MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_011832	ACC	2	6	2472466	2472471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852898
54502	NC_011832	TGC	2	6	2472481	2472486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852898
54503	NC_011832	TCC	2	6	2472570	2472575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852898
54504	NC_011832	GAG	2	6	2472577	2472582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852898
54505	NC_011832	TGT	2	6	2472595	2472600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852898
54506	NC_011832	TC	3	6	2472777	2472782	0 %	50 %	0 %	50 %	219852898
54507	NC_011832	TC	3	6	2472785	2472790	0 %	50 %	0 %	50 %	219852898
54508	NC_011832	AGC	2	6	2472889	2472894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852898
54509	NC_011832	CAA	2	6	2472918	2472923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852898
54510	NC_011832	GAA	2	6	2472924	2472929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852898
54511	NC_011832	CTG	2	6	2472942	2472947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852898
54512	NC_011832	CCG	2	6	2472948	2472953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852898
54513	NC_011832	TGC	2	6	2473072	2473077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852898
54514	NC_011832	AGA	2	6	2473086	2473091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852898
54515	NC_011832	CAT	2	6	2473126	2473131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852898
54516	NC_011832	AGA	2	6	2473163	2473168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852898
54517	NC_011832	AAC	2	6	2473242	2473247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852898
54518	NC_011832	ATG	2	6	2473262	2473267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852898
54519	NC_011832	CAG	2	6	2473276	2473281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54520	NC_011832	ATG	2	6	2473375	2473380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852899
54521	NC_011832	GCA	2	6	2473394	2473399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852899
54522	NC_011832	GCT	2	6	2473498	2473503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852899
54523	NC_011832	ATC	2	6	2473520	2473525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852899
54524	NC_011832	GAC	2	6	2473684	2473689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852900
54525	NC_011832	AGA	2	6	2473725	2473730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852900
54526	NC_011832	GGA	2	6	2473731	2473736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852900
54527	NC_011832	CCG	2	6	2473895	2473900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852900
54528	NC_011832	ATC	2	6	2473967	2473972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852900
54529	NC_011832	GCA	2	6	2474009	2474014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852900
54530	NC_011832	C	6	6	2474048	2474053	0 %	0 %	0 %	100 %	219852901
54531	NC_011832	GGCT	2	8	2474071	2474078	0 %	25 %	50 %	25 %	219852901
54532	NC_011832	ATG	2	6	2474079	2474084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852901
54533	NC_011832	ATG	2	6	2474091	2474096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852901
54534	NC_011832	GGT	2	6	2474174	2474179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852901
54535	NC_011832	AGC	2	6	2474196	2474201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852901
54536	NC_011832	CAG	2	6	2474252	2474257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852901
54537	NC_011832	CCT	2	6	2474274	2474279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852901
54538	NC_011832	ATA	2	6	2474481	2474486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852901
54539	NC_011832	GAT	2	6	2474498	2474503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852901
54540	NC_011832	CCT	2	6	2474505	2474510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852901
54541	NC_011832	CGG	2	6	2474582	2474587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852901
54542	NC_011832	ATG	2	6	2474829	2474834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852901
54543	NC_011832	AGG	5	15	2474964	2474978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852901
54544	NC_011832	GAT	2	6	2475023	2475028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852901
54545	NC_011832	TAA	2	6	2475038	2475043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852901
54546	NC_011832	ATTG	2	8	2475107	2475114	25 %	50 %	25 %	0 %	219852901
54547	NC_011832	GAG	2	6	2475218	2475223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852901
54548	NC_011832	GAG	2	6	2475269	2475274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852901
54549	NC_011832	CTG	2	6	2475322	2475327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852901
54550	NC_011832	CGGG	2	8	2475363	2475370	0 %	0 %	75 %	25 %	219852901
54551	NC_011832	TCT	2	6	2475382	2475387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852901
54552	NC_011832	GCCA	2	8	2475423	2475430	25 %	0 %	25 %	50 %	219852901
54553	NC_011832	GGA	2	6	2475435	2475440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852901
54554	NC_011832	ATG	2	6	2475533	2475538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852901
54555	NC_011832	GGA	2	6	2475571	2475576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852901
54556	NC_011832	TCG	2	6	2475579	2475584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852901
54557	NC_011832	GAA	2	6	2475629	2475634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852901
54558	NC_011832	T	6	6	2475635	2475640	0 %	100 %	0 %	0 %	219852901
54559	NC_011832	CAT	2	6	2475641	2475646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852901
54560	NC_011832	TTC	2	6	2475669	2475674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852901
54561	NC_011832	GTG	2	6	2475735	2475740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852901
54562	NC_011832	GTTG	2	8	2475761	2475768	0 %	50 %	50 %	0 %	219852901
54563	NC_011832	GAT	2	6	2475806	2475811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852901
54564	NC_011832	CTT	2	6	2475917	2475922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852901
54565	NC_011832	CTG	2	6	2475953	2475958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852901
54566	NC_011832	CTT	2	6	2476034	2476039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852901
54567	NC_011832	CTG	2	6	2476050	2476055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852902
54568	NC_011832	GCC	2	6	2476210	2476215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852902
54569	NC_011832	GA	3	6	2476256	2476261	50 %	0 %	50 %	0 %	219852902
54570	NC_011832	GA	3	6	2476265	2476270	50 %	0 %	50 %	0 %	219852902
54571	NC_011832	GA	3	6	2476339	2476344	50 %	0 %	50 %	0 %	219852903
54572	NC_011832	CGGAC	2	10	2476447	2476456	20 %	0 %	40 %	40 %	219852903
54573	NC_011832	GTG	2	6	2476513	2476518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852903
54574	NC_011832	ATATT	2	10	2476706	2476715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54575	NC_011832	CAG	2	6	2476748	2476753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852904
54576	NC_011832	GCC	2	6	2476847	2476852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852904
54577	NC_011832	A	6	6	2476872	2476877	100 %	0 %	0 %	0 %	219852904
