MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_011832	ATA	2	6	2381747	2381752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852816
52502	NC_011832	GAG	2	6	2381783	2381788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852816
52503	NC_011832	AAC	2	6	2381789	2381794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852816
52504	NC_011832	TCA	2	6	2381796	2381801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852816
52505	NC_011832	ATCG	2	8	2381804	2381811	25 %	25 %	25 %	25 %	219852816
52506	NC_011832	TCA	2	6	2381887	2381892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852816
52507	NC_011832	GGCCG	2	10	2381906	2381915	0 %	0 %	60 %	40 %	219852816
52508	NC_011832	TCT	2	6	2381938	2381943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852816
52509	NC_011832	CTG	2	6	2381968	2381973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852816
52510	NC_011832	GAT	2	6	2381990	2381995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852816
52511	NC_011832	CGA	2	6	2382010	2382015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852816
52512	NC_011832	TCCT	2	8	2382019	2382026	0 %	50 %	0 %	50 %	219852816
52513	NC_011832	CGA	2	6	2382070	2382075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852816
52514	NC_011832	CACC	2	8	2382154	2382161	25 %	0 %	0 %	75 %	219852816
52515	NC_011832	GAT	2	6	2382203	2382208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852816
52516	NC_011832	CCA	2	6	2382273	2382278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852816
52517	NC_011832	ATT	2	6	2382297	2382302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852816
52518	NC_011832	A	6	6	2382392	2382397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52519	NC_011832	CTG	2	6	2382419	2382424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52520	NC_011832	GT	3	6	2382425	2382430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52521	NC_011832	CAG	2	6	2382440	2382445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52522	NC_011832	CTG	2	6	2382462	2382467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52523	NC_011832	GCC	2	6	2382524	2382529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852817
52524	NC_011832	CTC	2	6	2382530	2382535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852817
52525	NC_011832	CTT	2	6	2382541	2382546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852817
52526	NC_011832	CTT	2	6	2382607	2382612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852817
52527	NC_011832	AG	3	6	2382618	2382623	50 %	0 %	50 %	0 %	219852817
52528	NC_011832	GAC	2	6	2382631	2382636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852817
52529	NC_011832	CTT	2	6	2382643	2382648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852817
52530	NC_011832	CAT	2	6	2382748	2382753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852817
52531	NC_011832	GCC	2	6	2382799	2382804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852817
52532	NC_011832	GAT	2	6	2382832	2382837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852817
52533	NC_011832	GCC	2	6	2382841	2382846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852817
52534	NC_011832	CGC	2	6	2382879	2382884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852817
52535	NC_011832	GAT	3	9	2382886	2382894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852817
52536	NC_011832	CTGC	2	8	2382926	2382933	0 %	25 %	25 %	50 %	219852817
52537	NC_011832	GCC	2	6	2382937	2382942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852817
52538	NC_011832	CAG	2	6	2383024	2383029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852817
52539	NC_011832	ACAT	2	8	2383112	2383119	50 %	25 %	0 %	25 %	219852817
52540	NC_011832	CGA	2	6	2383356	2383361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852817
52541	NC_011832	CTCAC	2	10	2383409	2383418	20 %	20 %	0 %	60 %	219852818
52542	NC_011832	GTG	2	6	2383460	2383465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852818
52543	NC_011832	GTT	2	6	2383481	2383486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852818
52544	NC_011832	GTA	2	6	2383499	2383504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852818
52545	NC_011832	CAT	2	6	2383525	2383530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852818
52546	NC_011832	AG	3	6	2383570	2383575	50 %	0 %	50 %	0 %	219852818
52547	NC_011832	TTG	2	6	2383581	2383586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852818
52548	NC_011832	CAT	2	6	2383639	2383644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852818
52549	NC_011832	GAC	2	6	2383709	2383714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852818
52550	NC_011832	CGC	2	6	2383744	2383749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852818
52551	NC_011832	TCA	2	6	2383909	2383914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852818
52552	NC_011832	GTG	2	6	2383968	2383973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852818
52553	NC_011832	CTG	2	6	2384080	2384085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852818
52554	NC_011832	TCGACG	2	12	2384097	2384108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	219852818
52555	NC_011832	GGT	2	6	2384140	2384145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852818
52556	NC_011832	CGG	2	6	2384161	2384166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852818
52557	NC_011832	TCG	2	6	2384170	2384175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852818
52558	NC_011832	CA	3	6	2384192	2384197	50 %	0 %	0 %	50 %	219852818
52559	NC_011832	TTC	2	6	2384217	2384222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852818
52560	NC_011832	CAT	2	6	2384240	2384245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852818
52561	NC_011832	CAGC	2	8	2384270	2384277	25 %	0 %	25 %	50 %	219852818
52562	NC_011832	CCA	2	6	2384283	2384288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852818
52563	NC_011832	GTG	2	6	2384312	2384317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852818
52564	NC_011832	TTG	2	6	2384340	2384345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852818
52565	NC_011832	GTT	2	6	2384414	2384419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852818
52566	NC_011832	AGC	2	6	2384469	2384474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852818
52567	NC_011832	AG	3	6	2384528	2384533	50 %	0 %	50 %	0 %	219852818
52568	NC_011832	CCCATG	2	12	2384545	2384556	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	219852818
52569	NC_011832	AGC	2	6	2384610	2384615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852818
52570	NC_011832	GTT	2	6	2384678	2384683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852818
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52572	NC_011832	CGT	2	6	2384783	2384788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852818
52573	NC_011832	ACC	3	9	2384843	2384851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852818
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52575	NC_011832	CTTC	2	8	2384913	2384920	0 %	50 %	0 %	50 %	219852818
52576	NC_011832	CGA	2	6	2385028	2385033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852818
