MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_011832	CGTCC	2	10	2627881	2627890	0 %	20 %	20 %	60 %	219853053
58002	NC_011832	TCG	2	6	2627975	2627980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58003	NC_011832	ATC	2	6	2628032	2628037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853053
58004	NC_011832	CCG	2	6	2628055	2628060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853053
58005	NC_011832	GAC	2	6	2628142	2628147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58006	NC_011832	CGG	2	6	2628198	2628203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853053
58007	NC_011832	GCC	2	6	2628218	2628223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853053
58008	NC_011832	GGCAG	2	10	2628331	2628340	20 %	0 %	60 %	20 %	219853053
58009	NC_011832	GAT	2	6	2628376	2628381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853053
58010	NC_011832	AGC	2	6	2628419	2628424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58011	NC_011832	CGA	2	6	2628432	2628437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58012	NC_011832	GT	3	6	2628445	2628450	0 %	50 %	50 %	0 %	219853053
58013	NC_011832	AGG	2	6	2628521	2628526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853053
58014	NC_011832	GAG	2	6	2628622	2628627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853053
58015	NC_011832	CAGA	2	8	2628649	2628656	50 %	0 %	25 %	25 %	219853053
58016	NC_011832	AGG	2	6	2628779	2628784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853053
58017	NC_011832	TTCG	2	8	2628799	2628806	0 %	50 %	25 %	25 %	219853053
58018	NC_011832	ATC	2	6	2628833	2628838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853053
58019	NC_011832	ATC	2	6	2628842	2628847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853053
58020	NC_011832	GTC	2	6	2628911	2628916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58021	NC_011832	CCG	2	6	2628917	2628922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853053
58022	NC_011832	GAC	2	6	2628955	2628960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58023	NC_011832	GCACC	2	10	2628999	2629008	20 %	0 %	20 %	60 %	219853053
58024	NC_011832	GAC	2	6	2629012	2629017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58025	NC_011832	TCG	2	6	2629094	2629099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58026	NC_011832	CGG	2	6	2629130	2629135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853053
58027	NC_011832	GAA	2	6	2629219	2629224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853053
58028	NC_011832	AGCCAG	2	12	2629232	2629243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58029	NC_011832	GCT	2	6	2629276	2629281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58030	NC_011832	GAA	2	6	2629300	2629305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853053
58031	NC_011832	GTG	2	6	2629313	2629318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853053
58032	NC_011832	GCC	2	6	2629324	2629329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853053
58033	NC_011832	TTC	2	6	2629382	2629387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853053
58034	NC_011832	CGA	2	6	2629395	2629400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853053
58035	NC_011832	TCCC	2	8	2629469	2629476	0 %	25 %	0 %	75 %	219853054
58036	NC_011832	GAA	2	6	2629521	2629526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853054
58037	NC_011832	GGA	2	6	2629609	2629614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853054
58038	NC_011832	GAT	2	6	2629659	2629664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853054
58039	NC_011832	AGA	2	6	2629712	2629717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853054
58040	NC_011832	CGT	2	6	2629719	2629724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853054
58041	NC_011832	GTT	3	9	2629752	2629760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219853054
58042	NC_011832	AG	3	6	2629791	2629796	50 %	0 %	50 %	0 %	219853054
58043	NC_011832	GCCG	2	8	2629878	2629885	0 %	0 %	50 %	50 %	219853054
58044	NC_011832	TCT	2	6	2629928	2629933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853054
58045	NC_011832	GTCC	2	8	2629951	2629958	0 %	25 %	25 %	50 %	219853054
58046	NC_011832	ATC	2	6	2629960	2629965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853054
58047	NC_011832	CGA	2	6	2629973	2629978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853054
58048	NC_011832	GAC	2	6	2629989	2629994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853054
58049	NC_011832	ATC	2	6	2630002	2630007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853054
58050	NC_011832	CCG	2	6	2630029	2630034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853054
58051	NC_011832	ACC	2	6	2630076	2630081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853054
58052	NC_011832	CCT	2	6	2630180	2630185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853054
58053	NC_011832	GCC	2	6	2630309	2630314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853054
58054	NC_011832	CGGGTT	2	12	2630397	2630408	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219853054
58055	NC_011832	GAA	2	6	2630436	2630441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853054
58056	NC_011832	CCG	3	9	2630443	2630451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853054
