MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 110190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_009565	TGC	2	6	645522	645527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821752
16003	NC_009565	CAG	2	6	645545	645550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821752
16004	NC_009565	GC	3	6	645558	645563	0 %	0 %	50 %	50 %	148821752
16005	NC_009565	CGA	2	6	645565	645570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821752
16006	NC_009565	GAT	2	6	645587	645592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821752
16007	NC_009565	CGT	2	6	645610	645615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821752
16008	NC_009565	GAT	2	6	645695	645700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821752
16009	NC_009565	CAG	2	6	645728	645733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821752
16010	NC_009565	ACCG	2	8	645734	645741	25 %	0 %	25 %	50 %	148821752
16011	NC_009565	TGG	2	6	645855	645860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821752
16012	NC_009565	GGT	2	6	646002	646007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821752
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16118	NC_009565	TGC	2	6	650382	650387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821756
16119	NC_009565	CAC	2	6	650482	650487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821756
16120	NC_009565	GC	3	6	650490	650495	0 %	0 %	50 %	50 %	148821756
16121	NC_009565	GCG	2	6	650522	650527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821756
16122	NC_009565	CGG	2	6	650547	650552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821756
16123	NC_009565	ACC	2	6	650582	650587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821756
16124	NC_009565	CGG	3	9	650601	650609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821756
16125	NC_009565	GGC	2	6	650764	650769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821756
16126	NC_009565	CCCCG	2	10	650814	650823	0 %	0 %	20 %	80 %	148821756
16127	NC_009565	CCGA	2	8	650885	650892	25 %	0 %	25 %	50 %	148821756
16128	NC_009565	GTG	2	6	650918	650923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821756
16129	NC_009565	CGG	3	9	650935	650943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821756
16130	NC_009565	ACG	2	6	651015	651020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821756
16131	NC_009565	CGA	2	6	651076	651081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821756
16132	NC_009565	GACC	2	8	651087	651094	25 %	0 %	25 %	50 %	148821756
16133	NC_009565	GTC	2	6	651145	651150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821756
16134	NC_009565	CGC	2	6	651166	651171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821756
16135	NC_009565	GGC	2	6	651178	651183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821756
16136	NC_009565	CTG	2	6	651205	651210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821757
16137	NC_009565	TGA	2	6	651234	651239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821757
16138	NC_009565	TGC	2	6	651266	651271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821757
16139	NC_009565	TGG	2	6	651332	651337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821757
16140	NC_009565	CGA	2	6	651422	651427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821757
16141	NC_009565	CGGAT	2	10	651443	651452	20 %	20 %	40 %	20 %	148821757
16142	NC_009565	TCCG	2	8	651483	651490	0 %	25 %	25 %	50 %	148821757
16143	NC_009565	ACA	2	6	651524	651529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821757
16144	NC_009565	GCA	2	6	651555	651560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821757
16145	NC_009565	ATC	2	6	651580	651585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821757
16146	NC_009565	CCGG	2	8	651586	651593	0 %	0 %	50 %	50 %	148821757
16147	NC_009565	GGT	2	6	651603	651608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821757
16148	NC_009565	CGC	4	12	651621	651632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821757
16149	NC_009565	CGT	2	6	651670	651675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821757
16150	NC_009565	AGC	2	6	651702	651707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821757
16151	NC_009565	GT	4	8	651762	651769	0 %	50 %	50 %	0 %	148821758
16152	NC_009565	TCG	2	6	651786	651791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821758
16153	NC_009565	TCC	2	6	651801	651806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148821758
16154	NC_009565	GGT	2	6	651832	651837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821758
16155	NC_009565	CGC	2	6	651897	651902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821758
16156	NC_009565	ACG	2	6	651930	651935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821758
16157	NC_009565	GCT	2	6	652069	652074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821758
16158	NC_009565	CGG	2	6	652100	652105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821758
16159	NC_009565	GCG	2	6	652187	652192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821758
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16161	NC_009565	TCG	2	6	652386	652391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821758
16162	NC_009565	GGC	2	6	652444	652449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821758
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16166	NC_009565	GCT	2	6	652711	652716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821758
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16169	NC_009565	GCT	2	6	652846	652851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821758
16170	NC_009565	CGC	2	6	652925	652930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821759
16171	NC_009565	TGACC	2	10	652988	652997	20 %	20 %	20 %	40 %	148821759
16172	NC_009565	GGC	2	6	653032	653037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821759
16173	NC_009565	TCGG	2	8	653045	653052	0 %	25 %	50 %	25 %	148821759
16174	NC_009565	CCG	2	6	653101	653106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821759
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16176	NC_009565	TG	3	6	653142	653147	0 %	50 %	50 %	0 %	148821759
16177	NC_009565	TCGG	2	8	653160	653167	0 %	25 %	50 %	25 %	148821759
16178	NC_009565	GCG	2	6	653175	653180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821759
