MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_009712	GCA	2	6	1311862	1311867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150832
24502	NC_009712	ATC	2	6	1311899	1311904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150832
24503	NC_009712	CCCA	2	8	1311919	1311926	25 %	0 %	0 %	75 %	154150832
24504	NC_009712	GAA	2	6	1311989	1311994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150832
24505	NC_009712	TGG	2	6	1312004	1312009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150832
24506	NC_009712	A	6	6	1312034	1312039	100 %	0 %	0 %	0 %	154150832
24507	NC_009712	TC	3	6	1312057	1312062	0 %	50 %	0 %	50 %	154150832
24508	NC_009712	CCA	2	6	1312105	1312110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154150832
24509	NC_009712	CGCGCT	2	12	1312114	1312125	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	154150832
24510	NC_009712	TCA	2	6	1312140	1312145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150832
24511	NC_009712	CAT	2	6	1312156	1312161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150832
24512	NC_009712	GCA	2	6	1312162	1312167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150832
24513	NC_009712	AAG	2	6	1312199	1312204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150832
24514	NC_009712	CCAC	2	8	1312224	1312231	25 %	0 %	0 %	75 %	154150832
24515	NC_009712	GAG	2	6	1312247	1312252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150832
24516	NC_009712	TCC	2	6	1312290	1312295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150832
24517	NC_009712	TTC	2	6	1312346	1312351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150832
24518	NC_009712	TCT	2	6	1312499	1312504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150833
24519	NC_009712	CTA	2	6	1312721	1312726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150833
24520	NC_009712	CTT	2	6	1312806	1312811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150833
24521	NC_009712	ACCCTC	2	12	1312821	1312832	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	154150833
24522	NC_009712	TTTC	2	8	1312836	1312843	0 %	75 %	0 %	25 %	154150833
24523	NC_009712	CT	3	6	1312866	1312871	0 %	50 %	0 %	50 %	154150833
24524	NC_009712	GCC	2	6	1312902	1312907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150833
24525	NC_009712	CTTGCA	2	12	1312920	1312931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	154150833
24526	NC_009712	CCG	2	6	1312980	1312985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150833
24527	NC_009712	TCC	2	6	1313020	1313025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150833
24528	NC_009712	TGTGC	2	10	1313026	1313035	0 %	40 %	40 %	20 %	154150833
24529	NC_009712	CAA	2	6	1313095	1313100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150833
24530	NC_009712	CCG	2	6	1313157	1313162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150833
24531	NC_009712	CTC	2	6	1313268	1313273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150833
24532	NC_009712	TGC	2	6	1313299	1313304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150833
24533	NC_009712	TGCC	3	12	1313384	1313395	0 %	25 %	25 %	50 %	154150833
24534	NC_009712	TCC	2	6	1313443	1313448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150833
24535	NC_009712	ATC	2	6	1313451	1313456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150833
24536	NC_009712	CGG	2	6	1313458	1313463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150833
24537	NC_009712	TGC	2	6	1313477	1313482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150833
24538	NC_009712	GTG	2	6	1313643	1313648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150833
24539	NC_009712	CTT	2	6	1313649	1313654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150833
24540	NC_009712	GTT	2	6	1313703	1313708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150833
24541	NC_009712	TCT	2	6	1313725	1313730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150833
24542	NC_009712	AGC	2	6	1313767	1313772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150833
24543	NC_009712	GA	3	6	1313809	1313814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24544	NC_009712	ATT	2	6	1313897	1313902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154150834
24545	NC_009712	GTT	2	6	1313930	1313935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150834
24546	NC_009712	TTC	2	6	1313940	1313945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150834
24547	NC_009712	CCT	2	6	1313965	1313970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150834
24548	NC_009712	GCA	2	6	1313995	1314000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150834
24549	NC_009712	CGG	2	6	1314018	1314023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150834
24550	NC_009712	TTA	2	6	1314099	1314104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154150834
24551	NC_009712	CAG	2	6	1314125	1314130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150834
24552	NC_009712	TCA	2	6	1314245	1314250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150834
24553	NC_009712	ATG	2	6	1314272	1314277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150834
24554	NC_009712	AGA	2	6	1314346	1314351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150834
24555	NC_009712	AAAG	2	8	1314359	1314366	75 %	0 %	25 %	0 %	154150834
24556	NC_009712	GTT	2	6	1314620	1314625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150834
