MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 110190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009565	ATCGC	2	10	611076	611085	20 %	20 %	20 %	40 %	148821717
15002	NC_009565	CGC	2	6	611107	611112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821717
15003	NC_009565	GC	3	6	611119	611124	0 %	0 %	50 %	50 %	148821717
15004	NC_009565	CCG	2	6	611142	611147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821717
15005	NC_009565	CAC	2	6	611169	611174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821717
15006	NC_009565	ACG	2	6	611184	611189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821717
15007	NC_009565	CCG	2	6	611195	611200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821717
15008	NC_009565	CTG	2	6	611213	611218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821718
15009	NC_009565	CGG	3	9	611240	611248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821718
15010	NC_009565	GC	3	6	611290	611295	0 %	0 %	50 %	50 %	148821718
15011	NC_009565	ACT	2	6	611351	611356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821718
15012	NC_009565	CGG	2	6	611388	611393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821718
15013	NC_009565	GGC	2	6	611530	611535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821718
15014	NC_009565	CAC	2	6	611557	611562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821718
15015	NC_009565	CGG	2	6	611613	611618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821718
15016	NC_009565	CGT	2	6	611632	611637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821718
15017	NC_009565	TCA	2	6	611676	611681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821718
15018	NC_009565	CCGA	2	8	611710	611717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15019	NC_009565	GCC	2	6	611771	611776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15020	NC_009565	AAG	2	6	611791	611796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_009565	TGA	2	6	611883	611888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_009565	GGT	2	6	611896	611901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821719
15023	NC_009565	GCC	2	6	611910	611915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821719
15024	NC_009565	CAG	2	6	611941	611946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821719
15025	NC_009565	GC	3	6	611970	611975	0 %	0 %	50 %	50 %	148821719
15026	NC_009565	TCG	2	6	612020	612025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821719
15027	NC_009565	CGG	2	6	612026	612031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821719
15028	NC_009565	CCGA	2	8	612054	612061	25 %	0 %	25 %	50 %	148821719
15029	NC_009565	GCG	2	6	612116	612121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821719
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15031	NC_009565	GGTC	2	8	612200	612207	0 %	25 %	50 %	25 %	148821719
15032	NC_009565	CTT	2	6	612222	612227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821719
15033	NC_009565	GCC	2	6	612280	612285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821719
15034	NC_009565	AGGC	2	8	612332	612339	25 %	0 %	50 %	25 %	148821719
15035	NC_009565	CTG	2	6	612373	612378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821719
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15041	NC_009565	CTG	2	6	612568	612573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821719
15042	NC_009565	GCTG	2	8	612605	612612	0 %	25 %	50 %	25 %	148821719
15043	NC_009565	CGC	2	6	612633	612638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821719
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15045	NC_009565	CCGA	2	8	612676	612683	25 %	0 %	25 %	50 %	148821719
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15055	NC_009565	GCA	2	6	613142	613147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821719
15056	NC_009565	CGA	2	6	613161	613166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821719
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15058	NC_009565	GTC	2	6	613383	613388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821720
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15061	NC_009565	GGGCC	2	10	613580	613589	0 %	0 %	60 %	40 %	148821720
15062	NC_009565	CGA	2	6	613655	613660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821720
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15072	NC_009565	CGG	2	6	614162	614167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15073	NC_009565	CAG	2	6	614178	614183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15103	NC_009565	CGG	2	6	615145	615150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821721
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15107	NC_009565	ATG	2	6	615363	615368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_009565	GTC	2	6	615385	615390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15239	NC_009565	GCAGA	2	10	619992	620001	40 %	0 %	40 %	20 %	148821728
15240	NC_009565	GCG	2	6	620015	620020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821728
15241	NC_009565	CGC	2	6	620046	620051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821728
15242	NC_009565	TGC	2	6	620066	620071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821728
15243	NC_009565	GGC	2	6	620107	620112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821728
15244	NC_009565	CGG	2	6	620133	620138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821728
15245	NC_009565	TCT	2	6	620150	620155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821728
15246	NC_009565	GCC	2	6	620177	620182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821728
15247	NC_009565	GC	3	6	620218	620223	0 %	0 %	50 %	50 %	148821728
15248	NC_009565	GT	3	6	620225	620230	0 %	50 %	50 %	0 %	148821728
15249	NC_009565	GAC	2	6	620236	620241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821728
15250	NC_009565	GTC	4	12	620254	620265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821728
15251	NC_009565	GT	3	6	620348	620353	0 %	50 %	50 %	0 %	148821728
15252	NC_009565	ACA	2	6	620378	620383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821728
15253	NC_009565	TCA	2	6	620405	620410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821728
15254	NC_009565	CCA	2	6	620486	620491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821728
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15256	NC_009565	GCTG	2	8	620559	620566	0 %	25 %	50 %	25 %	148821728
