MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_009712	TCC	2	6	1007710	1007715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19002	NC_009712	GCC	2	6	1007725	1007730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19003	NC_009712	T	6	6	1007747	1007752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_009712	CCT	2	6	1007763	1007768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19005	NC_009712	A	7	7	1007794	1007800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_009712	A	6	6	1007847	1007852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_009712	T	6	6	1007869	1007874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_009712	AGC	2	6	1008042	1008047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150571
19009	NC_009712	ACA	2	6	1008103	1008108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150571
19010	NC_009712	T	6	6	1008229	1008234	0 %	100 %	0 %	0 %	154150571
19011	NC_009712	AT	3	6	1008262	1008267	50 %	50 %	0 %	0 %	154150571
19012	NC_009712	GC	3	6	1008337	1008342	0 %	0 %	50 %	50 %	154150571
19013	NC_009712	TGA	2	6	1008402	1008407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150571
19014	NC_009712	AGC	2	6	1008489	1008494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150571
19015	NC_009712	CAG	2	6	1008521	1008526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150571
19016	NC_009712	CAG	2	6	1008569	1008574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150571
19017	NC_009712	CGC	2	6	1008645	1008650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150571
19018	NC_009712	GGA	2	6	1008784	1008789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150571
19019	NC_009712	GCGGT	2	10	1008798	1008807	0 %	20 %	60 %	20 %	154150571
19020	NC_009712	CTT	2	6	1009020	1009025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_009712	CAGG	2	8	1009055	1009062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19022	NC_009712	TGT	2	6	1009089	1009094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19023	NC_009712	T	6	6	1009094	1009099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_009712	CTGCC	2	10	1009116	1009125	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19025	NC_009712	GCA	2	6	1009142	1009147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19026	NC_009712	TGCC	2	8	1009148	1009155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19027	NC_009712	TGC	2	6	1009189	1009194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19028	NC_009712	GCGG	2	8	1009204	1009211	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19029	NC_009712	ATG	2	6	1009229	1009234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19030	NC_009712	T	6	6	1009251	1009256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_009712	CCG	2	6	1009274	1009279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19032	NC_009712	ATT	2	6	1009334	1009339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_009712	AAC	2	6	1009350	1009355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19034	NC_009712	CTT	2	6	1009359	1009364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19035	NC_009712	A	7	7	1009430	1009436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19036	NC_009712	GCC	2	6	1009585	1009590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19037	NC_009712	GTT	2	6	1009677	1009682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150572
19038	NC_009712	TCC	2	6	1009692	1009697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150572
19039	NC_009712	G	6	6	1009710	1009715	0 %	0 %	100 %	0 %	154150572
19040	NC_009712	TGG	2	6	1009753	1009758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150572
19041	NC_009712	GAA	2	6	1009836	1009841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150572
19042	NC_009712	T	6	6	1009907	1009912	0 %	100 %	0 %	0 %	154150572
19043	NC_009712	CAT	2	6	1009921	1009926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150572
19044	NC_009712	CTGC	2	8	1009948	1009955	0 %	25 %	25 %	50 %	154150572
19045	NC_009712	GT	3	6	1010007	1010012	0 %	50 %	50 %	0 %	154150572
19046	NC_009712	CAA	2	6	1010046	1010051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19047	NC_009712	TAT	2	6	1010080	1010085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19048	NC_009712	A	7	7	1010135	1010141	100 %	0 %	0 %	0 %	154150573
19049	NC_009712	GATC	2	8	1010143	1010150	25 %	25 %	25 %	25 %	154150573
19050	NC_009712	CAGG	2	8	1010189	1010196	25 %	0 %	50 %	25 %	154150573
19051	NC_009712	TC	3	6	1010203	1010208	0 %	50 %	0 %	50 %	154150573
19052	NC_009712	ATT	2	6	1010388	1010393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154150573
19053	NC_009712	ATC	2	6	1010435	1010440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150573
19054	NC_009712	GAT	2	6	1010581	1010586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150573
19055	NC_009712	TGGCGA	2	12	1010658	1010669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154150573
19056	NC_009712	TGC	2	6	1010770	1010775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19057	NC_009712	GGA	2	6	1010866	1010871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150573
19058	NC_009712	GAG	2	6	1010876	1010881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150573
19059	NC_009712	TCT	2	6	1010920	1010925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150573
19060	NC_009712	CGAT	2	8	1011027	1011034	25 %	25 %	25 %	25 %	154150573
19061	NC_009712	ATT	2	6	1011080	1011085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154150573
19062	NC_009712	CGG	2	6	1011186	1011191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150573
19063	NC_009712	CAT	2	6	1011354	1011359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150573
19064	NC_009712	ACA	2	6	1011378	1011383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150573
19065	NC_009712	GGA	2	6	1011385	1011390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150573
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19068	NC_009712	TGG	2	6	1011570	1011575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150573