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52581	NC_011832	GAT	2	6	2385579	2385584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852819
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52584	NC_011832	GAT	2	6	2385684	2385689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852819
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52587	NC_011832	TCT	2	6	2385731	2385736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852819
52588	NC_011832	GAG	2	6	2385801	2385806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852819
52589	NC_011832	TC	3	6	2385814	2385819	0 %	50 %	0 %	50 %	219852819
52590	NC_011832	CGGTGT	2	12	2385857	2385868	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	219852819
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52596	NC_011832	CTT	2	6	2386185	2386190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852819
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52601	NC_011832	TCA	2	6	2386366	2386371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852819
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52607	NC_011832	GAT	2	6	2386739	2386744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852820
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52611	NC_011832	CCT	2	6	2386856	2386861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52612	NC_011832	T	7	7	2386871	2386877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52613	NC_011832	GCTT	2	8	2386878	2386885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52614	NC_011832	TCT	2	6	2386965	2386970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52615	NC_011832	GAT	2	6	2387042	2387047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52616	NC_011832	AT	4	8	2387046	2387053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52617	NC_011832	GAT	2	6	2387223	2387228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852821
52618	NC_011832	CTG	2	6	2387448	2387453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852821
52619	NC_011832	TCGT	2	8	2387456	2387463	0 %	50 %	25 %	25 %	219852821
52620	NC_011832	TCC	2	6	2387500	2387505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52621	NC_011832	TGCT	2	8	2387529	2387536	0 %	50 %	25 %	25 %	219852822
52622	NC_011832	GTGG	2	8	2387571	2387578	0 %	25 %	75 %	0 %	219852822
52623	NC_011832	TGA	2	6	2387594	2387599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852822
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52646	NC_011832	CTTC	2	8	2388905	2388912	0 %	50 %	0 %	50 %	219852823
52647	NC_011832	CA	3	6	2389044	2389049	50 %	0 %	0 %	50 %	219852823
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52713	NC_011832	CA	3	6	2392942	2392947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52714	NC_011832	AAT	2	6	2392992	2392997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52715	NC_011832	CCTG	2	8	2393031	2393038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52716	NC_011832	TAA	2	6	2393077	2393082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52717	NC_011832	ATT	2	6	2393144	2393149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52718	NC_011832	CCA	2	6	2393153	2393158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52719	NC_011832	TCA	2	6	2393258	2393263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852828
52720	NC_011832	CTG	2	6	2393264	2393269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852828
52721	NC_011832	CGA	2	6	2393270	2393275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852828
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52729	NC_011832	CTT	2	6	2393547	2393552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852828
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52732	NC_011832	TCA	2	6	2393627	2393632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852828
52733	NC_011832	GAG	3	9	2393635	2393643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852828
52734	NC_011832	CTT	2	6	2393676	2393681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852828
52735	NC_011832	GCC	2	6	2393725	2393730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852828
52736	NC_011832	GCGAT	2	10	2393732	2393741	20 %	20 %	40 %	20 %	219852828
52737	NC_011832	GCG	2	6	2393744	2393749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852828
52738	NC_011832	GGT	2	6	2393776	2393781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852828
52739	NC_011832	GAA	2	6	2393811	2393816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852828
52740	NC_011832	GCAT	2	8	2393983	2393990	25 %	25 %	25 %	25 %	219852828
52741	NC_011832	TCA	2	6	2394008	2394013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852828
52742	NC_011832	CGG	2	6	2394027	2394032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852828
52743	NC_011832	CCAGTT	2	12	2394048	2394059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	219852828
52744	NC_011832	TCT	2	6	2394099	2394104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52745	NC_011832	T	7	7	2394109	2394115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52746	NC_011832	TGA	2	6	2394210	2394215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52747	NC_011832	AT	3	6	2394234	2394239	50 %	50 %	0 %	0 %	219852829
52748	NC_011832	T	6	6	2394434	2394439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52749	NC_011832	A	8	8	2394479	2394486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52750	NC_011832	TAT	2	6	2394523	2394528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52751	NC_011832	TTC	2	6	2394549	2394554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52752	NC_011832	GAT	2	6	2394613	2394618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52753	NC_011832	TCA	2	6	2394650	2394655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852830
52754	NC_011832	CCG	2	6	2394688	2394693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852830
52755	NC_011832	GA	3	6	2394716	2394721	50 %	0 %	50 %	0 %	219852830
52756	NC_011832	GCA	2	6	2394734	2394739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852830
52757	NC_011832	CTC	2	6	2394748	2394753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852830
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52760	NC_011832	GAG	2	6	2394975	2394980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52761	NC_011832	GAA	2	6	2395027	2395032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52763	NC_011832	TCA	2	6	2395104	2395109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852831
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52765	NC_011832	AGGG	2	8	2395179	2395186	25 %	0 %	75 %	0 %	219852831
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52777	NC_011832	GATC	2	8	2395875	2395882	25 %	25 %	25 %	25 %	219852832
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52843	NC_011832	GGA	2	6	2398830	2398835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852834
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52965	NC_011832	CTG	2	6	2403737	2403742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852838
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