MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_011832	GCC	2	6	2875988	2875993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853301
63502	NC_011832	TCG	2	6	2876149	2876154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63503	NC_011832	CAG	2	6	2876175	2876180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63504	NC_011832	GAT	2	6	2876190	2876195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63505	NC_011832	AAG	2	6	2876205	2876210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63506	NC_011832	AGG	2	6	2876295	2876300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63507	NC_011832	AAG	2	6	2876321	2876326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63508	NC_011832	CT	3	6	2876365	2876370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63509	NC_011832	GGC	2	6	2876405	2876410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63510	NC_011832	GAG	2	6	2876411	2876416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63511	NC_011832	A	6	6	2876417	2876422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63512	NC_011832	CAT	2	6	2876435	2876440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63513	NC_011832	AGG	2	6	2876450	2876455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63514	NC_011832	GAT	3	9	2876557	2876565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63515	NC_011832	TGC	2	6	2876616	2876621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853302
63516	NC_011832	C	6	6	2876660	2876665	0 %	0 %	0 %	100 %	219853302
63517	NC_011832	CTT	2	6	2876739	2876744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853302
63518	NC_011832	GTG	2	6	2876800	2876805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853302
63519	NC_011832	ACC	2	6	2876818	2876823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853302
63520	NC_011832	CAG	2	6	2876836	2876841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853302
63521	NC_011832	GTTC	2	8	2876886	2876893	0 %	50 %	25 %	25 %	219853302
63522	NC_011832	CTC	2	6	2876962	2876967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853302
63523	NC_011832	CGG	2	6	2876985	2876990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853302
63524	NC_011832	AG	3	6	2877091	2877096	50 %	0 %	50 %	0 %	219853302
63525	NC_011832	CTG	2	6	2877121	2877126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853302
63526	NC_011832	CGG	2	6	2877149	2877154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853302
63527	NC_011832	CGG	2	6	2877168	2877173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853302
63528	NC_011832	ATC	2	6	2877285	2877290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853303
63529	NC_011832	GGC	2	6	2877323	2877328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853303
63530	NC_011832	CTC	3	9	2877438	2877446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853303
63531	NC_011832	AGG	2	6	2877511	2877516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853303
63532	NC_011832	CAGG	2	8	2877532	2877539	25 %	0 %	50 %	25 %	219853303
63533	NC_011832	ACC	2	6	2877551	2877556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853303
63534	NC_011832	CAG	2	6	2877621	2877626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853303
63535	NC_011832	GGGC	2	8	2877713	2877720	0 %	0 %	75 %	25 %	219853303
63536	NC_011832	CGA	2	6	2877758	2877763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853303
63537	NC_011832	AAG	2	6	2877814	2877819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853303
63538	NC_011832	CTC	2	6	2877824	2877829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853303
63539	NC_011832	GAT	2	6	2877842	2877847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853303
63540	NC_011832	CGT	2	6	2877947	2877952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853303
63541	NC_011832	TCGG	2	8	2878021	2878028	0 %	25 %	50 %	25 %	219853303
63542	NC_011832	TCG	2	6	2878033	2878038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853303
63543	NC_011832	ATC	2	6	2878050	2878055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853303
63544	NC_011832	TCG	3	9	2878072	2878080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853303
63545	NC_011832	GAA	2	6	2878127	2878132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853303
63546	NC_011832	CAGG	2	8	2878173	2878180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63547	NC_011832	C	6	6	2878197	2878202	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63548	NC_011832	TCT	2	6	2878243	2878248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63549	NC_011832	GCT	2	6	2878258	2878263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63550	NC_011832	CAGC	2	8	2878314	2878321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63551	NC_011832	CGA	2	6	2878323	2878328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63552	NC_011832	TGG	2	6	2878333	2878338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63553	NC_011832	ATG	2	6	2878392	2878397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63554	NC_011832	GATC	2	8	2878414	2878421	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63555	NC_011832	AAT	2	6	2878461	2878466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63556	NC_011832	CAG	2	6	2878491	2878496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63557	NC_011832	CTG	2	6	2878522	2878527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63558	NC_011832	CTCGA	2	10	2878606	2878615	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63559	