24557	NC_009712	TCT	2	6	1314666	1314671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150834
24558	NC_009712	TCT	2	6	1314717	1314722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150834
24559	NC_009712	TCT	2	6	1314729	1314734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150834
24560	NC_009712	GCTG	2	8	1314738	1314745	0 %	25 %	50 %	25 %	154150834
24561	NC_009712	TCGTT	2	10	1314801	1314810	0 %	60 %	20 %	20 %	154150834
24562	NC_009712	AGG	2	6	1314918	1314923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150835
24563	NC_009712	ACC	2	6	1314953	1314958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154150835
24564	NC_009712	GAA	2	6	1314975	1314980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150835
24565	NC_009712	CAG	2	6	1314981	1314986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150835
24566	NC_009712	CCG	2	6	1315034	1315039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150835
24567	NC_009712	CCG	2	6	1315043	1315048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150835
24568	NC_009712	GCA	2	6	1315077	1315082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150835
24569	NC_009712	AT	3	6	1315136	1315141	50 %	50 %	0 %	0 %	154150835
24570	NC_009712	GCG	2	6	1315199	1315204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150835
24571	NC_009712	ATG	2	6	1315243	1315248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150835
24572	NC_009712	GCT	2	6	1315295	1315300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150835
24573	NC_009712	TCC	2	6	1315351	1315356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150835
24574	NC_009712	A	6	6	1315380	1315385	100 %	0 %	0 %	0 %	154150835
24575	NC_009712	GGA	2	6	1315458	1315463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24576	NC_009712	GCAT	2	8	1315483	1315490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24577	NC_009712	T	7	7	1315498	1315504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24578	NC_009712	GAC	2	6	1315545	1315550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24579	NC_009712	GGGGGA	2	12	1315564	1315575	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24580	NC_009712	CAT	2	6	1315751	1315756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150836
24581	NC_009712	TCT	2	6	1315786	1315791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150836
24582	NC_009712	TCA	2	6	1315813	1315818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150836
24583	NC_009712	CTG	2	6	1315833	1315838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150836
24584	NC_009712	AACA	2	8	1315839	1315846	75 %	0 %	0 %	25 %	154150836
24585	NC_009712	CTT	2	6	1315875	1315880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150836
24586	NC_009712	TCG	2	6	1315911	1315916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150836
24587	NC_009712	GCT	2	6	1315945	1315950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150836
24588	NC_009712	TCA	2	6	1315996	1316001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150836
24589	NC_009712	G	6	6	1316055	1316060	0 %	0 %	100 %	0 %	154150836
24590	NC_009712	CTC	2	6	1316109	1316114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150836
24591	NC_009712	AAAG	2	8	1316138	1316145	75 %	0 %	25 %	0 %	154150836
24592	NC_009712	TCG	2	6	1316176	1316181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150836
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24595	NC_009712	AT	3	6	1316354	1316359	50 %	50 %	0 %	0 %	154150836
24596	NC_009712	TTC	2	6	1316453	1316458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150837
24597	NC_009712	A	6	6	1316459	1316464	100 %	0 %	0 %	0 %	154150837
24598	NC_009712	ATC	2	6	1316477	1316482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150837
24599	NC_009712	CCCAGG	2	12	1316535	1316546	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	154150837
24600	NC_009712	GGGA	2	8	1316553	1316560	25 %	0 %	75 %	0 %	154150837
24601	NC_009712	AC	3	6	1316601	1316606	50 %	0 %	0 %	50 %	154150837
24602	NC_009712	GCT	2	6	1316653	1316658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150837
24603	NC_009712	CTT	2	6	1316701	1316706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150837
24604	NC_009712	ATTTA	2	10	1316756	1316765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24605	NC_009712	ATT	2	6	1316826	1316831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154150838
24606	NC_009712	CCCCG	2	10	1316917	1316926	0 %	0 %	20 %	80 %	154150838
24607	NC_009712	CTT	2	6	1317011	1317016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150838
24608	NC_009712	CT	3	6	1317035	1317040	0 %	50 %	0 %	50 %	154150838
24609	NC_009712	CCT	2	6	1317082	1317087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150838
24610	NC_009712	CGG	2	6	1317169	1317174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150838
24611	NC_009712	CTT	2	6	1317187	1317192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150838
24612	NC_009712	T	6	6	1317222	1317227	0 %	100 %	0 %	0 %	154150838
24613	NC_009712	C	7	7	1317250	1317256	0 %	0 %	0 %	100 %	154150838
24614	NC_009712	TC	3	6	1317268	1317273	0 %	50 %	0 %	50 %	154150838
24615	NC_009712	TGGA	2	8	1317415	1317422	25 %	25 %	50 %	0 %	154150838
24616	NC_009712	AAG	2	6	1317423	1317428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150838
