MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011832	GAT	2	6	393538	393543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851038
9002	NC_011832	AGA	2	6	393590	393595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219851038
9003	NC_011832	CATC	2	8	393663	393670	25 %	25 %	0 %	50 %	219851038
9004	NC_011832	GAC	3	9	393739	393747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9005	NC_011832	CGG	2	6	393822	393827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851038
9006	NC_011832	GGT	2	6	393831	393836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851038
9007	NC_011832	CTGG	2	8	393837	393844	0 %	25 %	50 %	25 %	219851038
9008	NC_011832	GACCGG	2	12	393856	393867	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219851038
9009	NC_011832	CAG	2	6	393895	393900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9010	NC_011832	CAG	2	6	393904	393909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9011	NC_011832	GCA	2	6	393917	393922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9012	NC_011832	GAT	2	6	393982	393987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851038
9013	NC_011832	GCA	2	6	394024	394029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9014	NC_011832	GCAC	2	8	394040	394047	25 %	0 %	25 %	50 %	219851038
9015	NC_011832	GGAA	2	8	394062	394069	50 %	0 %	50 %	0 %	219851038
9016	NC_011832	GT	3	6	394072	394077	0 %	50 %	50 %	0 %	219851038
9017	NC_011832	GT	5	10	394082	394091	0 %	50 %	50 %	0 %	219851038
9018	NC_011832	A	7	7	394097	394103	100 %	0 %	0 %	0 %	219851038
9019	NC_011832	CAG	2	6	394176	394181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9020	NC_011832	TGC	2	6	394197	394202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9021	NC_011832	ACC	2	6	394204	394209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851038
9022	NC_011832	TGC	2	6	394227	394232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9023	NC_011832	CGGC	2	8	394264	394271	0 %	0 %	50 %	50 %	219851038
9024	NC_011832	CAC	2	6	394274	394279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219851038
9025	NC_011832	ACT	2	6	394307	394312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851038
9026	NC_011832	GGT	2	6	394365	394370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851038
9027	NC_011832	GCT	2	6	394442	394447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851038
9028	NC_011832	CCGGGC	2	12	394452	394463	0 %	0 %	50 %	50 %	219851038
9029	NC_011832	GCC	2	6	394474	394479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851038
9030	NC_011832	GTCG	2	8	394521	394528	0 %	25 %	50 %	25 %	219851038
9031	NC_011832	GGC	2	6	394569	394574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851038
9032	NC_011832	GA	3	6	394635	394640	50 %	0 %	50 %	0 %	219851038
9033	NC_011832	CGG	2	6	394727	394732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9034	NC_011832	GA	3	6	394825	394830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_011832	AC	3	6	394881	394886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_011832	AGAA	2	8	394895	394902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_011832	T	8	8	394952	394959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_011832	A	9	9	394964	394972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_011832	TCG	2	6	394997	395002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851039
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9041	NC_011832	TGA	2	6	395141	395146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851039
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9045	NC_011832	TCG	2	6	395253	395258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851039
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9051	NC_011832	TAC	2	6	395585	395590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851039
9052	NC_011832	ATC	2	6	395617	395622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219851039
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9054	NC_011832	AAAC	2	8	395638	395645	75 %	0 %	0 %	25 %	219851039
9055	NC_011832	TGC	2	6	395685	395690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851039
9056	NC_011832	A	6	6	395763	395768	100 %	0 %	0 %	0 %	219851039
9057	NC_011832	GA	3	6	395840	395845	50 %	0 %	50 %	0 %	219851040
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9093	NC_011832	AT	3	6	397548	397553	50 %	50 %	0 %	0 %	219851042
9094	NC_011832	GACA	2	8	397576	397583	50 %	0 %	25 %	25 %	219851042
9095	NC_011832	ATG	3	9	397601	397609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851042
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9104	NC_011832	CAA	2	6	398303	398308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219851044
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9106	NC_011832	AG	3	6	398357	398362	50 %	0 %	50 %	0 %	219851044
9107	NC_011832	ATCG	2	8	398396	398403	25 %	25 %	25 %	25 %	219851044
9108	NC_011832	CGT	2	6	398447	398452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851044
9109	NC_011832	ATCTC	2	10	398500	398509	20 %	40 %	0 %	40 %	219851044
9110	NC_011832	TAA	2	6	398568	398573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_011832	ATC	2	6	398622	398627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_011832	GTG	2	6	398643	398648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9116	NC_011832	TA	3	6	398950	398955	50 %	50 %	0 %	0 %	219851046
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9120	NC_011832	GTC	2	6	399066	399071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851046
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9124	NC_011832	G	7	7	399297	399303	0 %	0 %	100 %	0 %	219851046
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9249	NC_011832	GGT	2	6	404773	404778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219851052
9250	NC_011832	TCC	2	6	404789	404794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851052
9251	NC_011832	TGA	2	6	404835	404840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219851052
9252	NC_011832	CCT	2	6	404866	404871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219851052
9253	NC_011832	CTG	2	6	404897	404902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219851052
9254	NC_011832	CGG	2	6	404905	404910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851052
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9264	NC_011832	TCT	2	6	405282	405287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219851052
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9279	NC_011832	GGC	2	6	405927	405932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219851053
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9284	NC_011832	CGA	2	6	406013	406018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851053
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9371	NC_011832	TGATCC	2	12	409651	409662	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9374	NC_011832	GGTCGC	2	12	409723	409734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219851058
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9494	NC_011832	CGC	2	6	414622	414627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219851064
9495	NC_011832	TCCG	2	8	414670	414677	0 %	25 %	25 %	50 %	219851064
9496	NC_011832	T	6	6	414755	414760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9497	NC_011832	A	7	7	414761	414767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9498	NC_011832	AT	3	6	414780	414785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9499	NC_011832	CGA	2	6	414843	414848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219851065
9500	NC_011832	CACG	2	8	414867	414874	25 %	0 %	25 %	50 %	219851065

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