MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011832	CGC	3	9	283142	283150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850929
6502	NC_011832	CCG	2	6	283154	283159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850929
6503	NC_011832	CA	3	6	283224	283229	50 %	0 %	0 %	50 %	219850929
6504	NC_011832	CGA	3	9	283382	283390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850929
6505	NC_011832	GTC	2	6	283402	283407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850929
6506	NC_011832	TGG	2	6	283424	283429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850929
6507	NC_011832	GCA	2	6	283490	283495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850929
6508	NC_011832	TCCA	2	8	283536	283543	25 %	25 %	0 %	50 %	219850929
6509	NC_011832	GAT	2	6	283661	283666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850930
6510	NC_011832	GCC	2	6	283670	283675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850930
6511	NC_011832	CGGT	2	8	283816	283823	0 %	25 %	50 %	25 %	219850930
6512	NC_011832	CGAG	2	8	283837	283844	25 %	0 %	50 %	25 %	219850930
6513	NC_011832	TGG	2	6	284067	284072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850930
6514	NC_011832	CGG	2	6	284167	284172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850930
6515	NC_011832	GAT	2	6	284192	284197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850930
6516	NC_011832	GGT	2	6	284207	284212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850930
6517	NC_011832	ACC	2	6	284292	284297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850930
6518	NC_011832	TCT	2	6	284347	284352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850930
6519	NC_011832	AGT	2	6	284389	284394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850930
6520	NC_011832	GAG	2	6	284456	284461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850930
6521	NC_011832	ATC	2	6	284514	284519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850930
6522	NC_011832	GAC	2	6	284561	284566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6523	NC_011832	CGG	2	6	284569	284574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850930
6524	NC_011832	TCG	2	6	284601	284606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6525	NC_011832	CAG	3	9	284609	284617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6526	NC_011832	GCT	2	6	284656	284661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6527	NC_011832	GA	3	6	284673	284678	50 %	0 %	50 %	0 %	219850930
6528	NC_011832	CAT	2	6	284693	284698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850930
6529	NC_011832	TCG	2	6	284718	284723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6530	NC_011832	GTC	2	6	284771	284776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6531	NC_011832	CGT	2	6	284865	284870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6532	NC_011832	GCA	2	6	284917	284922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6533	NC_011832	GAT	2	6	285005	285010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850930
6534	NC_011832	CGG	2	6	285023	285028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850930
6535	NC_011832	TCG	2	6	285030	285035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850930
6536	NC_011832	CCGA	2	8	285080	285087	25 %	0 %	25 %	50 %	219850930
6537	NC_011832	GA	4	8	285113	285120	50 %	0 %	50 %	0 %	219850930
6538	NC_011832	TGT	2	6	285127	285132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850930
6539	NC_011832	CAC	2	6	285282	285287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850931
6540	NC_011832	CTT	2	6	285381	285386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850931
6541	NC_011832	ACG	2	6	285424	285429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850931
6542	NC_011832	GAT	2	6	285456	285461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850931
6543	NC_011832	GTG	2	6	285595	285600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850931
6544	NC_011832	GCC	2	6	285630	285635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850931
6545	NC_011832	CAA	2	6	285718	285723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850931
6546	NC_011832	TCA	2	6	285799	285804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850931
6547	NC_011832	GAG	2	6	285943	285948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850931
6548	NC_011832	ACATC	2	10	286061	286070	40 %	20 %	0 %	40 %	219850931
6549	NC_011832	CTGG	2	8	286124	286131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6550	NC_011832	CAGA	2	8	286166	286173	50 %	0 %	25 %	25 %	219850932
6551	NC_011832	TGC	3	9	286205	286213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850932
6552	NC_011832	AACTG	2	10	286250	286259	40 %	20 %	20 %	20 %	219850932
6553	NC_011832	GA	3	6	286273	286278	50 %	0 %	50 %	0 %	219850932
6554	NC_011832	TCG	2	6	286300	286305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850932
6555	NC_011832	CGAC	2	8	286311	286318	25 %	0 %	25 %	50 %	219850932
6556	NC_011832	ATC	2	6	286401	286406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850932
6557	NC_011832	GCCA	2	8	286413	286420	25 %	0 %	25 %	50 %	219850932
6558	NC_011832	TCA	2	6	286423	286428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850932
