MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium abscessus plasmid

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010394	A	6	6	38	43	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010394	CG	3	6	73	78	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010394	CCT	2	6	126	131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010394	GCCC	2	8	169	176	0 %	0 %	25 %	75 %	169786810
5	NC_010394	CG	3	6	185	190	0 %	0 %	50 %	50 %	169786810
6	NC_010394	CGA	2	6	227	232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
7	NC_010394	GCC	2	6	270	275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786810
8	NC_010394	CGA	2	6	284	289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
9	NC_010394	CTG	3	9	327	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
10	NC_010394	CCGG	2	8	358	365	0 %	0 %	50 %	50 %	169786810
11	NC_010394	TGC	2	6	412	417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
12	NC_010394	GC	3	6	416	421	0 %	0 %	50 %	50 %	169786810
13	NC_010394	CAAGGC	2	12	449	460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
14	NC_010394	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
15	NC_010394	CGA	2	6	515	520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786810
16	NC_010394	CGC	2	6	542	547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786810
17	NC_010394	CTT	2	6	620	625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786810
18	NC_010394	CCA	2	6	703	708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786810
19	NC_010394	GACG	2	8	713	720	25 %	0 %	50 %	25 %	169786810
20	NC_010394	TCA	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786810
21	NC_010394	GAG	2	6	759	764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786810
22	NC_010394	TCG	2	6	769	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
23	NC_010394	GCT	2	6	803	808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
24	NC_010394	ACC	2	6	810	815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786810
25	NC_010394	GC	3	6	822	827	0 %	0 %	50 %	50 %	169786810
26	NC_010394	CCT	2	6	914	919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169786810
27	NC_010394	CCA	2	6	923	928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786810
28	NC_010394	CCGAAA	2	12	941	952	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	169786810
29	NC_010394	CGT	2	6	958	963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786810
30	NC_010394	ACC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786810
31	NC_010394	TCA	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786811
32	NC_010394	CGGT	2	8	1037	1044	0 %	25 %	50 %	25 %	169786811
33	NC_010394	CCG	3	9	1047	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786811
34	NC_010394	CGC	2	6	1073	1078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786811
35	NC_010394	GCC	2	6	1079	1084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786811
36	NC_010394	ACG	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786811
37	NC_010394	CGA	2	6	1132	1137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786811
38	NC_010394	GACAA	2	10	1190	1199	60 %	0 %	20 %	20 %	169786811
39	NC_010394	ACC	2	6	1226	1231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786811
40	NC_010394	GC	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	169786811
41	NC_010394	GCA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786811
42	NC_010394	CGG	2	6	1417	1422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010394	ACC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786812
44	NC_010394	CGG	2	6	1517	1522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786812
45	NC_010394	GATC	2	8	1577	1584	25 %	25 %	25 %	25 %	169786812
46	NC_010394	ACC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786812
47	NC_010394	GGC	2	6	1599	1604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786812
48	NC_010394	CGT	2	6	1607	1612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786812
49	NC_010394	CCG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786812
50	NC_010394	CGC	2	6	1637	1642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786812
51	NC_010394	AGC	2	6	1669	1674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786812
52	NC_010394	CGA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786812
53	NC_010394	CCG	2	6	1708	1713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786812
54	NC_010394	CGA	3	9	1753	1761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010394	CGAC	2	8	1774	1781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010394	TCG	3	9	1824	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010394	GGC	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010394	CGG	3	9	1864	1872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010394	ATC	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010394	GCG	2	6	1968	1973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010394	CAT	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010394	CGA	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010394	AC	3	6	2021	2026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010394	TTC	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010394	CGG	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010394	CGGC	2	8	2247	2254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010394	GCTTCT	2	12	2265	2276	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010394	GTC	2	6	2315	2320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010394	CTG	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010394	TTC	2	6	2363	2368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010394	GCCT	3	12	2392	2403	0 %	25 %	25 %	50 %	169786813
72	NC_010394	GC	3	6	2466	2471	0 %	0 %	50 %	50 %	169786813
73	NC_010394	TCG	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786813
74	NC_010394	GGC	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786813
75	NC_010394	CG	3	6	2566	2571	0 %	0 %	50 %	50 %	169786813