24617	NC_009712	ATC	2	6	1317440	1317445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150838
24618	NC_009712	GCCGG	2	10	1317484	1317493	0 %	0 %	60 %	40 %	154150838
24619	NC_009712	TCC	2	6	1317499	1317504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150838
24620	NC_009712	CGG	2	6	1317510	1317515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150838
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24627	NC_009712	GTC	2	6	1317957	1317962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150839
24628	NC_009712	CTT	2	6	1317972	1317977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150839
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24630	NC_009712	GCG	2	6	1318024	1318029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150839
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24648	NC_009712	AAT	2	6	1318889	1318894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24649	NC_009712	GCA	2	6	1318982	1318987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150840
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24653	NC_009712	GAT	2	6	1319083	1319088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150840
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24672	NC_009712	T	7	7	1319909	1319915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24673	NC_009712	TCTT	2	8	1319968	1319975	0 %	75 %	0 %	25 %	154150841
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24682	NC_009712	AGAAA	2	10	1320400	1320409	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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24699	NC_009712	GT	3	6	1321385	1321390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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24704	NC_009712	A	6	6	1321618	1321623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24705	NC_009712	TCA	2	6	1321721	1321726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150843
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24724	NC_009712	ATA	2	6	1322525	1322530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154150843
24725	NC_009712	GGT	2	6	1322548	1322553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150843
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24731	NC_009712	GCA	2	6	1322813	1322818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150844
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24734	NC_009712	GA	3	6	1322882	1322887	50 %	0 %	50 %	0 %	154150844
24735	NC_009712	TGC	2	6	1322892	1322897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150844
24736	NC_009712	ATT	2	6	1322923	1322928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154150844
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24749	NC_009712	TTTTC	2	10	1323866	1323875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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24761	NC_009712	TAT	2	6	1324317	1324322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24765	NC_009712	TCT	2	6	1324533	1324538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24768	NC_009712	TCAT	2	8	1324741	1324748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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24777	NC_009712	AAG	2	6	1325299	1325304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24854	NC_009712	GAA	2	6	1330002	1330007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150849
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24857	NC_009712	CTTCT	2	10	1330175	1330184	0 %	60 %	0 %	40 %	154150849
24858	NC_009712	TGCC	2	8	1330300	1330307	0 %	25 %	25 %	50 %	154150849
24859	NC_009712	T	6	6	1330362	1330367	0 %	100 %	0 %	0 %	154150849
24860	NC_009712	CTG	2	6	1330468	1330473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150849
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24886	NC_009712	CCGG	2	8	1331639	1331646	0 %	0 %	50 %	50 %	154150850
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24928	NC_009712	T	7	7	1334402	1334408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24929	NC_009712	ATTT	2	8	1334413	1334420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24960	NC_009712	CCG	2	6	1335732	1335737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24964	NC_009712	GGGA	2	8	1335829	1335836	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24965	NC_009712	AACA	2	8	1335860	1335867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24966	NC_009712	TTA	2	6	1335869	1335874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24973	NC_009712	CTT	2	6	1336486	1336491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150854
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24977	NC_009712	GAG	2	6	1336654	1336659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150854
24978	NC_009712	CGG	2	6	1336671	1336676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150854
24979	NC_009712	GGAT	2	8	1336846	1336853	25 %	25 %	50 %	0 %	154150854
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24981	NC_009712	GAA	2	6	1337018	1337023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24982	NC_009712	AGTG	2	8	1337025	1337032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24983	NC_009712	GGA	2	6	1337033	1337038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24991	NC_009712	TAA	2	6	1337400	1337405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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