MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_009712	AGA	2	6	1337989	1337994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150855
25003	NC_009712	CTTA	2	8	1338006	1338013	25 %	50 %	0 %	25 %	154150855
25004	NC_009712	GCT	2	6	1338191	1338196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150856
25005	NC_009712	TCA	2	6	1338202	1338207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150856
25006	NC_009712	AGCG	2	8	1338306	1338313	25 %	0 %	50 %	25 %	154150856
25007	NC_009712	GAA	2	6	1338321	1338326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150856
25008	NC_009712	TTCA	2	8	1338407	1338414	25 %	50 %	0 %	25 %	154150856
25009	NC_009712	CAA	2	6	1338505	1338510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150856
25010	NC_009712	GGCCG	2	10	1338584	1338593	0 %	0 %	60 %	40 %	154150856
25011	NC_009712	AGG	2	6	1338637	1338642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150856
25012	NC_009712	AGT	2	6	1338680	1338685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150856
25013	NC_009712	TACCGG	2	12	1338702	1338713	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154150856
25014	NC_009712	TTG	2	6	1338718	1338723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150856
25015	NC_009712	GCA	2	6	1338735	1338740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150856
25016	NC_009712	GT	3	6	1338764	1338769	0 %	50 %	50 %	0 %	154150856
25017	NC_009712	CGC	2	6	1338809	1338814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150856
25018	NC_009712	CCG	2	6	1338841	1338846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150856
25019	NC_009712	CAC	2	6	1338881	1338886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154150856
25020	NC_009712	GGCA	2	8	1339045	1339052	25 %	0 %	50 %	25 %	154150856
25021	NC_009712	TTG	2	6	1339078	1339083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150856
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25023	NC_009712	CTC	2	6	1339110	1339115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150856
25024	NC_009712	CTC	2	6	1339131	1339136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150856
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25028	NC_009712	CTT	2	6	1339488	1339493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150856
25029	NC_009712	GAG	2	6	1339500	1339505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150856
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25032	NC_009712	CAT	2	6	1339594	1339599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150857
25033	NC_009712	CT	3	6	1339673	1339678	0 %	50 %	0 %	50 %	154150857
25034	NC_009712	CCG	2	6	1339712	1339717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150857
25035	NC_009712	TGC	2	6	1339723	1339728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150857
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25051	NC_009712	GGTG	2	8	1341267	1341274	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25052	NC_009712	CTT	2	6	1341286	1341291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150858
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25055	NC_009712	TGC	2	6	1341429	1341434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150858
25056	NC_009712	CTG	2	6	1341478	1341483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150858
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25100	NC_009712	CGA	2	6	1343836	1343841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150860
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25103	NC_009712	GCT	2	6	1344052	1344057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150860
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25105	NC_009712	T	6	6	1344148	1344153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25106	NC_009712	AAC	2	6	1344169	1344174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25107	NC_009712	A	6	6	1344187	1344192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25108	NC_009712	A	9	9	1344220	1344228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25109	NC_009712	A	6	6	1344253	1344258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25110	NC_009712	ACC	2	6	1344264	1344269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25111	NC_009712	C	6	6	1344273	1344278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25112	NC_009712	TCAA	2	8	1344279	1344286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25113	NC_009712	A	8	8	1344285	1344292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25114	NC_009712	A	7	7	1344328	1344334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25115	NC_009712	ATCG	2	8	1344359	1344366	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25116	NC_009712	ATCG	2	8	1344453	1344460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25117	NC_009712	CGAT	2	8	1344489	1344496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25118	NC_009712	CAG	2	6	1344501	1344506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25119	NC_009712	C	7	7	1344524	1344530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25120	NC_009712	A	7	7	1344545	1344551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25121	NC_009712	TCGG	2	8	1344552	1344559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25122	NC_009712	ATCG	2	8	1344560	1344567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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25232	NC_009712	A	6	6	1350544	1350549	100 %	0 %	0 %	0 %	154150867
25233	NC_009712	CGG	2	6	1350569	1350574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150867
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25237	NC_009712	CCCA	2	8	1351039	1351046	25 %	0 %	0 %	75 %	154150868
25238	NC_009712	CCG	2	6	1351047	1351052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150868
25239	NC_009712	GCC	2	6	1351105	1351110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150868
25240	NC_009712	CTG	2	6	1351133	1351138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150868
25241	NC_009712	AGC	2	6	1351153	1351158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150868
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25243	NC_009712	GATCTC	2	12	1351393	1351404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154150869
25244	NC_009712	TCT	2	6	1351593	1351598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150869
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25246	NC_009712	TCGTGC	2	12	1351697	1351708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150869
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25248	NC_009712	TTG	2	6	1351826	1351831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25264	NC_009712	T	6	6	1352562	1352567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25348	NC_009712	TGA	2	6	1356644	1356649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150873
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25351	NC_009712	GGC	2	6	1356838	1356843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150873
25352	NC_009712	T	6	6	1356853	1356858	0 %	100 %	0 %	0 %	154150873
25353	NC_009712	AGC	2	6	1356889	1356894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150873
25354	NC_009712	GCT	2	6	1356977	1356982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150873
25355	NC_009712	A	6	6	1357080	1357085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25356	NC_009712	ACT	2	6	1357090	1357095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25357	NC_009712	ATT	2	6	1357102	1357107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25358	NC_009712	CGA	2	6	1357114	1357119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150874