76	NC_010394	GCG	2	6	2588	2593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786813
77	NC_010394	CGG	2	6	2601	2606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786813
78	NC_010394	GCTC	2	8	2612	2619	0 %	25 %	25 %	50 %	169786813
79	NC_010394	CCG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786813
80	NC_010394	GA	3	6	2692	2697	50 %	0 %	50 %	0 %	169786813
81	NC_010394	CGC	2	6	2709	2714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786813
82	NC_010394	GAGC	2	8	2752	2759	25 %	0 %	50 %	25 %	169786813
83	NC_010394	GCC	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786813
84	NC_010394	CGG	2	6	2801	2806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786813
85	NC_010394	AGC	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786813
86	NC_010394	ATC	3	9	2839	2847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786813
87	NC_010394	CG	3	6	2945	2950	0 %	0 %	50 %	50 %	169786813
88	NC_010394	CAG	2	6	2956	2961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786813
89	NC_010394	TCT	2	6	2999	3004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452857699
90	NC_010394	CCG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857699
91	NC_010394	TCGG	2	8	3156	3163	0 %	25 %	50 %	25 %	452857699
92	NC_010394	GGC	2	6	3194	3199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857699
93	NC_010394	CGG	2	6	3215	3220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857699
94	NC_010394	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452857699
95	NC_010394	CCG	2	6	3292	3297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452857699
96	NC_010394	GCA	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857699
97	NC_010394	CAG	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857699
98	NC_010394	GCA	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857699
99	NC_010394	CCA	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452857699
100	NC_010394	ACGG	2	8	3370	3377	25 %	0 %	50 %	25 %	452857699
101	NC_010394	CGG	3	9	3421	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786814
102	NC_010394	GCG	3	9	3453	3461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786814
103	NC_010394	CGG	2	6	3466	3471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786814
104	NC_010394	AACG	2	8	3474	3481	50 %	0 %	25 %	25 %	169786814
105	NC_010394	CGG	2	6	3546	3551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786814
106	NC_010394	GC	3	6	3697	3702	0 %	0 %	50 %	50 %	169786814
107	NC_010394	GAA	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786814
108	NC_010394	CCA	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786814
109	NC_010394	CGG	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010394	CCG	2	6	3895	3900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010394	ATC	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786815
112	NC_010394	CGG	2	6	3949	3954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
113	NC_010394	GCG	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
114	NC_010394	CGC	3	9	3964	3972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
115	NC_010394	CGC	2	6	3976	3981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
116	NC_010394	CAC	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
117	NC_010394	GTG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786815
118	NC_010394	CCA	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
119	NC_010394	CGG	2	6	4027	4032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
120	NC_010394	GCT	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
121	NC_010394	CGC	3	9	4075	4083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
122	NC_010394	CGC	2	6	4129	4134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
123	NC_010394	CGGCC	2	10	4153	4162	0 %	0 %	40 %	60 %	169786815
124	NC_010394	TGA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786815
125	NC_010394	GCG	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
126	NC_010394	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
127	NC_010394	CGT	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
128	NC_010394	TCG	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
129	NC_010394	CGG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
130	NC_010394	CGG	2	6	4309	4314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
131	NC_010394	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169786815
132	NC_010394	CT	3	6	4405	4410	0 %	50 %	0 %	50 %	169786815
133	NC_010394	ACC	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
134	NC_010394	CGG	3	9	4465	4473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786815
135	NC_010394	CGCC	2	8	4504	4511	0 %	0 %	25 %	75 %	169786815
136	NC_010394	GTG	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786815
137	NC_010394	GCT	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
138	NC_010394	CCG	2	6	4554	4559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
139	NC_010394	CACACC	2	12	4619	4630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
140	NC_010394	CGA	2	6	4651	4656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786815
141	NC_010394	CCG	2	6	4674	4679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
142	NC_010394	GCT	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
143	NC_010394	GCC	2	6	4737	4742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
144	NC_010394	CCG	2	6	4749	4754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
145	NC_010394	CG	3	6	4791	4796	0 %	0 %	50 %	50 %	169786815
146	NC_010394	TCG	2	6	4806	4811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
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150	NC_010394	GCC	2	6	4934	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
151	NC_010394	CCG	2	6	4986	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
152	NC_010394	CCG	3	9	5025	5033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
153	NC_010394	TCG	2	6	5118	5123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
