MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62002	NC_011832	TG	3	6	2807760	2807765	0 %	50 %	50 %	0 %	219853231
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62004	NC_011832	ATCG	2	8	2807938	2807945	25 %	25 %	25 %	25 %	219853231
62005	NC_011832	GGT	2	6	2808046	2808051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853231
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62115	NC_011832	CATC	2	8	2813185	2813192	25 %	25 %	0 %	50 %	219853237
62116	NC_011832	TCGG	2	8	2813199	2813206	0 %	25 %	50 %	25 %	219853237
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62119	NC_011832	TGT	2	6	2813372	2813377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853237
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62155	NC_011832	CATG	2	8	2815395	2815402	25 %	25 %	25 %	25 %	219853241
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62216	NC_011832	TCA	2	6	2818335	2818340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853242
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62220	NC_011832	GTCA	2	8	2818492	2818499	25 %	25 %	25 %	25 %	219853242
62221	NC_011832	CTG	2	6	2818591	2818596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853242
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62224	NC_011832	ATC	2	6	2818735	2818740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853242
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62226	NC_011832	ATC	2	6	2818914	2818919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62227	NC_011832	AGC	2	6	2818933	2818938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62228	NC_011832	AGA	2	6	2818990	2818995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853243
62229	NC_011832	AGA	2	6	2819032	2819037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853243
62230	NC_011832	TCA	2	6	2819051	2819056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853243
62231	NC_011832	CAT	2	6	2819091	2819096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853243
62232	NC_011832	GGAG	2	8	2819110	2819117	25 %	0 %	75 %	0 %	219853243
62233	NC_011832	ACC	2	6	2819122	2819127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853243
62234	NC_011832	TC	3	6	2819200	2819205	0 %	50 %	0 %	50 %	219853243
62235	NC_011832	GAA	2	6	2819212	2819217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853243
62236	NC_011832	GGA	3	9	2819281	2819289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853243
62237	NC_011832	CGG	2	6	2819294	2819299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853243
62238	NC_011832	CCG	2	6	2819331	2819336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853243
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62240	NC_011832	CT	3	6	2819366	2819371	0 %	50 %	0 %	50 %	219853243
62241	NC_011832	TGA	2	6	2819427	2819432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853243
62242	NC_011832	GGAA	2	8	2819571	2819578	50 %	0 %	50 %	0 %	219853243
62243	NC_011832	GAG	2	6	2819723	2819728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853243
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62249	NC_011832	GGGA	2	8	2820017	2820024	25 %	0 %	75 %	0 %	219853244
62250	NC_011832	GAG	2	6	2820061	2820066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853244
62251	NC_011832	T	6	6	2820136	2820141	0 %	100 %	0 %	0 %	219853244
62252	NC_011832	CGACC	2	10	2820153	2820162	20 %	0 %	20 %	60 %	219853244
62253	NC_011832	GCC	2	6	2820201	2820206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853244
62254	NC_011832	AAG	2	6	2820214	2820219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853244
62255	NC_011832	GTC	2	6	2820235	2820240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853244
62256	NC_011832	TC	4	8	2820251	2820258	0 %	50 %	0 %	50 %	219853244
62257	NC_011832	TCG	2	6	2820311	2820316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853244
62258	NC_011832	AAG	2	6	2820324	2820329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853244
62259	NC_011832	TGA	2	6	2820347	2820352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853244
62260	NC_011832	TCA	2	6	2820454	2820459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853244
62261	NC_011832	TTGC	2	8	2820611	2820618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62262	NC_011832	GAA	2	6	2820640	2820645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62263	NC_011832	GGA	2	6	2820669	2820674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62264	NC_011832	T	6	6	2820741	2820746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62265	NC_011832	ACA	2	6	2820752	2820757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62266	NC_011832	A	6	6	2820762	2820767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62267	NC_011832	AAT	2	6	2820774	2820779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62268	NC_011832	AGA	2	6	2820809	2820814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853245
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62270	NC_011832	AAGAGG	2	12	2820887	2820898	50 %	0 %	50 %	0 %	219853245
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62272	NC_011832	CAG	2	6	2820949	2820954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853245
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62291	NC_011832	TCCA	2	8	2821479	2821486	25 %	25 %	0 %	50 %	219853247
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62301	NC_011832	AG	3	6	2821949	2821954	50 %	0 %	50 %	0 %	219853247
62302	NC_011832	GAT	2	6	2821955	2821960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853247
62303	NC_011832	TCG	2	6	2821983	2821988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853247
62304	NC_011832	CCGA	2	8	2821992	2821999	25 %	0 %	25 %	50 %	219853247
62305	NC_011832	GAA	2	6	2822009	2822014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853247
62306	NC_011832	CGT	3	9	2822165	2822173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853247
62307	NC_011832	CAG	2	6	2822246	2822251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853247
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62309	NC_011832	GGGA	2	8	2822401	2822408	25 %	0 %	75 %	0 %	219853247
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62317	NC_011832	CACC	2	8	2822606	2822613	25 %	0 %	0 %	75 %	219853248
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62328	NC_011832	CGCAT	2	10	2823093	2823102	20 %	20 %	20 %	40 %	219853248
62329	NC_011832	AGGG	2	8	2823124	2823131	25 %	0 %	75 %	0 %	219853248
62330	NC_011832	TCG	2	6	2823133	2823138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853248
62331	NC_011832	CCTTC	2	10	2823177	2823186	0 %	40 %	0 %	60 %	219853248
62332	NC_011832	ACCC	2	8	2823290	2823297	25 %	0 %	0 %	75 %	219853248
62333	NC_011832	CAT	2	6	2823414	2823419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853248
