MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_011832	T	6	6	2313602	2313607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51002	NC_011832	ATT	2	6	2313609	2313614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51003	NC_011832	ATC	2	6	2313618	2313623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51004	NC_011832	CGC	2	6	2313649	2313654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51005	NC_011832	A	6	6	2313683	2313688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51006	NC_011832	ACG	2	6	2313763	2313768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51007	NC_011832	AAC	2	6	2313798	2313803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51008	NC_011832	T	8	8	2313838	2313845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51009	NC_011832	TAG	2	6	2313890	2313895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51010	NC_011832	GAA	2	6	2313902	2313907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51011	NC_011832	AG	3	6	2313921	2313926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51012	NC_011832	CAA	2	6	2313967	2313972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51013	NC_011832	TTA	2	6	2313988	2313993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51014	NC_011832	TCCA	2	8	2314015	2314022	25 %	25 %	0 %	50 %	219852765
51015	NC_011832	A	7	7	2314022	2314028	100 %	0 %	0 %	0 %	219852765
51016	NC_011832	ATT	2	6	2314044	2314049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852765
51017	NC_011832	TTC	2	6	2314111	2314116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852765
51018	NC_011832	ATT	2	6	2314128	2314133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852765
51019	NC_011832	TTCT	2	8	2314163	2314170	0 %	75 %	0 %	25 %	219852765
51020	NC_011832	TCTT	2	8	2314176	2314183	0 %	75 %	0 %	25 %	219852765
51021	NC_011832	CT	3	6	2314216	2314221	0 %	50 %	0 %	50 %	219852765
51022	NC_011832	T	6	6	2314234	2314239	0 %	100 %	0 %	0 %	219852765
51023	NC_011832	T	6	6	2314296	2314301	0 %	100 %	0 %	0 %	219852765
51024	NC_011832	TCT	2	6	2314340	2314345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852765
51025	NC_011832	T	7	7	2314351	2314357	0 %	100 %	0 %	0 %	219852765
51026	NC_011832	CAAT	2	8	2314390	2314397	50 %	25 %	0 %	25 %	219852765
51027	NC_011832	AAG	2	6	2314544	2314549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852765
51028	NC_011832	TA	3	6	2314558	2314563	50 %	50 %	0 %	0 %	219852765
51029	NC_011832	ACT	2	6	2314643	2314648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852765
51030	NC_011832	GAT	2	6	2314677	2314682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852765
51031	NC_011832	GACAA	2	10	2314691	2314700	60 %	0 %	20 %	20 %	219852765
51032	NC_011832	A	6	6	2314699	2314704	100 %	0 %	0 %	0 %	219852765
51033	NC_011832	GTT	3	9	2314719	2314727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852765
51034	NC_011832	T	7	7	2314726	2314732	0 %	100 %	0 %	0 %	219852765
51035	NC_011832	ATTTGT	2	12	2314737	2314748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	219852765
51036	NC_011832	CTT	2	6	2314770	2314775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852765
51037	NC_011832	TC	3	6	2314796	2314801	0 %	50 %	0 %	50 %	219852765
51038	NC_011832	AGAGG	2	10	2314806	2314815	40 %	0 %	60 %	0 %	219852765
51039	NC_011832	TTGT	2	8	2314872	2314879	0 %	75 %	25 %	0 %	219852765
51040	NC_011832	ATT	2	6	2314915	2314920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852765
51041	NC_011832	TA	3	6	2314935	2314940	50 %	50 %	0 %	0 %	219852765
51042	NC_011832	T	6	6	2315013	2315018	0 %	100 %	0 %	0 %	219852765
51043	NC_011832	CTG	2	6	2315041	2315046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852765
51044	NC_011832	T	6	6	2315052	2315057	0 %	100 %	0 %	0 %	219852765
51045	NC_011832	AT	3	6	2315061	2315066	50 %	50 %	0 %	0 %	219852765
51046	NC_011832	CAA	2	6	2315183	2315188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852765
51047	NC_011832	TAT	2	6	2315211	2315216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852765
51048	NC_011832	A	6	6	2315225	2315230	100 %	0 %	0 %	0 %	219852765
51049	NC_011832	TGA	2	6	2315236	2315241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852765
51050	NC_011832	ATG	2	6	2315259	2315264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852765
51051	NC_011832	TGA	2	6	2315278	2315283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852765
51052	NC_011832	TA	3	6	2315301	2315306	50 %	50 %	0 %	0 %	219852765
