MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009712	TGAT	2	8	210733	210740	25 %	50 %	25 %	0 %	154149769
4002	NC_009712	T	6	6	210794	210799	0 %	100 %	0 %	0 %	154149769
4003	NC_009712	CAT	2	6	210824	210829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149769
4004	NC_009712	GCC	2	6	210830	210835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149770
4005	NC_009712	TGA	2	6	210882	210887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149770
4006	NC_009712	CAC	2	6	210889	210894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149770
4007	NC_009712	GCA	2	6	210924	210929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149770
4008	NC_009712	GAT	2	6	210964	210969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149770
4009	NC_009712	GTA	2	6	211027	211032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149770
4010	NC_009712	GCC	2	6	211097	211102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149770
4011	NC_009712	GTT	2	6	211129	211134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149770
4012	NC_009712	GCCG	2	8	211225	211232	0 %	0 %	50 %	50 %	154149770
4013	NC_009712	CAT	2	6	211254	211259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149770
4014	NC_009712	AAGG	2	8	211264	211271	50 %	0 %	50 %	0 %	154149770
4015	NC_009712	GCC	2	6	211297	211302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149770
4016	NC_009712	CAA	2	6	211314	211319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149770
4017	NC_009712	CCT	2	6	211338	211343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149770
4018	NC_009712	ACC	2	6	211424	211429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149770
4019	NC_009712	TTTC	2	8	211687	211694	0 %	75 %	0 %	25 %	154149770
4020	NC_009712	AAG	2	6	211708	211713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149770
4021	NC_009712	GTT	2	6	211729	211734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149770
4022	NC_009712	TCC	2	6	211763	211768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149770
4023	NC_009712	TGC	2	6	211858	211863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149770
4024	NC_009712	GCGTC	2	10	211890	211899	0 %	20 %	40 %	40 %	154149770
4025	NC_009712	TCA	2	6	211932	211937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149770
4026	NC_009712	CCG	2	6	211958	211963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149770
4027	NC_009712	GCA	2	6	212007	212012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149771
4028	NC_009712	CGC	2	6	212021	212026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149771
4029	NC_009712	CGC	2	6	212065	212070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149771
4030	NC_009712	CCG	2	6	212136	212141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149771
4031	NC_009712	AAAC	2	8	212311	212318	75 %	0 %	0 %	25 %	154149771
4032	NC_009712	CCGG	2	8	212341	212348	0 %	0 %	50 %	50 %	154149771
4033	NC_009712	T	6	6	212359	212364	0 %	100 %	0 %	0 %	154149771
4034	NC_009712	GCG	2	6	212462	212467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149771
4035	NC_009712	TCC	2	6	212576	212581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149772
4036	NC_009712	T	6	6	212584	212589	0 %	100 %	0 %	0 %	154149772
4037	NC_009712	CGA	2	6	212614	212619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149772
4038	NC_009712	ACCG	2	8	212669	212676	25 %	0 %	25 %	50 %	154149772
4039	NC_009712	AAC	2	6	212692	212697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149772
4040	NC_009712	GTT	2	6	212776	212781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149772
4041	NC_009712	GCT	2	6	212895	212900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149772
4042	NC_009712	CAT	2	6	213112	213117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149772
4043	NC_009712	CGG	2	6	213134	213139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149772
4044	NC_009712	TG	3	6	213193	213198	0 %	50 %	50 %	0 %	154149772
4045	NC_009712	T	6	6	213281	213286	0 %	100 %	0 %	0 %	154149772
4046	NC_009712	ATG	2	6	213314	213319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149772
4047	NC_009712	GCG	2	6	213343	213348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149773
4048	NC_009712	CGC	2	6	213357	213362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149773
4049	NC_009712	CGGGC	2	10	213469	213478	0 %	0 %	60 %	40 %	154149773
4050	NC_009712	GAT	2	6	213504	213509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149773
4051	NC_009712	GCGT	2	8	213510	213517	0 %	25 %	50 %	25 %	154149773
4052	NC_009712	TCT	2	6	213518	213523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149773
4053	NC_009712	AAG	2	6	213537	213542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149773
4054	NC_009712	TA	3	6	213588	213593	50 %	50 %	0 %	0 %	154149773
4055	NC_009712	GAC	2	6	213672	213677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149773
4056	NC_009712	GTG	2	6	213858	213863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149773
4057	NC_009712	GAT	2	6	213882	213887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149773
4058	NC_009712	CTGC	2	8	213908	213915	0 %	25 %	25 %	50 %	154149773