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62335	NC_011832	TCT	2	6	2823596	2823601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853248
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62338	NC_011832	GAGT	2	8	2823762	2823769	25 %	25 %	50 %	0 %	219853248
62339	NC_011832	TATCGA	2	12	2823851	2823862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219853248
62340	NC_011832	GAG	2	6	2823950	2823955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853249
62341	NC_011832	GGC	2	6	2823959	2823964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853249
62342	NC_011832	GGAAA	2	10	2823992	2824001	60 %	0 %	40 %	0 %	219853249
62343	NC_011832	CCT	2	6	2824027	2824032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853249
62344	NC_011832	CTC	2	6	2824088	2824093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853249
62345	NC_011832	ATC	2	6	2824095	2824100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853249
62346	NC_011832	CTT	2	6	2824133	2824138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853249
62347	NC_011832	C	7	7	2824177	2824183	0 %	0 %	0 %	100 %	219853249
62348	NC_011832	CCTG	2	8	2824234	2824241	0 %	25 %	25 %	50 %	219853249
62349	NC_011832	CAC	2	6	2824309	2824314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853249
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62351	NC_011832	GAT	2	6	2824379	2824384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853249
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62362	NC_011832	CGG	3	9	2824761	2824769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853249
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62387	NC_011832	CTT	2	6	2825856	2825861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62388	NC_011832	TA	3	6	2825866	2825871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62389	NC_011832	AGC	2	6	2825964	2825969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853250
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62417	NC_011832	CCGG	2	8	2826986	2826993	0 %	0 %	50 %	50 %	219853251
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62440	NC_011832	CTGA	2	8	2827895	2827902	25 %	25 %	25 %	25 %	219853252
62441	NC_011832	TGA	2	6	2827917	2827922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853252
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62446	NC_011832	CT	3	6	2828241	2828246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62447	NC_011832	CTC	2	6	2828289	2828294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853253
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62451	NC_011832	CCCTT	2	10	2828516	2828525	0 %	40 %	0 %	60 %	219853253
62452	NC_011832	TTG	2	6	2828539	2828544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853253
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62454	NC_011832	TAG	2	6	2828630	2828635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853253
62455	NC_011832	GATC	2	8	2828653	2828660	25 %	25 %	25 %	25 %	219853253
62456	NC_011832	GA	3	6	2828686	2828691	50 %	0 %	50 %	0 %	219853253
62457	NC_011832	ATC	2	6	2828697	2828702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853253
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62462	NC_011832	AGG	2	6	2828815	2828820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853253
62463	NC_011832	CAT	2	6	2828878	2828883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62464	NC_011832	AAT	2	6	2828901	2828906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62465	NC_011832	TA	3	6	2828908	2828913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62466	NC_011832	TTCAA	2	10	2828918	2828927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62467	NC_011832	T	6	6	2828928	2828933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62468	NC_011832	GGA	2	6	2828942	2828947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62469	NC_011832	TAA	2	6	2828949	2828954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853254
62470	NC_011832	TCA	2	6	2828973	2828978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853254
62471	NC_011832	AGG	2	6	2829012	2829017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853254
62472	NC_011832	GCA	3	9	2829035	2829043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62473	NC_011832	TCA	2	6	2829126	2829131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853254
62474	NC_011832	GAC	2	6	2829215	2829220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62475	NC_011832	ACC	3	9	2829236	2829244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853254
62476	NC_011832	GCAGA	2	10	2829278	2829287	40 %	0 %	40 %	20 %	219853254
62477	NC_011832	CGA	2	6	2829309	2829314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62478	NC_011832	CGACG	2	10	2829385	2829394	20 %	0 %	40 %	40 %	219853254
62479	NC_011832	TCGA	2	8	2829443	2829450	25 %	25 %	25 %	25 %	219853254
62480	NC_011832	TCG	3	9	2829477	2829485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62481	NC_011832	TGA	2	6	2829492	2829497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853254
62482	NC_011832	GTC	3	9	2829524	2829532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62483	NC_011832	TGA	2	6	2829538	2829543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853254
62484	NC_011832	CAT	2	6	2829544	2829549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853254
62485	NC_011832	AAG	2	6	2829554	2829559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853254
62486	NC_011832	GTC	2	6	2829647	2829652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62487	NC_011832	CAAGAT	2	12	2829712	2829723	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	219853254
62488	NC_011832	GAA	2	6	2829775	2829780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853254
62489	NC_011832	CGC	2	6	2829799	2829804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853254
62490	NC_011832	CTC	2	6	2829818	2829823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853254
62491	NC_011832	CGA	2	6	2829886	2829891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62492	NC_011832	CGA	2	6	2829936	2829941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62493	NC_011832	CAA	2	6	2829946	2829951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853254
62494	NC_011832	AGG	2	6	2830005	2830010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853254
62495	NC_011832	CGAC	2	8	2830077	2830084	25 %	0 %	25 %	50 %	219853254
62496	NC_011832	CGT	2	6	2830111	2830116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853254
62497	NC_011832	CGATG	2	10	2830138	2830147	20 %	20 %	40 %	20 %	219853254
62498	NC_011832	TGGT	2	8	2830164	2830171	0 %	50 %	50 %	0 %	219853254
62499	NC_011832	GGC	2	6	2830172	2830177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853254
62500	NC_011832	CTG	2	6	2830193	2830198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853254

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