25359	NC_009712	AGA	4	12	1357152	1357163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150874
25360	NC_009712	TCG	2	6	1357236	1357241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150874
25361	NC_009712	TC	3	6	1357246	1357251	0 %	50 %	0 %	50 %	154150874
25362	NC_009712	CCT	2	6	1357288	1357293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150874
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25364	NC_009712	CTG	2	6	1357439	1357444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150874
25365	NC_009712	ACC	2	6	1357445	1357450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154150874
25366	NC_009712	T	8	8	1357463	1357470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25367	NC_009712	CAT	2	6	1357546	1357551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150875
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25370	NC_009712	GAG	2	6	1357886	1357891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150875
25371	NC_009712	AAG	2	6	1357955	1357960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150875
25372	NC_009712	TGA	2	6	1358038	1358043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150875
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25374	NC_009712	TGCT	2	8	1358304	1358311	0 %	50 %	25 %	25 %	154150875
25375	NC_009712	TCA	2	6	1358355	1358360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150875
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25382	NC_009712	CG	3	6	1358883	1358888	0 %	0 %	50 %	50 %	154150875
25383	NC_009712	TCA	2	6	1358961	1358966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150875
25384	NC_009712	AGCG	2	8	1359038	1359045	25 %	0 %	50 %	25 %	154150875
25385	NC_009712	CCGG	2	8	1359165	1359172	0 %	0 %	50 %	50 %	154150875
25386	NC_009712	TCCT	2	8	1359194	1359201	0 %	50 %	0 %	50 %	154150875
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25389	NC_009712	TAT	2	6	1359236	1359241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154150875
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25394	NC_009712	TGG	2	6	1359502	1359507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150876
25395	NC_009712	ACT	2	6	1359563	1359568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150876
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25398	NC_009712	GA	3	6	1359714	1359719	50 %	0 %	50 %	0 %	154150876
25399	NC_009712	CGCCC	2	10	1359779	1359788	0 %	0 %	20 %	80 %	154150876
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25407	NC_009712	CAG	2	6	1360298	1360303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150876
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25410	NC_009712	GCA	2	6	1360407	1360412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150876
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25420	NC_009712	ATA	2	6	1360822	1360827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154150877
25421	NC_009712	TCA	2	6	1360898	1360903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150877
25422	NC_009712	G	6	6	1360961	1360966	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25423	NC_009712	GTCA	2	8	1360974	1360981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25424	NC_009712	TCA	2	6	1361011	1361016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150878
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25442	NC_009712	TGC	2	6	1361939	1361944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150879
25443	NC_009712	CAA	2	6	1361993	1361998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150879
25444	NC_009712	TGG	2	6	1362005	1362010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150879
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25451	NC_009712	T	6	6	1362244	1362249	0 %	100 %	0 %	0 %	154150879
25452	NC_009712	TCG	2	6	1362277	1362282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150879
25453	NC_009712	CCG	2	6	1362368	1362373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150879
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25456	NC_009712	ATC	2	6	1362559	1362564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150879
25457	NC_009712	ATC	3	9	1362568	1362576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150879
25458	NC_009712	TCT	2	6	1362644	1362649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150879
25459	NC_009712	ATG	2	6	1362706	1362711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150879
25460	NC_009712	TGCCGC	2	12	1362768	1362779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	154150879
25461	NC_009712	TTCG	2	8	1362785	1362792	0 %	50 %	25 %	25 %	154150879
25462	NC_009712	CAG	2	6	1362812	1362817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150879
25463	NC_009712	CTG	2	6	1362824	1362829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150879
25464	NC_009712	GCC	2	6	1362856	1362861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150879
25465	NC_009712	TGC	2	6	1362897	1362902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150879
25466	NC_009712	GGTGA	2	10	1362939	1362948	20 %	20 %	60 %	0 %	154150879
25467	NC_009712	TCA	2	6	1363058	1363063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150879
25468	NC_009712	TCC	2	6	1363108	1363113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150879
25469	NC_009712	GCA	2	6	1363117	1363122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150879
25470	NC_009712	CT	3	6	1363150	1363155	0 %	50 %	0 %	50 %	154150879
25471	NC_009712	CTC	2	6	1363179	1363184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150879
25472	NC_009712	CTG	2	6	1363209	1363214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150879
25473	NC_009712	CATG	2	8	1363222	1363229	25 %	25 %	25 %	25 %	154150879
25474	NC_009712	GGA	3	9	1363260	1363268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150879
25475	NC_009712	CCA	2	6	1363273	1363278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154150879
25476	NC_009712	TCG	2	6	1363288	1363293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150879
25477	NC_009712	GCC	2	6	1363362	1363367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150879
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25479	NC_009712	TCA	2	6	1363474	1363479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150879
25480	NC_009712	TTG	2	6	1363519	1363524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150879
25481	NC_009712	GCC	2	6	1363766	1363771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150880
25482	NC_009712	CCGGCA	2	12	1363772	1363783	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	154150880
25483	NC_009712	TTC	2	6	1363820	1363825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150880
25484	NC_009712	GA	3	6	1363973	1363978	50 %	0 %	50 %	0 %	154150880
25485	NC_009712	GCGG	2	8	1364050	1364057	0 %	0 %	75 %	25 %	154150880
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25491	NC_009712	G	6	6	1364242	1364247	0 %	0 %	100 %	0 %	154150880
25492	NC_009712	GGT	2	6	1364259	1364264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150880
25493	NC_009712	CGG	2	6	1364358	1364363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150880
25494	NC_009712	GCA	2	6	1364439	1364444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150880
25495	NC_009712	TCT	2	6	1364511	1364516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150880
25496	NC_009712	TCGA	2	8	1364555	1364562	25 %	25 %	25 %	25 %	154150880
25497	NC_009712	GCA	2	6	1364574	1364579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150880
25498	NC_009712	TCA	2	6	1364612	1364617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150880
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