6559	NC_011832	CCT	2	6	286429	286434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850932
6560	NC_011832	ATCG	2	8	286460	286467	25 %	25 %	25 %	25 %	219850932
6561	NC_011832	TGA	2	6	286498	286503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850932
6562	NC_011832	GCC	2	6	286521	286526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850932
6563	NC_011832	AAGGA	2	10	286555	286564	60 %	0 %	40 %	0 %	219850932
6564	NC_011832	ATG	2	6	286630	286635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850932
6565	NC_011832	TTG	2	6	286657	286662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850932
6566	NC_011832	CGTT	2	8	286674	286681	0 %	50 %	25 %	25 %	219850932
6567	NC_011832	CTGGTG	2	12	286698	286709	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219850932
6568	NC_011832	GTC	2	6	286740	286745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850932
6569	NC_011832	GC	3	6	286788	286793	0 %	0 %	50 %	50 %	219850932
6570	NC_011832	TGG	2	6	286801	286806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850932
6571	NC_011832	CAC	2	6	286831	286836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850932
6572	NC_011832	GATCGA	2	12	286856	286867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219850932
6573	NC_011832	CGGC	2	8	286872	286879	0 %	0 %	50 %	50 %	219850932
6574	NC_011832	GGA	2	6	286880	286885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850932
6575	NC_011832	ACTG	2	8	286889	286896	25 %	25 %	25 %	25 %	219850932
6576	NC_011832	CTG	2	6	286957	286962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850932
6577	NC_011832	ATC	2	6	286977	286982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850932
6578	NC_011832	GAG	2	6	286986	286991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850932
6579	NC_011832	TAT	2	6	287018	287023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850932
6580	NC_011832	ATC	2	6	287032	287037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850932
6581	NC_011832	AGAA	2	8	287086	287093	75 %	0 %	25 %	0 %	219850932
6582	NC_011832	AAG	2	6	287112	287117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_011832	CTA	2	6	287160	287165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850933
6584	NC_011832	GCC	2	6	287200	287205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850933
6585	NC_011832	GAG	3	9	287218	287226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850933
6586	NC_011832	ACC	2	6	287254	287259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850933
6587	NC_011832	GTG	2	6	287386	287391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850933
6588	NC_011832	GCT	2	6	287433	287438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850933
6589	NC_011832	TGGT	2	8	287510	287517	0 %	50 %	50 %	0 %	219850933
6590	NC_011832	CCGA	2	8	287572	287579	25 %	0 %	25 %	50 %	219850933
6591	NC_011832	GCT	2	6	287602	287607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850933
6592	NC_011832	GAC	2	6	287632	287637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850933
6593	NC_011832	CTGA	2	8	287644	287651	25 %	25 %	25 %	25 %	219850933
6594	NC_011832	CAG	2	6	287653	287658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850933
6595	NC_011832	CGC	2	6	287916	287921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850933
6596	NC_011832	CGG	2	6	287985	287990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850933
6597	NC_011832	CA	3	6	288001	288006	50 %	0 %	0 %	50 %	219850933
6598	NC_011832	ACG	2	6	288032	288037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850933
6599	NC_011832	GGT	2	6	288115	288120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850933
6600	NC_011832	CGG	3	9	288183	288191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850933
6601	NC_011832	GGCAAC	2	12	288394	288405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850934
6602	NC_011832	CTG	2	6	288412	288417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850934
6603	NC_011832	CGA	2	6	288420	288425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850934
6604	NC_011832	TCG	2	6	288486	288491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850934
6605	NC_011832	TTCTCT	2	12	288515	288526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850934
6606	NC_011832	TG	3	6	288590	288595	0 %	50 %	50 %	0 %	219850934
6607	NC_011832	CCGG	2	8	288670	288677	0 %	0 %	50 %	50 %	219850934
6608	NC_011832	CAG	2	6	288790	288795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850934
6609	NC_011832	TCG	2	6	288854	288859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850934
6610	NC_011832	C	6	6	288893	288898	0 %	0 %	0 %	100 %	219850934
6611	NC_011832	CAC	2	6	288907	288912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850934
6612	NC_011832	CTG	2	6	289014	289019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850934
6613	NC_011832	GCC	2	6	289042	289047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850934
6614	NC_011832	TTG	2	6	289163	289168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850934
6615	NC_011832	CT	3	6	289178	289183	0 %	50 %	0 %	50 %	219850934
6616	NC_011832	T	7	7	289190	289196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_011832	T	7	7	289205	289211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_011832	TGA	2	6	289255	289260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850935
