MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_009712	A	6	6	2199798	2199803	100 %	0 %	0 %	0 %	154151666
41003	NC_009712	CTGC	3	12	2199804	2199815	0 %	25 %	25 %	50 %	154151666
41004	NC_009712	GCCCC	2	10	2199833	2199842	0 %	0 %	20 %	80 %	154151666
41005	NC_009712	TGT	2	6	2199856	2199861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151666
41006	NC_009712	CTG	2	6	2199935	2199940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151666
41007	NC_009712	A	7	7	2200071	2200077	100 %	0 %	0 %	0 %	154151666
41008	NC_009712	T	6	6	2200095	2200100	0 %	100 %	0 %	0 %	154151667
41009	NC_009712	GCT	2	6	2200115	2200120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151667
41010	NC_009712	AGGA	2	8	2200147	2200154	50 %	0 %	50 %	0 %	154151667
41011	NC_009712	CCT	2	6	2200160	2200165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151667
41012	NC_009712	A	6	6	2200189	2200194	100 %	0 %	0 %	0 %	154151667
41013	NC_009712	ATG	2	6	2200207	2200212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151667
41014	NC_009712	ACTGCC	2	12	2200281	2200292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	154151667
41015	NC_009712	CGA	2	6	2200316	2200321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151667
41016	NC_009712	GCGG	2	8	2200344	2200351	0 %	0 %	75 %	25 %	154151667
41017	NC_009712	AGG	2	6	2200360	2200365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41018	NC_009712	AAAG	2	8	2200428	2200435	75 %	0 %	25 %	0 %	154151668
41019	NC_009712	TTG	2	6	2200448	2200453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151668
41020	NC_009712	GAA	2	6	2200510	2200515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151668
41021	NC_009712	ACC	2	6	2200565	2200570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151668
41022	NC_009712	CAT	2	6	2200584	2200589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151668
41023	NC_009712	GCC	2	6	2200601	2200606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151668
41024	NC_009712	TAT	2	6	2200683	2200688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151668
41025	NC_009712	CTTT	2	8	2200833	2200840	0 %	75 %	0 %	25 %	154151669
41026	NC_009712	CGTG	2	8	2200880	2200887	0 %	25 %	50 %	25 %	154151669
41027	NC_009712	GCAC	2	8	2200899	2200906	25 %	0 %	25 %	50 %	154151669
41028	NC_009712	CAT	2	6	2200959	2200964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151669
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41030	NC_009712	CTT	2	6	2201002	2201007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151669
41031	NC_009712	TGT	2	6	2201081	2201086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41032	NC_009712	CGGA	2	8	2201104	2201111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41033	NC_009712	CAA	2	6	2201178	2201183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41034	NC_009712	AC	3	6	2201186	2201191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41035	NC_009712	TTTC	2	8	2201272	2201279	0 %	75 %	0 %	25 %	154151670
41036	NC_009712	GAT	2	6	2201344	2201349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151670
41037	NC_009712	CAA	2	6	2201452	2201457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151670
41038	NC_009712	C	6	6	2201459	2201464	0 %	0 %	0 %	100 %	154151670
41039	NC_009712	ATC	2	6	2201596	2201601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151670
41040	NC_009712	CCGGG	2	10	2201813	2201822	0 %	0 %	60 %	40 %	154151670
41041	NC_009712	TCGA	2	8	2201887	2201894	25 %	25 %	25 %	25 %	154151670
41042	NC_009712	TGC	2	6	2202011	2202016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151670
41043	NC_009712	TGA	2	6	2202035	2202040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151670
41044	NC_009712	GGCC	2	8	2202066	2202073	0 %	0 %	50 %	50 %	154151670
41045	NC_009712	AG	3	6	2202086	2202091	50 %	0 %	50 %	0 %	154151670
41046	NC_009712	GAG	2	6	2202160	2202165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151670
41047	NC_009712	TGC	2	6	2202389	2202394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151670
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41050	NC_009712	AT	3	6	2202539	2202544	50 %	50 %	0 %	0 %	154151670
41051	NC_009712	CGG	2	6	2202563	2202568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151670
41052	NC_009712	TGC	2	6	2202587	2202592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151670
41053	NC_009712	ACG	2	6	2202692	2202697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151670
41054	NC_009712	TGAA	2	8	2202968	2202975	50 %	25 %	25 %	0 %	154151671
41055	NC_009712	AT	4	8	2202988	2202995	50 %	50 %	0 %	0 %	154151671
41056	NC_009712	GGTCA	2	10	2203035	2203044	20 %	20 %	40 %	20 %	154151671
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41058	NC_009712	AT	3	6	2203086	2203091	50 %	50 %	0 %	0 %	154151671
41059	NC_009712	ACA	2	6	2203138	2203143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151671
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41061	NC_009712	TAA	2	6	2203189	2203194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151671
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41063	NC_009712	CAG	2	6	2203230	2203235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151671
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41065	NC_009712	GAC	2	6	2203290	2203295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151671
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41067	NC_009712	TGC	2	6	2203377	2203382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151671
41068	NC_009712	TGA	2	6	2203416	2203421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151671
