MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_011832	CTG	2	6	2651485	2651490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853078
58502	NC_011832	CGA	2	6	2651562	2651567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853079
58503	NC_011832	GTTC	2	8	2651598	2651605	0 %	50 %	25 %	25 %	219853079
58504	NC_011832	GAA	2	6	2651607	2651612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853079
58505	NC_011832	CAG	2	6	2651719	2651724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853079
58506	NC_011832	TGAC	2	8	2651792	2651799	25 %	25 %	25 %	25 %	219853080
58507	NC_011832	AGG	2	6	2651800	2651805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853080
58508	NC_011832	GTA	2	6	2651814	2651819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853080
58509	NC_011832	ACC	2	6	2651820	2651825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853080
58510	NC_011832	CAG	2	6	2651835	2651840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853080
58511	NC_011832	TC	3	6	2651888	2651893	0 %	50 %	0 %	50 %	219853080
58512	NC_011832	CTG	2	6	2651918	2651923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853080
58513	NC_011832	CCA	2	6	2652027	2652032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853080
58514	NC_011832	CGC	2	6	2652131	2652136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853080
58515	NC_011832	CAG	2	6	2652144	2652149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853080
58516	NC_011832	GCC	2	6	2652171	2652176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853080
58517	NC_011832	CCG	2	6	2652179	2652184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853080
58518	NC_011832	CAC	2	6	2652207	2652212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853080
58519	NC_011832	CAG	2	6	2652234	2652239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853080
58520	NC_011832	CCAC	2	8	2652294	2652301	25 %	0 %	0 %	75 %	219853080
58521	NC_011832	AGA	2	6	2652377	2652382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853080
58522	NC_011832	CCA	2	6	2652392	2652397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853080
58523	NC_011832	CAT	2	6	2652408	2652413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853080
58524	NC_011832	AGAT	2	8	2652421	2652428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58525	NC_011832	ATT	2	6	2652483	2652488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58526	NC_011832	TCC	2	6	2652501	2652506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853081
58527	NC_011832	GGC	2	6	2652541	2652546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853081
58528	NC_011832	GTC	2	6	2652768	2652773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853081
58529	NC_011832	ATG	2	6	2652816	2652821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853081
58530	NC_011832	TCG	2	6	2652829	2652834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853081
58531	NC_011832	GAC	2	6	2652837	2652842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853081
58532	NC_011832	CTC	2	6	2652850	2652855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853081
58533	NC_011832	CCG	2	6	2652897	2652902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853081
58534	NC_011832	TC	3	6	2652906	2652911	0 %	50 %	0 %	50 %	219853081
58535	NC_011832	AGCC	2	8	2652982	2652989	25 %	0 %	25 %	50 %	219853081
58536	NC_011832	CTC	2	6	2653015	2653020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853081
58537	NC_011832	CTT	2	6	2653053	2653058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853081
58538	NC_011832	AGC	2	6	2653066	2653071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853081
58539	NC_011832	CGG	2	6	2653076	2653081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853081
58540	NC_011832	AGG	2	6	2653132	2653137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853081
58541	NC_011832	TCA	2	6	2653182	2653187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853081
58542	NC_011832	CGG	2	6	2653191	2653196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853081
58543	NC_011832	GGA	2	6	2653197	2653202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853081
58544	NC_011832	CAT	2	6	2653244	2653249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853081
58545	NC_011832	GCCG	2	8	2653261	2653268	0 %	0 %	50 %	50 %	219853081
58546	NC_011832	TCG	2	6	2653303	2653308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853081
58547	NC_011832	TC	3	6	2653324	2653329	0 %	50 %	0 %	50 %	219853081
58548	NC_011832	CTC	2	6	2653442	2653447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853081
58549	NC_011832	CTGACC	2	12	2653467	2653478	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219853081
58550	NC_011832	GGT	2	6	2653544	2653549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853081
58551	NC_011832	AGG	2	6	2653569	2653574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853081
58552	NC_011832	CT	3	6	2653593	2653598	0 %	50 %	0 %	50 %	219853081
58553	NC_011832	GACG	2	8	2653606	2653613	25 %	0 %	50 %	25 %	219853081
58554	NC_011832	CCGG	2	8	2653643	2653650	0 %	0 %	50 %	50 %	219853081
58555	NC_011832	CTC	2	6	2653658	2653663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853081
58556	NC_011832	TCG	2	6	2653666	2653671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853081
58557	NC_011832	GAT	2	6	2653673	2653678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853081
58558	NC_011832	CTG	2	6	2653698	2653703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853081
58559	NC_011832	AGA	2	6	2653790	2653795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853082
58560	NC_011832	AAG	2	6	2653816	2653821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853082
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58562	NC_011832	GAA	2	6	2653860	2653865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853082
58563	NC_011832	TCGGGG	2	12	2653877	2653888	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	219853082
58564	NC_011832	GTC	2	6	2653909	2653914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853082
58565	NC_011832	GTG	2	6	2653969	2653974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853082
58566	NC_011832	ATC	2	6	2654014	2654019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853082
58567	NC_011832	GGT	2	6	2654031	2654036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853082
58568	NC_011832	GCT	2	6	2654041	2654046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853082
58569	NC_011832	CTG	2	6	2654071	2654076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853082
58570	NC_011832	ATA	2	6	2654114	2654119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219853082
58571	NC_011832	TCCC	2	8	2654131	2654138	0 %	25 %	0 %	75 %	219853082
58572	NC_011832	CAC	2	6	2654147	2654152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853082
58573	NC_011832	TGG	2	6	2654195	2654200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853082
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58576	NC_011832	CGA	2	6	2654327	2654332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853082
58577	NC_011832	GTC	2	6	2654344	2654349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853082
58578	NC_011832	ACC	2	6	2654419	2654424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853082
58579	NC_011832	GTC	2	6	2654428	2654433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853082