4059	NC_009712	GCT	2	6	213978	213983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149773
4060	NC_009712	CAA	2	6	214031	214036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149773
4061	NC_009712	GGC	2	6	214038	214043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149773
4062	NC_009712	CGC	2	6	214161	214166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149773
4063	NC_009712	TGCC	2	8	214233	214240	0 %	25 %	25 %	50 %	154149773
4064	NC_009712	CATC	2	8	214241	214248	25 %	25 %	0 %	50 %	154149773
4065	NC_009712	GA	3	6	214389	214394	50 %	0 %	50 %	0 %	154149774
4066	NC_009712	CGAG	2	8	214522	214529	25 %	0 %	50 %	25 %	154149774
4067	NC_009712	CGGAC	2	10	214624	214633	20 %	0 %	40 %	40 %	154149774
4068	NC_009712	TGG	2	6	214665	214670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149774
4069	NC_009712	AGAC	2	8	214725	214732	50 %	0 %	25 %	25 %	154149774
4070	NC_009712	CCCGGG	2	12	214751	214762	0 %	0 %	50 %	50 %	154149774
4071	NC_009712	GAT	2	6	214769	214774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149774
4072	NC_009712	GCG	2	6	214807	214812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149774
4073	NC_009712	GGCC	2	8	214833	214840	0 %	0 %	50 %	50 %	154149774
4074	NC_009712	CTG	2	6	214856	214861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149774
4075	NC_009712	CCTG	2	8	214931	214938	0 %	25 %	25 %	50 %	154149775
4076	NC_009712	TCA	2	6	214950	214955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149775
4077	NC_009712	TCTCGG	2	12	214971	214982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149775
4078	NC_009712	GAT	2	6	215158	215163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149775
4079	NC_009712	CCGG	2	8	215201	215208	0 %	0 %	50 %	50 %	154149775
4080	NC_009712	GGT	2	6	215241	215246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149775
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4082	NC_009712	CTT	2	6	215431	215436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149775
4083	NC_009712	TTGA	2	8	215585	215592	25 %	50 %	25 %	0 %	154149775
4084	NC_009712	TCC	2	6	215643	215648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149775
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4087	NC_009712	T	7	7	215752	215758	0 %	100 %	0 %	0 %	154149775
4088	NC_009712	CATCA	2	10	215782	215791	40 %	20 %	0 %	40 %	154149775
4089	NC_009712	T	6	6	215797	215802	0 %	100 %	0 %	0 %	154149775
4090	NC_009712	CGGT	2	8	215828	215835	0 %	25 %	50 %	25 %	154149775
4091	NC_009712	GCG	2	6	215852	215857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149775
4092	NC_009712	GCC	2	6	215873	215878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149775
4093	NC_009712	GGT	2	6	215934	215939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149775
4094	NC_009712	GGT	2	6	216006	216011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149775
4095	NC_009712	CA	3	6	216220	216225	50 %	0 %	0 %	50 %	154149775
4096	NC_009712	TCT	2	6	216261	216266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149775
4097	NC_009712	GCCCG	2	10	216300	216309	0 %	0 %	40 %	60 %	154149775
4098	NC_009712	GCG	2	6	216330	216335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149775
4099	NC_009712	GGT	2	6	216488	216493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_009712	ATT	2	6	216558	216563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_009712	T	6	6	216579	216584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_009712	CGGC	2	8	216634	216641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_009712	CTC	2	6	216713	216718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149776
4104	NC_009712	CA	3	6	216806	216811	50 %	0 %	0 %	50 %	154149776
4105	NC_009712	AGA	3	9	216880	216888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149776
4106	NC_009712	AT	3	6	216927	216932	50 %	50 %	0 %	0 %	154149776
4107	NC_009712	AGG	2	6	216945	216950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149776
4108	NC_009712	TGCC	2	8	216980	216987	0 %	25 %	25 %	50 %	154149776
4109	NC_009712	TA	3	6	217095	217100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_009712	CCG	2	6	217103	217108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_009712	AGC	2	6	217157	217162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149777
4112	NC_009712	GGGT	2	8	217171	217178	0 %	25 %	75 %	0 %	154149777
4113	NC_009712	GAT	2	6	217191	217196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149777
4114	NC_009712	ATC	2	6	217201	217206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149777
4115	NC_009712	T	6	6	217209	217214	0 %	100 %	0 %	0 %	154149777
4116	NC_009712	TTG	2	6	217217	217222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149777
4117	NC_009712	GCCC	2	8	217377	217384	0 %	0 %	25 %	75 %	154149777
4118	NC_009712	ATC	2	6	217387	217392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149777
4119	NC_009712	TATT	2	8	217409	217416	25 %	75 %	0 %	0 %	154149777
4120	NC_009712	TGC	2	6	217427	217432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149777
4121	NC_009712	GCT	2	6	217488	217493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149777
4122	NC_009712	GGT	2	6	217512	217517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149777