58057	NC_011832	CCT	2	6	2630462	2630467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853054
58058	NC_011832	CCT	2	6	2630474	2630479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853054
58059	NC_011832	GAT	2	6	2630583	2630588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853054
58060	NC_011832	GCA	2	6	2630597	2630602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853054
58061	NC_011832	CGGT	2	8	2630650	2630657	0 %	25 %	50 %	25 %	219853054
58062	NC_011832	ACG	2	6	2630686	2630691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853054
58063	NC_011832	GGC	2	6	2630709	2630714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853054
58064	NC_011832	GTTGGT	2	12	2630793	2630804	0 %	50 %	50 %	0 %	219853054
58065	NC_011832	ACGA	2	8	2630806	2630813	50 %	0 %	25 %	25 %	219853054
58066	NC_011832	CCGG	2	8	2630857	2630864	0 %	0 %	50 %	50 %	219853054
58067	NC_011832	AGA	2	6	2630887	2630892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853054
58068	NC_011832	GAG	2	6	2630934	2630939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853054
58069	NC_011832	GAG	2	6	2630988	2630993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853054
58070	NC_011832	CGG	2	6	2631030	2631035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853054
58071	NC_011832	GAA	2	6	2631045	2631050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853054
58072	NC_011832	CGG	2	6	2631086	2631091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853054
58073	NC_011832	GTT	2	6	2631181	2631186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58074	NC_011832	CGA	2	6	2631237	2631242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58075	NC_011832	CTAAT	2	10	2631249	2631258	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58076	NC_011832	TAGA	2	8	2631303	2631310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58077	NC_011832	T	7	7	2631330	2631336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58078	NC_011832	ATC	2	6	2631337	2631342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58079	NC_011832	TCA	2	6	2631500	2631505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58080	NC_011832	TG	3	6	2631546	2631551	0 %	50 %	50 %	0 %	219853055
58081	NC_011832	CAG	2	6	2631600	2631605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853055
58082	NC_011832	CCT	2	6	2631635	2631640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853055
58083	NC_011832	ACCATG	2	12	2631708	2631719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219853055
58084	NC_011832	AG	3	6	2631733	2631738	50 %	0 %	50 %	0 %	219853055
58085	NC_011832	TCG	2	6	2631786	2631791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853055
58086	NC_011832	CAA	2	6	2631794	2631799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219853055
58087	NC_011832	CTT	2	6	2631862	2631867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219853055
58088	NC_011832	TCGA	2	8	2631936	2631943	25 %	25 %	25 %	25 %	219853055
58089	NC_011832	GAA	2	6	2631950	2631955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853055
58090	NC_011832	C	6	6	2631973	2631978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58091	NC_011832	AGT	2	6	2632054	2632059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58092	NC_011832	ATC	2	6	2632070	2632075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58093	NC_011832	GAA	2	6	2632086	2632091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58094	NC_011832	CTC	2	6	2632143	2632148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853056
58095	NC_011832	CGG	2	6	2632229	2632234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853056
58096	NC_011832	CGA	2	6	2632268	2632273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853056
58097	NC_011832	CAGTG	2	10	2632311	2632320	20 %	20 %	40 %	20 %	219853056
58098	NC_011832	AGC	2	6	2632380	2632385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853056
58099	NC_011832	A	6	6	2632391	2632396	100 %	0 %	0 %	0 %	219853056
58100	NC_011832	GAC	3	9	2632409	2632417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853056
58101	NC_011832	CTC	2	6	2632428	2632433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853056
58102	NC_011832	CGG	2	6	2632483	2632488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853056
58103	NC_011832	CCT	2	6	2632543	2632548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853056
58104	NC_011832	G	7	7	2632625	2632631	0 %	0 %	100 %	0 %	219853056
58105	NC_011832	TCG	2	6	2632636	2632641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853056
58106	NC_011832	AGG	2	6	2632663	2632668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219853056
58107	NC_011832	CTC	2	6	2632676	2632681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219853056
58108	NC_011832	GCC	2	6	2632772	2632777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853056
58109	NC_011832	GTC	2	6	2632800	2632805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853056
58110	NC_011832	CTCG	2	8	2632808	2632815	0 %	25 %	25 %	50 %	219853056
58111	NC_011832	GCG	2	6	2632818	2632823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853056
58112	NC_011832	CGGA	2	8	2632839	2632846	25 %	0 %	50 %	25 %	219853056
