MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_011832	GCT	2	6	2716983	2716988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853154
60002	NC_011832	C	6	6	2717008	2717013	0 %	0 %	0 %	100 %	219853154
60003	NC_011832	CGAC	2	8	2717028	2717035	25 %	0 %	25 %	50 %	219853154
60004	NC_011832	TCC	2	6	2717123	2717128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853154
60005	NC_011832	AGC	2	6	2717135	2717140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853154
60006	NC_011832	GTCG	2	8	2717181	2717188	0 %	25 %	50 %	25 %	219853154
60007	NC_011832	GCGAG	2	10	2717205	2717214	20 %	0 %	60 %	20 %	219853154
60008	NC_011832	ACC	2	6	2717217	2717222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853154
60009	NC_011832	C	6	6	2717309	2717314	0 %	0 %	0 %	100 %	219853154
60010	NC_011832	CAG	3	9	2717320	2717328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853154
60011	NC_011832	CTT	2	6	2717465	2717470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853154
60012	NC_011832	GAC	2	6	2717473	2717478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853154
60013	NC_011832	GAA	2	6	2717515	2717520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60014	NC_011832	GCC	3	9	2717748	2717756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853155
60015	NC_011832	CGAGGC	2	12	2717768	2717779	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	219853155
60016	NC_011832	CT	3	6	2717804	2717809	0 %	50 %	0 %	50 %	219853155
60017	NC_011832	TCC	2	6	2717815	2717820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853155
60018	NC_011832	TGA	2	6	2717836	2717841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853155
60019	NC_011832	CGG	2	6	2717903	2717908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853155
60020	NC_011832	CGATG	2	10	2717915	2717924	20 %	20 %	40 %	20 %	219853155
60021	NC_011832	ATC	2	6	2717937	2717942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853155
60022	NC_011832	CGG	3	9	2717951	2717959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853155
60023	NC_011832	GGAG	2	8	2718014	2718021	25 %	0 %	75 %	0 %	219853155
60024	NC_011832	TCA	2	6	2718148	2718153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853155
60025	NC_011832	CGA	2	6	2718206	2718211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853155
60026	NC_011832	CTGG	2	8	2718254	2718261	0 %	25 %	50 %	25 %	219853155
60027	NC_011832	GAA	2	6	2718329	2718334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853155
60028	NC_011832	GAT	2	6	2718398	2718403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853155
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60031	NC_011832	AGC	2	6	2718427	2718432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853155
60032	NC_011832	CTC	2	6	2718435	2718440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853155
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60042	NC_011832	TGA	2	6	2718712	2718717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853155
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60050	NC_011832	TCG	2	6	2718946	2718951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853155
60051	NC_011832	GAG	2	6	2718978	2718983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853155
60052	NC_011832	GAC	2	6	2719011	2719016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853155
60053	NC_011832	GCT	3	9	2719244	2719252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853155
60054	NC_011832	GGC	2	6	2719258	2719263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853155
60055	NC_011832	GTG	2	6	2719311	2719316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853155
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60058	NC_011832	GCC	2	6	2719396	2719401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853155
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60063	NC_011832	TCC	2	6	2719644	2719649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853155
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60066	NC_011832	T	7	7	2719874	2719880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60116	NC_011832	CTG	2	6	2721828	2721833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853157
60117	NC_011832	GACGA	2	10	2721881	2721890	40 %	0 %	40 %	20 %	219853157
60118	NC_011832	CGG	2	6	2721911	2721916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853157
60119	NC_011832	TTGA	2	8	2721991	2721998	25 %	50 %	25 %	0 %	219853158
60120	NC_011832	GAT	2	6	2722012	2722017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853158
60121	NC_011832	AGCGT	2	10	2722081	2722090	20 %	20 %	40 %	20 %	219853158
60122	NC_011832	TCC	2	6	2722151	2722156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853158
60123	NC_011832	GGA	2	6	2722164	2722169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853158
60124	NC_011832	TGG	2	6	2722183	2722188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853158
60125	NC_011832	GCT	2	6	2722243	2722248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60126	NC_011832	CTG	3	9	2722302	2722310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853159
60127	NC_011832	GGT	2	6	2722331	2722336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853159
60128	NC_011832	AAGCG	2	10	2722394	2722403	40 %	0 %	40 %	20 %	219853159
60129	NC_011832	TCAGT	2	10	2722438	2722447	20 %	40 %	20 %	20 %	219853159
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60144	NC_011832	CAG	2	6	2722870	2722875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853160
60145	NC_011832	TCCC	2	8	2722887	2722894	0 %	25 %	0 %	75 %	219853160
60146	NC_011832	AAGG	2	8	2722927	2722934	50 %	0 %	50 %	0 %	219853160
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60196	NC_011832	TCC	2	6	2724768	2724773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853161
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60201	NC_011832	GAG	2	6	2724908	2724913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853161
60202	NC_011832	GAT	2	6	2724920	2724925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853161