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41073	NC_009712	GCA	2	6	2203813	2203818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151671
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41089	NC_009712	AAT	2	6	2204616	2204621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151671
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41112	NC_009712	TGT	2	6	2205626	2205631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151672
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41117	NC_009712	GTG	2	6	2205885	2205890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151672
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41238	NC_009712	CAA	2	6	2212001	2212006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151678
41239	NC_009712	ACC	2	6	2212024	2212029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151678
41240	NC_009712	TCCGT	2	10	2212061	2212070	0 %	40 %	20 %	40 %	154151678
41241	NC_009712	TCA	2	6	2212082	2212087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151678
41242	NC_009712	GGC	2	6	2212134	2212139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151678
41243	NC_009712	CGG	2	6	2212321	2212326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154151679
41244	NC_009712	CGGG	2	8	2212330	2212337	0 %	0 %	75 %	25 %	154151679
41245	NC_009712	AGA	2	6	2212377	2212382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151679
41246	NC_009712	AGA	2	6	2212434	2212439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151679
41247	NC_009712	CCGGTG	2	12	2212489	2212500	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	154151679
41248	NC_009712	GAT	2	6	2212507	2212512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151679
41249	NC_009712	GCC	2	6	2212588	2212593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151679
41250	NC_009712	CTC	2	6	2212654	2212659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151679
41251	NC_009712	TTG	2	6	2212662	2212667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154151679
41252	NC_009712	CAT	2	6	2212827	2212832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151679
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41254	NC_009712	TCTT	2	8	2213033	2213040	0 %	75 %	0 %	25 %	154151679
41255	NC_009712	CCT	2	6	2213079	2213084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151679
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41258	NC_009712	ATA	2	6	2213219	2213224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151679
41259	NC_009712	TGGG	2	8	2213267	2213274	0 %	25 %	75 %	0 %	154151679
41260	NC_009712	TCT	2	6	2213462	2213467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151679
41261	NC_009712	GAT	2	6	2213512	2213517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154151679
41262	NC_009712	CGT	2	6	2213584	2213589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151679
41263	NC_009712	GAG	2	6	2213600	2213605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151679
41264	NC_009712	C	7	7	2213658	2213664	0 %	0 %	0 %	100 %	154151679
41265	NC_009712	GATC	2	8	2213733	2213740	25 %	25 %	25 %	25 %	154151679
41266	NC_009712	CCG	2	6	2213745	2213750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151679
41267	NC_009712	CCG	2	6	2213828	2213833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151679
41268	NC_009712	TAT	4	12	2213894	2213905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41269	NC_009712	CGT	2	6	2213911	2213916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41270	NC_009712	CTGCC	2	10	2213946	2213955	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41271	NC_009712	TGA	2	6	2213966	2213971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41272	NC_009712	AAC	2	6	2214142	2214147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151680
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41275	NC_009712	AAC	2	6	2214389	2214394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151680
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41278	NC_009712	CCT	2	6	2214543	2214548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151680
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41283	NC_009712	A	6	6	2214770	2214775	100 %	0 %	0 %	0 %	154151680
41284	NC_009712	T	6	6	2214785	2214790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41285	NC_009712	AAG	2	6	2214821	2214826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151681
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41291	NC_009712	CG	3	6	2215237	2215242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41292	NC_009712	CTGT	2	8	2215343	2215350	0 %	50 %	25 %	25 %	154151682
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41297	NC_009712	A	7	7	2215536	2215542	100 %	0 %	0 %	0 %	154151682
41298	NC_009712	ATT	2	6	2215602	2215607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41299	NC_009712	T	6	6	2215609	2215614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41300	NC_009712	ATT	2	6	2215649	2215654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41301	NC_009712	GATCT	2	10	2215710	2215719	20 %	40 %	20 %	20 %	154151683
41302	NC_009712	TCC	2	6	2215788	2215793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151683
41303	NC_009712	ATT	2	6	2215909	2215914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41304	NC_009712	GA	3	6	2216108	2216113	50 %	0 %	50 %	0 %	154151684
41305	NC_009712	CAGC	2	8	2216176	2216183	25 %	0 %	25 %	50 %	154151684
41306	NC_009712	CTGC	2	8	2216196	2216203	0 %	25 %	25 %	50 %	154151684