NC_011832	CTGGG	2	10	2878641	2878650	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63560	NC_011832	ACAG	2	8	2878763	2878770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63561	NC_011832	TGG	2	6	2878942	2878947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63562	NC_011832	GAT	2	6	2878953	2878958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63563	NC_011832	ATG	2	6	2879073	2879078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63564	NC_011832	CAA	2	6	2879089	2879094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63565	NC_011832	CCG	2	6	2879127	2879132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63566	NC_011832	GCCG	2	8	2879139	2879146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63567	NC_011832	GATG	2	8	2879167	2879174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63568	NC_011832	CAC	2	6	2879273	2879278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63569	NC_011832	CAC	2	6	2879335	2879340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63570	NC_011832	CGA	2	6	2879346	2879351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63571	NC_011832	CCA	2	6	2879376	2879381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63572	NC_011832	ACC	2	6	2879426	2879431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63573	NC_011832	GAG	2	6	2879495	2879500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63574	NC_011832	GGT	2	6	2879513	2879518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63575	NC_011832	CT	3	6	2879520	2879525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63576	NC_011832	ACTC	2	8	2879562	2879569	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63577	NC_011832	CTCACC	2	12	2879600	2879611	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63578	NC_011832	GAT	2	6	2879612	2879617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63579	NC_011832	TTC	2	6	2879639	2879644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63580	NC_011832	CAA	2	6	2879647	2879652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63581	NC_011832	TGG	2	6	2879669	2879674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63582	NC_011832	GTG	2	6	2879756	2879761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63583	NC_011832	CCA	2	6	2879790	2879795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63584	NC_011832	TGA	2	6	2879836	2879841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63585	NC_011832	CAG	2	6	2879865	2879870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63586	NC_011832	C	6	6	2879873	2879878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63587	NC_011832	CGA	2	6	2880053	2880058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63588	NC_011832	ATGGG	2	10	2880117	2880126	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63589	NC_011832	CAA	2	6	2880177	2880182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63590	NC_011832	TCC	2	6	2880306	2880311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63591	NC_011832	TAG	2	6	2880355	2880360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63592	NC_011832	TA	3	6	2880361	2880366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63593	NC_011832	ATTA	2	8	2880404	2880411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63594	NC_011832	AATA	2	8	2880431	2880438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63595	NC_011832	CTTCT	2	10	2880542	2880551	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63596	NC_011832	GCA	2	6	2880593	2880598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853304
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63598	NC_011832	GCT	2	6	2880692	2880697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853304
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63600	NC_011832	CTG	2	6	2880817	2880822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853304
63601	NC_011832	CTCGA	2	10	2880902	2880911	20 %	20 %	20 %	40 %	219853304
63602	NC_011832	ATG	2	6	2880918	2880923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853304
63603	NC_011832	GAGG	2	8	2880947	2880954	25 %	0 %	75 %	0 %	219853304
63604	NC_011832	CAG	2	6	2880986	2880991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853304
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63606	NC_011832	ACC	2	6	2881094	2881099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853304
63607	NC_011832	G	6	6	2881146	2881151	0 %	0 %	100 %	0 %	219853304
63608	NC_011832	TCAG	2	8	2881152	2881159	25 %	25 %	25 %	25 %	219853304
63609	NC_011832	GGC	2	6	2881237	2881242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853304
63610	NC_011832	GGA	2	6	2881279	2881284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853304
63611	NC_011832	GGT	3	9	2881337	2881345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853304
63612	NC_011832	ATG	2	6	2881368	2881373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853304
63613	NC_011832	CAA	2	6	2881384	2881389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853304
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63615	NC_011832	TAT	2	6	2881487	2881492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853304
63616	NC_011832	CAC	2	6	2881573	2881578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853304
63617	NC_011832	ATC	2	6	2881697	2881702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853304
63618	NC_011832	ACCGTC	2	12	2881799	2881810	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219853304
