MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_011832	TCCA	2	8	2495473	2495480	25 %	25 %	0 %	50 %	219852925
55002	NC_011832	GCT	2	6	2495495	2495500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852925
55003	NC_011832	GAT	2	6	2495517	2495522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852925
55004	NC_011832	CTG	2	6	2495559	2495564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852925
55005	NC_011832	GAT	2	6	2495588	2495593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852925
55006	NC_011832	ACATCG	2	12	2495632	2495643	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	219852925
55007	NC_011832	GAT	2	6	2495654	2495659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852925
55008	NC_011832	ATG	2	6	2495683	2495688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852925
55009	NC_011832	GACC	2	8	2495699	2495706	25 %	0 %	25 %	50 %	219852925
55010	NC_011832	ACG	2	6	2495809	2495814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852925
55011	NC_011832	ACC	2	6	2495827	2495832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852925
55012	NC_011832	AGG	2	6	2495846	2495851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852925
55013	NC_011832	GTTCA	2	10	2495871	2495880	20 %	40 %	20 %	20 %	219852925
55014	NC_011832	CTACG	2	10	2495895	2495904	20 %	20 %	20 %	40 %	219852925
55015	NC_011832	GGC	2	6	2495924	2495929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852925
55016	NC_011832	CAG	2	6	2495958	2495963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852925
55017	NC_011832	ACA	2	6	2495989	2495994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852925
55018	NC_011832	CTC	2	6	2496024	2496029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852925
55019	NC_011832	AG	3	6	2496030	2496035	50 %	0 %	50 %	0 %	219852925
55020	NC_011832	GCA	2	6	2496048	2496053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852925
55021	NC_011832	CAA	2	6	2496068	2496073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852925
55022	NC_011832	TCGG	2	8	2496087	2496094	0 %	25 %	50 %	25 %	219852925
55023	NC_011832	GAG	2	6	2496096	2496101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852925
55024	NC_011832	AGA	2	6	2496197	2496202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852925
55025	NC_011832	TCG	2	6	2496217	2496222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852925
55026	NC_011832	GCC	2	6	2496231	2496236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852925
55027	NC_011832	GAA	3	9	2496269	2496277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852925
55028	NC_011832	CGA	2	6	2496320	2496325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852925
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55030	NC_011832	GCT	2	6	2496347	2496352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852925
55031	NC_011832	CGC	3	9	2496364	2496372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852925
55032	NC_011832	GTC	2	6	2496390	2496395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852925
55033	NC_011832	CCGA	2	8	2496408	2496415	25 %	0 %	25 %	50 %	219852925
55034	NC_011832	ATC	2	6	2496477	2496482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852925
55035	NC_011832	CAGAC	2	10	2496487	2496496	40 %	0 %	20 %	40 %	219852925
55036	NC_011832	GCA	2	6	2496636	2496641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852925
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55038	NC_011832	GCC	2	6	2496705	2496710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852925
55039	NC_011832	AGA	2	6	2496767	2496772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55040	NC_011832	TCT	2	6	2496856	2496861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852926
55041	NC_011832	CATT	2	8	2496869	2496876	25 %	50 %	0 %	25 %	219852926
55042	NC_011832	TCTG	2	8	2496896	2496903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55043	NC_011832	TGT	2	6	2496940	2496945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55044	NC_011832	TCC	2	6	2496958	2496963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55045	NC_011832	TTA	2	6	2496999	2497004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55046	NC_011832	ATC	2	6	2497027	2497032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55047	NC_011832	T	6	6	2497061	2497066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55048	NC_011832	TCA	2	6	2497114	2497119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55049	NC_011832	CG	3	6	2497199	2497204	0 %	0 %	50 %	50 %	219852927
55050	NC_011832	TTG	2	6	2497211	2497216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852927
55051	NC_011832	CTG	2	6	2497237	2497242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852927
55052	NC_011832	TCT	2	6	2497277	2497282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852927
55053	NC_011832	GAATGC	2	12	2497461	2497472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	219852927
55054	NC_011832	GACCC	2	10	2497474	2497483	20 %	0 %	20 %	60 %	219852927
55055	NC_011832	TCC	2	6	2497520	2497525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852927
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55065	NC_011832	GCA	2	6	2497774	2497779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852927
