MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium extorquens PA1 chromosome

Total Repeats: 141176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12006	NC_010172	CCGA	2	8	496513	496520	25 %	0 %	25 %	50 %	163849904
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12121	NC_010172	CAG	2	6	501027	501032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12122	NC_010172	CGG	2	6	501052	501057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849910
12123	NC_010172	GGT	2	6	501087	501092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849910
12124	NC_010172	AGCG	2	8	501128	501135	25 %	0 %	50 %	25 %	163849910
12125	NC_010172	CGG	2	6	501169	501174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849910
12126	NC_010172	TCG	2	6	501203	501208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849910
12127	NC_010172	CCAG	2	8	501212	501219	25 %	0 %	25 %	50 %	163849910
12128	NC_010172	TCA	2	6	501264	501269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849910
12129	NC_010172	GTGAG	2	10	501285	501294	20 %	20 %	60 %	0 %	163849910
12130	NC_010172	CGT	2	6	501295	501300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849910
12131	NC_010172	GCT	2	6	501392	501397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849910
12132	NC_010172	GC	3	6	501438	501443	0 %	0 %	50 %	50 %	163849910
12133	NC_010172	ACCG	2	8	501466	501473	25 %	0 %	25 %	50 %	163849910
12134	NC_010172	CAT	2	6	501556	501561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849910
12135	NC_010172	GCGT	2	8	501668	501675	0 %	25 %	50 %	25 %	163849910
12136	NC_010172	TGC	2	6	501676	501681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849910
12137	NC_010172	CGG	2	6	501765	501770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849910
12138	NC_010172	GCCG	2	8	501784	501791	0 %	0 %	50 %	50 %	163849910
12139	NC_010172	CACG	2	8	501816	501823	25 %	0 %	25 %	50 %	163849910
12140	NC_010172	GTG	2	6	501828	501833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849910
12141	NC_010172	TCC	2	6	501845	501850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163849910
12142	NC_010172	GCC	2	6	501902	501907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849910
12143	NC_010172	ATGCCG	2	12	501965	501976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163849910
12144	NC_010172	GAG	2	6	502055	502060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12145	NC_010172	GGT	2	6	502162	502167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849911
12146	NC_010172	TGC	2	6	502244	502249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
12147	NC_010172	TCG	3	9	502274	502282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
12148	NC_010172	AGG	2	6	502307	502312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849911
12149	NC_010172	GGT	2	6	502350	502355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849911
12150	NC_010172	ATC	2	6	502372	502377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849911
12151	NC_010172	GTC	2	6	502387	502392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
12152	NC_010172	AGC	2	6	502444	502449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849911
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12154	NC_010172	CAT	2	6	502512	502517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849911
12155	NC_010172	CGA	2	6	502523	502528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849911
12156	NC_010172	TGG	2	6	502529	502534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163849911
12157	NC_010172	TGC	2	6	502556	502561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
12158	NC_010172	ATC	2	6	502564	502569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849911
12159	NC_010172	GCT	2	6	502578	502583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
12160	NC_010172	GTC	3	9	502630	502638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
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12162	NC_010172	TCGC	2	8	502759	502766	0 %	25 %	25 %	50 %	163849911
12163	NC_010172	TCG	2	6	502805	502810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
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12172	NC_010172	TGC	3	9	503111	503119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849911
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12194	NC_010172	GAG	2	6	504212	504217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849912
12195	NC_010172	GCAG	2	8	504244	504251	25 %	0 %	50 %	25 %	163849912
12196	NC_010172	CGG	2	6	504334	504339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849912
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12199	NC_010172	CGG	2	6	504492	504497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849912
12200	NC_010172	GCCTGG	2	12	504498	504509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163849912
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12202	NC_010172	GATCGG	2	12	504671	504682	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12203	NC_010172	GCG	2	6	504683	504688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12204	NC_010172	GCC	2	6	504697	504702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12205	NC_010172	GC	3	6	504728	504733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12206	NC_010172	CGA	2	6	504806	504811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849913
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12209	NC_010172	GCC	2	6	504882	504887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849913
12210	NC_010172	AC	3	6	504920	504925	50 %	0 %	0 %	50 %	163849913
12211	NC_010172	CT	4	8	504929	504936	0 %	50 %	0 %	50 %	163849913
12212	NC_010172	CCG	2	6	505088	505093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849913
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12214	NC_010172	CGGCA	2	10	505263	505272	20 %	0 %	40 %	40 %	163849913
12215	NC_010172	ATC	2	6	505278	505283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849913
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12217	NC_010172	CAT	2	6	505346	505351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163849913
12218	NC_010172	TGC	2	6	505357	505362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849913
12219	NC_010172	AGGC	2	8	505382	505389	25 %	0 %	50 %	25 %	163849913