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41309	NC_009712	CCG	2	6	2216409	2216414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154151684
41310	NC_009712	A	8	8	2216500	2216507	100 %	0 %	0 %	0 %	154151684
41311	NC_009712	GAG	2	6	2216602	2216607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151684
41312	NC_009712	TGC	2	6	2216660	2216665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151684
41313	NC_009712	TCC	2	6	2216681	2216686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154151684
41314	NC_009712	GGCCA	2	10	2216703	2216712	20 %	0 %	40 %	40 %	154151684
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41318	NC_009712	GGA	2	6	2216911	2216916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151685
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41322	NC_009712	TCT	2	6	2217188	2217193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151685
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41324	NC_009712	TCTG	2	8	2217418	2217425	0 %	50 %	25 %	25 %	154151685
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41332	NC_009712	CAG	2	6	2217938	2217943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151685
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41335	NC_009712	CAAA	2	8	2218266	2218273	75 %	0 %	0 %	25 %	154151685
41336	NC_009712	GCAGA	2	10	2218329	2218338	40 %	0 %	40 %	20 %	154151685
41337	NC_009712	GCT	2	6	2218394	2218399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151685
41338	NC_009712	A	8	8	2218474	2218481	100 %	0 %	0 %	0 %	154151685
41339	NC_009712	CAT	2	6	2218560	2218565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151686
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41341	NC_009712	AGG	3	9	2218674	2218682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151686
41342	NC_009712	GAG	2	6	2218700	2218705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154151686
41343	NC_009712	T	7	7	2218725	2218731	0 %	100 %	0 %	0 %	154151686
41344	NC_009712	CAG	2	6	2218831	2218836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151686
41345	NC_009712	GAC	2	6	2218854	2218859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151686
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41347	NC_009712	GCA	2	6	2218969	2218974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151686
41348	NC_009712	TC	3	6	2219025	2219030	0 %	50 %	0 %	50 %	154151686
41349	NC_009712	ACA	2	6	2219060	2219065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154151686
41350	NC_009712	ACCG	2	8	2219115	2219122	25 %	0 %	25 %	50 %	154151686
41351	NC_009712	TTTCC	2	10	2219182	2219191	0 %	60 %	0 %	40 %	154151686
41352	NC_009712	TCAT	2	8	2219210	2219217	25 %	50 %	0 %	25 %	154151686
41353	NC_009712	CGAT	2	8	2219246	2219253	25 %	25 %	25 %	25 %	154151686
41354	NC_009712	ATC	2	6	2219320	2219325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154151686
41355	NC_009712	G	6	6	2219338	2219343	0 %	0 %	100 %	0 %	154151686
41356	NC_009712	T	7	7	2219385	2219391	0 %	100 %	0 %	0 %	154151686
41357	NC_009712	C	7	7	2219419	2219425	0 %	0 %	0 %	100 %	154151686
41358	NC_009712	TGG	2	6	2219528	2219533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151686
41359	NC_009712	A	6	6	2219620	2219625	100 %	0 %	0 %	0 %	154151686
41360	NC_009712	CGGT	2	8	2219631	2219638	0 %	25 %	50 %	25 %	154151686
41361	NC_009712	AGA	3	9	2219781	2219789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154151686
41362	NC_009712	GA	3	6	2219848	2219853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41363	NC_009712	GCTC	2	8	2219919	2219926	0 %	25 %	25 %	50 %	154151687
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41365	NC_009712	CGGC	2	8	2220099	2220106	0 %	0 %	50 %	50 %	154151687
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41370	NC_009712	ATA	2	6	2220551	2220556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154151688
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41377	NC_009712	ATT	2	6	2220878	2220883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154151688
41378	NC_009712	T	6	6	2220910	2220915	0 %	100 %	0 %	0 %	154151688
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41390	NC_009712	CTG	2	6	2221475	2221480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151688
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41400	NC_009712	T	8	8	2221885	2221892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41401	NC_009712	G	6	6	2221907	2221912	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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41403	NC_009712	ATCG	2	8	2222086	2222093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41404	NC_009712	CCGA	2	8	2222096	2222103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41405	NC_009712	T	7	7	2222104	2222110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41432	NC_009712	TGG	2	6	2223721	2223726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154151690
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41478	NC_009712	GTC	2	6	2225772	2225777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154151693
41479	NC_009712	CTT	2	6	2225800	2225805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151693
41480	NC_009712	TTC	2	6	2225825	2225830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154151693
41481	NC_009712	GCA	2	6	2225838	2225843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154151693
41482	NC_009712	ACC	2	6	2225884	2225889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154151693
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41491	NC_009712	GT	3	6	2226197	2226202	0 %	50 %	50 %	0 %	154151694
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