MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_011832	GA	3	6	2357826	2357831	50 %	0 %	50 %	0 %	219852797
52003	NC_011832	GTCCG	2	10	2357936	2357945	0 %	20 %	40 %	40 %	219852797
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52005	NC_011832	TCG	2	6	2358089	2358094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852797
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52013	NC_011832	CGT	2	6	2358419	2358424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852797
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52015	NC_011832	TGATCG	2	12	2358473	2358484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	219852797
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52119	NC_011832	A	8	8	2364554	2364561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52120	NC_011832	GA	3	6	2364583	2364588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52121	NC_011832	TCAGG	2	10	2364617	2364626	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52122	NC_011832	GAT	2	6	2364627	2364632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52123	NC_011832	AC	3	6	2364633	2364638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52124	NC_011832	AGG	2	6	2364649	2364654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52125	NC_011832	CAT	2	6	2364656	2364661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52126	NC_011832	GCA	2	6	2364668	2364673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52127	NC_011832	CCT	2	6	2364674	2364679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52128	NC_011832	CCAT	2	8	2364787	2364794	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52129	NC_011832	GAC	2	6	2364885	2364890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52130	NC_011832	ATT	2	6	2364910	2364915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52131	NC_011832	TG	3	6	2364924	2364929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52132	NC_011832	T	6	6	2364981	2364986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52133	NC_011832	GAA	2	6	2364987	2364992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52134	NC_011832	CAT	2	6	2365026	2365031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52183	NC_011832	TTCA	2	8	2367024	2367031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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52222	NC_011832	TGT	2	6	2368721	2368726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52224	NC_011832	GA	3	6	2368772	2368777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52225	NC_011832	TGCA	2	8	2368832	2368839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52226	NC_011832	CCACC	2	10	2368849	2368858	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
52227	NC_011832	CTCC	2	8	2368986	2368993	0 %	25 %	0 %	75 %	219852802
52228	NC_011832	GA	3	6	2368997	2369002	50 %	0 %	50 %	0 %	219852802
52229	NC_011832	GCGT	2	8	2369015	2369022	0 %	25 %	50 %	25 %	219852802
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52238	NC_011832	AGG	2	6	2369279	2369284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852802
52239	NC_011832	TCTG	2	8	2369348	2369355	0 %	50 %	25 %	25 %	219852802
52240	NC_011832	CTGA	2	8	2369409	2369416	25 %	25 %	25 %	25 %	219852802
52241	NC_011832	CCT	2	6	2369435	2369440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852802
52242	NC_011832	GAGG	2	8	2369457	2369464	25 %	0 %	75 %	0 %	219852802
52243	NC_011832	CGA	2	6	2369501	2369506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852802
52244	NC_011832	GAGG	2	8	2369537	2369544	25 %	0 %	75 %	0 %	219852802
52245	NC_011832	ATGG	2	8	2369627	2369634	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52246	NC_011832	CGG	2	6	2369698	2369703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52247	NC_011832	TC	3	6	2369748	2369753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52248	NC_011832	TGT	2	6	2369786	2369791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52269	NC_011832	TTG	2	6	2370617	2370622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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52271	NC_011832	CTCTC	2	10	2370702	2370711	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52272	NC_011832	GA	3	6	2370721	2370726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52273	NC_011832	GAA	2	6	2370778	2370783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52274	NC_011832	CT	3	6	2370822	2370827	0 %	50 %	0 %	50 %	219852804
52275	NC_011832	GGGGAG	2	12	2370884	2370895	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	219852804
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52278	NC_011832	TC	3	6	2371075	2371080	0 %	50 %	0 %	50 %	219852804
52279	NC_011832	GATC	2	8	2371150	2371157	25 %	25 %	25 %	25 %	219852804
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52310	NC_011832	CAG	2	6	2372625	2372630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52312	NC_011832	AATT	2	8	2372767	2372774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52313	NC_011832	ACG	3	9	2372801	2372809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52341	NC_011832	GCGG	2	8	2373924	2373931	0 %	0 %	75 %	25 %	219852806
52342	NC_011832	GTG	2	6	2373932	2373937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852806
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52345	NC_011832	TTCA	2	8	2374078	2374085	25 %	50 %	0 %	25 %	219852806
52346	NC_011832	CTG	2	6	2374180	2374185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
