MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59501	NC_011832	GCATG	2	10	2695494	2695503	20 %	20 %	40 %	20 %	219853125
59502	NC_011832	TC	3	6	2695551	2695556	0 %	50 %	0 %	50 %	219853125
59503	NC_011832	A	7	7	2695614	2695620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59504	NC_011832	TAA	2	6	2695645	2695650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853126
59505	NC_011832	GAG	2	6	2695701	2695706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853126
59506	NC_011832	GAA	2	6	2695743	2695748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853126
59507	NC_011832	A	7	7	2695747	2695753	100 %	0 %	0 %	0 %	219853126
59508	NC_011832	GAG	2	6	2695783	2695788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853126
59509	NC_011832	CTGT	2	8	2695802	2695809	0 %	50 %	25 %	25 %	219853126
59510	NC_011832	TGA	2	6	2695866	2695871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853126
59511	NC_011832	CAT	2	6	2695884	2695889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853126
59512	NC_011832	GCCG	2	8	2695977	2695984	0 %	0 %	50 %	50 %	219853126
59513	NC_011832	GGA	2	6	2696019	2696024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853126
59514	NC_011832	TTG	2	6	2696054	2696059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853126
59515	NC_011832	ATA	2	6	2696108	2696113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59516	NC_011832	TA	5	10	2696117	2696126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59517	NC_011832	TAG	2	6	2696155	2696160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59518	NC_011832	TTTC	2	8	2696178	2696185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59519	NC_011832	CT	3	6	2696194	2696199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59520	NC_011832	T	6	6	2696220	2696225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59521	NC_011832	TA	3	6	2696240	2696245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59522	NC_011832	CCCA	2	8	2696247	2696254	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59523	NC_011832	AAT	2	6	2696276	2696281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59524	NC_011832	TCCA	2	8	2696299	2696306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59525	NC_011832	CGG	2	6	2696310	2696315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59526	NC_011832	TGA	2	6	2696328	2696333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59527	NC_011832	C	6	6	2696352	2696357	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59528	NC_011832	GA	4	8	2696369	2696376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59529	NC_011832	GAT	3	9	2696407	2696415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59530	NC_011832	GTG	2	6	2696442	2696447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853127
59531	NC_011832	GCC	2	6	2696454	2696459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853127
59532	NC_011832	CTGG	2	8	2696462	2696469	0 %	25 %	50 %	25 %	219853127
59533	NC_011832	CTT	2	6	2696522	2696527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853127
59534	NC_011832	CTG	3	9	2696556	2696564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853127
59535	NC_011832	ATC	2	6	2696568	2696573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853127
59536	NC_011832	CTGG	2	8	2696624	2696631	0 %	25 %	50 %	25 %	219853127
59537	NC_011832	TCG	2	6	2696653	2696658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853127
59538	NC_011832	TCG	2	6	2696734	2696739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853127
59539	NC_011832	ATC	2	6	2696871	2696876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853127
59540	NC_011832	TCG	2	6	2696881	2696886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853127
59541	NC_011832	GGCTCG	2	12	2696905	2696916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219853127
59542	NC_011832	GAG	2	6	2696928	2696933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853127
59543	NC_011832	GGTCG	2	10	2696951	2696960	0 %	20 %	60 %	20 %	219853127
59544	NC_011832	GGC	2	6	2696966	2696971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853127
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59547	NC_011832	GGTT	2	8	2697014	2697021	0 %	50 %	50 %	0 %	219853127
59548	NC_011832	ATC	2	6	2697030	2697035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853127
59549	NC_011832	AGG	2	6	2697036	2697041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853127
59550	NC_011832	GTG	2	6	2697054	2697059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853127
59551	NC_011832	GCCG	2	8	2697098	2697105	0 %	0 %	50 %	50 %	219853127
59552	NC_011832	CGC	2	6	2697113	2697118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853127
59553	NC_011832	ATG	2	6	2697261	2697266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853127
59554	NC_011832	GAT	2	6	2697293	2697298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853127
59555	NC_011832	CCT	2	6	2697299	2697304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853127
59556	NC_011832	ATC	2	6	2697363	2697368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853127
59557	NC_011832	TCG	2	6	2697370	2697375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853127
59558	NC_011832	GAA	2	6	2697449	2697454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59559	NC_011832	A	6	6	2697466	2697471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59560	NC_011832	ACA	3	9	2697481	2697489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59561	NC_011832	CCA	2	6	2697541	2697546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853128
59562	NC_011832	GTC	2	6	2697599	2697604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853128