19069	NC_009712	AGA	2	6	1011618	1011623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150573
19070	NC_009712	TGCC	2	8	1011681	1011688	0 %	25 %	25 %	50 %	154150573
19071	NC_009712	GCGA	2	8	1011816	1011823	25 %	0 %	50 %	25 %	154150573
19072	NC_009712	TGT	2	6	1011844	1011849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150573
19073	NC_009712	GCT	2	6	1011871	1011876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19074	NC_009712	ATT	2	6	1011879	1011884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154150573
19075	NC_009712	GGCA	2	8	1011888	1011895	25 %	0 %	50 %	25 %	154150573
19076	NC_009712	CGAT	2	8	1011932	1011939	25 %	25 %	25 %	25 %	154150573
19077	NC_009712	TCA	2	6	1011948	1011953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150573
19078	NC_009712	ACCGGG	2	12	1011969	1011980	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	154150573
19079	NC_009712	CTG	2	6	1012172	1012177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19080	NC_009712	GCT	2	6	1012204	1012209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19081	NC_009712	CAGT	2	8	1012233	1012240	25 %	25 %	25 %	25 %	154150573
19082	NC_009712	GGA	2	6	1012285	1012290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150573
19083	NC_009712	CTG	2	6	1012355	1012360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19084	NC_009712	CA	3	6	1012458	1012463	50 %	0 %	0 %	50 %	154150573
19085	NC_009712	ACA	2	6	1012473	1012478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150573
19086	NC_009712	ATC	2	6	1012493	1012498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150573
19087	NC_009712	CGC	2	6	1012513	1012518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150573
19088	NC_009712	GAG	3	9	1012523	1012531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150573
19089	NC_009712	AGC	2	6	1012548	1012553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19090	NC_009712	AGC	3	9	1012605	1012613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19091	NC_009712	GAC	2	6	1012667	1012672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19092	NC_009712	CGG	2	6	1012702	1012707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150573
19093	NC_009712	GCA	2	6	1012778	1012783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150573
19094	NC_009712	TCA	2	6	1012883	1012888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150574
19095	NC_009712	TAC	2	6	1012988	1012993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150574
19096	NC_009712	GCA	2	6	1013004	1013009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150574
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19099	NC_009712	GGC	2	6	1013163	1013168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150574
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19101	NC_009712	CGC	2	6	1013204	1013209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150574
19102	NC_009712	GAA	2	6	1013256	1013261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150574
19103	NC_009712	CGG	2	6	1013298	1013303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150574
19104	NC_009712	GCT	2	6	1013328	1013333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150574
19105	NC_009712	TTG	2	6	1013411	1013416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150574
19106	NC_009712	GCCGC	2	10	1013421	1013430	0 %	0 %	40 %	60 %	154150574
19107	NC_009712	TGA	2	6	1013438	1013443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150574
19108	NC_009712	ACCGG	2	10	1013571	1013580	20 %	0 %	40 %	40 %	154150574
19109	NC_009712	CAA	2	6	1013604	1013609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150574
19110	NC_009712	GCA	2	6	1013625	1013630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150574
19111	NC_009712	TGA	2	6	1013633	1013638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150574
19112	NC_009712	CGG	2	6	1013652	1013657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150574
19113	NC_009712	GCG	2	6	1013662	1013667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150574
19114	NC_009712	GTG	2	6	1013671	1013676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150574
19115	NC_009712	AAAC	2	8	1013801	1013808	75 %	0 %	0 %	25 %	154150574
19116	NC_009712	CTT	2	6	1013814	1013819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150574
19117	NC_009712	GAC	2	6	1013857	1013862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150574
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19119	NC_009712	CGG	2	6	1013955	1013960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150574
19120	NC_009712	AGA	2	6	1013988	1013993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154150574
19121	NC_009712	GAT	2	6	1014079	1014084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150574
19122	NC_009712	GAC	2	6	1014088	1014093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150574
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19131	NC_009712	TCAA	2	8	1014526	1014533	50 %	25 %	0 %	25 %	154150575
19132	NC_009712	ACA	2	6	1014568	1014573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150575
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19142	NC_009712	AAAT	2	8	1014881	1014888	75 %	25 %	0 %	0 %	154150575
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19182	NC_009712	TAA	2	6	1016873	1016878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19231	NC_009712	T	6	6	1019948	1019953	0 %	100 %	0 %	0 %	154150579
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19234	NC_009712	TGC	2	6	1020192	1020197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150580
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19236	NC_009712	CCCG	2	8	1020362	1020369	0 %	0 %	25 %	75 %	154150580
19237	NC_009712	CCG	2	6	1020412	1020417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150580
19238	NC_009712	ATC	2	6	1020484	1020489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150580
19239	NC_009712	TGG	2	6	1020496	1020501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150580