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55068	NC_011832	AATC	2	8	2497842	2497849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55069	NC_011832	T	7	7	2497852	2497858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55070	NC_011832	AG	4	8	2497866	2497873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55071	NC_011832	T	6	6	2497885	2497890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55072	NC_011832	AGT	2	6	2497894	2497899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55076	NC_011832	CCG	2	6	2497983	2497988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55077	NC_011832	TTC	2	6	2498029	2498034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55078	NC_011832	TCCG	2	8	2498074	2498081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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55084	NC_011832	CG	3	6	2498344	2498349	0 %	0 %	50 %	50 %	219852928
55085	NC_011832	TCG	2	6	2498356	2498361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852928
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55102	NC_011832	TCCC	2	8	2499027	2499034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55103	NC_011832	GGTCG	2	10	2499161	2499170	0 %	20 %	60 %	20 %	219852929
55104	NC_011832	CAGAA	2	10	2499224	2499233	60 %	0 %	20 %	20 %	219852929
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55108	NC_011832	TC	3	6	2499467	2499472	0 %	50 %	0 %	50 %	219852929
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55110	NC_011832	GATG	2	8	2499613	2499620	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55111	NC_011832	AGAT	2	8	2499655	2499662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55112	NC_011832	CCTC	2	8	2499762	2499769	0 %	25 %	0 %	75 %	219852930
55113	NC_011832	TC	3	6	2499768	2499773	0 %	50 %	0 %	50 %	219852930
55114	NC_011832	GATCGT	2	12	2499796	2499807	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219852930
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55118	NC_011832	TC	3	6	2499921	2499926	0 %	50 %	0 %	50 %	219852930
55119	NC_011832	ACTG	2	8	2499928	2499935	25 %	25 %	25 %	25 %	219852930
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55132	NC_011832	TCT	2	6	2500593	2500598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852930
55133	NC_011832	CTA	2	6	2500639	2500644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852930
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55138	NC_011832	A	7	7	2501081	2501087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55139	NC_011832	AGGAGA	2	12	2501092	2501103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55140	NC_011832	CAT	2	6	2501107	2501112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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55144	NC_011832	GCG	2	6	2501274	2501279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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55146	NC_011832	CATC	2	8	2501326	2501333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55147	NC_011832	GGA	2	6	2501365	2501370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55148	NC_011832	CGCT	2	8	2501437	2501444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55149	NC_011832	CTC	2	6	2501497	2501502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55150	NC_011832	CTG	2	6	2501542	2501547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55152	NC_011832	GTT	2	6	2501650	2501655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55153	NC_011832	GA	3	6	2501692	2501697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55154	NC_011832	AG	3	6	2501698	2501703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55155	NC_011832	ACTGA	2	10	2501704	2501713	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55156	NC_011832	A	6	6	2501723	2501728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55157	NC_011832	A	6	6	2501731	2501736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55158	NC_011832	GATC	2	8	2501752	2501759	25 %	25 %	25 %	25 %	219852931
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55179	NC_011832	TC	3	6	2502659	2502664	0 %	50 %	0 %	50 %	219852931
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55232	NC_011832	TAA	2	6	2505045	2505050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55233	NC_011832	TAA	2	6	2505070	2505075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55234	NC_011832	AG	3	6	2505109	2505114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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55236	NC_011832	AG	3	6	2505128	2505133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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55474	NC_011832	GTT	2	6	2517092	2517097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55475	NC_011832	ATG	2	6	2517160	2517165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55476	NC_011832	CGA	2	6	2517181	2517186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55477	NC_011832	ACA	2	6	2517431	2517436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852943
55478	NC_011832	CTG	2	6	2517487	2517492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852943
55479	NC_011832	TGG	2	6	2517494	2517499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852943
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