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59564	NC_011832	GCC	2	6	2697922	2697927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853129
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59571	NC_011832	GGT	2	6	2698089	2698094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853129
59572	NC_011832	ACCG	2	8	2698108	2698115	25 %	0 %	25 %	50 %	219853129
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59578	NC_011832	CGGC	2	8	2698243	2698250	0 %	0 %	50 %	50 %	219853130
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59580	NC_011832	GCCG	2	8	2698284	2698291	0 %	0 %	50 %	50 %	219853130
59581	NC_011832	CAGG	2	8	2698316	2698323	25 %	0 %	50 %	25 %	219853130
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59586	NC_011832	TGT	2	6	2698530	2698535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853130
59587	NC_011832	CAC	2	6	2698563	2698568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59588	NC_011832	TC	3	6	2698600	2698605	0 %	50 %	0 %	50 %	219853131
59589	NC_011832	TCGG	2	8	2698709	2698716	0 %	25 %	50 %	25 %	219853131
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59592	NC_011832	TGA	2	6	2698752	2698757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853131
59593	NC_011832	GAG	2	6	2698787	2698792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853131
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59601	NC_011832	GA	3	6	2699130	2699135	50 %	0 %	50 %	0 %	219853131
59602	NC_011832	ATCT	2	8	2699153	2699160	25 %	50 %	0 %	25 %	219853131
59603	NC_011832	TCG	2	6	2699268	2699273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853131
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59608	NC_011832	TGA	2	6	2699568	2699573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853131
59609	NC_011832	GGT	2	6	2699610	2699615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853131
59610	NC_011832	TCCGA	2	10	2699641	2699650	20 %	20 %	20 %	40 %	219853131
59611	NC_011832	GATCTC	2	12	2699669	2699680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59612	NC_011832	GGA	2	6	2699715	2699720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59613	NC_011832	TCA	2	6	2699721	2699726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853132
59614	NC_011832	CGACCG	2	12	2699838	2699849	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	219853132
59615	NC_011832	AT	3	6	2699895	2699900	50 %	50 %	0 %	0 %	219853132
59616	NC_011832	CGG	2	6	2699923	2699928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853132
59617	NC_011832	GATG	2	8	2699944	2699951	25 %	25 %	50 %	0 %	219853132
59618	NC_011832	GCG	2	6	2699972	2699977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853132
59619	NC_011832	CGA	2	6	2700094	2700099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853132
59620	NC_011832	ACC	2	6	2700119	2700124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853132
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59623	NC_011832	CGA	2	6	2700246	2700251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853133
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59966	NC_011832	CGG	2	6	2715200	2715205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59967	NC_011832	GGAG	2	8	2715223	2715230	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59968	NC_011832	TGC	2	6	2715242	2715247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59969	NC_011832	GGA	2	6	2715317	2715322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59970	NC_011832	ATC	2	6	2715402	2715407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853151
59971	NC_011832	GTT	2	6	2715427	2715432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853151
59972	NC_011832	CGC	2	6	2715434	2715439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853151
59973	NC_011832	CTG	2	6	2715477	2715482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853151
59974	NC_011832	TGC	2	6	2715545	2715550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853151
59975	NC_011832	CTG	2	6	2715625	2715630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853151
59976	NC_011832	GAA	2	6	2715674	2715679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853151
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59981	NC_011832	ATC	2	6	2715906	2715911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853151
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59986	NC_011832	GAT	2	6	2716043	2716048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853151
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59988	NC_011832	GATCT	2	10	2716308	2716317	20 %	40 %	20 %	20 %	219853151
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59991	NC_011832	GAC	2	6	2716451	2716456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853152
59992	NC_011832	GCC	2	6	2716724	2716729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853153
59993	NC_011832	ATCTG	2	10	2716803	2716812	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59994	NC_011832	C	8	8	2716866	2716873	0 %	0 %	0 %	100 %	219853154
59995	NC_011832	CCGT	2	8	2716900	2716907	0 %	25 %	25 %	50 %	219853154
59996	NC_011832	GTC	2	6	2716916	2716921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853154
59997	NC_011832	ACGA	2	8	2716940	2716947	50 %	0 %	25 %	25 %	219853154
59998	NC_011832	CAGG	2	8	2716951	2716958	25 %	0 %	50 %	25 %	219853154
59999	NC_011832	CCT	2	6	2716965	2716970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853154
60000	NC_011832	GCA	2	6	2716972	2716977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853154

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