58113	NC_011832	CGG	2	6	2632870	2632875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853056
58114	NC_011832	CGA	2	6	2632886	2632891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853056
58115	NC_011832	AG	3	6	2633070	2633075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58116	NC_011832	TC	4	8	2633082	2633089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58117	NC_011832	CGA	2	6	2633110	2633115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58118	NC_011832	TCGA	2	8	2633124	2633131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58119	NC_011832	C	6	6	2633135	2633140	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58120	NC_011832	TCA	2	6	2633184	2633189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58125	NC_011832	GGGA	2	8	2633372	2633379	25 %	0 %	75 %	0 %	219853057
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58132	NC_011832	CCGG	2	8	2633727	2633734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58133	NC_011832	TTC	2	6	2633789	2633794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58152	NC_011832	TCT	2	6	2635020	2635025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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58225	NC_011832	ACC	2	6	2638379	2638384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853063
58226	NC_011832	A	7	7	2638393	2638399	100 %	0 %	0 %	0 %	219853063
58227	NC_011832	GGT	2	6	2638454	2638459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219853064
58228	NC_011832	GCA	2	6	2638539	2638544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219853064
58229	NC_011832	TGC	2	6	2638598	2638603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853064
58230	NC_011832	T	6	6	2638681	2638686	0 %	100 %	0 %	0 %	219853064
58231	NC_011832	ATC	2	6	2638851	2638856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853064
58232	NC_011832	TAT	2	6	2638865	2638870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219853064
58233	NC_011832	TGC	2	6	2638940	2638945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853064
58234	NC_011832	ACAT	2	8	2638993	2639000	50 %	25 %	0 %	25 %	219853064
58235	NC_011832	ATT	2	6	2639002	2639007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58236	NC_011832	CG	3	6	2639135	2639140	0 %	0 %	50 %	50 %	219853065
58237	NC_011832	CCG	2	6	2639163	2639168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219853065
58238	NC_011832	GTC	2	6	2639235	2639240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853065
58239	NC_011832	CAC	3	9	2639289	2639297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219853065
58240	NC_011832	GAT	2	6	2639300	2639305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219853065
58241	NC_011832	CTG	2	6	2639362	2639367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219853065
58242	NC_011832	A	6	6	2639384	2639389	100 %	0 %	0 %	0 %	219853065
58243	NC_011832	GTC	2	6	2639421	2639426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58244	NC_011832	CGC	2	6	2639462	2639467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58245	NC_011832	CAC	2	6	2639525	2639530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58246	NC_011832	ATA	2	6	2639562	2639567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58247	NC_011832	CTGTGG	2	12	2639594	2639605	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219853066
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58250	NC_011832	CATGAT	2	12	2639742	2639753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	219853066
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58256	NC_011832	TTCT	2	8	2640009	2640016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58257	NC_011832	TCAC	2	8	2640067	2640074	25 %	25 %	0 %	50 %	219853067
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58345	NC_011832	T	6	6	2643869	2643874	0 %	100 %	0 %	0 %	219853070
58346	NC_011832	TAC	2	6	2643903	2643908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219853070
58347	NC_011832	TTATAA	2	12	2644002	2644013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58348	NC_011832	GACC	2	8	2644045	2644052	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58349	NC_011832	A	6	6	2644075	2644080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58350	NC_011832	AT	3	6	2644178	2644183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58351	NC_011832	ATTC	2	8	2644274	2644281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58352	NC_011832	CAG	3	9	2644334	2644342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58353	NC_011832	CCCGA	2	10	2644362	2644371	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
58354	NC_011832	GGT	2	6	2644440	2644445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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58356	NC_011832	TCC	2	6	2644497	2644502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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58475	NC_011832	GCG	2	6	2650446	2650451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219853077
58476	NC_011832	GACA	2	8	2650454	2650461	50 %	0 %	25 %	25 %	219853077
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58478	NC_011832	GAA	2	6	2650551	2650556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219853077
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