154	NC_010394	CCG	3	9	5124	5132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
155	NC_010394	CGGT	2	8	5137	5144	0 %	25 %	50 %	25 %	169786815
156	NC_010394	CGT	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
157	NC_010394	TCA	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786815
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159	NC_010394	AGC	2	6	5229	5234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786815
160	NC_010394	CGC	2	6	5284	5289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786815
161	NC_010394	ACC	2	6	5300	5305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786815
162	NC_010394	CTG	2	6	5323	5328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786815
163	NC_010394	TGA	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010394	C	7	7	5376	5382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
165	NC_010394	GCC	2	6	5415	5420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_010394	GCTG	2	8	5432	5439	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_010394	CGC	3	9	5445	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_010394	GCT	2	6	5508	5513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786816
169	NC_010394	CGC	2	6	5547	5552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786816
170	NC_010394	GCT	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786816
171	NC_010394	CGCTGC	2	12	5630	5641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	169786816
172	NC_010394	CGC	2	6	5655	5660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786816
173	NC_010394	ATC	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786816
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176	NC_010394	CGG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786816
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178	NC_010394	ATC	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786816
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181	NC_010394	GGC	2	6	5978	5983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786817
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199	NC_010394	GAA	2	6	6729	6734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786818
200	NC_010394	CGT	2	6	6742	6747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786818
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210	NC_010394	GGA	2	6	7068	7073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786818
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232	NC_010394	CCG	2	6	7745	7750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786818
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235	NC_010394	CGGAC	2	10	7806	7815	20 %	0 %	40 %	40 %	169786818
236	NC_010394	ACC	3	9	7882	7890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786818
237	NC_010394	TCG	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_010394	CG	3	6	8154	8159	0 %	0 %	50 %	50 %	169786819
239	NC_010394	CGC	2	6	8196	8201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786819
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243	NC_010394	TGG	2	6	8321	8326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169786819
244	NC_010394	ATCG	2	8	8335	8342	25 %	25 %	25 %	25 %	169786819
245	NC_010394	GC	3	6	8409	8414	0 %	0 %	50 %	50 %	169786819
246	NC_010394	CCA	2	6	8462	8467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169786819
247	NC_010394	GCTG	2	8	8478	8485	0 %	25 %	50 %	25 %	169786819
248	NC_010394	CTCGAA	2	12	8488	8499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169786819
249	NC_010394	GCGCC	2	10	8511	8520	0 %	0 %	40 %	60 %	169786819
250	NC_010394	CG	3	6	8525	8530	0 %	0 %	50 %	50 %	169786819
251	NC_010394	GCC	2	6	8603	8608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786819
252	NC_010394	TGA	2	6	8716	8721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169786819
253	NC_010394	CCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_010394	GAA	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169786820
255	NC_010394	GCC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169786820
256	NC_010394	GAG	2	6	8848	8853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169786820
257	NC_010394	GCT	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786820
258	NC_010394	CGA	2	6	8916	8921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786820
259	NC_010394	ATC	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169786820
260	NC_010394	G	6	6	8934	8939	0 %	0 %	100 %	0 %	169786820
261	NC_010394	GTC	2	6	9055	9060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786820
262	NC_010394	GCT	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786820
263	NC_010394	CTG	2	6	9112	9117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786820
264	NC_010394	CGA	2	6	9144	9149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169786820
265	NC_010394	TCT	2	6	9179	9184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169786820
266	NC_010394	CGG	2	6	9186	9191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786820
267	NC_010394	CGG	3	9	9255	9263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169786820
268	NC_010394	GACT	2	8	9266	9273	25 %	25 %	25 %	25 %	169786820
269	NC_010394	GTC	2	6	9300	9305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786820
270	NC_010394	GCT	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169786820
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272	NC_010394	TGTGGC	3	18	9483	9500	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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391	NC_010394	GGTG	2	8	13846	13853	0 %	25 %	75 %	0 %	452857701
392	NC_010394	CGA	2	6	13867	13872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452857701
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394	NC_010394	GCG	2	6	13908	13913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452857701
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