MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 47475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009712	ATGT	2	8	237481	237488	25 %	50 %	25 %	0 %	154149801
4502	NC_009712	CTC	2	6	237546	237551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149801
4503	NC_009712	AGG	2	6	237586	237591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149801
4504	NC_009712	GCA	2	6	237592	237597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149801
4505	NC_009712	AGC	2	6	237739	237744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149801
4506	NC_009712	TGA	2	6	237782	237787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149801
4507	NC_009712	GGT	2	6	237876	237881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149801
4508	NC_009712	ATC	2	6	237913	237918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149801
4509	NC_009712	AGAGG	2	10	237933	237942	40 %	0 %	60 %	0 %	154149801
4510	NC_009712	CAT	2	6	238164	238169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149801
4511	NC_009712	TCCC	2	8	238233	238240	0 %	25 %	0 %	75 %	154149801
4512	NC_009712	CT	3	6	238274	238279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_009712	ACC	2	6	238415	238420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149802
4514	NC_009712	TCGG	2	8	238447	238454	0 %	25 %	50 %	25 %	154149802
4515	NC_009712	CT	3	6	238490	238495	0 %	50 %	0 %	50 %	154149802
4516	NC_009712	AGA	2	6	238580	238585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149802
4517	NC_009712	CCG	2	6	238654	238659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149802
4518	NC_009712	GAT	2	6	238737	238742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149802
4519	NC_009712	TGG	2	6	238757	238762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149802
4520	NC_009712	ACC	2	6	238765	238770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149802
4521	NC_009712	AGG	2	6	238798	238803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149802
4522	NC_009712	AGA	2	6	238804	238809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149802
4523	NC_009712	CAT	2	6	238848	238853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149802
4524	NC_009712	GGAT	2	8	238968	238975	25 %	25 %	50 %	0 %	154149802
4525	NC_009712	GGT	2	6	238989	238994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149802
4526	NC_009712	TGC	2	6	239152	239157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149802
4527	NC_009712	CTG	2	6	239202	239207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149802
4528	NC_009712	TGCGG	2	10	239301	239310	0 %	20 %	60 %	20 %	154149802
4529	NC_009712	ACA	2	6	239534	239539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149802
4530	NC_009712	GCA	2	6	239602	239607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149803
4531	NC_009712	CATG	2	8	239645	239652	25 %	25 %	25 %	25 %	154149803
4532	NC_009712	AAGA	2	8	239682	239689	75 %	0 %	25 %	0 %	154149803
4533	NC_009712	CGTG	2	8	239709	239716	0 %	25 %	50 %	25 %	154149803
4534	NC_009712	AAG	2	6	239718	239723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149803
4535	NC_009712	GTT	2	6	239754	239759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149803
4536	NC_009712	AAT	2	6	239766	239771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154149803
4537	NC_009712	GCCGGG	2	12	239824	239835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149803
4538	NC_009712	AGA	2	6	239843	239848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149803
4539	NC_009712	GCCG	2	8	239852	239859	0 %	0 %	50 %	50 %	154149803
4540	NC_009712	TTC	2	6	239865	239870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149803
4541	NC_009712	GGC	2	6	239970	239975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149803
4542	NC_009712	C	6	6	240098	240103	0 %	0 %	0 %	100 %	154149803
4543	NC_009712	ATT	2	6	240220	240225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154149803
4544	NC_009712	GCAGGG	2	12	240283	240294	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	154149804
4545	NC_009712	GAG	2	6	240335	240340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149804
4546	NC_009712	GAT	2	6	240347	240352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149804
4547	NC_009712	CT	3	6	240443	240448	0 %	50 %	0 %	50 %	154149804
4548	NC_009712	AGC	2	6	240453	240458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149804
4549	NC_009712	CTG	2	6	240460	240465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149804
4550	NC_009712	GCC	2	6	240553	240558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149804
4551	NC_009712	GCG	2	6	240570	240575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149804
4552	NC_009712	CTT	2	6	240662	240667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149804
4553	NC_009712	GCAGG	2	10	240763	240772	20 %	0 %	60 %	20 %	154149804
4554	NC_009712	CCAC	2	8	240951	240958	25 %	0 %	0 %	75 %	154149805
4555	NC_009712	GCT	2	6	240988	240993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149805
4556	NC_009712	CGT	2	6	241042	241047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149805
4557	NC_009712	CGTCC	2	10	241073	241082	0 %	20 %	20 %	60 %	154149805
4558	NC_009712	TGC	2	6	241139	241144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149805
4559	NC_009712	CACCG	2	10	241145	241154	20 %	0 %	20 %	60 %	154149805
4560	NC_009712	GAC	2	6	241169	241174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149805
4561	NC_009712	CCCCG	2	10	241217	241226	0 %	0 %	20 %	80 %	154149805
4562	NC_009712	TCC	2	6	241242	241247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149805
4563	NC_009712	G	6	6	241324	241329	0 %	0 %	100 %	0 %	154149805
4564	NC_009712	GGC	2	6	241356	241361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149805
4565	NC_009712	TGC	2	6	241394	241399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149805
4566	NC_009712	CCA	2	6	241444	241449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149805
4567	NC_009712	GCG	2	6	241454	241459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149805
4568	NC_009712	ATCG	2	8	241528	241535	25 %	25 %	25 %	25 %	154149806
4569	NC_009712	GAT	2	6	241600	241605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149806