63619	NC_011832	AGC	2	6	2881843	2881848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853304
63620	NC_011832	ACTG	2	8	2881906	2881913	25 %	25 %	25 %	25 %	219853304
63621	NC_011832	CGA	2	6	2881933	2881938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853304
63622	NC_011832	ACC	2	6	2881958	2881963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853304
63623	NC_011832	TCC	2	6	2882003	2882008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853304
63624	NC_011832	CTG	2	6	2882039	2882044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853304
63625	NC_011832	CTT	2	6	2882134	2882139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853304
63626	NC_011832	GTG	2	6	2882272	2882277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63627	NC_011832	AACA	2	8	2882291	2882298	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63628	NC_011832	GAG	2	6	2882330	2882335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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63630	NC_011832	ACT	2	6	2882351	2882356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63631	NC_011832	CCT	2	6	2882375	2882380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63632	NC_011832	A	7	7	2882408	2882414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63633	NC_011832	CTG	2	6	2882442	2882447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63634	NC_011832	TAGTC	2	10	2882451	2882460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63635	NC_011832	TCA	2	6	2882540	2882545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63636	NC_011832	TTC	2	6	2882550	2882555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63638	NC_011832	TGG	2	6	2882640	2882645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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63657	NC_011832	GA	3	6	2883449	2883454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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63662	NC_011832	TCG	2	6	2883626	2883631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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63671	NC_011832	TCAG	2	8	2883981	2883988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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63736	NC_011832	T	6	6	2886909	2886914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63742	NC_011832	TGA	2	6	2887038	2887043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853308
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63748	NC_011832	GAT	2	6	2887439	2887444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853308
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63842	NC_011832	CTTAA	2	10	2891927	2891936	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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63848	NC_011832	CAA	2	6	2892343	2892348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63850	NC_011832	T	9	9	2892358	2892366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63851	NC_011832	ATGCT	2	10	2892486	2892495	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63852	NC_011832	AAT	2	6	2892594	2892599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63853	NC_011832	TTC	2	6	2892703	2892708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63855	NC_011832	CCT	2	6	2892782	2892787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63856	NC_011832	TAT	2	6	2892809	2892814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63857	NC_011832	TTCT	2	8	2892824	2892831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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63859	NC_011832	TA	3	6	2892959	2892964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63982	NC_011832	ATC	2	6	2899283	2899288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853317
63983	NC_011832	ATG	3	9	2899364	2899372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853317
63984	NC_011832	GTC	2	6	2899403	2899408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853317
63985	NC_011832	CAA	2	6	2899451	2899456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63986	NC_011832	T	8	8	2899466	2899473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63987	NC_011832	G	6	6	2899531	2899536	0 %	0 %	100 %	0 %	219853318
63988	NC_011832	ATC	2	6	2899706	2899711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63989	NC_011832	CTC	2	6	2899743	2899748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63990	NC_011832	AGG	2	6	2899752	2899757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63991	NC_011832	CCT	2	6	2899784	2899789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63992	NC_011832	GGC	2	6	2899888	2899893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63993	NC_011832	CTCC	2	8	2899912	2899919	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63994	NC_011832	GCT	2	6	2900052	2900057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853319
63995	NC_011832	CTG	2	6	2900080	2900085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853319
63996	NC_011832	TCG	2	6	2900119	2900124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853319
63997	NC_011832	ATGGA	2	10	2900176	2900185	40 %	20 %	40 %	0 %	219853319
63998	NC_011832	GCA	2	6	2900206	2900211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853319
63999	NC_011832	CTT	2	6	2900229	2900234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853319
64000	NC_011832	TCG	2	6	2900246	2900251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853319

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