4123	NC_009712	CTT	2	6	217531	217536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149777
4124	NC_009712	CTA	2	6	217542	217547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149777
4125	NC_009712	GCAAAG	2	12	217570	217581	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	154149777
4126	NC_009712	TGG	2	6	217601	217606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149777
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4131	NC_009712	T	6	6	217767	217772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_009712	TCC	2	6	217847	217852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149778
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4141	NC_009712	CCGT	2	8	218365	218372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4145	NC_009712	CCGCA	2	10	218763	218772	20 %	0 %	20 %	60 %	154149780
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4161	NC_009712	TTGTA	2	10	219733	219742	20 %	60 %	20 %	0 %	154149781
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4201	NC_009712	GCTT	2	8	221437	221444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4202	NC_009712	GAAA	2	8	221508	221515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4232	NC_009712	A	8	8	223290	223297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_009712	A	7	7	223315	223321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_009712	GGCTTC	2	12	223446	223457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149785
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4236	NC_009712	TCT	2	6	223613	223618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149786
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4243	NC_009712	GTC	2	6	223902	223907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149786
4244	NC_009712	GCGG	2	8	223916	223923	0 %	0 %	75 %	25 %	154149786
4245	NC_009712	A	6	6	224034	224039	100 %	0 %	0 %	0 %	154149786
4246	NC_009712	GCA	2	6	224041	224046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149786
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4248	NC_009712	CT	3	6	224260	224265	0 %	50 %	0 %	50 %	154149787
4249	NC_009712	GGA	2	6	224332	224337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149787
4250	NC_009712	CTGTC	2	10	224387	224396	0 %	40 %	20 %	40 %	154149787
4251	NC_009712	TC	3	6	224398	224403	0 %	50 %	0 %	50 %	154149787
4252	NC_009712	CCT	2	6	224514	224519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149787
4253	NC_009712	GAT	2	6	224534	224539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149787
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4255	NC_009712	TCCTG	2	10	224691	224700	0 %	40 %	20 %	40 %	154149787
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4259	NC_009712	AAG	2	6	224868	224873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149787
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4265	NC_009712	CGCTC	2	10	225287	225296	0 %	20 %	20 %	60 %	154149787
4266	NC_009712	CAGG	2	8	225431	225438	25 %	0 %	50 %	25 %	154149787
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4284	NC_009712	GC	3	6	225967	225972	0 %	0 %	50 %	50 %	154149789
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4287	NC_009712	A	7	7	226251	226257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4319	NC_009712	TCT	2	6	227640	227645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149793
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4375	NC_009712	TCA	2	6	230739	230744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149796
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4378	NC_009712	T	6	6	230893	230898	0 %	100 %	0 %	0 %	154149796
4379	NC_009712	GCA	3	9	230927	230935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149796
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4383	NC_009712	GAT	2	6	231088	231093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149796
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4395	NC_009712	GAT	2	6	231592	231597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149796
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4483	NC_009712	TGC	2	6	236509	236514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149800
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4486	NC_009712	CCCT	2	8	236639	236646	0 %	25 %	0 %	75 %	154149800
4487	NC_009712	TGA	2	6	236688	236693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149800
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4491	NC_009712	ACG	2	6	236903	236908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149800
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4495	NC_009712	CTG	2	6	237033	237038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149800
4496	NC_009712	CTGC	2	8	237048	237055	0 %	25 %	25 %	50 %	154149800
4497	NC_009712	CGC	2	6	237075	237080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149801
4498	NC_009712	TGC	2	6	237131	237136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149801
4499	NC_009712	TCG	2	6	237400	237405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149801
4500	NC_009712	ATG	2	6	237463	237468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149801

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