MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_009464	GCT	2	6	2280495	2280500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920929
46002	NC_009464	AGC	2	6	2280533	2280538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920929
46003	NC_009464	CAG	2	6	2280549	2280554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920929
46004	NC_009464	CAG	2	6	2280781	2280786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920929
46005	NC_009464	TGC	2	6	2280788	2280793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920929
46006	NC_009464	CAA	2	6	2280804	2280809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147920929
46007	NC_009464	CGG	2	6	2280831	2280836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920929
46008	NC_009464	AGG	2	6	2280914	2280919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147920929
46009	NC_009464	GGCCTC	2	12	2280988	2280999	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	147920929
46010	NC_009464	GCA	2	6	2281067	2281072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920929
46011	NC_009464	CTT	2	6	2281074	2281079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920929
46012	NC_009464	ATC	2	6	2281098	2281103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920929
46013	NC_009464	AGCC	2	8	2281174	2281181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46014	NC_009464	CAT	2	6	2281213	2281218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920930
46015	NC_009464	CCG	2	6	2281419	2281424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920930
46016	NC_009464	GGC	2	6	2281444	2281449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920930
46017	NC_009464	T	6	6	2281460	2281465	0 %	100 %	0 %	0 %	147920930
46018	NC_009464	CAA	2	6	2281531	2281536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147920930
46019	NC_009464	TCA	3	9	2281626	2281634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920930
46020	NC_009464	CGA	2	6	2281639	2281644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920930
46021	NC_009464	CGT	2	6	2281720	2281725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920930
46022	NC_009464	GCC	2	6	2281763	2281768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920930
46023	NC_009464	ACC	2	6	2281793	2281798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147920930
46024	NC_009464	CGA	2	6	2281828	2281833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920930
46025	NC_009464	CGC	2	6	2281882	2281887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920930
46026	NC_009464	AG	3	6	2282037	2282042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46027	NC_009464	TA	3	6	2282061	2282066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46028	NC_009464	TA	3	6	2282087	2282092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46029	NC_009464	CAC	2	6	2282212	2282217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46030	NC_009464	CGC	2	6	2282469	2282474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920931
46031	NC_009464	GTA	2	6	2282503	2282508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147920931
46032	NC_009464	GCT	2	6	2282560	2282565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920931
46033	NC_009464	AGC	2	6	2282570	2282575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920931
46034	NC_009464	ACTG	2	8	2282580	2282587	25 %	25 %	25 %	25 %	147920931
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46037	NC_009464	ACTG	2	8	2282728	2282735	25 %	25 %	25 %	25 %	147920931
46038	NC_009464	CAC	2	6	2282785	2282790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147920931
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46040	NC_009464	GGC	2	6	2282866	2282871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920931
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46042	NC_009464	CT	4	8	2282928	2282935	0 %	50 %	0 %	50 %	147920931
46043	NC_009464	GGC	2	6	2282944	2282949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920931
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46045	NC_009464	CG	3	6	2282998	2283003	0 %	0 %	50 %	50 %	147920931
46046	NC_009464	CCGG	2	8	2283059	2283066	0 %	0 %	50 %	50 %	147920931
46047	NC_009464	CTG	2	6	2283094	2283099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920931
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46052	NC_009464	TATC	2	8	2283276	2283283	25 %	50 %	0 %	25 %	147920931
46053	NC_009464	GGC	2	6	2283294	2283299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920931
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46058	NC_009464	GCA	2	6	2283711	2283716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920931
46059	NC_009464	CGT	2	6	2283717	2283722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920931
46060	NC_009464	CTG	2	6	2283740	2283745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920931
46061	NC_009464	GCT	3	9	2283757	2283765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920931
46062	NC_009464	TACC	2	8	2283801	2283808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46063	NC_009464	CGTC	2	8	2283822	2283829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46064	NC_009464	ATC	2	6	2283915	2283920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920932
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46072	NC_009464	GCC	2	6	2284559	2284564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920932
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46101	NC_009464	GCG	2	6	2285805	2285810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920933
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46103	NC_009464	GTA	2	6	2285963	2285968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147920933
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46106	NC_009464	AG	3	6	2286106	2286111	50 %	0 %	50 %	0 %	147920933