58580	NC_011832	T	7	7	2654524	2654530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58581	NC_011832	T	7	7	2654538	2654544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58582	NC_011832	TAGA	2	8	2654659	2654666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58583	NC_011832	TGAA	2	8	2654715	2654722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58584	NC_011832	ATT	2	6	2654758	2654763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58585	NC_011832	TCT	2	6	2654783	2654788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58586	NC_011832	T	6	6	2654838	2654843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58587	NC_011832	T	7	7	2654930	2654936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58588	NC_011832	GAG	2	6	2655005	2655010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58589	NC_011832	TCG	2	6	2655033	2655038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58590	NC_011832	CTTT	2	8	2655069	2655076	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58591	NC_011832	TC	3	6	2655087	2655092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58592	NC_011832	AAC	2	6	2655093	2655098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58593	NC_011832	GAA	2	6	2655127	2655132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58594	NC_011832	T	7	7	2655165	2655171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58595	NC_011832	GA	3	6	2655193	2655198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58596	NC_011832	CAA	2	6	2655208	2655213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58597	NC_011832	T	7	7	2655222	2655228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58598	NC_011832	ATC	2	6	2655237	2655242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58599	NC_011832	TC	3	6	2655241	2655246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58600	NC_011832	T	6	6	2655247	2655252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58601	NC_011832	TC	3	6	2655257	2655262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58602	NC_011832	GGA	2	6	2655384	2655389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58603	NC_011832	ATCA	2	8	2655436	2655443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58604	NC_011832	TCC	3	9	2655473	2655481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58605	NC_011832	TCC	2	6	2655537	2655542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58606	NC_011832	AG	3	6	2655681	2655686	50 %	0 %	50 %	0 %	219853083
58607	NC_011832	AGA	2	6	2655734	2655739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853083
58608	NC_011832	CGA	2	6	2655743	2655748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853083
58609	NC_011832	GA	3	6	2655754	2655759	50 %	0 %	50 %	0 %	219853083
58610	NC_011832	CGT	2	6	2655782	2655787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853083
58611	NC_011832	AGC	2	6	2655802	2655807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853083
58612	NC_011832	TCG	2	6	2655853	2655858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853083
58613	NC_011832	GGT	2	6	2655881	2655886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853083
58614	NC_011832	GGC	2	6	2655889	2655894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853083
58615	NC_011832	AGG	2	6	2655916	2655921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853083
58616	NC_011832	AGA	2	6	2655931	2655936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853083
58617	NC_011832	GAT	2	6	2655938	2655943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853083
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58619	NC_011832	ATC	2	6	2655954	2655959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853083
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58623	NC_011832	ACT	2	6	2656094	2656099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58737	NC_011832	GGA	2	6	2661971	2661976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853095
58738	NC_011832	GCG	2	6	2662096	2662101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853095
58739	NC_011832	GAG	2	6	2662125	2662130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853095
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58851	NC_011832	GCT	2	6	2666887	2666892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853101
58852	NC_011832	GCG	2	6	2666937	2666942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853101
58853	NC_011832	CCA	2	6	2667006	2667011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853101
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58863	NC_011832	GATC	2	8	2667327	2667334	25 %	25 %	25 %	25 %	219853101
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58883	NC_011832	CCCG	2	8	2668185	2668192	0 %	0 %	25 %	75 %	219853103
58884	NC_011832	GAC	2	6	2668233	2668238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853103
58885	NC_011832	CAG	2	6	2668246	2668251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853103
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58900	NC_011832	A	7	7	2668918	2668924	100 %	0 %	0 %	0 %	219853104
58901	NC_011832	CTGGAA	2	12	2668967	2668978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219853104
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58922	NC_011832	TGG	2	6	2669950	2669955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853105
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58930	NC_011832	GTC	3	9	2670464	2670472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853105
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58934	NC_011832	CAT	2	6	2670586	2670591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853105
58935	NC_011832	TCT	2	6	2670606	2670611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853105
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58938	NC_011832	GGCG	2	8	2670650	2670657	0 %	0 %	75 %	25 %	219853105
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58942	NC_011832	CTG	2	6	2670745	2670750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853106
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58945	NC_011832	CGC	2	6	2670942	2670947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853106
58946	NC_011832	CTTC	2	8	2670972	2670979	0 %	50 %	0 %	50 %	219853106
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58950	NC_011832	CTG	2	6	2671183	2671188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853106
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58953	NC_011832	GCCG	2	8	2671353	2671360	0 %	0 %	50 %	50 %	219853106
58954	NC_011832	CCA	2	6	2671367	2671372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853107
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58961	NC_011832	TCT	2	6	2671784	2671789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58964	NC_011832	GGT	2	6	2671911	2671916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853108
58965	NC_011832	CAG	2	6	2671959	2671964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853108
58966	NC_011832	CAGGT	2	10	2672002	2672011	20 %	20 %	40 %	20 %	219853108
58967	NC_011832	GGA	2	6	2672015	2672020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853108
58968	NC_011832	ACCC	2	8	2672059	2672066	25 %	0 %	0 %	75 %	219853108
58969	NC_011832	TCT	2	6	2672069	2672074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853108
58970	NC_011832	CCA	2	6	2672159	2672164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853108
58971	NC_011832	GGT	2	6	2672211	2672216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853108
58972	NC_011832	GAAGAT	2	12	2672235	2672246	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219853108
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58982	NC_011832	CAC	2	6	2672532	2672537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853108
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58987	NC_011832	A	7	7	2672735	2672741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58993	NC_011832	CAG	2	6	2673135	2673140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853109
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58997	NC_011832	TGGACC	2	12	2673243	2673254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219853109
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