MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 46439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009635	CTA	2	6	17270	17275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400453
502	NC_009635	TAT	2	6	17307	17312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400453
503	NC_009635	TA	3	6	17361	17366	50 %	50 %	0 %	0 %	150400453
504	NC_009635	CAT	2	6	17378	17383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400453
505	NC_009635	T	6	6	17412	17417	0 %	100 %	0 %	0 %	150400453
506	NC_009635	CTA	2	6	17429	17434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400453
507	NC_009635	TTAA	2	8	17455	17462	50 %	50 %	0 %	0 %	150400453
508	NC_009635	TTA	2	6	17495	17500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009635	CTG	2	6	17510	17515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_009635	ATTTT	2	10	17520	17529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009635	TTA	2	6	17530	17535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009635	ATTTT	2	10	17536	17545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009635	TTA	2	6	17546	17551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009635	AAT	2	6	17600	17605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400454
515	NC_009635	TCC	2	6	17636	17641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150400454
516	NC_009635	TTC	2	6	17687	17692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400454
517	NC_009635	AACT	2	8	17735	17742	50 %	25 %	0 %	25 %	150400454
518	NC_009635	CTT	2	6	17755	17760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400454
519	NC_009635	ATTA	2	8	17762	17769	50 %	50 %	0 %	0 %	150400454
520	NC_009635	CCA	2	6	17820	17825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150400454
521	NC_009635	AT	3	6	17829	17834	50 %	50 %	0 %	0 %	150400454
522	NC_009635	TTC	2	6	17876	17881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400454
523	NC_009635	T	6	6	17899	17904	0 %	100 %	0 %	0 %	150400454
524	NC_009635	TTG	2	6	17928	17933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400454
525	NC_009635	CTA	2	6	17965	17970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400454
526	NC_009635	T	6	6	18006	18011	0 %	100 %	0 %	0 %	150400454
527	NC_009635	TTC	2	6	18047	18052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400454
528	NC_009635	CTG	2	6	18055	18060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150400454
529	NC_009635	AAC	2	6	18068	18073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400454
530	NC_009635	ATT	2	6	18081	18086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400454
531	NC_009635	ATTT	3	12	18106	18117	25 %	75 %	0 %	0 %	150400454
532	NC_009635	AT	3	6	18127	18132	50 %	50 %	0 %	0 %	150400454
533	NC_009635	T	6	6	18132	18137	0 %	100 %	0 %	0 %	150400454
534	NC_009635	TCTTT	2	10	18139	18148	0 %	80 %	0 %	20 %	150400454
535	NC_009635	CAAT	2	8	18151	18158	50 %	25 %	0 %	25 %	150400454
536	NC_009635	CATAAA	2	12	18203	18214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400454
537	NC_009635	T	6	6	18228	18233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009635	TAT	2	6	18242	18247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009635	TTTTA	2	10	18255	18264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009635	TTTA	2	8	18274	18281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009635	TTTTTA	2	12	18282	18293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009635	T	7	7	18294	18300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009635	CTT	2	6	18321	18326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009635	TAAA	2	8	18363	18370	75 %	25 %	0 %	0 %	150400455
545	NC_009635	ATT	2	6	18401	18406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400455
546	NC_009635	TAT	2	6	18435	18440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400455
547	NC_009635	ATA	2	6	18462	18467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400455
548	NC_009635	A	6	6	18526	18531	100 %	0 %	0 %	0 %	150400455
549	NC_009635	ATTT	2	8	18645	18652	25 %	75 %	0 %	0 %	150400455
550	NC_009635	T	6	6	18650	18655	0 %	100 %	0 %	0 %	150400455
551	NC_009635	AT	3	6	18656	18661	50 %	50 %	0 %	0 %	150400455
552	NC_009635	ATT	2	6	18667	18672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400455
553	NC_009635	GATAT	2	10	18678	18687	40 %	40 %	20 %	0 %	150400455
554	NC_009635	TAT	2	6	18697	18702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400455
555	NC_009635	ATT	2	6	18707	18712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400455
556	NC_009635	ATT	2	6	18797	18802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400455
557	NC_009635	GTA	2	6	18811	18816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400455
558	NC_009635	ATT	2	6	18845	18850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400455
559	NC_009635	GTA	2	6	18859	18864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400455
560	NC_009635	ACA	2	6	18878	18883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400455
561	NC_009635	TAG	2	6	18943	18948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400455
562	NC_009635	TAGT	2	8	18975	18982	25 %	50 %	25 %	0 %	150400455
563	NC_009635	AT	3	6	19032	19037	50 %	50 %	0 %	0 %	150400455
564	NC_009635	AAG	2	6	19051	19056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400455
565	NC_009635	AAT	2	6	19078	19083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400455
566	NC_009635	TGAT	2	8	19093	19100	25 %	50 %	25 %	0 %	150400455