46107	NC_009464	TGC	2	6	2286144	2286149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920933
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46110	NC_009464	CGG	2	6	2286184	2286189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920933
46111	NC_009464	ATC	2	6	2286233	2286238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920933
46112	NC_009464	TA	3	6	2286263	2286268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46113	NC_009464	TTTACC	2	12	2286275	2286286	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46114	NC_009464	CCTGCA	2	12	2286339	2286350	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46115	NC_009464	TCCT	2	8	2286400	2286407	0 %	50 %	0 %	50 %	147920934
46116	NC_009464	GCG	2	6	2286447	2286452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920934
46117	NC_009464	TCT	2	6	2286460	2286465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920934
46118	NC_009464	GGC	2	6	2286501	2286506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920934
46119	NC_009464	GCC	2	6	2286567	2286572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147920934
46120	NC_009464	TAC	2	6	2286573	2286578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920934
46121	NC_009464	GCT	3	9	2286602	2286610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920934
46122	NC_009464	TTC	2	6	2286777	2286782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147920934
46123	NC_009464	CAT	2	6	2286800	2286805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920934
46124	NC_009464	GCAT	2	8	2286855	2286862	25 %	25 %	25 %	25 %	147920934
46125	NC_009464	CTC	2	6	2286891	2286896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147920934
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46128	NC_009464	AGTC	2	8	2287140	2287147	25 %	25 %	25 %	25 %	147920935
46129	NC_009464	CAT	3	9	2287171	2287179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920935
46130	NC_009464	CGA	2	6	2287261	2287266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920935
46131	NC_009464	GGC	2	6	2287412	2287417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147920935
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46134	NC_009464	CAT	2	6	2287519	2287524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920935
46135	NC_009464	GAC	2	6	2287588	2287593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147920935
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46143	NC_009464	CA	3	6	2288075	2288080	50 %	0 %	0 %	50 %	147920936
46144	NC_009464	CATCA	2	10	2288119	2288128	40 %	20 %	0 %	40 %	147920936
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46147	NC_009464	CAC	2	6	2288209	2288214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147920936
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46152	NC_009464	CAT	2	6	2288290	2288295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147920936
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46154	NC_009464	GATA	2	8	2288341	2288348	50 %	25 %	25 %	0 %	147920936
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46156	NC_009464	GCCA	2	8	2288766	2288773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46157	NC_009464	TGA	2	6	2288964	2288969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46159	NC_009464	AAAT	2	8	2289181	2289188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46160	NC_009464	ACA	2	6	2289242	2289247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46161	NC_009464	TGAAT	2	10	2289273	2289282	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46162	NC_009464	T	6	6	2289330	2289335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46163	NC_009464	AT	3	6	2289408	2289413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46164	NC_009464	AGCA	2	8	2289427	2289434	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46165	NC_009464	CAGCG	2	10	2289481	2289490	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46166	NC_009464	TCC	2	6	2289498	2289503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46167	NC_009464	TTA	2	6	2289548	2289553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46168	NC_009464	TCGTA	2	10	2289590	2289599	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46169	NC_009464	GAGATG	3	18	2289637	2289654	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	147920937
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46218	NC_009464	CCG	2	6	2291686	2291691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46219	NC_009464	GATTT	2	10	2291751	2291760	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46220	NC_009464	TGG	2	6	2291783	2291788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46221	NC_009464	CTG	2	6	2291828	2291833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46222	NC_009464	CGT	2	6	2291847	2291852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46223	NC_009464	TA	3	6	2291909	2291914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46224	NC_009464	TAA	2	6	2291993	2291998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46225	NC_009464	CTATA	2	10	2292011	2292020	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46226	NC_009464	TGC	2	6	2292036	2292041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46227	NC_009464	ATT	2	6	2292070	2292075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147920940
46228	NC_009464	GCTCC	2	10	2292118	2292127	0 %	20 %	20 %	60 %	147920940
46229	NC_009464	GCT	2	6	2292161	2292166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147920940
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46231	NC_009464	T	6	6	2292320	2292325	0 %	100 %	0 %	0 %	147920940
46232	NC_009464	AAT	2	6	2292341	2292346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147920940
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