15257	NC_009565	GGT	2	6	620580	620585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821728
15258	NC_009565	GAG	3	9	620599	620607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148821728
15259	NC_009565	GTCGG	2	10	620610	620619	0 %	20 %	60 %	20 %	148821728
15260	NC_009565	CTG	2	6	620673	620678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821729
15261	NC_009565	CTG	2	6	620697	620702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821729
15262	NC_009565	CTGGT	2	10	620704	620713	0 %	40 %	40 %	20 %	148821729
15263	NC_009565	TG	3	6	620730	620735	0 %	50 %	50 %	0 %	148821729
15264	NC_009565	GGC	2	6	620768	620773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821729
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15268	NC_009565	CGT	2	6	620807	620812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821729
15269	NC_009565	CGG	2	6	620851	620856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821729
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15272	NC_009565	GCT	3	9	620942	620950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821729
15273	NC_009565	TCG	2	6	620974	620979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821729
15274	NC_009565	CGC	2	6	621037	621042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821729
15275	NC_009565	CTGGGG	2	12	621204	621215	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148821729
15276	NC_009565	GTTCG	2	10	621236	621245	0 %	40 %	40 %	20 %	148821729
15277	NC_009565	GCTG	2	8	621268	621275	0 %	25 %	50 %	25 %	148821729
15278	NC_009565	CGG	2	6	621305	621310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821729
15279	NC_009565	GCT	2	6	621314	621319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821729
15280	NC_009565	CGGT	2	8	621325	621332	0 %	25 %	50 %	25 %	148821729
15281	NC_009565	ACG	2	6	621358	621363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821729
15282	NC_009565	TCGTG	2	10	621364	621373	0 %	40 %	40 %	20 %	148821729
15283	NC_009565	GC	3	6	621440	621445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15284	NC_009565	TGC	2	6	621486	621491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821730
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15286	NC_009565	CTG	2	6	621527	621532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821730
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15294	NC_009565	GCC	2	6	621812	621817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821730
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15303	NC_009565	CGT	2	6	622086	622091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821730
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15310	NC_009565	CTG	2	6	622379	622384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821730
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15314	NC_009565	CGA	2	6	622435	622440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821730
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15333	NC_009565	GCT	4	12	623118	623129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821731
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15339	NC_009565	CTG	2	6	623305	623310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821731
15340	NC_009565	GCGT	2	8	623311	623318	0 %	25 %	50 %	25 %	148821731
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15344	NC_009565	TGC	2	6	623417	623422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821731
15345	NC_009565	CTG	2	6	623455	623460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821731
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15348	NC_009565	GC	3	6	623663	623668	0 %	0 %	50 %	50 %	148821731
15349	NC_009565	GCG	2	6	623682	623687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821731
15350	NC_009565	TCG	2	6	623840	623845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821731
15351	NC_009565	GTGG	2	8	623847	623854	0 %	25 %	75 %	0 %	148821731
15352	NC_009565	CG	3	6	623874	623879	0 %	0 %	50 %	50 %	148821731
15353	NC_009565	CGG	2	6	623885	623890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821731
15354	NC_009565	GCC	2	6	623908	623913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821731
15355	NC_009565	TTC	2	6	623956	623961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148821731
15356	NC_009565	GCA	2	6	624038	624043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15357	NC_009565	CGG	2	6	624104	624109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821732
15358	NC_009565	ATC	2	6	624115	624120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821732
15359	NC_009565	GCC	2	6	624134	624139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821732
15360	NC_009565	CAC	2	6	624157	624162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821732
15361	NC_009565	GGT	2	6	624174	624179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821732
15362	NC_009565	CTA	2	6	624245	624250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821732
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15365	NC_009565	GCT	2	6	624350	624355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821732
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15377	NC_009565	CG	4	8	625048	625055	0 %	0 %	50 %	50 %	148821732
15378	NC_009565	GTC	2	6	625077	625082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821732
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15385	NC_009565	TCG	3	9	625314	625322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15387	NC_009565	GAG	2	6	625409	625414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15388	NC_009565	CCT	2	6	625433	625438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15389	NC_009565	GCT	3	9	625541	625549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821733
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15433	NC_009565	GGTG	2	8	626657	626664	0 %	25 %	75 %	0 %	148821734
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15477	NC_009565	CGG	2	6	627328	627333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821734
15478	NC_009565	CGG	4	12	627337	627348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821734
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15480	NC_009565	GGT	2	6	627398	627403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821734
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15491	NC_009565	GCT	2	6	627523	627528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821734
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