 %	50 %	50 %	0 %	219850714
630	NC_011832	CCG	2	6	26191	26196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850714
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632	NC_011832	G	6	6	26205	26210	0 %	0 %	100 %	0 %	219850714
633	NC_011832	GCG	2	6	26234	26239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850714
634	NC_011832	TCCAT	2	10	26259	26268	20 %	40 %	0 %	40 %	219850714
635	NC_011832	GA	3	6	26281	26286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011832	A	6	6	26310	26315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011832	ATC	2	6	26332	26337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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639	NC_011832	TCA	2	6	26356	26361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_011832	TCA	2	6	26379	26384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850715
642	NC_011832	CTG	2	6	26404	26409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850715
643	NC_011832	GCC	2	6	26427	26432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850715
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678	NC_011832	CTC	2	6	27991	27996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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753	NC_011832	AAG	2	6	31013	31018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850719
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756	NC_011832	TCG	2	6	31104	31109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850719
757	NC_011832	AGA	2	6	31110	31115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850719
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759	NC_011832	CGA	2	6	31159	31164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850719
760	NC_011832	CCG	2	6	31207	31212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850719
761	NC_011832	AGA	2	6	31218	31223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850719
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874	NC_011832	CCAG	2	8	35136	35143	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
875	NC_011832	ACC	2	6	35181	35186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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883	NC_011832	CGG	2	6	35419	35424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850724
884	NC_011832	AGATC	2	10	35471	35480	40 %	20 %	20 %	20 %	219850724
885	NC_011832	TCA	2	6	35530	35535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850724
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887	NC_011832	CTG	2	6	35632	35637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850724
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939	NC_011832	CGA	2	6	37915	37920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850726
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952	NC_011832	CTC	2	6	38274	38279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850726
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959	NC_011832	ACC	2	6	38623	38628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850726
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963	NC_011832	CGA	2	6	38771	38776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850726
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965	NC_011832	CGG	2	6	38795	38800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850726
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973	NC_011832	AAG	2	6	39254	39259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850727
974	NC_011832	ATC	2	6	39260	39265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850727
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977	NC_011832	CGA	2	6	39370	39375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850727
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983	NC_011832	CAA	2	6	39619	39624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850727
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991	NC_011832	CGA	2	6	39844	39849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850727
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994	NC_011832	TCT	2	6	39900	39905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850727
995	NC_011832	CCAA	2	8	39914	39921	50 %	0 %	0 %	50 %	219850727
996	NC_011832	G	6	6	39929	39934	0 %	0 %	100 %	0 %	219850727
997	NC_011832	TCG	2	6	39939	39944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850727
998	NC_011832	CCTG	2	8	40024	40031	0 %	25 %	25 %	50 %	219850727
999	NC_011832	TGG	2	6	40050	40055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850727
1000	NC_011832	AGG	2	6	40056	40061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850727

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