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60208	NC_011832	TAA	2	6	2725103	2725108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60209	NC_011832	A	6	6	2725156	2725161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60210	NC_011832	GAA	2	6	2725226	2725231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853162
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60213	NC_011832	CCTG	2	8	2725277	2725284	0 %	25 %	25 %	50 %	219853162
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60216	NC_011832	TGGA	2	8	2725369	2725376	25 %	25 %	50 %	0 %	219853162
60217	NC_011832	TGGTG	2	10	2725529	2725538	0 %	40 %	60 %	0 %	219853162
60218	NC_011832	CGA	2	6	2725609	2725614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853162
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60221	NC_011832	TGA	2	6	2725843	2725848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853162
60222	NC_011832	GTT	2	6	2725859	2725864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853162
60223	NC_011832	CACC	2	8	2725894	2725901	25 %	0 %	0 %	75 %	219853162
60224	NC_011832	GCA	2	6	2725902	2725907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853162
60225	NC_011832	TCT	2	6	2725999	2726004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853162
60226	NC_011832	ATA	2	6	2726039	2726044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853162
60227	NC_011832	TCT	2	6	2726105	2726110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60228	NC_011832	A	6	6	2726122	2726127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60229	NC_011832	CTATG	2	10	2726319	2726328	20 %	40 %	20 %	20 %	219853163
60230	NC_011832	AGG	2	6	2726405	2726410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853163
60231	NC_011832	TTCCTC	2	12	2726422	2726433	0 %	50 %	0 %	50 %	219853163
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60350	NC_011832	TCC	2	6	2730952	2730957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853168
60351	NC_011832	GAA	2	6	2730984	2730989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853168
60352	NC_011832	GCCG	2	8	2731166	2731173	0 %	0 %	50 %	50 %	219853168
60353	NC_011832	GTG	2	6	2731189	2731194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853168
60354	NC_011832	CGA	2	6	2731223	2731228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853168
60355	NC_011832	GGT	2	6	2731235	2731240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853168
60356	NC_011832	GA	3	6	2731259	2731264	50 %	0 %	50 %	0 %	219853168
60357	NC_011832	TGC	2	6	2731316	2731321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853168
60358	NC_011832	ACC	2	6	2731330	2731335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853168
60359	NC_011832	CTG	2	6	2731380	2731385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853168
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60361	NC_011832	TTG	2	6	2731421	2731426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853168
60362	NC_011832	CAG	2	6	2731446	2731451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853168
60363	NC_011832	TGC	3	9	2731480	2731488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853168
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60374	NC_011832	GAG	2	6	2731910	2731915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853169
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60376	NC_011832	CGATCT	2	12	2731975	2731986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219853169
60377	NC_011832	GCC	2	6	2731990	2731995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853169
60378	NC_011832	CAT	2	6	2732051	2732056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853169
60379	NC_011832	ATC	2	6	2732118	2732123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853169
60380	NC_011832	CTC	2	6	2732135	2732140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853169
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60384	NC_011832	GCA	2	6	2732302	2732307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853169
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60393	NC_011832	GGC	2	6	2732564	2732569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853170
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60395	NC_011832	CGA	2	6	2732645	2732650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853170
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60411	NC_011832	CCG	2	6	2733197	2733202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853170
60412	NC_011832	CAGTC	2	10	2733248	2733257	20 %	20 %	20 %	40 %	219853170
60413	NC_011832	CCT	2	6	2733305	2733310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853170
60414	NC_011832	TCG	2	6	2733380	2733385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853170
60415	NC_011832	CGC	2	6	2733411	2733416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853170
60416	NC_011832	TCG	2	6	2733418	2733423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853170
60417	NC_011832	ACG	2	6	2733424	2733429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853170
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60420	NC_011832	CTTC	2	8	2733523	2733530	0 %	50 %	0 %	50 %	219853171
60421	NC_011832	GCT	2	6	2733583	2733588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853171
60422	NC_011832	GCCG	2	8	2733629	2733636	0 %	0 %	50 %	50 %	219853171
60423	NC_011832	CCG	2	6	2733687	2733692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853171
60424	NC_011832	GCACCG	2	12	2733700	2733711	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219853171
60425	NC_011832	GGT	2	6	2733758	2733763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853171
60426	NC_011832	CTC	2	6	2733785	2733790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853171
60427	NC_011832	CGG	2	6	2733814	2733819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853171
60428	NC_011832	CAG	2	6	2733866	2733871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853171
60429	NC_011832	CCT	2	6	2733991	2733996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853171
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60431	NC_011832	CGG	2	6	2734089	2734094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853171