51053	NC_011832	A	6	6	2315313	2315318	100 %	0 %	0 %	0 %	219852765
51054	NC_011832	CGG	2	6	2315321	2315326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852765
51055	NC_011832	TAG	2	6	2315383	2315388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852765
51056	NC_011832	TCT	2	6	2315404	2315409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852765
51057	NC_011832	T	7	7	2315409	2315415	0 %	100 %	0 %	0 %	219852765
51058	NC_011832	TAA	2	6	2315438	2315443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852765
51059	NC_011832	AAT	2	6	2315489	2315494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852765
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51061	NC_011832	CAA	2	6	2315709	2315714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852765
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51064	NC_011832	ATT	2	6	2315859	2315864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852765
51065	NC_011832	AAAT	2	8	2315867	2315874	75 %	25 %	0 %	0 %	219852765
51066	NC_011832	TTCAA	2	10	2315937	2315946	40 %	40 %	0 %	20 %	219852765
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51073	NC_011832	ATT	2	6	2316266	2316271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852766
51074	NC_011832	GAG	2	6	2316277	2316282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852766
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51077	NC_011832	AGAAT	2	10	2316593	2316602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51078	NC_011832	GCA	2	6	2316697	2316702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51079	NC_011832	TCCA	2	8	2316704	2316711	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51080	NC_011832	TCC	2	6	2316830	2316835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51081	NC_011832	TAT	2	6	2316890	2316895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51082	NC_011832	TCA	2	6	2316905	2316910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51083	NC_011832	CAT	2	6	2316925	2316930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51084	NC_011832	CAAC	2	8	2316951	2316958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51085	NC_011832	ACC	2	6	2316998	2317003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51086	NC_011832	GGC	2	6	2317014	2317019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51087	NC_011832	AT	3	6	2317053	2317058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51088	NC_011832	AC	3	6	2317126	2317131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51089	NC_011832	GAC	2	6	2317151	2317156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51091	NC_011832	A	6	6	2317185	2317190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51092	NC_011832	AAC	2	6	2317207	2317212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51093	NC_011832	AT	3	6	2317244	2317249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51094	NC_011832	TCT	2	6	2317495	2317500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51098	NC_011832	TGA	2	6	2317759	2317764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51099	NC_011832	ACA	2	6	2317850	2317855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51101	NC_011832	TC	3	6	2317948	2317953	0 %	50 %	0 %	50 %	219852767
51102	NC_011832	TGT	2	6	2317955	2317960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852767
51103	NC_011832	TCGA	2	8	2317961	2317968	25 %	25 %	25 %	25 %	219852767
51104	NC_011832	TAC	2	6	2317969	2317974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852767
51105	NC_011832	A	6	6	2317987	2317992	100 %	0 %	0 %	0 %	219852767
51106	NC_011832	GCA	2	6	2318032	2318037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852767
51107	NC_011832	CAT	2	6	2318081	2318086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852767
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51109	NC_011832	ATC	2	6	2318119	2318124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852767
51110	NC_011832	TAT	2	6	2318205	2318210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219852767
51111	NC_011832	CAAT	2	8	2318227	2318234	50 %	25 %	0 %	25 %	219852767
51112	NC_011832	GAA	2	6	2318409	2318414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852767