567	NC_009635	TA	3	6	19101	19106	50 %	50 %	0 %	0 %	150400455
568	NC_009635	TAATA	2	10	19113	19122	60 %	40 %	0 %	0 %	150400455
569	NC_009635	TAA	2	6	19128	19133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400455
570	NC_009635	TTTTA	2	10	19173	19182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009635	AT	3	6	19183	19188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009635	AT	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_009635	TAATTA	2	12	19200	19211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009635	GTATT	2	10	19223	19232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009635	TAAT	2	8	19274	19281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009635	TAAT	2	8	19284	19291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009635	ATTAT	2	10	19296	19305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009635	ACA	2	6	19311	19316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_009635	TAT	2	6	19338	19343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009635	A	6	6	19405	19410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009635	A	6	6	19435	19440	100 %	0 %	0 %	0 %	150400456
582	NC_009635	AT	4	8	19457	19464	50 %	50 %	0 %	0 %	150400456
583	NC_009635	TA	3	6	19497	19502	50 %	50 %	0 %	0 %	150400456
584	NC_009635	AT	3	6	19504	19509	50 %	50 %	0 %	0 %	150400456
585	NC_009635	AATAT	2	10	19527	19536	60 %	40 %	0 %	0 %	150400456
586	NC_009635	ATA	2	6	19601	19606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400456
587	NC_009635	TGT	2	6	19627	19632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400456
588	NC_009635	CGA	2	6	19645	19650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150400456
589	NC_009635	A	6	6	19656	19661	100 %	0 %	0 %	0 %	150400456
590	NC_009635	ATA	2	6	19691	19696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400456
591	NC_009635	GTT	2	6	19718	19723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400456
592	NC_009635	ATA	3	9	19744	19752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400456
593	NC_009635	AT	3	6	19770	19775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009635	AT	4	8	19809	19816	50 %	50 %	0 %	0 %	150400457
595	NC_009635	TAAA	2	8	19817	19824	75 %	25 %	0 %	0 %	150400457
596	NC_009635	A	6	6	19822	19827	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
597	NC_009635	A	6	6	19841	19846	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
598	NC_009635	TTC	2	6	19908	19913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150400457
599	NC_009635	TAA	2	6	19947	19952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400457
600	NC_009635	ATT	2	6	19967	19972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400457
601	NC_009635	AT	3	6	19998	20003	50 %	50 %	0 %	0 %	150400457
602	NC_009635	AGA	2	6	20025	20030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400457
603	NC_009635	TAAA	2	8	20141	20148	75 %	25 %	0 %	0 %	150400457
604	NC_009635	ATT	3	9	20156	20164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400457
605	NC_009635	TTA	2	6	20188	20193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400457
606	NC_009635	CATA	2	8	20203	20210	50 %	25 %	0 %	25 %	150400457
607	NC_009635	A	6	6	20269	20274	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
608	NC_009635	A	6	6	20285	20290	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
609	NC_009635	ATA	2	6	20306	20311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400457
610	NC_009635	AT	3	6	20326	20331	50 %	50 %	0 %	0 %	150400457
611	NC_009635	ATT	2	6	20355	20360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400457
612	NC_009635	AT	3	6	20373	20378	50 %	50 %	0 %	0 %	150400457
613	NC_009635	A	6	6	20400	20405	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
614	NC_009635	ATA	2	6	20419	20424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400457
615	NC_009635	TATT	2	8	20451	20458	25 %	75 %	0 %	0 %	150400457
616	NC_009635	T	6	6	20489	20494	0 %	100 %	0 %	0 %	150400457
617	NC_009635	A	8	8	20505	20512	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
618	NC_009635	ATAA	2	8	20575	20582	75 %	25 %	0 %	0 %	150400457
619	NC_009635	A	6	6	20587	20592	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
620	NC_009635	TAT	2	6	20614	20619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400457
621	NC_009635	AAT	2	6	20638	20643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400457
622	NC_009635	T	6	6	20690	20695	0 %	100 %	0 %	0 %	150400457
623	NC_009635	A	7	7	20739	20745	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
624	NC_009635	TAA	2	6	20769	20774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400457
625	NC_009635	TTG	2	6	20797	20802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150400457
626	NC_009635	TAA	2	6	20808	20813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400457
627	NC_009635	A	6	6	20812	20817	100 %	0 %	0 %	0 %	150400457
628	NC_009635	TTGA	2	8	20837	20844	25 %	50 %	25 %	0 %	150400457
629	NC_009635	TAA	2	6	20849	20854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009635	TA	3	6	20978	20983	50 %	50 %	0 %	0 %	150400458
631	NC_009635	AT	3	6	20984	20989	50 %	50 %	0 %	0 %	150400458
632	NC_009635	GTA	2	6	20994	20999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400458
633	NC_009635	ATAAA	2	10	21009	21018	80 %	20 %	0 %	0 %	150400458
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635	NC_009635	TGA	2	6	21049	21054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400458
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