60432	NC_011832	GGA	2	6	2734120	2734125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853171
60433	NC_011832	CCG	2	6	2734140	2734145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853171
60434	NC_011832	GAT	2	6	2734223	2734228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853171
60435	NC_011832	CCGG	2	8	2734235	2734242	0 %	0 %	50 %	50 %	219853171
60436	NC_011832	CGCGGC	2	12	2734345	2734356	0 %	0 %	50 %	50 %	219853172
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60439	NC_011832	CCG	2	6	2734478	2734483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853172
60440	NC_011832	CCA	3	9	2734485	2734493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853172
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60442	NC_011832	CT	3	6	2734519	2734524	0 %	50 %	0 %	50 %	219853172
60443	NC_011832	CGG	2	6	2734578	2734583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853172
60444	NC_011832	TCG	2	6	2734622	2734627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853172
60445	NC_011832	CAT	2	6	2734651	2734656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853172
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60447	NC_011832	GA	3	6	2734847	2734852	50 %	0 %	50 %	0 %	219853172
60448	NC_011832	CTC	2	6	2734932	2734937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853172
60449	NC_011832	CCAGGT	2	12	2734959	2734970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219853172
60450	NC_011832	GAT	2	6	2735020	2735025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853172
60451	NC_011832	TTC	2	6	2735028	2735033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853172
60452	NC_011832	ATT	2	6	2735048	2735053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853172
60453	NC_011832	AC	3	6	2735086	2735091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60454	NC_011832	GCA	2	6	2735104	2735109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60455	NC_011832	A	6	6	2735280	2735285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60456	NC_011832	CAC	2	6	2735290	2735295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60457	NC_011832	TAT	2	6	2735361	2735366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853173
60458	NC_011832	TCT	3	9	2735370	2735378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853173
60459	NC_011832	G	6	6	2735397	2735402	0 %	0 %	100 %	0 %	219853173
60460	NC_011832	GCA	2	6	2735410	2735415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60461	NC_011832	TTC	2	6	2735486	2735491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853173
60462	NC_011832	GCT	2	6	2735494	2735499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60463	NC_011832	CGG	2	6	2735552	2735557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853173
60464	NC_011832	TGTA	2	8	2735626	2735633	25 %	50 %	25 %	0 %	219853173
60465	NC_011832	TCG	2	6	2735655	2735660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60466	NC_011832	TGG	2	6	2735682	2735687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853173
60467	NC_011832	TCC	2	6	2735714	2735719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853173
60468	NC_011832	G	6	6	2735722	2735727	0 %	0 %	100 %	0 %	219853173
60469	NC_011832	CGAT	2	8	2735748	2735755	25 %	25 %	25 %	25 %	219853173
60470	NC_011832	CAC	2	6	2735800	2735805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853173
60471	NC_011832	TCT	2	6	2735859	2735864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853173
60472	NC_011832	CCCGG	2	10	2735929	2735938	0 %	0 %	40 %	60 %	219853173
60473	NC_011832	CGG	2	6	2735942	2735947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853173
60474	NC_011832	CGT	2	6	2735998	2736003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60475	NC_011832	GTC	2	6	2736020	2736025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60476	NC_011832	CTT	2	6	2736028	2736033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853173
60477	NC_011832	TTC	2	6	2736047	2736052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853173
60478	NC_011832	TTC	2	6	2736080	2736085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853173
60479	NC_011832	TCC	2	6	2736138	2736143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853173
60480	NC_011832	G	6	6	2736152	2736157	0 %	0 %	100 %	0 %	219853173
60481	NC_011832	CTG	2	6	2736191	2736196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60482	NC_011832	CGG	2	6	2736222	2736227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853173
60483	NC_011832	GCT	2	6	2736250	2736255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60484	NC_011832	AGA	2	6	2736264	2736269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853173
60485	NC_011832	TTC	2	6	2736302	2736307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853173
60486	NC_011832	G	6	6	2736308	2736313	0 %	0 %	100 %	0 %	219853173
60487	NC_011832	GCT	2	6	2736352	2736357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60488	NC_011832	GCT	2	6	2736364	2736369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853173
60489	NC_011832	GAG	2	6	2736395	2736400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853173
60490	NC_011832	GCCG	2	8	2736407	2736414	0 %	0 %	50 %	50 %	219853173
60491	NC_011832	ATA	2	6	2736429	2736434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853173
60492	NC_011832	TA	3	6	2736450	2736455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60493	NC_011832	TCCCT	2	10	2736538	2736547	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
60494	NC_011832	TG	3	6	2736624	2736629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60495	NC_011832	CTC	2	6	2736638	2736643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60496	NC_011832	T	6	6	2736657	2736662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60497	NC_011832	CAC	2	6	2736686	2736691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60498	NC_011832	GGC	2	6	2736845	2736850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60499	NC_011832	TCT	2	6	2736886	2736891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60500	NC_011832	TCT	2	6	2736910	2736915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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