54578	NC_011832	TACC	2	8	2476898	2476905	25 %	25 %	0 %	50 %	219852904
54579	NC_011832	A	6	6	2476940	2476945	100 %	0 %	0 %	0 %	219852904
54580	NC_011832	TGA	2	6	2476999	2477004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852904
54581	NC_011832	ATG	2	6	2477040	2477045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852904
54582	NC_011832	AGC	2	6	2477074	2477079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852904
54583	NC_011832	GAT	2	6	2477178	2477183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852904
54584	NC_011832	ATG	2	6	2477270	2477275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852905
54585	NC_011832	ATGG	2	8	2477309	2477316	25 %	25 %	50 %	0 %	219852905
54586	NC_011832	GGA	2	6	2477344	2477349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852905
54587	NC_011832	AC	3	6	2477476	2477481	50 %	0 %	0 %	50 %	219852905
54588	NC_011832	AGA	2	6	2477584	2477589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852905
54589	NC_011832	TCGTGA	2	12	2477590	2477601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219852905
54590	NC_011832	TGA	3	9	2477599	2477607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852905
54591	NC_011832	AAT	2	6	2477612	2477617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852905
54592	NC_011832	CGA	2	6	2477623	2477628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852905
54593	NC_011832	CAA	2	6	2477659	2477664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852905
54594	NC_011832	TGCA	2	8	2477696	2477703	25 %	25 %	25 %	25 %	219852905
54595	NC_011832	CAA	2	6	2477788	2477793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852905
54596	NC_011832	CGAT	2	8	2477847	2477854	25 %	25 %	25 %	25 %	219852905
54597	NC_011832	ATC	2	6	2477889	2477894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852905
54598	NC_011832	CAC	2	6	2477897	2477902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852905
54599	NC_011832	TCG	2	6	2477953	2477958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852905
54600	NC_011832	CAT	2	6	2477972	2477977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852905
54601	NC_011832	AAC	2	6	2477985	2477990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852905
54602	NC_011832	TGC	2	6	2478049	2478054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852905
54603	NC_011832	AAT	2	6	2478058	2478063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852905
54604	NC_011832	GAC	2	6	2478071	2478076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852905
54605	NC_011832	GGT	2	6	2478140	2478145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852905
54606	NC_011832	ATG	2	6	2478188	2478193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852905
54607	NC_011832	ATC	2	6	2478252	2478257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852905
54608	NC_011832	CCT	2	6	2478267	2478272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852906
54609	NC_011832	TCA	2	6	2478303	2478308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852906
54610	NC_011832	TGG	2	6	2478330	2478335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852906
54611	NC_011832	CAC	2	6	2478370	2478375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852906
54612	NC_011832	TGC	2	6	2478387	2478392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852906
54613	NC_011832	GC	3	6	2478426	2478431	0 %	0 %	50 %	50 %	219852906
54614	NC_011832	TCC	2	6	2478479	2478484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852906
54615	NC_011832	CGAT	2	8	2478558	2478565	25 %	25 %	25 %	25 %	219852906
54616	NC_011832	GATG	2	8	2478633	2478640	25 %	25 %	50 %	0 %	219852906
54617	NC_011832	GAAC	2	8	2478693	2478700	50 %	0 %	25 %	25 %	219852906
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54619	NC_011832	GAG	2	6	2478730	2478735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852906
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54621	NC_011832	AGG	2	6	2478827	2478832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852906
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54642	NC_011832	CAT	2	6	2479586	2479591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852907
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54644	NC_011832	GAT	2	6	2479752	2479757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852907
54645	NC_011832	ATC	3	9	2479777	2479785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852907
54646	NC_011832	CGT	2	6	2479848	2479853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852907
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54692	NC_011832	GAG	2	6	2481602	2481607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54719	NC_011832	GA	3	6	2482755	2482760	50 %	0 %	50 %	0 %	219852911
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54729	NC_011832	CCA	2	6	2483064	2483069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852911
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54731	NC_011832	CCT	2	6	2483134	2483139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852911
54732	NC_011832	TCGAT	2	10	2483426	2483435	20 %	40 %	20 %	20 %	219852912
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54734	NC_011832	ATC	2	6	2483475	2483480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852912
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54742	NC_011832	AT	3	6	2483795	2483800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54743	NC_011832	TTGA	2	8	2483822	2483829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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54966	NC_011832	TGA	2	6	2494052	2494057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852923
54967	NC_011832	TGA	2	6	2494139	2494144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852923
54968	NC_011832	TCT	2	6	2494157	2494162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852923
54969	NC_011832	ATC	2	6	2494204	2494209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852923
54970	NC_011832	CTT	2	6	2494233	2494238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852923
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54974	NC_011832	GGT	2	6	2494452	2494457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852923
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54978	NC_011832	ATGCC	2	10	2494682	2494691	20 %	20 %	20 %	40 %	219852924
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54981	NC_011832	TTC	2	6	2494909	2494914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852924
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54983	NC_011832	TCG	2	6	2494931	2494936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852924
54984	NC_011832	CTG	2	6	2495025	2495030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852924
54985	NC_011832	TAG	2	6	2495079	2495084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54986	NC_011832	TA	3	6	2495088	2495093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54987	NC_011832	AT	3	6	2495095	2495100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54988	NC_011832	ATC	2	6	2495116	2495121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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54991	NC_011832	AG	3	6	2495228	2495233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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