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16180	NC_009565	GAC	2	6	653238	653243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821759
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16182	NC_009565	CGGG	2	8	653332	653339	0 %	0 %	75 %	25 %	148821759
16183	NC_009565	CTA	2	6	653343	653348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821759
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16185	NC_009565	GTT	2	6	653378	653383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821759
16186	NC_009565	GCGG	2	8	653432	653439	0 %	0 %	75 %	25 %	148821759
16187	NC_009565	GGT	2	6	653533	653538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821759
16188	NC_009565	CGG	2	6	653564	653569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821759
16189	NC_009565	CAAA	2	8	653603	653610	75 %	0 %	0 %	25 %	148821759
16190	NC_009565	AGT	2	6	653679	653684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821760
16191	NC_009565	GATC	2	8	653685	653692	25 %	25 %	25 %	25 %	148821760
16192	NC_009565	GCG	2	6	653693	653698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821760
16193	NC_009565	CG	3	6	653733	653738	0 %	0 %	50 %	50 %	148821760
16194	NC_009565	GTTGC	2	10	653743	653752	0 %	40 %	40 %	20 %	148821760
16195	NC_009565	CAAGC	2	10	653820	653829	40 %	0 %	20 %	40 %	148821760
16196	NC_009565	GTT	2	6	653872	653877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821760
16197	NC_009565	CGT	2	6	653886	653891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821760
16198	NC_009565	GTC	2	6	653893	653898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821760
16199	NC_009565	CGA	2	6	653943	653948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821760
16200	NC_009565	CAGC	2	8	653952	653959	25 %	0 %	25 %	50 %	148821760
16201	NC_009565	CGT	2	6	653989	653994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16202	NC_009565	AGC	2	6	654026	654031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821761
16203	NC_009565	GCCG	2	8	654100	654107	0 %	0 %	50 %	50 %	148821761
16204	NC_009565	CG	3	6	654125	654130	0 %	0 %	50 %	50 %	148821761
16205	NC_009565	GAT	2	6	654145	654150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821761
16206	NC_009565	CCG	2	6	654165	654170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821761
16207	NC_009565	CG	3	6	654169	654174	0 %	0 %	50 %	50 %	148821761
16208	NC_009565	CGC	2	6	654217	654222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821761
16209	NC_009565	AGG	2	6	654246	654251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148821761
16210	NC_009565	GCC	2	6	654260	654265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821761
16211	NC_009565	GCAC	2	8	654266	654273	25 %	0 %	25 %	50 %	148821761
16212	NC_009565	CGA	2	6	654333	654338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821761
16213	NC_009565	GCT	2	6	654419	654424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821761
16214	NC_009565	CGG	3	9	654444	654452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821761
16215	NC_009565	GTG	2	6	654473	654478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821761
16216	NC_009565	CGC	2	6	654540	654545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821761
16217	NC_009565	GGC	2	6	654568	654573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821761
16218	NC_009565	CTCC	2	8	654615	654622	0 %	25 %	0 %	75 %	148821761
16219	NC_009565	AT	4	8	654691	654698	50 %	50 %	0 %	0 %	148821761
16220	NC_009565	AT	3	6	654710	654715	50 %	50 %	0 %	0 %	148821761
16221	NC_009565	GCCG	2	8	654749	654756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16222	NC_009565	CGG	2	6	654766	654771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821762
16223	NC_009565	TCG	2	6	654772	654777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821762
16224	NC_009565	CGA	2	6	654780	654785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821762
16225	NC_009565	GTC	3	9	654835	654843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821762
16226	NC_009565	TCA	2	6	654879	654884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821762
16227	NC_009565	AAC	2	6	654944	654949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821762
16228	NC_009565	GC	3	6	654958	654963	0 %	0 %	50 %	50 %	148821762
16229	NC_009565	CAG	2	6	654994	654999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821762
16230	NC_009565	CAG	2	6	655033	655038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821762
16231	NC_009565	CGG	2	6	655041	655046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821762
16232	NC_009565	GCC	2	6	655050	655055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821762
16233	NC_009565	CGC	2	6	655158	655163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821762
16234	NC_009565	CGA	2	6	655180	655185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821762
16235	NC_009565	CG	4	8	655189	655196	0 %	0 %	50 %	50 %	148821762
16236	NC_009565	GTA	2	6	655237	655242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821762
16237	NC_009565	GGC	2	6	655527	655532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821762
16238	NC_009565	ACC	2	6	655568	655573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821762
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16240	NC_009565	GTC	2	6	655660	655665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821762
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16251	NC_009565	CG	3	6	656076	656081	0 %	0 %	50 %	50 %	148821763
16252	NC_009565	CGA	2	6	656118	656123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821763
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16255	NC_009565	CGG	2	6	656160	656165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821763
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16309	NC_009565	TGA	2	6	658235	658240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162286715
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16350	NC_009565	CGGT	2	8	660094	660101	0 %	25 %	50 %	25 %	148821766
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16355	NC_009565	GAA	2	6	660276	660281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148821766
16356	NC_009565	CGAT	2	8	660397	660404	25 %	25 %	25 %	25 %	148821766
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