19240	NC_009712	T	6	6	1020574	1020579	0 %	100 %	0 %	0 %	154150580
19241	NC_009712	GCA	2	6	1020621	1020626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150580
19242	NC_009712	A	6	6	1020670	1020675	100 %	0 %	0 %	0 %	154150580
19243	NC_009712	CCGTT	2	10	1020718	1020727	0 %	40 %	20 %	40 %	154150580
19244	NC_009712	CAA	2	6	1020743	1020748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150580
19245	NC_009712	AG	3	6	1020772	1020777	50 %	0 %	50 %	0 %	154150580
19246	NC_009712	GCA	2	6	1020884	1020889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150580
19247	NC_009712	GTC	2	6	1020918	1020923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150580
19248	NC_009712	GA	3	6	1020970	1020975	50 %	0 %	50 %	0 %	154150580
19249	NC_009712	CTC	2	6	1020981	1020986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150580
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19251	NC_009712	TGTC	2	8	1021037	1021044	0 %	50 %	25 %	25 %	154150580
19252	NC_009712	TTA	2	6	1021080	1021085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19253	NC_009712	GAG	2	6	1021092	1021097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19254	NC_009712	GCTC	2	8	1021104	1021111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19255	NC_009712	ATG	2	6	1021184	1021189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19256	NC_009712	AGT	2	6	1021278	1021283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19257	NC_009712	GAG	2	6	1021335	1021340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150581
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19264	NC_009712	TGC	2	6	1021589	1021594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150581
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19270	NC_009712	GGA	2	6	1022052	1022057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150581
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19275	NC_009712	GTCCG	2	10	1022397	1022406	0 %	20 %	40 %	40 %	154150582
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19279	NC_009712	A	7	7	1022845	1022851	100 %	0 %	0 %	0 %	154150582
19280	NC_009712	GATC	2	8	1022880	1022887	25 %	25 %	25 %	25 %	154150582
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19282	NC_009712	TCG	2	6	1023030	1023035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154150582
19283	NC_009712	TTG	2	6	1023058	1023063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154150582
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19285	NC_009712	A	7	7	1023116	1023122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19286	NC_009712	TTC	2	6	1023164	1023169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150583
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19318	NC_009712	CAT	2	6	1024855	1024860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154150584
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19324	NC_009712	TAA	2	6	1025057	1025062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19325	NC_009712	G	6	6	1025093	1025098	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19326	NC_009712	CCGG	2	8	1025128	1025135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19327	NC_009712	T	8	8	1025141	1025148	0 %	100 %	0 %	0 %	154150585
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19334	NC_009712	GATC	2	8	1025440	1025447	25 %	25 %	25 %	25 %	154150585
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19340	NC_009712	GTG	2	6	1025724	1025729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150585
19341	NC_009712	GCAGA	2	10	1025832	1025841	40 %	0 %	40 %	20 %	154150585
19342	NC_009712	GGA	2	6	1026064	1026069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154150585
19343	NC_009712	GGT	2	6	1026112	1026117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154150585
19344	NC_009712	CCA	2	6	1026214	1026219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154150585
19345	NC_009712	CAA	2	6	1026352	1026357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154150585
19346	NC_009712	GAT	2	6	1026365	1026370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150585
19347	NC_009712	CGG	2	6	1026460	1026465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150585
19348	NC_009712	GGCAG	2	10	1026543	1026552	20 %	0 %	60 %	20 %	154150585
19349	NC_009712	CGGG	2	8	1026572	1026579	0 %	0 %	75 %	25 %	154150585
19350	NC_009712	GAGC	2	8	1026631	1026638	25 %	0 %	50 %	25 %	154150585
19351	NC_009712	GCA	2	6	1026771	1026776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150585
19352	NC_009712	CCT	2	6	1026790	1026795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150585
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19354	NC_009712	GCC	2	6	1026866	1026871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154150585
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19455	NC_009712	GT	3	6	1032625	1032630	0 %	50 %	50 %	0 %	154150591
19456	NC_009712	GCA	2	6	1032789	1032794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154150591
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19462	NC_009712	TGATC	2	10	1033217	1033226	20 %	40 %	20 %	20 %	154150592
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19467	NC_009712	G	6	6	1033451	1033456	0 %	0 %	100 %	0 %	154150593
19468	NC_009712	GCGAT	2	10	1033467	1033476	20 %	20 %	40 %	20 %	154150593
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19472	NC_009712	CGG	2	6	1033634	1033639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154150593
19473	NC_009712	ACGT	2	8	1033661	1033668	25 %	25 %	25 %	25 %	154150593
19474	NC_009712	CTT	2	6	1033688	1033693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154150593
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19480	NC_009712	ATG	2	6	1034192	1034197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154150593
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19499	NC_009712	CCT	2	6	1035276	1035281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154150594
19500	NC_009712	A	6	6	1035417	1035422	100 %	0 %	0 %	0 %	154150594

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