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51115	NC_011832	T	7	7	2318556	2318562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51116	NC_011832	AGA	2	6	2318572	2318577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51117	NC_011832	A	6	6	2318616	2318621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51118	NC_011832	CT	3	6	2318625	2318630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51119	NC_011832	AGT	2	6	2318653	2318658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51120	NC_011832	AAAT	2	8	2318708	2318715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51122	NC_011832	CAA	2	6	2318741	2318746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852768
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51222	NC_011832	GA	3	6	2322777	2322782	50 %	0 %	50 %	0 %	219852771
51223	NC_011832	C	6	6	2322794	2322799	0 %	0 %	0 %	100 %	219852771
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51233	NC_011832	CCA	2	6	2323196	2323201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51234	NC_011832	GAG	2	6	2323219	2323224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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51237	NC_011832	ACTC	2	8	2323319	2323326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51238	NC_011832	TCCT	2	8	2323447	2323454	0 %	50 %	0 %	50 %	219852772
51239	NC_011832	CCAT	2	8	2323463	2323470	25 %	25 %	0 %	50 %	219852772
51240	NC_011832	AGAGA	2	10	2323477	2323486	60 %	0 %	40 %	0 %	219852772
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51242	NC_011832	GACG	2	8	2323536	2323543	25 %	0 %	50 %	25 %	219852772
51243	NC_011832	AAC	2	6	2323565	2323570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219852772
51244	NC_011832	CAT	2	6	2323575	2323580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852772
51245	NC_011832	CGA	2	6	2323701	2323706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852772
51246	NC_011832	GAA	2	6	2323753	2323758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852772
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51248	NC_011832	GAAGA	2	10	2323816	2323825	60 %	0 %	40 %	0 %	219852772
51249	NC_011832	T	6	6	2323842	2323847	0 %	100 %	0 %	0 %	219852772
51250	NC_011832	GTAT	2	8	2323871	2323878	25 %	50 %	25 %	0 %	219852772
51251	NC_011832	TACC	2	8	2323920	2323927	25 %	25 %	0 %	50 %	219852772
51252	NC_011832	GATCT	2	10	2323948	2323957	20 %	40 %	20 %	20 %	219852772
51253	NC_011832	AG	3	6	2323970	2323975	50 %	0 %	50 %	0 %	219852772
51254	NC_011832	TA	3	6	2323978	2323983	50 %	50 %	0 %	0 %	219852772
51255	NC_011832	TCA	2	6	2324084	2324089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852772
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51257	NC_011832	GAAT	2	8	2324201	2324208	50 %	25 %	25 %	0 %	219852772
51258	NC_011832	GAT	2	6	2324261	2324266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852772
51259	NC_011832	ATT	2	6	2324305	2324310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51260	NC_011832	CCT	2	6	2324377	2324382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852773
51261	NC_011832	CT	3	6	2324389	2324394	0 %	50 %	0 %	50 %	219852773
51262	NC_011832	GAA	2	6	2324398	2324403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852773
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51284	NC_011832	ATA	2	6	2325632	2325637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51302	NC_011832	ATC	2	6	2326219	2326224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852774
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51358	NC_011832	CA	3	6	2328644	2328649	50 %	0 %	0 %	50 %	219852776
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51361	NC_011832	AAT	2	6	2328694	2328699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852776
51362	NC_011832	TGAT	2	8	2328756	2328763	25 %	50 %	25 %	0 %	219852776
51363	NC_011832	TTG	2	6	2328916	2328921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852776
51364	NC_011832	CCGG	2	8	2328940	2328947	0 %	0 %	50 %	50 %	219852776
51365	NC_011832	ATC	2	6	2329044	2329049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852776
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51368	NC_011832	TTG	2	6	2329195	2329200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852776
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51394	NC_011832	GAAT	2	8	2330809	2330816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51395	NC_011832	CGT	2	6	2330847	2330852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852778
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51434	NC_011832	A	6	6	2332793	2332798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51439	NC_011832	AC	3	6	2332987	2332992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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