4570	NC_009712	GAT	2	6	241807	241812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149806
4571	NC_009712	T	6	6	242002	242007	0 %	100 %	0 %	0 %	154149806
4572	NC_009712	TGCA	2	8	242015	242022	25 %	25 %	25 %	25 %	154149806
4573	NC_009712	TCC	2	6	242051	242056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149806
4574	NC_009712	T	6	6	242134	242139	0 %	100 %	0 %	0 %	154149806
4575	NC_009712	GCT	2	6	242191	242196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149806
4576	NC_009712	ATG	2	6	242243	242248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149806
4577	NC_009712	CAGG	2	8	242284	242291	25 %	0 %	50 %	25 %	154149806
4578	NC_009712	GGA	2	6	242301	242306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149806
4579	NC_009712	TG	3	6	242372	242377	0 %	50 %	50 %	0 %	154149806
4580	NC_009712	GTCCTT	2	12	242383	242394	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	154149806
4581	NC_009712	T	6	6	242446	242451	0 %	100 %	0 %	0 %	154149806
4582	NC_009712	CCT	2	6	242472	242477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149806
4583	NC_009712	GTC	2	6	242578	242583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149806
4584	NC_009712	CT	3	6	242639	242644	0 %	50 %	0 %	50 %	154149807
4585	NC_009712	TC	3	6	242774	242779	0 %	50 %	0 %	50 %	154149807
4586	NC_009712	TGAG	2	8	242831	242838	25 %	25 %	50 %	0 %	154149807
4587	NC_009712	C	7	7	242933	242939	0 %	0 %	0 %	100 %	154149807
4588	NC_009712	TTG	2	6	242950	242955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149807
4589	NC_009712	GAG	2	6	243039	243044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149807
4590	NC_009712	GGGC	2	8	243072	243079	0 %	0 %	75 %	25 %	154149807
4591	NC_009712	TC	3	6	243158	243163	0 %	50 %	0 %	50 %	154149807
4592	NC_009712	GCA	2	6	243284	243289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149807
4593	NC_009712	CCT	2	6	243290	243295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149807
4594	NC_009712	CGAC	2	8	243417	243424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_009712	ATCG	2	8	243440	243447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_009712	T	7	7	243457	243463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_009712	AGC	2	6	243468	243473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_009712	G	6	6	243478	243483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_009712	G	6	6	243485	243490	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_009712	CCGA	2	8	243523	243530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_009712	A	6	6	243627	243632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_009712	CCGA	2	8	243642	243649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_009712	TCGG	2	8	243658	243665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_009712	T	8	8	243674	243681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_009712	GAG	3	9	243698	243706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_009712	T	6	6	243717	243722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_009712	G	6	6	243729	243734	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_009712	TCC	2	6	243735	243740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_009712	T	6	6	243745	243750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_009712	CCGGC	2	10	243778	243787	0 %	0 %	40 %	60 %	154149808
4611	NC_009712	CCGG	2	8	243986	243993	0 %	0 %	50 %	50 %	154149808
4612	NC_009712	TCGG	2	8	244042	244049	0 %	25 %	50 %	25 %	154149808
4613	NC_009712	GTGCCG	2	12	244291	244302	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	154149808
4614	NC_009712	GGGT	2	8	244371	244378	0 %	25 %	75 %	0 %	154149808
4615	NC_009712	CCGG	2	8	244379	244386	0 %	0 %	50 %	50 %	154149808
4616	NC_009712	CCA	2	6	244448	244453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149808
4617	NC_009712	GAT	2	6	244518	244523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149808
4618	NC_009712	GGT	2	6	244548	244553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149808
4619	NC_009712	ATA	2	6	244594	244599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154149808
4620	NC_009712	CGGG	2	8	244623	244630	0 %	0 %	75 %	25 %	154149808
4621	NC_009712	TCC	2	6	244663	244668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149808
4622	NC_009712	TGC	2	6	244728	244733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149808
4623	NC_009712	GTC	2	6	244755	244760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149808
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4625	NC_009712	C	6	6	244924	244929	0 %	0 %	0 %	100 %	154149808
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4748	NC_009712	CCA	2	6	251243	251248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149815
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4750	NC_009712	TGCC	2	8	251297	251304	0 %	25 %	25 %	50 %	154149816
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4842	NC_009712	GAG	2	6	257336	257341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149820
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4851	NC_009712	GAT	2	6	258435	258440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149821
4852	NC_009712	TGCCA	2	10	258481	258490	20 %	20 %	20 %	40 %	154149821
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4855	NC_009712	TCC	2	6	258718	258723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149821
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4859	NC_009712	ATA	2	6	258913	258918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154149821
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4870	NC_009712	GTGA	2	8	259452	259459	25 %	25 %	50 %	0 %	154149822
4871	NC_009712	A	6	6	259464	259469	100 %	0 %	0 %	0 %	154149822
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4997	NC_009712	CGG	2	6	267216	267221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149830
4998	NC_009712	GCA	2	6	267234	267239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149830
4999	NC_009712	GGT	2	6	267343	267348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149830
5000	NC_009712	CGGG	2	8	267370	267377	0 %	0 %	75 %	25 %	154149830

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