MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_011832	CTC	2	6	2247446	2247451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852704
49502	NC_011832	GGA	2	6	2247495	2247500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852704
49503	NC_011832	GTG	2	6	2247516	2247521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852704
49504	NC_011832	TCC	2	6	2247525	2247530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852704
49505	NC_011832	CAT	2	6	2247536	2247541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852704
49506	NC_011832	TGG	2	6	2247572	2247577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852704
49507	NC_011832	ACC	2	6	2247582	2247587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852704
49508	NC_011832	T	7	7	2247601	2247607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49509	NC_011832	AGG	2	6	2247614	2247619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49510	NC_011832	GAA	2	6	2247714	2247719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49511	NC_011832	AAGGA	2	10	2247793	2247802	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49512	NC_011832	A	11	11	2247822	2247832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49513	NC_011832	TTC	2	6	2247898	2247903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852705
49514	NC_011832	CCT	2	6	2247923	2247928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852705
49515	NC_011832	GTT	2	6	2247939	2247944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852705
49516	NC_011832	CAG	2	6	2247948	2247953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852705
49517	NC_011832	ACC	2	6	2247958	2247963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852705
49518	NC_011832	ACC	2	6	2247984	2247989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852705
49519	NC_011832	TGA	2	6	2248019	2248024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852705
49520	NC_011832	TGA	2	6	2248151	2248156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852705
49521	NC_011832	CCT	2	6	2248181	2248186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852705
49522	NC_011832	GAA	2	6	2248269	2248274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852705
49523	NC_011832	GAA	2	6	2248278	2248283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852705
49524	NC_011832	G	6	6	2248301	2248306	0 %	0 %	100 %	0 %	219852705
49525	NC_011832	GGC	2	6	2248308	2248313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852705
49526	NC_011832	TTC	2	6	2248359	2248364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852705
49527	NC_011832	CCT	2	6	2248409	2248414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852705
49528	NC_011832	CCG	2	6	2248425	2248430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852705
49529	NC_011832	ATGG	2	8	2248485	2248492	25 %	25 %	50 %	0 %	219852705
49530	NC_011832	GAG	2	6	2248504	2248509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852705
49531	NC_011832	CTC	2	6	2248515	2248520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852705
49532	NC_011832	CAT	2	6	2248530	2248535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852705
49533	NC_011832	TTC	2	6	2248621	2248626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852705
49534	NC_011832	TCT	2	6	2248640	2248645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852705
49535	NC_011832	CCG	2	6	2248651	2248656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219852705
49536	NC_011832	GGA	2	6	2248694	2248699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852705
49537	NC_011832	GGT	2	6	2248728	2248733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852705
49538	NC_011832	CAC	2	6	2248751	2248756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852705
49539	NC_011832	TCAT	2	8	2248870	2248877	25 %	50 %	0 %	25 %	219852705
49540	NC_011832	GAT	2	6	2249037	2249042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852705
49541	NC_011832	AG	4	8	2249069	2249076	50 %	0 %	50 %	0 %	219852705
49542	NC_011832	TTCT	2	8	2249098	2249105	0 %	75 %	0 %	25 %	219852705
49543	NC_011832	CTC	2	6	2249205	2249210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852705
49544	NC_011832	GGT	2	6	2249262	2249267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852705
49545	NC_011832	CTG	2	6	2249303	2249308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852705
49546	NC_011832	TCT	2	6	2249321	2249326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219852705
49547	NC_011832	CTGC	2	8	2249332	2249339	0 %	25 %	25 %	50 %	219852705
49548	NC_011832	CAG	2	6	2249484	2249489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49549	NC_011832	TTGAGG	2	12	2249556	2249567	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49550	NC_011832	GAA	2	6	2249574	2249579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852706
49551	NC_011832	GA	3	6	2249593	2249598	50 %	0 %	50 %	0 %	219852706
49552	NC_011832	CAT	2	6	2249663	2249668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852706
49553	NC_011832	TGA	2	6	2249684	2249689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852706
49554	NC_011832	A	8	8	2249769	2249776	100 %	0 %	0 %	0 %	219852706
49555	NC_011832	GAA	2	6	2249816	2249821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852706
49556	NC_011832	CCT	2	6	2249831	2249836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852706
49557	NC_011832	GTG	2	6	2249872	2249877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852706
49558	NC_011832	CAG	2	6	2249940	2249945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852707
49559	NC_011832	AAG	2	6	2249958	2249963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852707
49560	NC_011832	GAC	2	6	2249970	2249975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852707
49561	NC_011832	GGAGAT	2	12	2249980	2249991	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	219852707
49562	NC_011832	GGT	2	6	2250003	2250008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852707