52347	NC_011832	GC	3	6	2374213	2374218	0 %	0 %	50 %	50 %	219852806
52348	NC_011832	ATA	2	6	2374276	2374281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852806
52349	NC_011832	TG	3	6	2374412	2374417	0 %	50 %	50 %	0 %	219852806
52350	NC_011832	GGT	2	6	2374420	2374425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852806
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52354	NC_011832	GAA	2	6	2374579	2374584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852806
52355	NC_011832	GTC	2	6	2374585	2374590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852806
52356	NC_011832	AG	3	6	2374711	2374716	50 %	0 %	50 %	0 %	219852806
52357	NC_011832	CGAT	2	8	2374722	2374729	25 %	25 %	25 %	25 %	219852806
52358	NC_011832	GAT	3	9	2374759	2374767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52359	NC_011832	AAT	2	6	2374797	2374802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52360	NC_011832	ATA	2	6	2374821	2374826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52361	NC_011832	GAT	2	6	2374838	2374843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52362	NC_011832	ATT	3	9	2374844	2374852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52363	NC_011832	GAAA	2	8	2374866	2374873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52364	NC_011832	TTA	2	6	2374877	2374882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52365	NC_011832	CTG	2	6	2374967	2374972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52366	NC_011832	ATC	2	6	2374983	2374988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852807
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52374	NC_011832	AAT	2	6	2375344	2375349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52385	NC_011832	TGC	2	6	2375715	2375720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852808
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52388	NC_011832	A	6	6	2375839	2375844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52389	NC_011832	A	7	7	2375854	2375860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52456	NC_011832	CAG	2	6	2379669	2379674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852813
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52466	NC_011832	G	6	6	2380070	2380075	0 %	0 %	100 %	0 %	219852813
52467	NC_011832	ATG	2	6	2380078	2380083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852813
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52469	NC_011832	GA	3	6	2380123	2380128	50 %	0 %	50 %	0 %	219852813
52470	NC_011832	TGC	2	6	2380146	2380151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852813
52471	NC_011832	CAC	2	6	2380218	2380223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852813
52472	NC_011832	CTC	2	6	2380236	2380241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852813
52473	NC_011832	AGCG	2	8	2380243	2380250	25 %	0 %	50 %	25 %	219852813
52474	NC_011832	CCA	2	6	2380286	2380291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852813
52475	NC_011832	GAG	3	9	2380365	2380373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852813
52476	NC_011832	GAG	2	6	2380440	2380445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852813
52477	NC_011832	CCA	2	6	2380490	2380495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852813
52478	NC_011832	CAG	2	6	2380592	2380597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852814
52479	NC_011832	ACC	2	6	2380612	2380617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852814
52480	NC_011832	CAC	2	6	2380658	2380663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852814
52481	NC_011832	CCT	2	6	2380726	2380731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852814
52482	NC_011832	CAC	2	6	2380733	2380738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852814
52483	NC_011832	ATC	2	6	2380851	2380856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852814
52484	NC_011832	TCG	2	6	2380857	2380862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852814
52485	NC_011832	GA	3	6	2380923	2380928	50 %	0 %	50 %	0 %	219852814
52486	NC_011832	TCT	2	6	2381077	2381082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852815
52487	NC_011832	AGA	2	6	2381140	2381145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852815
52488	NC_011832	CAT	2	6	2381231	2381236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852815
52489	NC_011832	CTT	2	6	2381238	2381243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52490	NC_011832	CT	3	6	2381263	2381268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52491	NC_011832	ACC	2	6	2381281	2381286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52492	NC_011832	GAT	2	6	2381309	2381314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852816
52493	NC_011832	ATC	2	6	2381363	2381368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852816
52494	NC_011832	AAGC	2	8	2381430	2381437	50 %	0 %	25 %	25 %	219852816
52495	NC_011832	ATC	2	6	2381487	2381492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852816
52496	NC_011832	TCCCA	2	10	2381512	2381521	20 %	20 %	0 %	60 %	219852816
52497	NC_011832	CCG	2	6	2381531	2381536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852816
52498	NC_011832	GTGA	2	8	2381543	2381550	25 %	25 %	50 %	0 %	219852816
52499	NC_011832	GACCAC	2	12	2381648	2381659	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	219852816
52500	NC_011832	ATC	2	6	2381660	2381665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852816

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