12220	NC_010172	CGG	2	6	505392	505397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12221	NC_010172	CAGC	2	8	505447	505454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12222	NC_010172	CCG	2	6	505487	505492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12223	NC_010172	CTG	2	6	505508	505513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849914
12224	NC_010172	CAGC	2	8	505580	505587	25 %	0 %	25 %	50 %	163849914
12225	NC_010172	CTT	2	6	505600	505605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163849914
12226	NC_010172	GGC	2	6	505606	505611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849914
12227	NC_010172	CGG	2	6	505642	505647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849914
12228	NC_010172	CA	3	6	505660	505665	50 %	0 %	0 %	50 %	163849914
12229	NC_010172	GCT	2	6	505681	505686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849914
12230	NC_010172	GCCG	2	8	505768	505775	0 %	0 %	50 %	50 %	163849914
12231	NC_010172	GAA	2	6	505793	505798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163849914
12232	NC_010172	GCG	2	6	505811	505816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849914
12233	NC_010172	AGG	2	6	505828	505833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163849914
12234	NC_010172	TGGG	2	8	505873	505880	0 %	25 %	75 %	0 %	163849914
12235	NC_010172	CGGC	2	8	505896	505903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12236	NC_010172	AAC	2	6	506055	506060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163849915
12237	NC_010172	ACG	2	6	506152	506157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849915
12238	NC_010172	GGGTGA	2	12	506219	506230	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	163849915
12239	NC_010172	CGA	2	6	506255	506260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849915
12240	NC_010172	GCT	2	6	506290	506295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849915
12241	NC_010172	GCC	2	6	506405	506410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163849915
12242	NC_010172	ACG	2	6	506440	506445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849915
12243	NC_010172	CGG	2	6	506561	506566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849915
12244	NC_010172	GAC	2	6	506607	506612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849915
12245	NC_010172	TGC	2	6	506633	506638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849915
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12253	NC_010172	GCTAC	2	10	507208	507217	20 %	20 %	20 %	40 %	163849916
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12260	NC_010172	GCC	2	6	507622	507627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12261	NC_010172	AC	3	6	507632	507637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12262	NC_010172	CTC	2	6	507668	507673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12263	NC_010172	CGA	2	6	507703	507708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12264	NC_010172	GCTG	2	8	507928	507935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12265	NC_010172	GACAGA	2	12	507958	507969	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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12270	NC_010172	GAG	2	6	508194	508199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12271	NC_010172	CGT	2	6	508221	508226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12290	NC_010172	CGGCG	2	10	509120	509129	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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12351	NC_010172	TGGCG	2	10	512254	512263	0 %	20 %	60 %	20 %	163849919
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12353	NC_010172	GCT	2	6	512315	512320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849919
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12356	NC_010172	CGAC	2	8	512492	512499	25 %	0 %	25 %	50 %	163849919
12357	NC_010172	TCG	2	6	512572	512577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849919
12358	NC_010172	GCGG	2	8	512579	512586	0 %	0 %	75 %	25 %	163849919
12359	NC_010172	CGG	2	6	512646	512651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163849919
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12478	NC_010172	C	7	7	518141	518147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12479	NC_010172	GGAC	2	8	518154	518161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12480	NC_010172	CAT	2	6	518191	518196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12481	NC_010172	GCG	2	6	518251	518256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12482	NC_010172	CG	3	6	518285	518290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12483	NC_010172	TCG	2	6	518300	518305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12484	NC_010172	CAG	2	6	518314	518319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12485	NC_010172	CGTCG	2	10	518379	518388	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12486	NC_010172	GCCT	2	8	518400	518407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12487	NC_010172	ATGGTC	2	12	518429	518440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12488	NC_010172	ACG	2	6	518457	518462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12489	NC_010172	TCG	2	6	518524	518529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12490	NC_010172	GC	3	6	518559	518564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12491	NC_010172	CAG	2	6	518602	518607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12492	NC_010172	TGT	2	6	518653	518658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12493	NC_010172	TAGA	2	8	518661	518668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12494	NC_010172	GCTC	2	8	518801	518808	0 %	25 %	25 %	50 %	163849923
12495	NC_010172	CAGC	2	8	518855	518862	25 %	0 %	25 %	50 %	163849923
12496	NC_010172	ACG	2	6	518934	518939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849923
12497	NC_010172	AGC	2	6	519013	519018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163849923
12498	NC_010172	TCG	2	6	519067	519072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849923
12499	NC_010172	CGT	2	6	519102	519107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849923
12500	NC_010172	GTC	2	6	519261	519266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163849923

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