6619	NC_011832	CGC	2	6	289314	289319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850935
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6621	NC_011832	TGGT	2	8	289422	289429	0 %	50 %	50 %	0 %	219850935
6622	NC_011832	GAT	2	6	289430	289435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850935
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6652	NC_011832	GCCGGG	2	12	290593	290604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850936
6653	NC_011832	GTCCCG	2	12	290635	290646	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	219850936
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6725	NC_011832	TCACT	2	10	293409	293418	20 %	40 %	0 %	40 %	219850937
6726	NC_011832	GCG	3	9	293422	293430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850937
6727	NC_011832	TGCA	2	8	293435	293442	25 %	25 %	25 %	25 %	219850937
6728	NC_011832	TAT	2	6	293467	293472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219850937
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6732	NC_011832	CTT	3	9	293550	293558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6733	NC_011832	GAT	2	6	293564	293569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6742	NC_011832	CAC	2	6	293792	293797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850938
6743	NC_011832	GTC	2	6	293825	293830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850938
6744	NC_011832	GCT	2	6	293846	293851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850938
6745	NC_011832	CCT	2	6	293967	293972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850938
6746	NC_011832	GCT	2	6	294046	294051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850938
6747	NC_011832	GGC	2	6	294059	294064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850938
6748	NC_011832	CAT	2	6	294113	294118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850938
6749	NC_011832	ATC	2	6	294140	294145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850938
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6751	NC_011832	TCTCA	2	10	294166	294175	20 %	40 %	0 %	40 %	219850938
6752	NC_011832	CAT	2	6	294178	294183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850938
6753	NC_011832	C	7	7	294208	294214	0 %	0 %	0 %	100 %	219850938
6754	NC_011832	CTCG	2	8	294217	294224	0 %	25 %	25 %	50 %	219850938
6755	NC_011832	CGA	2	6	294264	294269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850938
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6757	NC_011832	TCT	2	6	294378	294383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850938
6758	NC_011832	CAG	2	6	294424	294429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6761	NC_011832	GCT	2	6	294505	294510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850939
6762	NC_011832	GGTG	2	8	294511	294518	0 %	25 %	75 %	0 %	219850939
6763	NC_011832	TTC	2	6	294530	294535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219850939
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6770	NC_011832	TGG	2	6	294994	294999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6805	NC_011832	TCG	3	9	296555	296563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6851	NC_011832	TA	3	6	298845	298850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6852	NC_011832	GAT	2	6	298881	298886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6853	NC_011832	AT	3	6	298905	298910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6854	NC_011832	ACCTG	2	10	298962	298971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6855	NC_011832	GGA	2	6	298972	298977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6856	NC_011832	TTC	2	6	298988	298993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6857	NC_011832	TGGAC	2	10	299126	299135	20 %	20 %	40 %	20 %	219850942
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6860	NC_011832	GAA	2	6	299316	299321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850942
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6885	NC_011832	A	7	7	300119	300125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6986	NC_011832	GAC	2	6	304348	304353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850946
6987	NC_011832	TGAC	2	8	304374	304381	25 %	25 %	25 %	25 %	219850946
6988	NC_011832	TCG	2	6	304413	304418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850946
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6990	NC_011832	GCC	2	6	304441	304446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850946
6991	NC_011832	GACC	2	8	304453	304460	25 %	0 %	25 %	50 %	219850946
6992	NC_011832	TGT	2	6	304492	304497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219850946
6993	NC_011832	GCT	2	6	304498	304503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850946
6994	NC_011832	ATG	2	6	304520	304525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850946
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6998	NC_011832	CT	3	6	304601	304606	0 %	50 %	0 %	50 %	219850946
6999	NC_011832	TC	3	6	304672	304677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7000	NC_011832	CTC	2	6	304739	304744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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