49563	NC_011832	TCG	2	6	2250041	2250046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852707
49564	NC_011832	TTG	3	9	2250047	2250055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219852707
49565	NC_011832	GCCT	2	8	2250075	2250082	0 %	25 %	25 %	50 %	219852707
49566	NC_011832	ACC	2	6	2250146	2250151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852707
49567	NC_011832	GA	3	6	2250158	2250163	50 %	0 %	50 %	0 %	219852707
49568	NC_011832	AGA	2	6	2250203	2250208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852707
49569	NC_011832	TCC	2	6	2250244	2250249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219852707
49570	NC_011832	GCCG	2	8	2250252	2250259	0 %	0 %	50 %	50 %	219852707
49571	NC_011832	GACA	2	8	2250282	2250289	50 %	0 %	25 %	25 %	219852707
49572	NC_011832	CCGG	2	8	2250307	2250314	0 %	0 %	50 %	50 %	219852707
49573	NC_011832	GTG	2	6	2250412	2250417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852707
49574	NC_011832	ACC	2	6	2250486	2250491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852707
49575	NC_011832	CCA	2	6	2250497	2250502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852707
49576	NC_011832	TGC	2	6	2250503	2250508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852707
49577	NC_011832	AGC	2	6	2250636	2250641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852707
49578	NC_011832	GAGG	2	8	2250669	2250676	25 %	0 %	75 %	0 %	219852707
49579	NC_011832	TGG	2	6	2250688	2250693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852707
49580	NC_011832	T	6	6	2250732	2250737	0 %	100 %	0 %	0 %	219852707
49581	NC_011832	CGA	2	6	2250746	2250751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852707
49582	NC_011832	AGG	2	6	2250782	2250787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852707
49583	NC_011832	GAA	2	6	2250800	2250805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852707
49584	NC_011832	GCA	2	6	2250856	2250861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852707
49585	NC_011832	CTG	2	6	2250921	2250926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852707
49586	NC_011832	AGAGAT	2	12	2250941	2250952	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	219852707
49587	NC_011832	CCA	2	6	2250958	2250963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852707
49588	NC_011832	ATG	2	6	2250998	2251003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852707
49589	NC_011832	GAG	2	6	2251074	2251079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852707
49590	NC_011832	A	6	6	2251099	2251104	100 %	0 %	0 %	0 %	219852707
49591	NC_011832	TTC	2	6	2251120	2251125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49592	NC_011832	AT	3	6	2251143	2251148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49593	NC_011832	ACT	2	6	2251167	2251172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49594	NC_011832	AAT	2	6	2251234	2251239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219852708
49595	NC_011832	A	6	6	2251278	2251283	100 %	0 %	0 %	0 %	219852708
49596	NC_011832	GAT	2	6	2251286	2251291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219852708
49597	NC_011832	CAG	2	6	2251392	2251397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852709
49598	NC_011832	ATCG	2	8	2251412	2251419	25 %	25 %	25 %	25 %	219852709
49599	NC_011832	GAA	2	6	2251426	2251431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852709
49600	NC_011832	GA	3	6	2251458	2251463	50 %	0 %	50 %	0 %	219852709
49601	NC_011832	C	6	6	2251507	2251512	0 %	0 %	0 %	100 %	219852709
49602	NC_011832	CGAT	2	8	2251568	2251575	25 %	25 %	25 %	25 %	219852709
49603	NC_011832	CAC	2	6	2251597	2251602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852709
49604	NC_011832	AGG	2	6	2251643	2251648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852709
49605	NC_011832	GAAGGC	2	12	2251651	2251662	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	219852709
49606	NC_011832	ACC	2	6	2251667	2251672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219852709
49607	NC_011832	ATCG	2	8	2251675	2251682	25 %	25 %	25 %	25 %	219852709
49608	NC_011832	AGA	2	6	2251710	2251715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852709
49609	NC_011832	GAA	2	6	2251795	2251800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852709
49610	NC_011832	ACG	2	6	2251814	2251819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852709
49611	NC_011832	CAT	2	6	2251831	2251836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219852709
49612	NC_011832	GAG	3	9	2251873	2251881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219852709
49613	NC_011832	CGA	2	6	2251956	2251961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219852709
49614	NC_011832	GAA	2	6	2251972	2251977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219852709
49615	NC_011832	GCT	2	6	2252056	2252061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219852709
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49617	NC_011832	AG	3	6	2252206	2252211	50 %	0 %	50 %	0 %	219852709
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49725	NC_011832	TCGA	2	8	2256875	2256882	25 %	25 %	25 %	25 %	219852714
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49734	NC_011832	CGTC	2	8	2257391	2257398	0 %	25 %	25 %	50 %	219852714
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49851	NC_011832	A	7	7	2262945	2262951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49852	NC_011832	GA	3	6	2262953	2262958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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49968	NC_011832	GGT	2	6	2268978	2268983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852726
49969	NC_011832	GCG	2	6	2269022	2269027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219852726
49970	NC_011832	GGT	2	6	2269068	2269073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219852726
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